MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_016857	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	379699240
503	NC_016857	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	379699240
504	NC_016857	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	379699240
505	NC_016857	TAC	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699240
506	NC_016857	A	6	6	25667	25672	100 %	0 %	0 %	0 %	379699240
507	NC_016857	CCG	2	6	25691	25696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699240
508	NC_016857	ACG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699240
509	NC_016857	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699240
510	NC_016857	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	379699241
511	NC_016857	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
512	NC_016857	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699241
513	NC_016857	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
514	NC_016857	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	379699241
515	NC_016857	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
516	NC_016857	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699241
517	NC_016857	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699241
518	NC_016857	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
519	NC_016857	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
520	NC_016857	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699241
521	NC_016857	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
522	NC_016857	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699241
523	NC_016857	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699241
524	NC_016857	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699241
525	NC_016857	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	379699241
526	NC_016857	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699241
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528	NC_016857	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699241
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530	NC_016857	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
531	NC_016857	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699241
532	NC_016857	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
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534	NC_016857	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699241
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536	NC_016857	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
537	NC_016857	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699241
538	NC_016857	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699241
539	NC_016857	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699241
540	NC_016857	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699241
541	NC_016857	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699241
542	NC_016857	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	379699241
543	NC_016857	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699241
544	NC_016857	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	379699241
545	NC_016857	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699241
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547	NC_016857	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699241
548	NC_016857	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699241
549	NC_016857	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699241
550	NC_016857	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699241
551	NC_016857	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
552	NC_016857	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699241
553	NC_016857	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699241
554	NC_016857	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699241
555	NC_016857	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	379699241
556	NC_016857	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
557	NC_016857	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699241
558	NC_016857	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699241
559	NC_016857	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699241
560	NC_016857	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699241
561	NC_016857	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	379699241
562	NC_016857	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
563	NC_016857	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
564	NC_016857	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379699241
565	NC_016857	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699241
566	NC_016857	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	379699241
567	NC_016857	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699241
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569	NC_016857	TCC	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699241
570	NC_016857	ACA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699241
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573	NC_016857	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	379699242
574	NC_016857	A	6	6	28591	28596	100 %	0 %	0 %	0 %	379699242
575	NC_016857	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	379699242
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598	NC_016857	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	379699244
599	NC_016857	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	379699244
600	NC_016857	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699244
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608	NC_016857	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	379699245
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610	NC_016857	CCG	2	6	30812	30817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699245
611	NC_016857	CGC	2	6	30846	30851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699245
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623	NC_016857	CGC	2	6	31474	31479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699246
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