MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 1294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016861	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987265
2	NC_016861	CCA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987265
3	NC_016861	AGT	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987265
4	NC_016861	GCG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987265
5	NC_016861	GCC	3	9	274	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987265
6	NC_016861	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987266
7	NC_016861	AGG	2	6	404	409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987266
8	NC_016861	GAA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987266
9	NC_016861	GCG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987266
10	NC_016861	CCA	2	6	512	517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987266
11	NC_016861	CTG	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987267
12	NC_016861	AGC	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987267
13	NC_016861	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987267
14	NC_016861	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987267
15	NC_016861	CAG	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987267
16	NC_016861	CTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987268
17	NC_016861	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987268
18	NC_016861	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987268
19	NC_016861	GCA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987268
20	NC_016861	GTC	2	6	1130	1135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987268
21	NC_016861	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987269
22	NC_016861	GAC	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987269
23	NC_016861	GCA	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987269
24	NC_016861	ACT	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987269
25	NC_016861	CTA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987269
26	NC_016861	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987270
27	NC_016861	TGC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987270
28	NC_016861	CGT	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987270
29	NC_016861	GCT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987270
30	NC_016861	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987270
31	NC_016861	CGC	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987270
32	NC_016861	CAG	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987270
33	NC_016861	GCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987270
34	NC_016861	CAG	2	6	2639	2644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987270
35	NC_016861	CGG	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987270
36	NC_016861	GCG	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987270
37	NC_016861	ATG	3	9	2729	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987270
38	NC_016861	ACT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987272
39	NC_016861	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987272
40	NC_016861	CAG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987272
41	NC_016861	CAC	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987272
42	NC_016861	ATG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987272
43	NC_016861	ACC	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987272
44	NC_016861	TCC	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987272
45	NC_016861	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987272
46	NC_016861	CAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987273
47	NC_016861	ACG	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987273
48	NC_016861	GCG	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987273
49	NC_016861	CAG	3	9	5516	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987273
50	NC_016861	TCC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987274
51	NC_016861	GTT	2	6	5851	5856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987274
52	NC_016861	CCA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987274
53	NC_016861	CGG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987274
54	NC_016861	TGC	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987274
55	NC_016861	CCG	2	6	6170	6175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987274
56	NC_016861	GCA	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987274
57	NC_016861	CCA	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987274
58	NC_016861	GAG	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987274
59	NC_016861	CTG	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987274
60	NC_016861	GCC	2	6	6325	6330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987274
61	NC_016861	CAG	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987274
62	NC_016861	TGC	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987274
63	NC_016861	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987275
64	NC_016861	CAG	3	9	6606	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987275
65	NC_016861	GGA	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987275
66	NC_016861	ATC	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987275
67	NC_016861	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987276
68	NC_016861	ACC	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
69	NC_016861	GCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987276
70	NC_016861	GGC	2	6	6757	6762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987276
71	NC_016861	TTG	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987276
72	NC_016861	CCA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
73	NC_016861	CGG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987276
74	NC_016861	CGG	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987276
75	NC_016861	CCA	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
76	NC_016861	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987276
77	NC_016861	TCA	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987276
78	NC_016861	CAG	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987276
79	NC_016861	CCA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
80	NC_016861	ACC	2	6	7202	7207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
81	NC_016861	ATA	2	6	7275	7280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987276
82	NC_016861	CTT	2	6	7600	7605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987277
83	NC_016861	CAT	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987277
84	NC_016861	GCA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987277
85	NC_016861	GCA	3	9	7786	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987277
86	NC_016861	CCG	2	6	7827	7832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987277
87	NC_016861	GCA	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987278
88	NC_016861	AAT	2	6	8086	8091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987278
89	NC_016861	ACC	2	6	9700	9705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987279
90	NC_016861	GTT	2	6	9768	9773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987279
91	NC_016861	CAT	2	6	9797	9802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987279
92	NC_016861	TAC	2	6	9830	9835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987279
93	NC_016861	ATT	2	6	9861	9866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987279
94	NC_016861	GCT	2	6	9900	9905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987279
95	NC_016861	GTG	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987279
96	NC_016861	CAC	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987279
97	NC_016861	CCG	2	6	10060	10065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987279
98	NC_016861	CAG	2	6	10161	10166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987279
99	NC_016861	GCC	2	6	10271	10276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987280
100	NC_016861	AGT	2	6	10429	10434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987280
101	NC_016861	TTC	2	6	10446	10451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987280
102	NC_016861	CCG	2	6	10464	10469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987280
103	NC_016861	CAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987280
104	NC_016861	CGG	2	6	10598	10603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987280
105	NC_016861	ATG	2	6	10668	10673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987280
106	NC_016861	CGG	2	6	10712	10717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987280
107	NC_016861	CTG	2	6	10740	10745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987280
108	NC_016861	GTG	2	6	10752	10757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987280
109	NC_016861	GCC	2	6	10775	10780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987280
110	NC_016861	CAG	2	6	10901	10906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987280
111	NC_016861	TCA	2	6	10924	10929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987280
112	NC_016861	CCT	2	6	10946	10951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987281
113	NC_016861	TCA	2	6	11051	11056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987281
114	NC_016861	GCA	2	6	11165	11170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987281
115	NC_016861	CAC	2	6	11217	11222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987281
116	NC_016861	AGG	2	6	11228	11233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987281
117	NC_016861	CAC	2	6	11310	11315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987281
118	NC_016861	TGG	2	6	11333	11338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987281
119	NC_016861	TCA	3	9	11414	11422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987281
120	NC_016861	GGT	2	6	11472	11477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987281
121	NC_016861	CAT	2	6	11499	11504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987281
122	NC_016861	GCT	3	9	11646	11654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987281
123	NC_016861	CTG	2	6	11671	11676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987281
124	NC_016861	TGG	2	6	11801	11806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987281
125	NC_016861	CCA	2	6	11847	11852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987281
126	NC_016861	TCC	2	6	11857	11862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987281
127	NC_016861	TGT	2	6	11933	11938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987281
128	NC_016861	TGT	2	6	12077	12082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987281
129	NC_016861	CGG	2	6	12119	12124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987281
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499	NC_016861	GCC	2	6	45204	45209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987326
500	NC_016861	GAA	2	6	45220	45225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987326

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