MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016857	CTG	2	6	235398	235403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699420
4502	NC_016857	TAA	2	6	235406	235411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699420
4503	NC_016857	GTGA	2	8	235515	235522	25 %	25 %	50 %	0 %	379699420
4504	NC_016857	CGG	3	9	235531	235539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699420
4505	NC_016857	CCA	2	6	235606	235611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699420
4506	NC_016857	TGAA	2	8	235618	235625	50 %	25 %	25 %	0 %	379699420
4507	NC_016857	GGC	2	6	235686	235691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699420
4508	NC_016857	TTA	2	6	235748	235753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699421
4509	NC_016857	TGG	2	6	235833	235838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699421
4510	NC_016857	TCG	2	6	235892	235897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699421
4511	NC_016857	CGGGAT	2	12	236068	236079	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379699421
4512	NC_016857	ATA	2	6	236266	236271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699422
4513	NC_016857	TGC	2	6	236285	236290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699422
4514	NC_016857	CAC	2	6	236352	236357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699422
4515	NC_016857	TAT	2	6	236362	236367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699422
4516	NC_016857	GGAG	2	8	236424	236431	25 %	0 %	75 %	0 %	379699422
4517	NC_016857	GAT	2	6	236629	236634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699422
4518	NC_016857	CTGG	2	8	236646	236653	0 %	25 %	50 %	25 %	379699422
4519	NC_016857	CCG	2	6	236704	236709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699422
4520	NC_016857	CAGTT	2	10	236718	236727	20 %	40 %	20 %	20 %	379699422
4521	NC_016857	AAC	2	6	236790	236795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699422
4522	NC_016857	G	6	6	236856	236861	0 %	0 %	100 %	0 %	379699422
4523	NC_016857	GCA	2	6	236876	236881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699422
4524	NC_016857	ATC	2	6	236981	236986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699422
4525	NC_016857	TAT	2	6	237081	237086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699422
4526	NC_016857	TGA	2	6	237087	237092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699422
4527	NC_016857	G	6	6	237099	237104	0 %	0 %	100 %	0 %	379699422
4528	NC_016857	CG	3	6	237229	237234	0 %	0 %	50 %	50 %	379699423
4529	NC_016857	TAT	2	6	237245	237250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699423
4530	NC_016857	GTC	2	6	237255	237260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4531	NC_016857	TG	3	6	237266	237271	0 %	50 %	50 %	0 %	379699423
4532	NC_016857	CGAC	2	8	237272	237279	25 %	0 %	25 %	50 %	379699423
4533	NC_016857	TCC	2	6	237322	237327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699423
4534	NC_016857	GAA	2	6	237339	237344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699423
4535	NC_016857	GAA	2	6	237411	237416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699423
4536	NC_016857	GCC	2	6	237429	237434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699423
4537	NC_016857	GAC	2	6	237444	237449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4538	NC_016857	CCT	2	6	237464	237469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699423
4539	NC_016857	GTG	2	6	237502	237507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699423
4540	NC_016857	TTCA	2	8	237546	237553	25 %	50 %	0 %	25 %	379699423
4541	NC_016857	GCC	2	6	237568	237573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699423
4542	NC_016857	CGA	2	6	237649	237654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4543	NC_016857	CGC	2	6	237680	237685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699423
4544	NC_016857	GAT	2	6	237687	237692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699423
4545	NC_016857	CAGGT	2	10	237703	237712	20 %	20 %	40 %	20 %	379699423
4546	NC_016857	ACG	2	6	237718	237723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4547	NC_016857	GTA	2	6	237726	237731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699423
4548	NC_016857	TCG	2	6	237775	237780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4549	NC_016857	CAG	2	6	237786	237791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4550	NC_016857	GC	3	6	237814	237819	0 %	0 %	50 %	50 %	379699423
4551	NC_016857	GCG	2	6	237842	237847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699423
4552	NC_016857	CGA	2	6	237878	237883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4553	NC_016857	CG	3	6	237921	237926	0 %	0 %	50 %	50 %	379699423
4554	NC_016857	GC	3	6	238016	238021	0 %	0 %	50 %	50 %	379699423
4555	NC_016857	CAG	2	6	238038	238043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4556	NC_016857	AGC	2	6	238064	238069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4557	NC_016857	TCG	2	6	238130	238135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699423
4558	NC_016857	GC	3	6	238226	238231	0 %	0 %	50 %	50 %	379699423
4559	NC_016857	CAT	2	6	238349	238354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699423
4560	NC_016857	GCC	2	6	238395	238400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699423
4561	NC_016857	CGC	2	6	238433	238438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699423
4562	NC_016857	CGC	2	6	238748	238753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699424
4563	NC_016857	GGC	2	6	238770	238775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699424
4564	NC_016857	GC	3	6	238853	238858	0 %	0 %	50 %	50 %	379699424
4565	NC_016857	CGG	2	6	238968	238973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699424
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4569	NC_016857	CGGCG	2	10	239196	239205	0 %	0 %	60 %	40 %	379699424
4570	NC_016857	CT	3	6	239212	239217	0 %	50 %	0 %	50 %	379699424
4571	NC_016857	GCG	2	6	239218	239223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699424
4572	NC_016857	CGC	2	6	239231	239236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699424
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4574	NC_016857	TCA	2	6	239321	239326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699424
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4583	NC_016857	GCCG	2	8	239583	239590	0 %	0 %	50 %	50 %	379699424
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4589	NC_016857	TGCTT	2	10	239690	239699	0 %	60 %	20 %	20 %	379699424
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4592	NC_016857	G	6	6	239715	239720	0 %	0 %	100 %	0 %	379699424
4593	NC_016857	GCT	2	6	239751	239756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699424
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4597	NC_016857	TGCTGG	2	12	239885	239896	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379699424
4598	NC_016857	GC	3	6	240004	240009	0 %	0 %	50 %	50 %	379699424
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4602	NC_016857	CGG	2	6	240273	240278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699425
4603	NC_016857	TGG	2	6	240365	240370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699425
4604	NC_016857	TGG	2	6	240395	240400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699425
4605	NC_016857	AACC	2	8	240450	240457	50 %	0 %	0 %	50 %	379699425
4606	NC_016857	CTTC	2	8	240488	240495	0 %	50 %	0 %	50 %	379699425
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4609	NC_016857	CAT	2	6	240695	240700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699426
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4612	NC_016857	CGC	2	6	240838	240843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699426
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4614	NC_016857	TGGC	2	8	240983	240990	0 %	25 %	50 %	25 %	379699426
4615	NC_016857	CGA	2	6	241027	241032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699426
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4988	NC_016857	T	7	7	260180	260186	0 %	100 %	0 %	0 %	379699443
4989	NC_016857	GCC	2	6	260190	260195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699443
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4991	NC_016857	CGC	2	6	260268	260273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699443
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5000	NC_016857	GC	3	6	260535	260540	0 %	0 %	50 %	50 %	379699443

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