MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016857	GGC	2	6	211556	211561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699402
4002	NC_016857	CAG	2	6	211601	211606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4003	NC_016857	GTC	2	6	211631	211636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4004	NC_016857	TTCA	2	8	211652	211659	25 %	50 %	0 %	25 %	379699402
4005	NC_016857	GGCAAT	2	12	211670	211681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379699402
4006	NC_016857	TCA	2	6	211732	211737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699402
4007	NC_016857	GCT	2	6	211765	211770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4008	NC_016857	TGAGC	2	10	211793	211802	20 %	20 %	40 %	20 %	379699402
4009	NC_016857	AAT	2	6	211823	211828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699402
4010	NC_016857	CGA	2	6	211837	211842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4011	NC_016857	CCA	2	6	211867	211872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699402
4012	NC_016857	CGC	2	6	211969	211974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699402
4013	NC_016857	AG	3	6	212012	212017	50 %	0 %	50 %	0 %	379699402
4014	NC_016857	ACGT	2	8	212031	212038	25 %	25 %	25 %	25 %	379699402
4015	NC_016857	CAC	2	6	212204	212209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699402
4016	NC_016857	CGT	2	6	212251	212256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4017	NC_016857	TGG	2	6	212269	212274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699402
4018	NC_016857	GAC	2	6	212308	212313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4019	NC_016857	GCA	2	6	212326	212331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4020	NC_016857	CAA	2	6	212356	212361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699402
4021	NC_016857	TTC	2	6	212497	212502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699403
4022	NC_016857	CTG	2	6	212539	212544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4023	NC_016857	CGG	2	6	212547	212552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699403
4024	NC_016857	CCG	2	6	212606	212611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699403
4025	NC_016857	GCCGAT	2	12	212668	212679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4026	NC_016857	GCAC	2	8	212727	212734	25 %	0 %	25 %	50 %	379699403
4027	NC_016857	CCAGCA	2	12	212736	212747	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379699403
4028	NC_016857	CAG	2	6	212785	212790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4029	NC_016857	GCC	2	6	212827	212832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699403
4030	NC_016857	CCAG	2	8	212916	212923	25 %	0 %	25 %	50 %	379699403
4031	NC_016857	GCC	2	6	212926	212931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699403
4032	NC_016857	CGCA	2	8	212956	212963	25 %	0 %	25 %	50 %	379699403
4033	NC_016857	GC	3	6	213045	213050	0 %	0 %	50 %	50 %	379699403
4034	NC_016857	CG	3	6	213061	213066	0 %	0 %	50 %	50 %	379699403
4035	NC_016857	CAGG	2	8	213096	213103	25 %	0 %	50 %	25 %	379699403
4036	NC_016857	AG	3	6	213134	213139	50 %	0 %	50 %	0 %	379699403
4037	NC_016857	TCG	2	6	213167	213172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4038	NC_016857	T	6	6	213223	213228	0 %	100 %	0 %	0 %	379699403
4039	NC_016857	CTTG	2	8	213231	213238	0 %	50 %	25 %	25 %	379699403
4040	NC_016857	GCA	2	6	213246	213251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4041	NC_016857	TGG	3	9	213258	213266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699403
4042	NC_016857	GCA	2	6	213413	213418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699404
4043	NC_016857	AGATC	2	10	213462	213471	40 %	20 %	20 %	20 %	379699404
4044	NC_016857	CGGT	2	8	213542	213549	0 %	25 %	50 %	25 %	379699404
4045	NC_016857	TTC	2	6	213667	213672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699404
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4047	NC_016857	GAA	2	6	213758	213763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699404
4048	NC_016857	CGA	2	6	213768	213773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699404
4049	NC_016857	GGC	2	6	213808	213813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699404
4050	NC_016857	CGCGG	2	10	213884	213893	0 %	0 %	60 %	40 %	379699405
4051	NC_016857	CG	3	6	213894	213899	0 %	0 %	50 %	50 %	379699405
4052	NC_016857	ACG	2	6	213915	213920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4053	NC_016857	GCG	2	6	213921	213926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699405
4054	NC_016857	TCG	2	6	213937	213942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4055	NC_016857	CGG	2	6	213972	213977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699405
4056	NC_016857	CAC	2	6	214000	214005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699405
4057	NC_016857	TAT	2	6	214028	214033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699405
4058	NC_016857	GC	3	6	214045	214050	0 %	0 %	50 %	50 %	379699405
4059	NC_016857	CGCGG	2	10	214068	214077	0 %	0 %	60 %	40 %	379699405
4060	NC_016857	CAT	2	6	214214	214219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699405
4061	NC_016857	CGT	2	6	214238	214243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4062	NC_016857	T	6	6	214271	214276	0 %	100 %	0 %	0 %	379699405
4063	NC_016857	CAG	2	6	214287	214292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4064	NC_016857	GGC	2	6	214308	214313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699405
4065	NC_016857	TTC	2	6	214366	214371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699405
4066	NC_016857	ATG	2	6	214384	214389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699405
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4069	NC_016857	GTT	2	6	214472	214477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699405
4070	NC_016857	GC	3	6	214533	214538	0 %	0 %	50 %	50 %	379699405
4071	NC_016857	GGA	2	6	214540	214545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699405
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4073	NC_016857	CTT	2	6	214700	214705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699405
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4075	NC_016857	GTA	2	6	214758	214763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699405
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4083	NC_016857	CGC	3	9	215063	215071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699405
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4087	NC_016857	ACG	2	6	215547	215552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699406
4088	NC_016857	GCCA	2	8	215695	215702	25 %	0 %	25 %	50 %	379699406
4089	NC_016857	TCG	2	6	215787	215792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699406
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4092	NC_016857	ATA	2	6	215838	215843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699406
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4094	NC_016857	CGC	2	6	215881	215886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699406
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4100	NC_016857	GCCAG	2	10	216052	216061	20 %	0 %	40 %	40 %	379699406
4101	NC_016857	G	6	6	216177	216182	0 %	0 %	100 %	0 %	379699406
4102	NC_016857	GCG	2	6	216249	216254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699406
4103	NC_016857	AGTC	2	8	216316	216323	25 %	25 %	25 %	25 %	379699406
4104	NC_016857	TGC	2	6	216325	216330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699406
4105	NC_016857	CAGC	2	8	216423	216430	25 %	0 %	25 %	50 %	379699407
4106	NC_016857	GGC	2	6	216474	216479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699407
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4108	NC_016857	TCT	2	6	216546	216551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699407
4109	NC_016857	CTC	2	6	216607	216612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699407
4110	NC_016857	GCGCG	2	10	216618	216627	0 %	0 %	60 %	40 %	379699407
4111	NC_016857	GGC	2	6	216649	216654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699407
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4244	NC_016857	TGG	2	6	222598	222603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699411
4245	NC_016857	CGG	2	6	222664	222669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699411
4246	NC_016857	GCG	2	6	222793	222798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699411
4247	NC_016857	CG	3	6	222804	222809	0 %	0 %	50 %	50 %	379699411
4248	NC_016857	GGC	2	6	222899	222904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699411
4249	NC_016857	GCA	2	6	222926	222931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699411
4250	NC_016857	GTC	2	6	222933	222938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699411
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4254	NC_016857	CGA	2	6	223093	223098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699411
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4256	NC_016857	GACGCC	2	12	223154	223165	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379699411
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4262	NC_016857	CAG	2	6	223287	223292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699411
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4282	NC_016857	CAGT	2	8	224023	224030	25 %	25 %	25 %	25 %	379699412
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4290	NC_016857	TTCAA	2	10	224324	224333	40 %	40 %	0 %	20 %	379699412
4291	NC_016857	GGAC	2	8	224339	224346	25 %	0 %	50 %	25 %	379699412
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4314	NC_016857	GCAGC	2	10	225737	225746	20 %	0 %	40 %	40 %	379699412
4315	NC_016857	GATG	2	8	225750	225757	25 %	25 %	50 %	0 %	379699412
4316	NC_016857	GTC	2	6	225760	225765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699412
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4349	NC_016857	GCCA	2	8	227256	227263	25 %	0 %	25 %	50 %	379699414
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4352	NC_016857	TGA	2	6	227302	227307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699414
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4355	NC_016857	ATCG	2	8	227439	227446	25 %	25 %	25 %	25 %	379699414
4356	NC_016857	AAG	2	6	227461	227466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699414
4357	NC_016857	CGC	2	6	227524	227529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699414
4358	NC_016857	CCG	2	6	227578	227583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699414
4359	NC_016857	GGC	2	6	227684	227689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699415
4360	NC_016857	GCC	2	6	227748	227753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699415
4361	NC_016857	TGTT	2	8	227778	227785	0 %	75 %	25 %	0 %	379699415
4362	NC_016857	GCC	2	6	227786	227791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699415
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4364	NC_016857	CAT	2	6	227872	227877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699415
4365	NC_016857	GAT	2	6	227884	227889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699415
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4367	NC_016857	GCT	2	6	227926	227931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699415
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4369	NC_016857	GC	3	6	228069	228074	0 %	0 %	50 %	50 %	379699415
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4485	NC_016857	GCA	2	6	234420	234425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699418
4486	NC_016857	CTA	2	6	234492	234497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699418
4487	NC_016857	GTG	2	6	234499	234504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699418
4488	NC_016857	CCAG	2	8	234538	234545	25 %	0 %	25 %	50 %	379699418
4489	NC_016857	GC	3	6	234650	234655	0 %	0 %	50 %	50 %	379699418
4490	NC_016857	ACA	2	6	234683	234688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699418
4491	NC_016857	GCCGC	2	10	234865	234874	0 %	0 %	40 %	60 %	379699419
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