MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016857	TGC	2	6	51456	51461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699261
1003	NC_016857	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	379699261
1004	NC_016857	GAC	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699261
1005	NC_016857	GAT	3	9	51588	51596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699261
1006	NC_016857	ATA	2	6	51625	51630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699261
1007	NC_016857	CAG	3	9	51636	51644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699261
1008	NC_016857	CAG	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699261
1009	NC_016857	GTA	2	6	51767	51772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699261
1010	NC_016857	ATG	2	6	51779	51784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699261
1011	NC_016857	TTG	2	6	52290	52295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699262
1012	NC_016857	AGC	2	6	52355	52360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699262
1013	NC_016857	GCA	2	6	52404	52409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699262
1014	NC_016857	TGA	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699262
1015	NC_016857	CAT	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699262
1016	NC_016857	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	379699262
1017	NC_016857	GCA	2	6	52651	52656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699263
1018	NC_016857	GCG	2	6	52737	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699263
1019	NC_016857	TCT	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699263
1020	NC_016857	TCA	2	6	52795	52800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699263
1021	NC_016857	TTAACC	2	12	52814	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699263
1022	NC_016857	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	379699264
1023	NC_016857	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	379699264
1024	NC_016857	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	379699264
1025	NC_016857	GAA	2	6	52989	52994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699264
1026	NC_016857	GGT	3	9	53015	53023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699264
1027	NC_016857	GCG	2	6	53122	53127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699264
1028	NC_016857	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	379699264
1029	NC_016857	CGC	2	6	53157	53162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699264
1030	NC_016857	CTG	2	6	53199	53204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699264
1031	NC_016857	GAT	2	6	53241	53246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699264
1032	NC_016857	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	379699264
1033	NC_016857	TTA	2	6	53283	53288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699264
1034	NC_016857	GGC	2	6	53346	53351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699264
1035	NC_016857	AGT	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699264
1036	NC_016857	CTG	2	6	53418	53423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699264
1037	NC_016857	CGA	2	6	53462	53467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699264
1038	NC_016857	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	379699264
1039	NC_016857	CAA	2	6	53628	53633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699264
1040	NC_016857	CTG	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699264
1041	NC_016857	AGC	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699264
1042	NC_016857	TGA	2	6	53735	53740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699264
1043	NC_016857	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	379699264
1044	NC_016857	TGA	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699265
1045	NC_016857	GCG	2	6	53907	53912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699265
1046	NC_016857	GAT	3	9	53954	53962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699265
1047	NC_016857	CAT	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699265
1048	NC_016857	A	6	6	53987	53992	100 %	0 %	0 %	0 %	379699265
1049	NC_016857	A	7	7	53996	54002	100 %	0 %	0 %	0 %	379699265
1050	NC_016857	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699265
1051	NC_016857	GCA	2	6	54039	54044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699265
1052	NC_016857	CAT	2	6	54346	54351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699265
1053	NC_016857	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	379699265
1054	NC_016857	GCGGAA	2	12	54440	54451	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379699265
1055	NC_016857	ACC	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699265
1056	NC_016857	CTG	2	6	54761	54766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699265
1057	NC_016857	CTG	2	6	55010	55015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699265
1058	NC_016857	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	379699265
1059	NC_016857	A	6	6	55044	55049	100 %	0 %	0 %	0 %	379699265
1060	NC_016857	GCA	2	6	55051	55056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699265
1061	NC_016857	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	379699265
1062	NC_016857	AAG	2	6	55134	55139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699265
1063	NC_016857	GCT	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699265
1064	NC_016857	GGC	2	6	55330	55335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699265
1065	NC_016857	GTG	2	6	55381	55386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699265
1066	NC_016857	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	379699265
1067	NC_016857	CCA	2	6	55476	55481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699265
1068	NC_016857	TGC	2	6	55522	55527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699265
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1070	NC_016857	TGA	2	6	55581	55586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699265
1071	NC_016857	TGA	2	6	55707	55712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699265
1072	NC_016857	TGC	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699265
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1075	NC_016857	CTG	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699265
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1081	NC_016857	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699265
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1085	NC_016857	CAA	2	6	56317	56322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699265
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1088	NC_016857	TGA	3	9	56497	56505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699265
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1093	NC_016857	GTA	2	6	56734	56739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699266
1094	NC_016857	GCA	2	6	56762	56767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699266
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1096	NC_016857	GCG	2	6	56879	56884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699266
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1098	NC_016857	ATC	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699266
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1100	NC_016857	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	379699266
1101	NC_016857	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699266
1102	NC_016857	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	379699266
1103	NC_016857	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	379699267
1104	NC_016857	GAT	2	6	57401	57406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699267
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1106	NC_016857	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	379699267
1107	NC_016857	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699267
1108	NC_016857	AAG	2	6	57510	57515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699267
1109	NC_016857	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	379699267
1110	NC_016857	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699267
1111	NC_016857	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699267
1112	NC_016857	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	379699267
1113	NC_016857	TTG	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699268
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1115	NC_016857	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	379699268
1116	NC_016857	G	6	6	58210	58215	0 %	0 %	100 %	0 %	379699268
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