MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 2901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016856	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378448276
2	NC_016856	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378448277
3	NC_016856	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378448278
4	NC_016856	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378448280
5	NC_016856	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	378448282
6	NC_016856	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	378448286
7	NC_016856	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	378448286
8	NC_016856	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	378448288
9	NC_016856	GTGAT	2	10	14912	14921	20 %	40 %	40 %	0 %	378448289
10	NC_016856	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	378448290
11	NC_016856	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	378448296
12	NC_016856	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	378448296
13	NC_016856	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	378448296
14	NC_016856	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	378448297
15	NC_016856	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	378448297
16	NC_016856	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	378448299
17	NC_016856	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	378448302
18	NC_016856	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	378448302
19	NC_016856	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	410023154
20	NC_016856	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	378448304
21	NC_016856	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	378448308
22	NC_016856	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	378448308
23	NC_016856	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	378448309
24	NC_016856	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	378448310
25	NC_016856	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	378448311
26	NC_016856	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	378448312
27	NC_016856	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	378448314
28	NC_016856	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	378448314
29	NC_016856	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	378448315
30	NC_016856	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	378448315
31	NC_016856	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	378448316
32	NC_016856	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	378448317
33	NC_016856	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	378448318
34	NC_016856	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	378448321
35	NC_016856	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	378448321
36	NC_016856	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	378448322
37	NC_016856	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	378448324
38	NC_016856	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	378448324
39	NC_016856	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	378448324
40	NC_016856	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	378448324
41	NC_016856	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	378448328
42	NC_016856	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	378448329
43	NC_016856	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	378448329
44	NC_016856	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	378448330
45	NC_016856	AGCGC	2	10	57234	57243	20 %	0 %	40 %	40 %	378448331
46	NC_016856	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	378448332
47	NC_016856	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	378448334
48	NC_016856	GGAAA	2	10	59739	59748	60 %	0 %	40 %	0 %	378448334
49	NC_016856	CGCTG	2	10	60229	60238	0 %	20 %	40 %	40 %	378448335
50	NC_016856	GCCTG	2	10	64788	64797	0 %	20 %	40 %	40 %	378448338
51	NC_016856	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	378448339
52	NC_016856	CGTGC	2	10	71365	71374	0 %	20 %	40 %	40 %	378448346
53	NC_016856	TTGAT	2	10	71535	71544	20 %	60 %	20 %	0 %	378448346
54	NC_016856	ACCGC	2	10	72095	72104	20 %	0 %	20 %	60 %	378448346
55	NC_016856	CGATG	2	10	77758	77767	20 %	20 %	40 %	20 %	378448352
56	NC_016856	GCGAA	2	10	78699	78708	40 %	0 %	40 %	20 %	378448352
57	NC_016856	CGTAC	2	10	79589	79598	20 %	20 %	20 %	40 %	378448352
58	NC_016856	TTGCC	2	10	81936	81945	0 %	40 %	20 %	40 %	378448356
59	NC_016856	CGTCC	2	10	82046	82055	0 %	20 %	20 %	60 %	378448356
60	NC_016856	TTCAG	2	10	85163	85172	20 %	40 %	20 %	20 %	378448359
61	NC_016856	GGCCA	2	10	85312	85321	20 %	0 %	40 %	40 %	378448359
62	NC_016856	GTACG	2	10	87883	87892	20 %	20 %	40 %	20 %	378448362
63	NC_016856	CAGAA	2	10	88596	88605	60 %	0 %	20 %	20 %	378448362
64	NC_016856	CCGCA	2	10	90715	90724	20 %	0 %	20 %	60 %	378448365
65	NC_016856	CGGTT	2	10	91220	91229	0 %	40 %	40 %	20 %	378448366
66	NC_016856	GCTCC	2	10	92356	92365	0 %	20 %	20 %	60 %	378448366
67	NC_016856	TGGCG	2	10	93000	93009	0 %	20 %	60 %	20 %	378448368
68	NC_016856	TTTCC	2	10	96914	96923	0 %	60 %	0 %	40 %	378448374
69	NC_016856	GTGGC	2	10	97483	97492	0 %	20 %	60 %	20 %	378448374
70	NC_016856	GCGCT	2	10	98635	98644	0 %	20 %	40 %	40 %	378448375
71	NC_016856	AGCGC	2	10	98702	98711	20 %	0 %	40 %	40 %	378448375
72	NC_016856	TGCAC	2	10	99400	99409	20 %	20 %	20 %	40 %	378448377
73	NC_016856	TGGCA	2	10	99469	99478	20 %	20 %	40 %	20 %	378448377
74	NC_016856	TCTGT	2	10	99795	99804	0 %	60 %	20 %	20 %	378448378
75	NC_016856	GCGCT	2	10	100105	100114	0 %	20 %	40 %	40 %	378448378
76	NC_016856	GGCGC	2	10	100519	100528	0 %	0 %	60 %	40 %	378448378
77	NC_016856	GCGAC	2	10	100832	100841	20 %	0 %	40 %	40 %	378448378
78	NC_016856	AACGT	2	10	103289	103298	40 %	20 %	20 %	20 %	378448382
79	NC_016856	CCCAA	2	10	105439	105448	40 %	0 %	0 %	60 %	378448385
80	NC_016856	TTGTT	2	10	106146	106155	0 %	80 %	20 %	0 %	378448385
81	NC_016856	GCTTC	2	10	107526	107535	0 %	40 %	20 %	40 %	378448386
82	NC_016856	TGCGT	2	10	107813	107822	0 %	40 %	40 %	20 %	378448386
83	NC_016856	TGATC	2	10	109513	109522	20 %	40 %	20 %	20 %	378448388
84	NC_016856	TGGCG	2	10	112673	112682	0 %	20 %	60 %	20 %	378448390
85	NC_016856	AGCGC	2	10	113233	113242	20 %	0 %	40 %	40 %	378448390
86	NC_016856	ACGTT	2	10	114050	114059	20 %	40 %	20 %	20 %	378448391
87	NC_016856	CCGCG	2	10	114318	114327	0 %	0 %	40 %	60 %	378448391
88	NC_016856	ACAGA	2	10	117645	117654	60 %	0 %	20 %	20 %	378448393
89	NC_016856	CAGCG	2	10	118820	118829	20 %	0 %	40 %	40 %	378448395
90	NC_016856	GCCGG	2	10	119120	119129	0 %	0 %	60 %	40 %	378448395
91	NC_016856	CGAGC	2	10	119245	119254	20 %	0 %	40 %	40 %	378448395
92	NC_016856	ATTTG	2	10	119688	119697	20 %	60 %	20 %	0 %	378448395
93	NC_016856	TTGCC	2	10	124192	124201	0 %	40 %	20 %	40 %	378448399
94	NC_016856	AGCAG	2	10	124869	124878	40 %	0 %	40 %	20 %	378448400
95	NC_016856	AGTTT	2	10	127099	127108	20 %	60 %	20 %	0 %	378448401
96	NC_016856	TAGTG	2	10	127517	127526	20 %	40 %	40 %	0 %	378448402
97	NC_016856	TCGAT	2	10	128947	128956	20 %	40 %	20 %	20 %	378448403
98	NC_016856	CGGCG	2	10	131258	131267	0 %	0 %	60 %	40 %	378448406
99	NC_016856	CGTTT	2	10	131720	131729	0 %	60 %	20 %	20 %	378448406
100	NC_016856	GACCG	2	10	133164	133173	20 %	0 %	40 %	40 %	378448408
101	NC_016856	ATTCC	2	10	136821	136830	20 %	40 %	0 %	40 %	378448413
102	NC_016856	AAAGC	2	10	139118	139127	60 %	0 %	20 %	20 %	378448416
103	NC_016856	CCGCA	2	10	139651	139660	20 %	0 %	20 %	60 %	378448416
104	NC_016856	TTGTT	2	10	140237	140246	0 %	80 %	20 %	0 %	378448417
105	NC_016856	AGTTC	2	10	142022	142031	20 %	40 %	20 %	20 %	378448420
106	NC_016856	TGCCT	2	10	142122	142131	0 %	40 %	20 %	40 %	378448421
107	NC_016856	AAGCG	2	10	146775	146784	40 %	0 %	40 %	20 %	378448424
108	NC_016856	GTTTG	2	10	148678	148687	0 %	60 %	40 %	0 %	378448426
109	NC_016856	CGTAT	2	10	150149	150158	20 %	40 %	20 %	20 %	378448427
110	NC_016856	ATCAG	2	10	151985	151994	40 %	20 %	20 %	20 %	378448429
111	NC_016856	CTGCC	2	10	153994	154003	0 %	20 %	20 %	60 %	378448430
112	NC_016856	CGGCG	2	10	156724	156733	0 %	0 %	60 %	40 %	378448433
113	NC_016856	CCGGC	2	10	160078	160087	0 %	0 %	40 %	60 %	378448436
114	NC_016856	GATCA	2	10	163396	163405	40 %	20 %	20 %	20 %	378448440
115	NC_016856	CGTCA	2	10	164142	164151	20 %	20 %	20 %	40 %	378448441
116	NC_016856	ATCCC	2	10	165842	165851	20 %	20 %	0 %	60 %	378448443
117	NC_016856	AGCGC	2	10	166550	166559	20 %	0 %	40 %	40 %	378448443
118	NC_016856	TGAGC	2	10	168399	168408	20 %	20 %	40 %	20 %	378448444
119	NC_016856	CGCAT	2	10	168661	168670	20 %	20 %	20 %	40 %	378448445
120	NC_016856	CGAAC	2	10	169390	169399	40 %	0 %	20 %	40 %	378448447
121	NC_016856	GTTCA	2	10	169656	169665	20 %	40 %	20 %	20 %	378448447
122	NC_016856	ATGAC	2	10	170622	170631	40 %	20 %	20 %	20 %	378448448
123	NC_016856	CTGGA	2	10	171212	171221	20 %	20 %	40 %	20 %	378448449
124	NC_016856	CAGAA	2	10	173331	173340	60 %	0 %	20 %	20 %	378448451
125	NC_016856	CGAAG	2	10	176202	176211	40 %	0 %	40 %	20 %	378448455
126	NC_016856	GGCAT	2	10	183481	183490	20 %	20 %	40 %	20 %	378448460
127	NC_016856	GGCCA	2	10	183903	183912	20 %	0 %	40 %	40 %	378448461
128	NC_016856	GCGCC	2	10	183916	183925	0 %	0 %	40 %	60 %	378448461
129	NC_016856	CGTTT	2	10	184418	184427	0 %	60 %	20 %	20 %	378448461
130	NC_016856	GGGGA	2	10	184470	184479	20 %	0 %	80 %	0 %	378448461
131	NC_016856	TCTGG	2	10	188095	188104	0 %	40 %	40 %	20 %	378448462
132	NC_016856	CCGCT	2	10	191746	191755	0 %	20 %	20 %	60 %	378448465
133	NC_016856	GCCCA	2	10	194298	194307	20 %	0 %	20 %	60 %	378448468
134	NC_016856	GCGCA	2	10	194703	194712	20 %	0 %	40 %	40 %	378448468
135	NC_016856	ATCGG	2	10	196094	196103	20 %	20 %	40 %	20 %	378448470
136	NC_016856	GCCGC	2	10	197304	197313	0 %	0 %	40 %	60 %	378448472
137	NC_016856	ATCCA	2	10	202654	202663	40 %	20 %	0 %	40 %	378448475
138	NC_016856	CGGCG	2	10	204771	204780	0 %	0 %	60 %	40 %	378448478
139	NC_016856	TGGTC	2	10	205637	205646	0 %	40 %	40 %	20 %	378448478
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141	NC_016856	AGCGC	2	10	208286	208295	20 %	0 %	40 %	40 %	378448479
142	NC_016856	CGGCG	2	10	210200	210209	0 %	0 %	60 %	40 %	378448483
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149	NC_016856	CGCGG	2	10	214592	214601	0 %	0 %	60 %	40 %	378448490
150	NC_016856	CGCGG	2	10	214776	214785	0 %	0 %	60 %	40 %	378448490
151	NC_016856	GCCAG	2	10	216760	216769	20 %	0 %	40 %	40 %	378448491
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247	NC_016856	TGAGC	2	10	372840	372849	20 %	20 %	40 %	20 %	410023156
248	NC_016856	TTTCA	2	10	373017	373026	20 %	60 %	0 %	20 %	410023156
249	NC_016856	CAACG	2	10	375214	375223	40 %	0 %	20 %	40 %	378448643
250	NC_016856	GCGTT	2	10	378403	378412	0 %	40 %	40 %	20 %	378448647
251	NC_016856	GACTG	2	10	382496	382505	20 %	20 %	40 %	20 %	378448651
252	NC_016856	ATTTT	2	10	384623	384632	20 %	80 %	0 %	0 %	378448652
253	NC_016856	TCCTG	2	10	389129	389138	0 %	40 %	20 %	40 %	378448657
254	NC_016856	TTGGC	2	10	389294	389303	0 %	40 %	40 %	20 %	378448657
255	NC_016856	GATGC	2	10	390852	390861	20 %	20 %	40 %	20 %	378448660
256	NC_016856	AAGCC	2	10	396060	396069	40 %	0 %	20 %	40 %	378448666
257	NC_016856	ACCAA	2	10	396552	396561	60 %	0 %	0 %	40 %	378448666
258	NC_016856	CACGA	2	10	399274	399283	40 %	0 %	20 %	40 %	378448669
259	NC_016856	TGTCG	2	10	400707	400716	0 %	40 %	40 %	20 %	378448669
260	NC_016856	CCGAT	2	10	400952	400961	20 %	20 %	20 %	40 %	378448669
261	NC_016856	CGCTT	2	10	402340	402349	0 %	40 %	20 %	40 %	378448672
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263	NC_016856	ATGTG	2	10	404721	404730	20 %	40 %	40 %	0 %	378448674
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