MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_016860	AGC	2	6	105989	105994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982635
2004	NC_016860	AGT	2	6	106052	106057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982635
2005	NC_016860	TGAT	2	8	106114	106121	25 %	50 %	25 %	0 %	378982635
2006	NC_016860	AAT	2	6	106148	106153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982635
2007	NC_016860	AT	3	6	106174	106179	50 %	50 %	0 %	0 %	378982635
2008	NC_016860	GCT	4	12	106242	106253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982635
2009	NC_016860	GTC	2	6	106362	106367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982635
2010	NC_016860	TGT	2	6	106382	106387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982635
2011	NC_016860	TAG	2	6	106414	106419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982635
2012	NC_016860	CGG	2	6	106451	106456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982635
2013	NC_016860	CAT	3	9	106457	106465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982635
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2022	NC_016860	GCCT	2	8	107322	107329	0 %	25 %	25 %	50 %	378982635
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2121	NC_016860	TCG	2	6	112067	112072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982638
2122	NC_016860	ACC	2	6	112073	112078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982638
2123	NC_016860	GCT	2	6	112116	112121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982638
2124	NC_016860	CGG	2	6	112127	112132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982638
2125	NC_016860	GTT	2	6	112158	112163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982638
2126	NC_016860	CGT	2	6	112185	112190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982638
2127	NC_016860	GCA	2	6	112248	112253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982638
2128	NC_016860	GAT	2	6	112291	112296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982638
2129	NC_016860	CCG	2	6	112308	112313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982638
2130	NC_016860	ATA	2	6	112320	112325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982638
2131	NC_016860	ATC	2	6	112340	112345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982638
2132	NC_016860	CAG	2	6	112384	112389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982638
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2134	NC_016860	CGA	2	6	112406	112411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982638
2135	NC_016860	CAT	2	6	112416	112421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982638
2136	NC_016860	GCTC	2	8	112494	112501	0 %	25 %	25 %	50 %	378982638
2137	NC_016860	AGCGC	2	10	112521	112530	20 %	0 %	40 %	40 %	378982638
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2139	NC_016860	TCT	2	6	112679	112684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982638
2140	NC_016860	GC	3	6	112774	112779	0 %	0 %	50 %	50 %	378982638
2141	NC_016860	CATC	2	8	112830	112837	25 %	25 %	0 %	50 %	378982638
2142	NC_016860	CAA	2	6	112839	112844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982638
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2150	NC_016860	GCG	2	6	113330	113335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982639
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2153	NC_016860	GCG	2	6	113504	113509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982639
2154	NC_016860	GCTG	2	8	113552	113559	0 %	25 %	50 %	25 %	378982639
2155	NC_016860	T	6	6	113589	113594	0 %	100 %	0 %	0 %	378982639
2156	NC_016860	CCGCG	2	10	113606	113615	0 %	0 %	40 %	60 %	378982639
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2207	NC_016860	TGA	2	6	116076	116081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982640
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2220	NC_016860	TCA	2	6	117202	117207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982641
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2229	NC_016860	CAA	2	6	117486	117491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982642
2230	NC_016860	GGT	2	6	117586	117591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982642
2231	NC_016860	GT	3	6	117650	117655	0 %	50 %	50 %	0 %	378982642
2232	NC_016860	GCC	2	6	117661	117666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982642
2233	NC_016860	ACA	2	6	117687	117692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982642
2234	NC_016860	GAC	2	6	117713	117718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982642
2235	NC_016860	ACC	3	9	117761	117769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982642
2236	NC_016860	CGC	2	6	117825	117830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982642
2237	NC_016860	TCT	2	6	117926	117931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982642
2238	NC_016860	CAGCG	2	10	118108	118117	20 %	0 %	40 %	40 %	378982643
2239	NC_016860	ATCA	2	8	118149	118156	50 %	25 %	0 %	25 %	378982643
2240	NC_016860	GC	3	6	118235	118240	0 %	0 %	50 %	50 %	378982643
2241	NC_016860	GCCA	2	8	118242	118249	25 %	0 %	25 %	50 %	378982643
2242	NC_016860	GCG	2	6	118331	118336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982643
2243	NC_016860	CAG	2	6	118362	118367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2244	NC_016860	CGA	2	6	118400	118405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2245	NC_016860	GCCGG	2	10	118408	118417	0 %	0 %	60 %	40 %	378982643
2246	NC_016860	GCC	2	6	118455	118460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982643
2247	NC_016860	GGAC	2	8	118509	118516	25 %	0 %	50 %	25 %	378982643
2248	NC_016860	AC	3	6	118515	118520	50 %	0 %	0 %	50 %	378982643
2249	NC_016860	CGAGC	2	10	118533	118542	20 %	0 %	40 %	40 %	378982643
2250	NC_016860	TCC	2	6	118579	118584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982643
2251	NC_016860	GCC	2	6	118596	118601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982643
2252	NC_016860	GCG	2	6	118642	118647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982643
2253	NC_016860	TGC	2	6	118684	118689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2254	NC_016860	GTA	2	6	118747	118752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982643
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2258	NC_016860	GCT	2	6	118872	118877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2259	NC_016860	TCGCCG	2	12	118906	118917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378982643
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2262	NC_016860	GTCA	2	8	119004	119011	25 %	25 %	25 %	25 %	378982643
2263	NC_016860	GAC	2	6	119139	119144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2264	NC_016860	TGC	2	6	119149	119154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2265	NC_016860	CG	3	6	119164	119169	0 %	0 %	50 %	50 %	378982643
2266	NC_016860	CCG	2	6	119191	119196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982643
2267	NC_016860	GGTTCA	2	12	119207	119218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378982643
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2273	NC_016860	CTG	2	6	119677	119682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982644
2274	NC_016860	GCG	2	6	119686	119691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982644
2275	NC_016860	GGC	2	6	119770	119775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982644
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2282	NC_016860	GCG	2	6	120094	120099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982644
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2286	NC_016860	TGC	2	6	120221	120226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982644
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2344	NC_016860	TA	3	6	123334	123339	50 %	50 %	0 %	0 %	378982646
2345	NC_016860	TAG	2	6	123464	123469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982647
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2350	NC_016860	CAG	3	9	123659	123667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982647
2351	NC_016860	GC	3	6	123692	123697	0 %	0 %	50 %	50 %	378982647
2352	NC_016860	GCC	2	6	123719	123724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982647
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2355	NC_016860	TGC	2	6	123849	123854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982647
2356	NC_016860	ATT	2	6	123875	123880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982647
2357	NC_016860	GCG	2	6	123916	123921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982647
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2359	NC_016860	CAA	2	6	123992	123997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982647
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2361	NC_016860	CGC	2	6	124042	124047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982647
2362	NC_016860	ATG	2	6	124079	124084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982647
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2364	NC_016860	AGCAG	2	10	124157	124166	40 %	0 %	40 %	20 %	378982648
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2485	NC_016860	GC	3	6	130124	130129	0 %	0 %	50 %	50 %	378982653
2486	NC_016860	AGG	2	6	130146	130151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982653
2487	NC_016860	GAT	2	6	130162	130167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982653
2488	NC_016860	GCG	2	6	130215	130220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982653
2489	NC_016860	TCT	2	6	130226	130231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982653
2490	NC_016860	CGA	2	6	130242	130247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982653
2491	NC_016860	GC	3	6	130443	130448	0 %	0 %	50 %	50 %	378982653
2492	NC_016860	CGC	2	6	130458	130463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982653
2493	NC_016860	GCC	2	6	130486	130491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982653
2494	NC_016860	GAT	2	6	130510	130515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982653
2495	NC_016860	CGGCG	2	10	130546	130555	0 %	0 %	60 %	40 %	378982653
2496	NC_016860	TGCCGA	2	12	130638	130649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378982653
2497	NC_016860	GTGG	2	8	130672	130679	0 %	25 %	75 %	0 %	378982653
2498	NC_016860	CGC	2	6	130692	130697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982653
2499	NC_016860	GC	4	8	130935	130942	0 %	0 %	50 %	50 %	378982653
2500	NC_016860	CAG	2	6	130999	131004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982653

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