MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_016860	CGG	2	6	233352	233357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
4503	NC_016860	GCT	2	6	233364	233369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982738
4504	NC_016860	TA	3	6	233423	233428	50 %	50 %	0 %	0 %	378982738
4505	NC_016860	ACT	2	6	233468	233473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982738
4506	NC_016860	CGC	2	6	233575	233580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982738
4507	NC_016860	A	6	6	233599	233604	100 %	0 %	0 %	0 %	378982738
4508	NC_016860	GGC	2	6	233632	233637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
4509	NC_016860	CGC	2	6	233639	233644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982738
4510	NC_016860	ACA	2	6	233663	233668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982738
4511	NC_016860	TGC	2	6	233825	233830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982738
4512	NC_016860	TCA	2	6	233848	233853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982738
4513	NC_016860	GCG	2	6	233904	233909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
4514	NC_016860	CT	3	6	233935	233940	0 %	50 %	0 %	50 %	378982738
4515	NC_016860	ATG	2	6	233979	233984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982739
4516	NC_016860	TGC	2	6	234016	234021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982739
4517	NC_016860	GGC	2	6	234030	234035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982739
4518	NC_016860	GCC	2	6	234051	234056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982739
4519	NC_016860	TCG	2	6	234202	234207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982739
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4521	NC_016860	CCG	2	6	234330	234335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982739
4522	NC_016860	T	6	6	234388	234393	0 %	100 %	0 %	0 %	378982739
4523	NC_016860	CCGC	2	8	234395	234402	0 %	0 %	25 %	75 %	378982739
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4528	NC_016860	GC	3	6	234655	234660	0 %	0 %	50 %	50 %	378982739
4529	NC_016860	ACA	2	6	234688	234693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982739
4530	NC_016860	GCCGC	2	10	234870	234879	0 %	0 %	40 %	60 %	378982740
4531	NC_016860	CGG	2	6	234893	234898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982740
4532	NC_016860	GAC	2	6	234923	234928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982740
4533	NC_016860	GC	3	6	235105	235110	0 %	0 %	50 %	50 %	378982740
4534	NC_016860	GCG	2	6	235153	235158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982740
4535	NC_016860	AAT	2	6	235194	235199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982740
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4537	NC_016860	A	7	7	235262	235268	100 %	0 %	0 %	0 %	378982740
4538	NC_016860	G	6	6	235288	235293	0 %	0 %	100 %	0 %	378982741
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4540	NC_016860	CTG	2	6	235403	235408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982741
4541	NC_016860	TAA	2	6	235411	235416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982741
4542	NC_016860	GTGA	2	8	235520	235527	25 %	25 %	50 %	0 %	378982741
4543	NC_016860	CGG	3	9	235536	235544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982741
4544	NC_016860	CCA	2	6	235611	235616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982741
4545	NC_016860	TGAA	2	8	235623	235630	50 %	25 %	25 %	0 %	378982741
4546	NC_016860	GGC	2	6	235691	235696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982741
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4549	NC_016860	TCG	2	6	235897	235902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982742
4550	NC_016860	CGGGAT	2	12	236073	236084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378982742
4551	NC_016860	ATA	2	6	236271	236276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982743
4552	NC_016860	TGC	2	6	236290	236295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982743
4553	NC_016860	CAC	2	6	236357	236362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982743
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4555	NC_016860	GGAG	2	8	236429	236436	25 %	0 %	75 %	0 %	378982743
4556	NC_016860	GAT	2	6	236634	236639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982743
4557	NC_016860	CTGG	2	8	236651	236658	0 %	25 %	50 %	25 %	378982743
4558	NC_016860	CCG	2	6	236709	236714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982743
4559	NC_016860	CAGTT	2	10	236723	236732	20 %	40 %	20 %	20 %	378982743
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4562	NC_016860	GCA	2	6	236881	236886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982743
4563	NC_016860	ATC	2	6	236986	236991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982743
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4565	NC_016860	TGA	2	6	237092	237097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982743
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4571	NC_016860	CGAC	2	8	237277	237284	25 %	0 %	25 %	50 %	378982744
4572	NC_016860	TCC	2	6	237327	237332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982744
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4583	NC_016860	GAT	2	6	237692	237697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982744
4584	NC_016860	CAGGT	2	10	237708	237717	20 %	20 %	40 %	20 %	378982744
4585	NC_016860	ACG	2	6	237723	237728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
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4589	NC_016860	GC	3	6	237819	237824	0 %	0 %	50 %	50 %	378982744
4590	NC_016860	GCG	2	6	237847	237852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982744
4591	NC_016860	CGA	2	6	237883	237888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
4592	NC_016860	CG	3	6	237926	237931	0 %	0 %	50 %	50 %	378982744
4593	NC_016860	GC	3	6	238021	238026	0 %	0 %	50 %	50 %	378982744
4594	NC_016860	CAG	2	6	238043	238048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
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4604	NC_016860	CGG	2	6	238973	238978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
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4607	NC_016860	CGG	2	6	239060	239065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
4608	NC_016860	CGGCG	2	10	239201	239210	0 %	0 %	60 %	40 %	378982745
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4610	NC_016860	GCG	2	6	239223	239228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
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4867	NC_016860	GC	3	6	251229	251234	0 %	0 %	50 %	50 %	378982756
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4874	NC_016860	GCA	2	6	251508	251513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982756
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4986	NC_016860	GGC	2	6	258110	258115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982762
4987	NC_016860	TGA	2	6	258119	258124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982762
4988	NC_016860	GGC	2	6	258140	258145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982762
4989	NC_016860	GGC	2	6	258179	258184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982762
4990	NC_016860	CTG	2	6	258207	258212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982762
4991	NC_016860	GCGG	2	8	258238	258245	0 %	0 %	75 %	25 %	378982762
4992	NC_016860	GCA	2	6	258268	258273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982762
4993	NC_016860	TGG	2	6	258404	258409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982762
4994	NC_016860	GTC	2	6	258466	258471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982762
4995	NC_016860	CCA	2	6	258514	258519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982762
4996	NC_016860	TGA	2	6	258520	258525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982762
4997	NC_016860	ATCC	2	8	258594	258601	25 %	25 %	0 %	50 %	378982762
4998	NC_016860	TCAT	2	8	258610	258617	25 %	50 %	0 %	25 %	378982762
4999	NC_016860	ATGGC	2	10	258696	258705	20 %	20 %	40 %	20 %	378982762
5000	NC_016860	GC	3	6	258724	258729	0 %	0 %	50 %	50 %	378982762

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