MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016857	GTC	2	6	106365	106370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699312
2003	NC_016857	TGT	2	6	106385	106390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699312
2004	NC_016857	TAG	2	6	106417	106422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699312
2005	NC_016857	CGG	2	6	106454	106459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699312
2006	NC_016857	CAT	3	9	106460	106468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699312
2007	NC_016857	GCA	2	6	106568	106573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699312
2008	NC_016857	AAG	2	6	106574	106579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699312
2009	NC_016857	GCTTC	2	10	106817	106826	0 %	40 %	20 %	40 %	379699312
2010	NC_016857	GTA	2	6	106977	106982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699312
2011	NC_016857	GCT	2	6	107013	107018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699312
2012	NC_016857	TGCGT	2	10	107104	107113	0 %	40 %	40 %	20 %	379699312
2013	NC_016857	TACT	2	8	107134	107141	25 %	50 %	0 %	25 %	379699312
2014	NC_016857	TGC	2	6	107224	107229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699312
2015	NC_016857	GCCT	2	8	107325	107332	0 %	25 %	25 %	50 %	379699312
2016	NC_016857	ATA	2	6	107362	107367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699312
2017	NC_016857	CGG	2	6	107374	107379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699312
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2021	NC_016857	AGG	2	6	107657	107662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699312
2022	NC_016857	CGC	2	6	107699	107704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699312
2023	NC_016857	GCT	2	6	107705	107710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699312
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2028	NC_016857	TGA	2	6	108112	108117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699312
2029	NC_016857	TGG	2	6	108140	108145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699312
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2032	NC_016857	TGA	2	6	108467	108472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699313
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2055	NC_016857	TAT	2	6	109549	109554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699314
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2061	NC_016857	CG	3	6	109696	109701	0 %	0 %	50 %	50 %	379699314
2062	NC_016857	CGC	2	6	109786	109791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699314
2063	NC_016857	TGG	2	6	109792	109797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699314
2064	NC_016857	CTGC	2	8	109822	109829	0 %	25 %	25 %	50 %	379699314
2065	NC_016857	ACA	2	6	109894	109899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699314
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2091	NC_016857	T	6	6	111066	111071	0 %	100 %	0 %	0 %	379699315
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2102	NC_016857	CGGCAG	2	12	111589	111600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379699315
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2110	NC_016857	TGGCG	2	10	111964	111973	0 %	20 %	60 %	20 %	379699315
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2118	NC_016857	GTT	2	6	112161	112166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699315
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2120	NC_016857	GCA	2	6	112251	112256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699315
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2243	NC_016857	TCC	2	6	118582	118587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699320
2244	NC_016857	GCC	2	6	118599	118604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
2245	NC_016857	GCG	2	6	118645	118650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699320
2246	NC_016857	TGC	2	6	118687	118692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699320
2247	NC_016857	GTA	2	6	118750	118755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699320
2248	NC_016857	GCC	2	6	118770	118775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
2249	NC_016857	CGC	2	6	118812	118817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
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2251	NC_016857	GCT	2	6	118875	118880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699320
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2255	NC_016857	GTCA	2	8	119007	119014	25 %	25 %	25 %	25 %	379699320
2256	NC_016857	GAC	2	6	119142	119147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699320
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2259	NC_016857	CCG	2	6	119194	119199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
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2270	NC_016857	GCG	2	6	119822	119827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699321
2271	NC_016857	CGA	2	6	119853	119858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699321
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2275	NC_016857	GCG	2	6	120097	120102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699321
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2279	NC_016857	TGC	2	6	120224	120229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699321
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2282	NC_016857	CGG	2	6	120567	120572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699321
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2332	NC_016857	GCT	3	9	123143	123151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699323
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2348	NC_016857	TGC	2	6	123852	123857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699324
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2352	NC_016857	CAA	2	6	123995	124000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699324
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2354	NC_016857	CGC	2	6	124045	124050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699324
2355	NC_016857	ATG	2	6	124082	124087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699324
2356	NC_016857	ATCA	2	8	124103	124110	50 %	25 %	0 %	25 %	379699324
2357	NC_016857	AGCAG	2	10	124160	124169	40 %	0 %	40 %	20 %	379699325
2358	NC_016857	CAG	3	9	124167	124175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699325
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2360	NC_016857	CGA	2	6	124274	124279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699325
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2362	NC_016857	AAG	2	6	124543	124548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699325
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2485	NC_016857	GC	3	6	130127	130132	0 %	0 %	50 %	50 %	379699332
2486	NC_016857	AGG	2	6	130149	130154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699332
2487	NC_016857	GAT	2	6	130165	130170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699332
2488	NC_016857	GCG	2	6	130218	130223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699332
2489	NC_016857	TCT	2	6	130229	130234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699332
2490	NC_016857	CGA	2	6	130245	130250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699332
2491	NC_016857	GC	3	6	130446	130451	0 %	0 %	50 %	50 %	379699332
2492	NC_016857	CGC	2	6	130461	130466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699332
2493	NC_016857	GCC	2	6	130489	130494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699332
2494	NC_016857	GAT	2	6	130513	130518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699332
2495	NC_016857	CGGCG	2	10	130549	130558	0 %	0 %	60 %	40 %	379699332
2496	NC_016857	TGCCGA	2	12	130641	130652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379699332
2497	NC_016857	GTGG	2	8	130675	130682	0 %	25 %	75 %	0 %	379699332
2498	NC_016857	CGC	2	6	130695	130700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699332
2499	NC_016857	GC	4	8	130938	130945	0 %	0 %	50 %	50 %	379699332
2500	NC_016857	CAG	2	6	131002	131007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699332

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