MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016860	GGC	2	6	157559	157564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982675
3003	NC_016860	GTT	2	6	157583	157588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982675
3004	NC_016860	TTCG	2	8	157637	157644	0 %	50 %	25 %	25 %	378982675
3005	NC_016860	TG	3	6	157680	157685	0 %	50 %	50 %	0 %	378982675
3006	NC_016860	ATT	2	6	157694	157699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982675
3007	NC_016860	AAT	2	6	157736	157741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982675
3008	NC_016860	GAC	2	6	157799	157804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982675
3009	NC_016860	TTA	2	6	158190	158195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982676
3010	NC_016860	CGC	2	6	158237	158242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982676
3011	NC_016860	GAC	2	6	158264	158269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982676
3012	NC_016860	CGT	2	6	158328	158333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982676
3013	NC_016860	CTTT	2	8	158391	158398	0 %	75 %	0 %	25 %	378982676
3014	NC_016860	CAT	2	6	158454	158459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982676
3015	NC_016860	AGG	2	6	158497	158502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982676
3016	NC_016860	CGC	2	6	158506	158511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982676
3017	NC_016860	TCG	2	6	158522	158527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982676
3018	NC_016860	TAT	2	6	158685	158690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982677
3019	NC_016860	ATT	2	6	158700	158705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982677
3020	NC_016860	CGT	2	6	158743	158748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982677
3021	NC_016860	TTA	2	6	158768	158773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982677
3022	NC_016860	AG	3	6	158868	158873	50 %	0 %	50 %	0 %	378982677
3023	NC_016860	GGT	2	6	158895	158900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982677
3024	NC_016860	GGT	2	6	158956	158961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982677
3025	NC_016860	AAC	2	6	159112	159117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982677
3026	NC_016860	GCCA	2	8	159177	159184	25 %	0 %	25 %	50 %	378982677
3027	NC_016860	AAC	2	6	159223	159228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982677
3028	NC_016860	ACA	2	6	159254	159259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982677
3029	NC_016860	TGG	2	6	159308	159313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982677
3030	NC_016860	CGC	2	6	159350	159355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982677
3031	NC_016860	CCGGC	2	10	159365	159374	0 %	0 %	40 %	60 %	378982677
3032	NC_016860	A	6	6	159397	159402	100 %	0 %	0 %	0 %	378982677
3033	NC_016860	AGA	2	6	159441	159446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982677
3034	NC_016860	TGA	2	6	159483	159488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982677
3035	NC_016860	GC	3	6	159493	159498	0 %	0 %	50 %	50 %	378982677
3036	NC_016860	AAG	2	6	159551	159556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982677
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3038	NC_016860	GC	4	8	159630	159637	0 %	0 %	50 %	50 %	378982677
3039	NC_016860	TCA	2	6	159686	159691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982677
3040	NC_016860	TTG	2	6	159692	159697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982677
3041	NC_016860	AAG	2	6	159767	159772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982677
3042	NC_016860	ACT	2	6	159824	159829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982677
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3044	NC_016860	CTAT	2	8	159896	159903	25 %	50 %	0 %	25 %	378982677
3045	NC_016860	CGT	2	6	159915	159920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982677
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3048	NC_016860	AG	3	6	160087	160092	50 %	0 %	50 %	0 %	378982677
3049	NC_016860	GCG	2	6	160180	160185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982677
3050	NC_016860	CGC	2	6	160257	160262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982677
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3052	NC_016860	CGG	2	6	160341	160346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982677
3053	NC_016860	CCG	2	6	160380	160385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982677
3054	NC_016860	TTC	2	6	160434	160439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982677
3055	NC_016860	ATG	2	6	160504	160509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982677
3056	NC_016860	CTG	2	6	160621	160626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982677
3057	NC_016860	ATG	3	9	160631	160639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982677
3058	NC_016860	CTG	2	6	160684	160689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982677
3059	NC_016860	CCG	2	6	160765	160770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982677
3060	NC_016860	GAG	2	6	160882	160887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982677
3061	NC_016860	AGA	2	6	160938	160943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982677
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3063	NC_016860	ATG	2	6	160960	160965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982677
3064	NC_016860	TGC	2	6	160988	160993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982677
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3069	NC_016860	GCC	2	6	161299	161304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982677
3070	NC_016860	CCTTGC	2	12	161338	161349	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378982677
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3091	NC_016860	TGT	2	6	162768	162773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982681
3092	NC_016860	GCC	2	6	162818	162823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982681
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3101	NC_016860	GC	3	6	163333	163338	0 %	0 %	50 %	50 %	378982682
3102	NC_016860	CG	3	6	163380	163385	0 %	0 %	50 %	50 %	378982682
3103	NC_016860	CAT	2	6	163389	163394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982682
3104	NC_016860	CGTCA	2	10	163429	163438	20 %	20 %	20 %	40 %	378982682
3105	NC_016860	ACC	2	6	163439	163444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982682
3106	NC_016860	CAG	2	6	163483	163488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982682
3107	NC_016860	CTG	2	6	163522	163527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982682
3108	NC_016860	CTG	2	6	163546	163551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982682
3109	NC_016860	TTC	2	6	163588	163593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982682
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3111	NC_016860	CGG	2	6	163644	163649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982682
3112	NC_016860	GGGC	2	8	163689	163696	0 %	0 %	75 %	25 %	378982682
3113	NC_016860	GC	3	6	163717	163722	0 %	0 %	50 %	50 %	378982682
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3118	NC_016860	GAA	2	6	164296	164301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982683
3119	NC_016860	A	6	6	164384	164389	100 %	0 %	0 %	0 %	378982683
3120	NC_016860	TCG	2	6	164474	164479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982683
3121	NC_016860	ACG	2	6	164611	164616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982683
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3123	NC_016860	GGC	2	6	164710	164715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982683
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3239	NC_016860	AGT	2	6	171156	171161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982690
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3483	NC_016860	CGT	2	6	183218	183223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982698
3484	NC_016860	ATA	2	6	183232	183237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982698
3485	NC_016860	TTGG	2	8	183319	183326	0 %	50 %	50 %	0 %	378982698
3486	NC_016860	GTAA	2	8	183389	183396	50 %	25 %	25 %	0 %	378982698
3487	NC_016860	CTG	2	6	183402	183407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982698
3488	NC_016860	GCAT	2	8	183421	183428	25 %	25 %	25 %	25 %	378982698
3489	NC_016860	GCC	2	6	183490	183495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982698
3490	NC_016860	GCC	2	6	183510	183515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982698
3491	NC_016860	TCT	2	6	183550	183555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982698
3492	NC_016860	CGG	2	6	183657	183662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982698
3493	NC_016860	GCC	2	6	183671	183676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982698
3494	NC_016860	CGTTT	2	10	183705	183714	0 %	60 %	20 %	20 %	378982698
3495	NC_016860	T	6	6	183712	183717	0 %	100 %	0 %	0 %	378982698
3496	NC_016860	CCG	2	6	183725	183730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982698
3497	NC_016860	GGC	2	6	183744	183749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982698
3498	NC_016860	GGGGA	2	10	183757	183766	20 %	0 %	80 %	0 %	378982698
3499	NC_016860	ATG	2	6	183864	183869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982699
3500	NC_016860	CG	3	6	183886	183891	0 %	0 %	50 %	50 %	378982699

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