MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016856	AAC	2	6	206022	206027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448479
4002	NC_016856	CGC	2	6	206054	206059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448479
4003	NC_016856	GC	3	6	206058	206063	0 %	0 %	50 %	50 %	378448479
4004	NC_016856	ACC	2	6	206064	206069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448479
4005	NC_016856	GTT	2	6	206096	206101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448479
4006	NC_016856	TGC	2	6	206131	206136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4007	NC_016856	CGAG	2	8	206140	206147	25 %	0 %	50 %	25 %	378448479
4008	NC_016856	ATA	2	6	206159	206164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448479
4009	NC_016856	CGC	2	6	206236	206241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448479
4010	NC_016856	CGC	2	6	206267	206272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448479
4011	NC_016856	GGCT	2	8	206283	206290	0 %	25 %	50 %	25 %	378448479
4012	NC_016856	GCC	2	6	206321	206326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448479
4013	NC_016856	TTG	2	6	206345	206350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448479
4014	NC_016856	CCG	2	6	206418	206423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448479
4015	NC_016856	TG	3	6	206436	206441	0 %	50 %	50 %	0 %	378448479
4016	NC_016856	GTG	2	6	206502	206507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448479
4017	NC_016856	TCG	3	9	206631	206639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4018	NC_016856	TCA	2	6	206643	206648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448479
4019	NC_016856	TTG	2	6	206727	206732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448479
4020	NC_016856	CTG	2	6	206756	206761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4021	NC_016856	TCT	2	6	206778	206783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448479
4022	NC_016856	TCG	2	6	206883	206888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4023	NC_016856	GTG	2	6	206958	206963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448479
4024	NC_016856	GAC	2	6	206972	206977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4025	NC_016856	GCC	2	6	207140	207145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448479
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4027	NC_016856	GTC	2	6	207197	207202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4028	NC_016856	GTT	2	6	207212	207217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448479
4029	NC_016856	CTT	2	6	207325	207330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448479
4030	NC_016856	CGTCA	2	10	207335	207344	20 %	20 %	20 %	40 %	378448479
4031	NC_016856	TGC	2	6	207355	207360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4032	NC_016856	CGG	2	6	207403	207408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448479
4033	NC_016856	TCG	2	6	207475	207480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4034	NC_016856	GCTG	2	8	207493	207500	0 %	25 %	50 %	25 %	378448479
4035	NC_016856	CGG	2	6	207586	207591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448479
4036	NC_016856	TCG	2	6	207753	207758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
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4038	NC_016856	CGG	2	6	207842	207847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448479
4039	NC_016856	GTT	2	6	207863	207868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448479
4040	NC_016856	GCTG	2	8	207925	207932	0 %	25 %	50 %	25 %	378448479
4041	NC_016856	TATTGA	2	12	208111	208122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378448479
4042	NC_016856	CG	3	6	208237	208242	0 %	0 %	50 %	50 %	378448479
4043	NC_016856	GT	3	6	208253	208258	0 %	50 %	50 %	0 %	378448479
4044	NC_016856	TGC	2	6	208264	208269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4045	NC_016856	AC	3	6	208280	208285	50 %	0 %	0 %	50 %	378448479
4046	NC_016856	AGCGC	2	10	208286	208295	20 %	0 %	40 %	40 %	378448479
4047	NC_016856	ATAA	2	8	208297	208304	75 %	25 %	0 %	0 %	378448479
4048	NC_016856	GTTT	2	8	208364	208371	0 %	75 %	25 %	0 %	378448480
4049	NC_016856	TGA	2	6	208401	208406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448480
4050	NC_016856	GGC	3	9	208429	208437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448480
4051	NC_016856	ATA	2	6	208528	208533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448480
4052	NC_016856	TTC	2	6	208544	208549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448480
4053	NC_016856	GT	3	6	208668	208673	0 %	50 %	50 %	0 %	378448480
4054	NC_016856	TGC	2	6	208692	208697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448480
4055	NC_016856	CCAG	2	8	208716	208723	25 %	0 %	25 %	50 %	378448480
4056	NC_016856	GCC	2	6	208753	208758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448480
4057	NC_016856	GTA	2	6	208773	208778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448480
4058	NC_016856	GCG	2	6	208809	208814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448480
4059	NC_016856	CAA	2	6	209006	209011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448480
4060	NC_016856	GCGG	2	8	209163	209170	0 %	0 %	75 %	25 %	378448481
4061	NC_016856	CTG	2	6	209201	209206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448481
4062	NC_016856	CAT	2	6	209300	209305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448481
4063	NC_016856	GC	3	6	209355	209360	0 %	0 %	50 %	50 %	378448481
4064	NC_016856	CTG	2	6	209368	209373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448481
4065	NC_016856	AG	3	6	209449	209454	50 %	0 %	50 %	0 %	378448481
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4068	NC_016856	GGC	2	6	209586	209591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448481
4069	NC_016856	AGTG	2	8	209601	209608	25 %	25 %	50 %	0 %	378448481
4070	NC_016856	ATT	2	6	209803	209808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448482
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4072	NC_016856	GCT	2	6	209872	209877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448482
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4076	NC_016856	GT	3	6	209932	209937	0 %	50 %	50 %	0 %	378448482
4077	NC_016856	A	7	7	209946	209952	100 %	0 %	0 %	0 %	378448482
4078	NC_016856	CAT	2	6	209961	209966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448482
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4081	NC_016856	TG	3	6	210139	210144	0 %	50 %	50 %	0 %	378448483
4082	NC_016856	CGGCG	2	10	210200	210209	0 %	0 %	60 %	40 %	378448483
4083	NC_016856	TGA	2	6	210229	210234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448483
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4086	NC_016856	CAG	3	9	210384	210392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448483
4087	NC_016856	TGC	2	6	210412	210417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448483
4088	NC_016856	AT	3	6	210495	210500	50 %	50 %	0 %	0 %	378448484
4089	NC_016856	GTT	2	6	210511	210516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448484
4090	NC_016856	ACG	2	6	210580	210585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448484
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4092	NC_016856	ATT	2	6	210683	210688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448484
4093	NC_016856	TGG	2	6	210878	210883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448484
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4095	NC_016856	GGCT	2	8	210962	210969	0 %	25 %	50 %	25 %	378448484
4096	NC_016856	ATC	2	6	211022	211027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448484
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4099	NC_016856	TTCGG	2	10	211080	211089	0 %	40 %	40 %	20 %	378448484
4100	NC_016856	GGA	2	6	211155	211160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448484
4101	NC_016856	GC	4	8	211189	211196	0 %	0 %	50 %	50 %	378448484
4102	NC_016856	TGA	2	6	211212	211217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448484
4103	NC_016856	TAT	2	6	211287	211292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448484
4104	NC_016856	T	6	6	211407	211412	0 %	100 %	0 %	0 %	378448484
4105	NC_016856	CGC	2	6	211432	211437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448484
4106	NC_016856	TA	3	6	211445	211450	50 %	50 %	0 %	0 %	378448484
4107	NC_016856	ATA	2	6	211463	211468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448484
4108	NC_016856	CGG	2	6	211492	211497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448484
4109	NC_016856	TCTT	2	8	211530	211537	0 %	75 %	0 %	25 %	378448484
4110	NC_016856	AGC	2	6	211572	211577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448484
4111	NC_016856	TGC	2	6	211646	211651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448484
4112	NC_016856	CTT	2	6	211824	211829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448485
4113	NC_016856	GCC	2	6	211889	211894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448485
4114	NC_016856	GAT	2	6	211909	211914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448485
4115	NC_016856	CTTGC	2	10	212089	212098	0 %	40 %	20 %	40 %	378448485
4116	NC_016856	GGC	2	6	212264	212269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448486
4117	NC_016856	CAG	2	6	212309	212314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4118	NC_016856	GTC	2	6	212339	212344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4119	NC_016856	TTCA	2	8	212360	212367	25 %	50 %	0 %	25 %	378448486
4120	NC_016856	GGCAAT	2	12	212378	212389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378448486
4121	NC_016856	TCA	2	6	212440	212445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448486
4122	NC_016856	GCT	2	6	212473	212478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4123	NC_016856	TGAGC	2	10	212501	212510	20 %	20 %	40 %	20 %	378448486
4124	NC_016856	AAT	2	6	212531	212536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448486
4125	NC_016856	CGA	2	6	212545	212550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448486
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4127	NC_016856	CGC	2	6	212677	212682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448486
4128	NC_016856	AG	3	6	212720	212725	50 %	0 %	50 %	0 %	378448486
4129	NC_016856	ACGT	2	8	212739	212746	25 %	25 %	25 %	25 %	378448486
4130	NC_016856	CAC	2	6	212912	212917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448486
4131	NC_016856	CGT	2	6	212959	212964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4132	NC_016856	TGG	2	6	212977	212982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448486
4133	NC_016856	GAC	2	6	213016	213021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448486
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4136	NC_016856	TGA	2	6	213086	213091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448487
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4140	NC_016856	CTG	2	6	213247	213252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448488
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4143	NC_016856	GCCGAT	2	12	213376	213387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378448488
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4150	NC_016856	CGCA	2	8	213664	213671	25 %	0 %	25 %	50 %	378448488
4151	NC_016856	GC	3	6	213753	213758	0 %	0 %	50 %	50 %	378448488
4152	NC_016856	CG	3	6	213769	213774	0 %	0 %	50 %	50 %	378448488
4153	NC_016856	CAGG	2	8	213804	213811	25 %	0 %	50 %	25 %	378448488
4154	NC_016856	AG	3	6	213842	213847	50 %	0 %	50 %	0 %	378448488
4155	NC_016856	TCG	2	6	213875	213880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448488
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4157	NC_016856	CTTG	2	8	213939	213946	0 %	50 %	25 %	25 %	378448488
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4162	NC_016856	CGGT	2	8	214250	214257	0 %	25 %	50 %	25 %	378448489
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4228	NC_016856	GCGCG	2	10	217326	217335	0 %	0 %	60 %	40 %	378448492
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4231	NC_016856	GTTC	2	8	217754	217761	0 %	50 %	25 %	25 %	378448493
4232	NC_016856	T	6	6	217769	217774	0 %	100 %	0 %	0 %	378448493
4233	NC_016856	GCA	2	6	217895	217900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448493
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4237	NC_016856	AATG	2	8	218205	218212	50 %	25 %	25 %	0 %	378448493
4238	NC_016856	CGT	2	6	218349	218354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448493
4239	NC_016856	A	6	6	218380	218385	100 %	0 %	0 %	0 %	378448493
4240	NC_016856	ATT	3	9	218451	218459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448494
4241	NC_016856	ACG	2	6	218532	218537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448494
4242	NC_016856	CGG	3	9	218563	218571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448494
4243	NC_016856	TGGC	2	8	218585	218592	0 %	25 %	50 %	25 %	378448494
4244	NC_016856	GCA	2	6	218598	218603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448494
4245	NC_016856	AAC	2	6	218640	218645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448494
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4247	NC_016856	GC	4	8	218661	218668	0 %	0 %	50 %	50 %	378448494
4248	NC_016856	CAA	2	6	218686	218691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448494
4249	NC_016856	CG	3	6	218694	218699	0 %	0 %	50 %	50 %	378448494
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4252	NC_016856	CGC	2	6	218866	218871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448494
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4264	NC_016856	CGGGG	2	10	219144	219153	0 %	0 %	80 %	20 %	378448495
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4274	NC_016856	TGA	2	6	219645	219650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448495
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4361	NC_016856	GGCGG	2	10	223077	223086	0 %	0 %	80 %	20 %	378448498
4362	NC_016856	GC	3	6	223122	223127	0 %	0 %	50 %	50 %	378448498
4363	NC_016856	CGC	2	6	223258	223263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448498
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4366	NC_016856	TGG	2	6	223306	223311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448498
4367	NC_016856	CGG	2	6	223372	223377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448498
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4370	NC_016856	GGC	2	6	223607	223612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448498
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4433	NC_016856	GGAAT	2	10	225786	225795	40 %	20 %	40 %	0 %	378448500
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4444	NC_016856	GTC	2	6	226468	226473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448500
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4454	NC_016856	TGG	2	6	226994	226999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448501
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4483	NC_016856	ATCG	2	8	228147	228154	25 %	25 %	25 %	25 %	378448502
4484	NC_016856	AAG	2	6	228169	228174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448502
4485	NC_016856	CGC	2	6	228232	228237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448502
4486	NC_016856	CCG	2	6	228286	228291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448502
4487	NC_016856	GGC	2	6	228392	228397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4488	NC_016856	GCC	2	6	228456	228461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448503
4489	NC_016856	TGTT	2	8	228486	228493	0 %	75 %	25 %	0 %	378448503
4490	NC_016856	GCC	2	6	228494	228499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448503
4491	NC_016856	GCTG	2	8	228501	228508	0 %	25 %	50 %	25 %	378448503
4492	NC_016856	CAT	2	6	228580	228585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448503
4493	NC_016856	GAT	2	6	228592	228597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448503
4494	NC_016856	CAGC	2	8	228607	228614	25 %	0 %	25 %	50 %	378448503
4495	NC_016856	GCT	2	6	228634	228639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4496	NC_016856	GC	3	6	228732	228737	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4497	NC_016856	GC	3	6	228777	228782	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4498	NC_016856	GCC	2	6	228797	228802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448503
4499	NC_016856	TCG	2	6	228819	228824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4500	NC_016856	GC	3	6	228825	228830	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503

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