MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016861	AAT	3	9	30815	30823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987308
502	NC_016861	TGG	2	6	30887	30892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987308
503	NC_016861	ATTCAT	2	12	30897	30908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378987308
504	NC_016861	AAC	2	6	31096	31101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987309
505	NC_016861	AAC	2	6	31133	31138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987309
506	NC_016861	ATTC	2	8	31168	31175	25 %	50 %	0 %	25 %	378987309
507	NC_016861	TTC	2	6	31206	31211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987309
508	NC_016861	CTG	2	6	31444	31449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987310
509	NC_016861	AGG	2	6	31509	31514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987310
510	NC_016861	TTG	2	6	31609	31614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987310
511	NC_016861	TGAAC	2	10	31627	31636	40 %	20 %	20 %	20 %	378987310
512	NC_016861	A	7	7	31690	31696	100 %	0 %	0 %	0 %	378987310
513	NC_016861	AGAA	2	8	31787	31794	75 %	0 %	25 %	0 %	378987310
514	NC_016861	T	6	6	31795	31800	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
515	NC_016861	AATA	2	8	31804	31811	75 %	25 %	0 %	0 %	378987310
516	NC_016861	AAT	2	6	31863	31868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987310
517	NC_016861	GTT	2	6	31891	31896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987310
518	NC_016861	TTC	2	6	31909	31914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987310
519	NC_016861	TAT	2	6	31915	31920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987310
520	NC_016861	T	6	6	31953	31958	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
521	NC_016861	T	6	6	31991	31996	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
522	NC_016861	ATT	2	6	32024	32029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987310
523	NC_016861	GTT	2	6	32034	32039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987310
524	NC_016861	TTC	2	6	32150	32155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987310
525	NC_016861	CT	3	6	32179	32184	0 %	50 %	0 %	50 %	378987310
526	NC_016861	T	6	6	32290	32295	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
527	NC_016861	ATA	2	6	32312	32317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987310
528	NC_016861	AGC	2	6	32933	32938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987311
529	NC_016861	TGA	2	6	32945	32950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987311
530	NC_016861	CAA	2	6	32979	32984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987311
531	NC_016861	ATGCTG	2	12	33021	33032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378987311
532	NC_016861	GCC	2	6	33075	33080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987311
533	NC_016861	TTTAC	2	10	33111	33120	20 %	60 %	0 %	20 %	378987311
534	NC_016861	TGGC	2	8	33230	33237	0 %	25 %	50 %	25 %	378987311
535	NC_016861	TCA	2	6	33274	33279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987311
536	NC_016861	AGGC	2	8	33330	33337	25 %	0 %	50 %	25 %	378987311
537	NC_016861	GAA	2	6	33393	33398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987311
538	NC_016861	ACGGG	2	10	33588	33597	20 %	0 %	60 %	20 %	378987311
539	NC_016861	GCA	3	9	33613	33621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987311
540	NC_016861	ATTT	2	8	33631	33638	25 %	75 %	0 %	0 %	378987311
541	NC_016861	TACA	2	8	33665	33672	50 %	25 %	0 %	25 %	378987311
542	NC_016861	GGCG	2	8	33673	33680	0 %	0 %	75 %	25 %	378987311
543	NC_016861	TGG	2	6	33694	33699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987311
544	NC_016861	CAT	2	6	33710	33715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987311
545	NC_016861	GCTG	2	8	33739	33746	0 %	25 %	50 %	25 %	378987311
546	NC_016861	GAA	2	6	33747	33752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987311
547	NC_016861	ATC	2	6	33850	33855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987311
548	NC_016861	GACC	2	8	34159	34166	25 %	0 %	25 %	50 %	378987312
549	NC_016861	ATT	2	6	34214	34219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987312
550	NC_016861	AAT	2	6	34221	34226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987312
551	NC_016861	CCA	2	6	34261	34266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987312
552	NC_016861	CAG	2	6	34442	34447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987312
553	NC_016861	CTTACC	2	12	34481	34492	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378987312
554	NC_016861	CAG	2	6	34505	34510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987312
555	NC_016861	AT	3	6	34518	34523	50 %	50 %	0 %	0 %	378987312
556	NC_016861	TCC	2	6	34581	34586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987312
557	NC_016861	TCG	2	6	34588	34593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987312
558	NC_016861	GAC	2	6	34594	34599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987312
559	NC_016861	ACG	2	6	34635	34640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987312
560	NC_016861	ACC	2	6	34649	34654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987312
561	NC_016861	TCA	2	6	34722	34727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987312
562	NC_016861	T	6	6	34754	34759	0 %	100 %	0 %	0 %	378987312
563	NC_016861	TTGT	2	8	34796	34803	0 %	75 %	25 %	0 %	378987312
564	NC_016861	ATTTT	2	10	34908	34917	20 %	80 %	0 %	0 %	378987312
565	NC_016861	CAG	2	6	34922	34927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987312
566	NC_016861	TGC	3	9	34929	34937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987312
567	NC_016861	CAC	2	6	34970	34975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987312
568	NC_016861	GTC	2	6	34993	34998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987312
569	NC_016861	TCA	2	6	35026	35031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987312
570	NC_016861	GCT	2	6	35032	35037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987312
571	NC_016861	TGG	2	6	35040	35045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987312
572	NC_016861	ATA	2	6	35054	35059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987312
573	NC_016861	TCAG	2	8	35188	35195	25 %	25 %	25 %	25 %	378987313
574	NC_016861	TCG	2	6	35254	35259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987313
575	NC_016861	GCT	2	6	35348	35353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987313
576	NC_016861	TCA	2	6	35359	35364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987313
577	NC_016861	ATA	2	6	35511	35516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987313
578	NC_016861	CAG	2	6	35574	35579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987313
579	NC_016861	GCCA	2	8	35740	35747	25 %	0 %	25 %	50 %	378987313
580	NC_016861	TCC	2	6	35749	35754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987313
581	NC_016861	CCT	2	6	35876	35881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987313
582	NC_016861	CGT	2	6	35925	35930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987313
583	NC_016861	TGCC	2	8	35945	35952	0 %	25 %	25 %	50 %	378987313
584	NC_016861	GGC	2	6	36050	36055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987313
585	NC_016861	CGCAG	2	10	36109	36118	20 %	0 %	40 %	40 %	378987313
586	NC_016861	AC	4	8	36137	36144	50 %	0 %	0 %	50 %	378987313
587	NC_016861	CCG	2	6	36314	36319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987313
588	NC_016861	AATC	2	8	36411	36418	50 %	25 %	0 %	25 %	378987313
589	NC_016861	CAG	2	6	36447	36452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987313
590	NC_016861	GGC	2	6	36479	36484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987313
591	NC_016861	ATTT	2	8	36488	36495	25 %	75 %	0 %	0 %	378987313
592	NC_016861	GCA	2	6	36514	36519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987313
593	NC_016861	CGT	2	6	36630	36635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987313
594	NC_016861	GGC	2	6	36697	36702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987313
595	NC_016861	GCT	2	6	36762	36767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987313
596	NC_016861	GGCG	2	8	36816	36823	0 %	0 %	75 %	25 %	378987314
597	NC_016861	TCT	2	6	36840	36845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987314
598	NC_016861	CAG	2	6	36870	36875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987314
599	NC_016861	TTCC	2	8	36890	36897	0 %	50 %	0 %	50 %	378987314
600	NC_016861	CGC	2	6	36919	36924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987314
601	NC_016861	ATA	2	6	37157	37162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987315
602	NC_016861	GGCCT	2	10	37172	37181	0 %	20 %	40 %	40 %	378987315
603	NC_016861	TGG	2	6	37216	37221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987315
604	NC_016861	GTT	2	6	37301	37306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987315
605	NC_016861	GAGCA	2	10	37361	37370	40 %	0 %	40 %	20 %	378987315
606	NC_016861	GC	3	6	37372	37377	0 %	0 %	50 %	50 %	378987315
607	NC_016861	GGCG	2	8	37385	37392	0 %	0 %	75 %	25 %	378987315
608	NC_016861	TGA	2	6	37405	37410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987315
609	NC_016861	CTT	2	6	37427	37432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987315
610	NC_016861	GTT	2	6	37436	37441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987315
611	NC_016861	ACG	2	6	37481	37486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987315
612	NC_016861	GGA	2	6	37487	37492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987315
613	NC_016861	GA	3	6	37491	37496	50 %	0 %	50 %	0 %	378987315
614	NC_016861	CAGC	2	8	37702	37709	25 %	0 %	25 %	50 %	378987315
615	NC_016861	ATG	2	6	37770	37775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987315
616	NC_016861	TGC	2	6	37892	37897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987316
617	NC_016861	GCT	2	6	37952	37957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987316
618	NC_016861	TCC	2	6	37959	37964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987316
619	NC_016861	CAT	2	6	37977	37982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987316
620	NC_016861	CCA	2	6	38102	38107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987317
621	NC_016861	CGCC	2	8	38231	38238	0 %	0 %	25 %	75 %	378987317
622	NC_016861	AAGA	2	8	38272	38279	75 %	0 %	25 %	0 %	378987317
623	NC_016861	TGG	2	6	38297	38302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987317
624	NC_016861	CGGG	2	8	38569	38576	0 %	0 %	75 %	25 %	378987317
625	NC_016861	CCT	2	6	38624	38629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987317
626	NC_016861	CTG	2	6	38658	38663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987317
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