MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016860	CCG	2	6	78318	78323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982609
1503	NC_016860	GGCG	2	8	78561	78568	0 %	0 %	75 %	25 %	378982609
1504	NC_016860	GCG	2	6	78643	78648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1505	NC_016860	GCGAA	2	10	78698	78707	40 %	0 %	40 %	20 %	378982609
1506	NC_016860	CGG	3	9	78741	78749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1507	NC_016860	ACT	2	6	78782	78787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982609
1508	NC_016860	CGG	2	6	78972	78977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1509	NC_016860	CGC	2	6	78983	78988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982609
1510	NC_016860	GC	5	10	78997	79006	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
1511	NC_016860	CG	3	6	79057	79062	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
1512	NC_016860	CTGAAG	2	12	79099	79110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378982609
1513	NC_016860	TGG	2	6	79181	79186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982609
1514	NC_016860	CTT	2	6	79193	79198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982609
1515	NC_016860	CGG	2	6	79265	79270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1516	NC_016860	TGC	2	6	79295	79300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982609
1517	NC_016860	TGA	2	6	79314	79319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982609
1518	NC_016860	GTGGAC	2	12	79330	79341	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378982609
1519	NC_016860	GGC	2	6	79372	79377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1520	NC_016860	GGCG	2	8	79398	79405	0 %	0 %	75 %	25 %	378982609
1521	NC_016860	CAG	2	6	79477	79482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982609
1522	NC_016860	TGA	2	6	79520	79525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982609
1523	NC_016860	GCG	2	6	79582	79587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1524	NC_016860	CGTAC	2	10	79588	79597	20 %	20 %	20 %	40 %	378982609
1525	NC_016860	GGC	2	6	79638	79643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1526	NC_016860	GC	3	6	79642	79647	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
1527	NC_016860	TAC	2	6	79705	79710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982609
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1529	NC_016860	CAA	2	6	79737	79742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982609
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1531	NC_016860	GAA	2	6	79863	79868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982609
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1533	NC_016860	TCCG	2	8	79888	79895	0 %	25 %	25 %	50 %	378982609
1534	NC_016860	GTG	2	6	79915	79920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982609
1535	NC_016860	CGC	2	6	79926	79931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982609
1536	NC_016860	GCT	2	6	79935	79940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982609
1537	NC_016860	CCAC	2	8	79964	79971	25 %	0 %	0 %	75 %	378982609
1538	NC_016860	GTC	2	6	80036	80041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982609
1539	NC_016860	TAT	2	6	80082	80087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982609
1540	NC_016860	ACC	2	6	80092	80097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982609
1541	NC_016860	CGC	2	6	80104	80109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982609
1542	NC_016860	CGC	2	6	80134	80139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982609
1543	NC_016860	GC	3	6	80141	80146	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
1544	NC_016860	CGG	2	6	80181	80186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982609
1545	NC_016860	ACG	2	6	80194	80199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982609
1546	NC_016860	TG	3	6	80549	80554	0 %	50 %	50 %	0 %	378982610
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1549	NC_016860	GAT	2	6	80727	80732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982610
1550	NC_016860	TGCCAG	2	12	80758	80769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378982610
1551	NC_016860	GAAA	2	8	80833	80840	75 %	0 %	25 %	0 %	378982610
1552	NC_016860	C	6	6	80878	80883	0 %	0 %	0 %	100 %	378982610
1553	NC_016860	GAT	2	6	80913	80918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982610
1554	NC_016860	CGTC	2	8	81043	81050	0 %	25 %	25 %	50 %	378982611
1555	NC_016860	CGGT	2	8	81065	81072	0 %	25 %	50 %	25 %	378982611
1556	NC_016860	TTC	2	6	81074	81079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982611
1557	NC_016860	GTA	2	6	81193	81198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982611
1558	NC_016860	CG	3	6	81199	81204	0 %	0 %	50 %	50 %	378982611
1559	NC_016860	CCA	2	6	81214	81219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982611
1560	NC_016860	TTGCC	2	10	81224	81233	0 %	40 %	20 %	40 %	378982611
1561	NC_016860	GGC	2	6	81266	81271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982611
1562	NC_016860	CT	3	6	81279	81284	0 %	50 %	0 %	50 %	378982611
1563	NC_016860	CGTCC	2	10	81334	81343	0 %	20 %	20 %	60 %	378982611
1564	NC_016860	CAC	2	6	81344	81349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982611
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1566	NC_016860	GCCT	2	8	81452	81459	0 %	25 %	25 %	50 %	378982611
1567	NC_016860	CAC	2	6	81578	81583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982611
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1571	NC_016860	CTT	2	6	81847	81852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982612
1572	NC_016860	CG	3	6	81872	81877	0 %	0 %	50 %	50 %	378982612
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1574	NC_016860	CG	3	6	81940	81945	0 %	0 %	50 %	50 %	378982612
1575	NC_016860	CTT	2	6	82003	82008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982612
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1584	NC_016860	ACTC	2	8	82501	82508	25 %	25 %	0 %	50 %	378982612
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1588	NC_016860	ACCA	2	8	82759	82766	50 %	0 %	0 %	50 %	378982613
1589	NC_016860	ATA	2	6	82799	82804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982613
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1592	NC_016860	CATCCT	2	12	82884	82895	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378982613
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1594	NC_016860	TCG	2	6	83051	83056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982613
1595	NC_016860	AAT	2	6	83131	83136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982613
1596	NC_016860	CAG	2	6	83170	83175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982613
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1598	NC_016860	GCG	2	6	83273	83278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982613
1599	NC_016860	ATC	3	9	83300	83308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982613
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1602	NC_016860	CGG	2	6	83400	83405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982613
1603	NC_016860	GCG	2	6	83420	83425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982613
1604	NC_016860	TCA	2	6	83474	83479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982613
1605	NC_016860	AGT	2	6	83505	83510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982613
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1607	NC_016860	GGT	2	6	83563	83568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982613
1608	NC_016860	CCG	2	6	83589	83594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982613
1609	NC_016860	CGT	2	6	83673	83678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982613
1610	NC_016860	GCT	2	6	83688	83693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982613
1611	NC_016860	CAGA	2	8	83701	83708	50 %	0 %	25 %	25 %	378982613
1612	NC_016860	CAG	2	6	83779	83784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982613
1613	NC_016860	TTC	2	6	83818	83823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982613
1614	NC_016860	A	6	6	83955	83960	100 %	0 %	0 %	0 %	378982613
1615	NC_016860	GTC	2	6	84073	84078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982613
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1618	NC_016860	ATG	2	6	84328	84333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982614
1619	NC_016860	TTCAG	2	10	84451	84460	20 %	40 %	20 %	20 %	378982614
1620	NC_016860	GT	4	8	84487	84494	0 %	50 %	50 %	0 %	378982614
1621	NC_016860	GCCA	2	8	84496	84503	25 %	0 %	25 %	50 %	378982614
1622	NC_016860	CGA	2	6	84521	84526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982614
1623	NC_016860	GATG	2	8	84551	84558	25 %	25 %	50 %	0 %	378982614
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1625	NC_016860	GGCCA	2	10	84600	84609	20 %	0 %	40 %	40 %	378982614
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1878	NC_016860	GAT	2	6	99269	99274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982628
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1881	NC_016860	GCG	2	6	99292	99297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982628
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1884	NC_016860	GCGCT	2	10	99393	99402	0 %	20 %	40 %	40 %	378982628
1885	NC_016860	CG	3	6	99407	99412	0 %	0 %	50 %	50 %	378982628
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1996	NC_016860	ACG	2	6	105647	105652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982634
1997	NC_016860	ATT	2	6	105655	105660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982634
1998	NC_016860	GAC	2	6	105661	105666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982634
1999	NC_016860	G	6	6	105690	105695	0 %	0 %	100 %	0 %	378982634
2000	NC_016860	AGC	2	6	105734	105739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982634

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