MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016857	CCAA	2	8	77647	77654	50 %	0 %	0 %	50 %	379699286
1503	NC_016857	GCT	2	6	77658	77663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699286
1504	NC_016857	TGA	2	6	77667	77672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699286
1505	NC_016857	GTG	2	6	77707	77712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699286
1506	NC_016857	CAT	2	6	77733	77738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699286
1507	NC_016857	CGATG	2	10	77760	77769	20 %	20 %	40 %	20 %	379699286
1508	NC_016857	CGG	2	6	77886	77891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699286
1509	NC_016857	CG	3	6	77954	77959	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
1510	NC_016857	CTC	2	6	77967	77972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699286
1511	NC_016857	GCC	2	6	78016	78021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699286
1512	NC_016857	TGA	2	6	78053	78058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699286
1513	NC_016857	CGG	2	6	78069	78074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699286
1514	NC_016857	CCT	2	6	78086	78091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699286
1515	NC_016857	ACC	2	6	78172	78177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699286
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1517	NC_016857	CGCA	2	8	78214	78221	25 %	0 %	25 %	50 %	379699286
1518	NC_016857	CGA	2	6	78294	78299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699286
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1520	NC_016857	GGCG	2	8	78564	78571	0 %	0 %	75 %	25 %	379699286
1521	NC_016857	GCG	2	6	78646	78651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699286
1522	NC_016857	GCGAA	2	10	78701	78710	40 %	0 %	40 %	20 %	379699286
1523	NC_016857	CGG	3	9	78744	78752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699286
1524	NC_016857	ACT	2	6	78785	78790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699286
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1527	NC_016857	GC	5	10	79000	79009	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
1528	NC_016857	CG	3	6	79060	79065	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
1529	NC_016857	CTGAAG	2	12	79102	79113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379699286
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1531	NC_016857	CTT	2	6	79196	79201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699286
1532	NC_016857	CGG	2	6	79268	79273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699286
1533	NC_016857	TGC	2	6	79298	79303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699286
1534	NC_016857	TGA	2	6	79317	79322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699286
1535	NC_016857	GTGGAC	2	12	79333	79344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379699286
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1537	NC_016857	GGCG	2	8	79401	79408	0 %	0 %	75 %	25 %	379699286
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1539	NC_016857	TGA	2	6	79523	79528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699286
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1541	NC_016857	CGTAC	2	10	79591	79600	20 %	20 %	20 %	40 %	379699286
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1543	NC_016857	GC	3	6	79645	79650	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
1544	NC_016857	TAC	2	6	79708	79713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699286
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1551	NC_016857	GTG	2	6	79918	79923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699286
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1555	NC_016857	GTC	2	6	80039	80044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699286
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1559	NC_016857	CGC	2	6	80137	80142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699286
1560	NC_016857	GC	3	6	80144	80149	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
1561	NC_016857	CGG	2	6	80184	80189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699286
1562	NC_016857	ACG	2	6	80197	80202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699286
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1572	NC_016857	CGGT	2	8	81068	81075	0 %	25 %	50 %	25 %	379699288
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1591	NC_016857	CG	3	6	81943	81948	0 %	0 %	50 %	50 %	379699289
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1601	NC_016857	ACTC	2	8	82504	82511	25 %	25 %	0 %	50 %	379699289
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1609	NC_016857	CATCCT	2	12	82887	82898	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379699290
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1997	NC_016857	AGT	2	6	106055	106060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699312
1998	NC_016857	TGAT	2	8	106117	106124	25 %	50 %	25 %	0 %	379699312
1999	NC_016857	AAT	2	6	106151	106156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699312
2000	NC_016857	AT	3	6	106177	106182	50 %	50 %	0 %	0 %	379699312

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