MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016860	TTC	2	6	208755	208760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982719
4002	NC_016860	GCG	2	6	208861	208866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982719
4003	NC_016860	GGC	2	6	208881	208886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982719
4004	NC_016860	AGTG	2	8	208896	208903	25 %	25 %	50 %	0 %	378982719
4005	NC_016860	AAG	2	6	209356	209361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982720
4006	NC_016860	ATG	2	6	209431	209436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982720
4007	NC_016860	TG	3	6	209435	209440	0 %	50 %	50 %	0 %	378982720
4008	NC_016860	CGGCG	2	10	209496	209505	0 %	0 %	60 %	40 %	378982720
4009	NC_016860	TGA	2	6	209525	209530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982720
4010	NC_016860	GGA	2	6	209583	209588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982720
4011	NC_016860	GC	3	6	209651	209656	0 %	0 %	50 %	50 %	378982720
4012	NC_016860	CAG	3	9	209680	209688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982720
4013	NC_016860	TGC	2	6	209708	209713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982720
4014	NC_016860	GTT	2	6	209807	209812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982721
4015	NC_016860	ACG	2	6	209876	209881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982721
4016	NC_016860	GCC	2	6	209888	209893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982721
4017	NC_016860	ATT	2	6	209979	209984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982721
4018	NC_016860	TGG	2	6	210174	210179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982721
4019	NC_016860	ATT	2	6	210197	210202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982721
4020	NC_016860	GGCT	2	8	210258	210265	0 %	25 %	50 %	25 %	378982721
4021	NC_016860	ATC	2	6	210318	210323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982721
4022	NC_016860	TGA	2	6	210334	210339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982721
4023	NC_016860	CCA	2	6	210366	210371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982721
4024	NC_016860	TTCGG	2	10	210376	210385	0 %	40 %	40 %	20 %	378982721
4025	NC_016860	GGA	2	6	210451	210456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982721
4026	NC_016860	GC	4	8	210485	210492	0 %	0 %	50 %	50 %	378982721
4027	NC_016860	TGA	2	6	210508	210513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982721
4028	NC_016860	TAT	2	6	210583	210588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982721
4029	NC_016860	T	6	6	210703	210708	0 %	100 %	0 %	0 %	378982721
4030	NC_016860	CGC	2	6	210728	210733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982721
4031	NC_016860	TA	3	6	210741	210746	50 %	50 %	0 %	0 %	378982721
4032	NC_016860	ATA	2	6	210759	210764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982721
4033	NC_016860	CGG	2	6	210788	210793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982721
4034	NC_016860	TCTT	2	8	210826	210833	0 %	75 %	0 %	25 %	378982721
4035	NC_016860	AGC	2	6	210868	210873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982721
4036	NC_016860	TGC	2	6	210942	210947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982721
4037	NC_016860	CTT	2	6	211120	211125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982722
4038	NC_016860	GCC	2	6	211185	211190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982722
4039	NC_016860	GAT	2	6	211205	211210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982722
4040	NC_016860	CTTGC	2	10	211385	211394	0 %	40 %	20 %	40 %	378982722
4041	NC_016860	GGC	2	6	211560	211565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982723
4042	NC_016860	CAG	2	6	211605	211610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4043	NC_016860	GTC	2	6	211635	211640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4044	NC_016860	TTCA	2	8	211656	211663	25 %	50 %	0 %	25 %	378982723
4045	NC_016860	GGCAAT	2	12	211674	211685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378982723
4046	NC_016860	TCA	2	6	211736	211741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982723
4047	NC_016860	GCT	2	6	211769	211774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4048	NC_016860	TGAGC	2	10	211797	211806	20 %	20 %	40 %	20 %	378982723
4049	NC_016860	AAT	2	6	211827	211832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982723
4050	NC_016860	CGA	2	6	211841	211846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4051	NC_016860	CCA	2	6	211871	211876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982723
4052	NC_016860	CGC	2	6	211973	211978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982723
4053	NC_016860	AG	3	6	212016	212021	50 %	0 %	50 %	0 %	378982723
4054	NC_016860	ACGT	2	8	212035	212042	25 %	25 %	25 %	25 %	378982723
4055	NC_016860	CAC	2	6	212208	212213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982723
4056	NC_016860	CGT	2	6	212255	212260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4057	NC_016860	TGG	2	6	212273	212278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982723
4058	NC_016860	GAC	2	6	212312	212317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4059	NC_016860	GCA	2	6	212330	212335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4060	NC_016860	CAA	2	6	212360	212365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982723
4061	NC_016860	TTC	2	6	212501	212506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982724
4062	NC_016860	CTG	2	6	212543	212548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982724
4063	NC_016860	CGG	2	6	212551	212556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982724
4064	NC_016860	CCG	2	6	212610	212615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982724
4065	NC_016860	GCCGAT	2	12	212672	212683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378982724
4066	NC_016860	GCAC	2	8	212731	212738	25 %	0 %	25 %	50 %	378982724
4067	NC_016860	CCAGCA	2	12	212740	212751	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378982724
4068	NC_016860	CAG	2	6	212789	212794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982724
4069	NC_016860	GCC	2	6	212831	212836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982724
4070	NC_016860	CCAG	2	8	212920	212927	25 %	0 %	25 %	50 %	378982724
4071	NC_016860	GCC	2	6	212930	212935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982724
4072	NC_016860	CGCA	2	8	212960	212967	25 %	0 %	25 %	50 %	378982724
4073	NC_016860	GC	3	6	213049	213054	0 %	0 %	50 %	50 %	378982724
4074	NC_016860	CG	3	6	213065	213070	0 %	0 %	50 %	50 %	378982724
4075	NC_016860	CAGG	2	8	213100	213107	25 %	0 %	50 %	25 %	378982724
4076	NC_016860	AG	3	6	213138	213143	50 %	0 %	50 %	0 %	378982724
4077	NC_016860	TCG	2	6	213171	213176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982724
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4079	NC_016860	CTTG	2	8	213235	213242	0 %	50 %	25 %	25 %	378982724
4080	NC_016860	GCA	2	6	213250	213255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982724
4081	NC_016860	TGG	3	9	213262	213270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982724
4082	NC_016860	GCA	2	6	213417	213422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982725
4083	NC_016860	AGATC	2	10	213466	213475	40 %	20 %	20 %	20 %	378982725
4084	NC_016860	CGGT	2	8	213546	213553	0 %	25 %	50 %	25 %	378982725
4085	NC_016860	TTC	2	6	213671	213676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982725
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4087	NC_016860	GAA	2	6	213762	213767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982725
4088	NC_016860	CGA	2	6	213772	213777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982725
4089	NC_016860	GGC	2	6	213812	213817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982725
4090	NC_016860	CGCGG	2	10	213888	213897	0 %	0 %	60 %	40 %	378982726
4091	NC_016860	CG	3	6	213898	213903	0 %	0 %	50 %	50 %	378982726
4092	NC_016860	ACG	2	6	213919	213924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982726
4093	NC_016860	GCG	2	6	213925	213930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982726
4094	NC_016860	TCG	2	6	213941	213946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982726
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4099	NC_016860	CGCGG	2	10	214072	214081	0 %	0 %	60 %	40 %	378982726
4100	NC_016860	CAT	2	6	214218	214223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982726
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4102	NC_016860	T	6	6	214275	214280	0 %	100 %	0 %	0 %	378982726
4103	NC_016860	CAG	2	6	214291	214296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982726
4104	NC_016860	GGC	2	6	214312	214317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982726
4105	NC_016860	TTC	2	6	214370	214375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982726
4106	NC_016860	ATG	2	6	214388	214393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982726
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4108	NC_016860	GGT	2	6	214461	214466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982726
4109	NC_016860	GTT	2	6	214476	214481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982726
4110	NC_016860	GC	3	6	214537	214542	0 %	0 %	50 %	50 %	378982726
4111	NC_016860	GGA	2	6	214544	214549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982726
4112	NC_016860	GC	3	6	214637	214642	0 %	0 %	50 %	50 %	378982726
4113	NC_016860	CTT	2	6	214704	214709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982726
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4117	NC_016860	TGT	2	6	214824	214829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982726
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4121	NC_016860	CCA	2	6	214965	214970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982726
4122	NC_016860	AAT	2	6	214985	214990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982726
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4124	NC_016860	GCA	2	6	215516	215521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982727
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4128	NC_016860	TCG	2	6	215791	215796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982727
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4237	NC_016860	GCGAA	2	10	220560	220569	40 %	0 %	40 %	20 %	378982731
4238	NC_016860	CAGCG	2	10	220623	220632	20 %	0 %	40 %	40 %	378982731
4239	NC_016860	CG	3	6	220647	220652	0 %	0 %	50 %	50 %	378982731
4240	NC_016860	GAA	2	6	220768	220773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982731
4241	NC_016860	CGT	2	6	220996	221001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982732
4242	NC_016860	GCA	2	6	221004	221009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982732
4243	NC_016860	GAC	2	6	221011	221016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982732
4244	NC_016860	ATG	3	9	221021	221029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982732
4245	NC_016860	GAA	2	6	221041	221046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982732
4246	NC_016860	GGCT	2	8	221098	221105	0 %	25 %	50 %	25 %	378982732
4247	NC_016860	A	6	6	221174	221179	100 %	0 %	0 %	0 %	378982732
4248	NC_016860	CGG	3	9	221216	221224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982732
4249	NC_016860	GAT	2	6	221367	221372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982732
4250	NC_016860	CGT	2	6	221374	221379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982732
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4253	NC_016860	AAC	2	6	221470	221475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982732
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4255	NC_016860	TTC	2	6	221523	221528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982732
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4258	NC_016860	ATG	2	6	221627	221632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982732
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4334	NC_016860	CTA	2	6	224563	224568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982733
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4344	NC_016860	GGAAT	2	10	225082	225091	40 %	20 %	40 %	0 %	378982733
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4353	NC_016860	GCAGC	2	10	225741	225750	20 %	0 %	40 %	40 %	378982733
4354	NC_016860	GATG	2	8	225754	225761	25 %	25 %	50 %	0 %	378982733
4355	NC_016860	GTC	2	6	225764	225769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982733
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4359	NC_016860	ACC	2	6	226004	226009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982734
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4361	NC_016860	GCC	2	6	226159	226164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982734
4362	NC_016860	AGC	2	6	226211	226216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982734
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4364	NC_016860	GGAA	2	8	226267	226274	50 %	0 %	50 %	0 %	378982734
4365	NC_016860	TGG	2	6	226290	226295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982734
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4481	NC_016860	GGCG	2	8	232040	232047	0 %	0 %	75 %	25 %	378982738
4482	NC_016860	GGC	2	6	232126	232131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
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4485	NC_016860	GC	3	6	232201	232206	0 %	0 %	50 %	50 %	378982738
4486	NC_016860	GCGG	2	8	232235	232242	0 %	0 %	75 %	25 %	378982738
4487	NC_016860	GAA	2	6	232330	232335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982738
4488	NC_016860	GGC	2	6	232459	232464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
4489	NC_016860	CCT	2	6	232484	232489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982738
4490	NC_016860	CGG	2	6	232518	232523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
4491	NC_016860	GCT	2	6	232581	232586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982738
4492	NC_016860	TGA	2	6	232701	232706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982738
4493	NC_016860	GAA	2	6	232747	232752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982738
4494	NC_016860	TGA	2	6	233028	233033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982738
4495	NC_016860	CAA	2	6	233067	233072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982738
4496	NC_016860	ACA	3	9	233108	233116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982738
4497	NC_016860	CG	3	6	233179	233184	0 %	0 %	50 %	50 %	378982738
4498	NC_016860	CTA	2	6	233208	233213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982738
4499	NC_016860	CGG	2	6	233280	233285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
4500	NC_016860	GCG	2	6	233300	233305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738

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