MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016856	GCT	2	6	153063	153068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448429
3002	NC_016856	CGG	2	6	153086	153091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448429
3003	NC_016856	AGG	2	6	153308	153313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448429
3004	NC_016856	GGC	2	6	153419	153424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448430
3005	NC_016856	GCCT	2	8	153561	153568	0 %	25 %	25 %	50 %	378448430
3006	NC_016856	GCG	2	6	153579	153584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448430
3007	NC_016856	CG	3	6	153675	153680	0 %	0 %	50 %	50 %	378448430
3008	NC_016856	GAA	2	6	153704	153709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448430
3009	NC_016856	AGT	2	6	153790	153795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448430
3010	NC_016856	AGA	2	6	153796	153801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448430
3011	NC_016856	ATG	2	6	153840	153845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448430
3012	NC_016856	GAA	2	6	153905	153910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448430
3013	NC_016856	TC	3	6	153970	153975	0 %	50 %	0 %	50 %	378448430
3014	NC_016856	TGA	2	6	153976	153981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448430
3015	NC_016856	CTGCC	2	10	153994	154003	0 %	20 %	20 %	60 %	378448430
3016	NC_016856	TC	3	6	154037	154042	0 %	50 %	0 %	50 %	378448430
3017	NC_016856	CTG	2	6	154124	154129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448430
3018	NC_016856	GGC	2	6	154177	154182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448430
3019	NC_016856	TGA	2	6	154277	154282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448431
3020	NC_016856	CTT	2	6	154291	154296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448431
3021	NC_016856	CGC	2	6	154299	154304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448431
3022	NC_016856	AAT	2	6	154305	154310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448431
3023	NC_016856	CTG	2	6	154338	154343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448431
3024	NC_016856	GGGT	2	8	154371	154378	0 %	25 %	75 %	0 %	378448431
3025	NC_016856	TGGA	2	8	154389	154396	25 %	25 %	50 %	0 %	378448431
3026	NC_016856	GAT	2	6	154461	154466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448431
3027	NC_016856	GC	3	6	154492	154497	0 %	0 %	50 %	50 %	378448431
3028	NC_016856	TGA	2	6	154592	154597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448431
3029	NC_016856	TGT	2	6	154720	154725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448431
3030	NC_016856	GCG	2	6	154815	154820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448431
3031	NC_016856	TAA	2	6	154853	154858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448431
3032	NC_016856	CAG	3	9	154935	154943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448431
3033	NC_016856	C	6	6	155021	155026	0 %	0 %	0 %	100 %	378448431
3034	NC_016856	CAGGCA	2	12	155052	155063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448431
3035	NC_016856	AAC	2	6	155065	155070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448431
3036	NC_016856	GTA	2	6	155099	155104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448432
3037	NC_016856	TAG	2	6	155139	155144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448432
3038	NC_016856	GTG	2	6	155240	155245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448432
3039	NC_016856	GC	3	6	155257	155262	0 %	0 %	50 %	50 %	378448432
3040	NC_016856	AAG	2	6	155388	155393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448432
3041	NC_016856	CGT	2	6	155404	155409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448432
3042	NC_016856	GTGCGC	2	12	155426	155437	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448432
3043	NC_016856	TGC	2	6	155451	155456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448432
3044	NC_016856	CGGT	2	8	155508	155515	0 %	25 %	50 %	25 %	378448432
3045	NC_016856	GCGT	2	8	155523	155530	0 %	25 %	50 %	25 %	378448432
3046	NC_016856	A	6	6	155575	155580	100 %	0 %	0 %	0 %	378448432
3047	NC_016856	GGC	2	6	155641	155646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448432
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3049	NC_016856	GGC	2	6	155738	155743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448432
3050	NC_016856	GC	3	6	155742	155747	0 %	0 %	50 %	50 %	378448432
3051	NC_016856	GTG	2	6	155783	155788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448432
3052	NC_016856	CGC	2	6	155817	155822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448432
3053	NC_016856	GC	3	6	155859	155864	0 %	0 %	50 %	50 %	378448432
3054	NC_016856	GGCG	2	8	155912	155919	0 %	0 %	75 %	25 %	378448432
3055	NC_016856	CCG	2	6	155921	155926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448432
3056	NC_016856	GCT	2	6	155980	155985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448432
3057	NC_016856	CAA	2	6	156032	156037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448432
3058	NC_016856	GGC	2	6	156055	156060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448432
3059	NC_016856	CGG	2	6	156076	156081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448432
3060	NC_016856	TGC	2	6	156103	156108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448432
3061	NC_016856	GC	3	6	156147	156152	0 %	0 %	50 %	50 %	378448432
3062	NC_016856	CGG	2	6	156204	156209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448432
3063	NC_016856	GCTG	2	8	156312	156319	0 %	25 %	50 %	25 %	378448432
3064	NC_016856	ACG	2	6	156420	156425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448433
3065	NC_016856	GGT	2	6	156449	156454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448433
3066	NC_016856	GGC	2	6	156455	156460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3067	NC_016856	TTC	2	6	156509	156514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448433
3068	NC_016856	CGG	2	6	156549	156554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3069	NC_016856	GGCGCT	2	12	156599	156610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448433
3070	NC_016856	GTCG	2	8	156620	156627	0 %	25 %	50 %	25 %	378448433
3071	NC_016856	CGG	2	6	156633	156638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3072	NC_016856	TGCG	2	8	156657	156664	0 %	25 %	50 %	25 %	378448433
3073	NC_016856	GGCA	2	8	156697	156704	25 %	0 %	50 %	25 %	378448433
3074	NC_016856	GCG	2	6	156708	156713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3075	NC_016856	CGGCG	2	10	156724	156733	0 %	0 %	60 %	40 %	378448433
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3078	NC_016856	ACG	2	6	156951	156956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448433
3079	NC_016856	CCCG	2	8	156996	157003	0 %	0 %	25 %	75 %	378448433
3080	NC_016856	TGA	2	6	157008	157013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448433
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3086	NC_016856	ACG	2	6	157302	157307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448433
3087	NC_016856	GTT	2	6	157322	157327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448433
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3089	NC_016856	CAG	2	6	157412	157417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448433
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3091	NC_016856	GGC	2	6	157486	157491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3092	NC_016856	AAGC	2	8	157532	157539	50 %	0 %	25 %	25 %	378448433
3093	NC_016856	GAT	2	6	157646	157651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448434
3094	NC_016856	CAAA	2	8	157652	157659	75 %	0 %	0 %	25 %	378448434
3095	NC_016856	AC	3	6	157700	157705	50 %	0 %	0 %	50 %	378448434
3096	NC_016856	A	6	6	157710	157715	100 %	0 %	0 %	0 %	378448434
3097	NC_016856	TCG	2	6	157763	157768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448434
3098	NC_016856	ATG	2	6	157855	157860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448434
3099	NC_016856	TGC	2	6	157889	157894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448434
3100	NC_016856	ATGG	2	8	157956	157963	25 %	25 %	50 %	0 %	378448434
3101	NC_016856	CTG	2	6	157986	157991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448434
3102	NC_016856	TGA	2	6	158006	158011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448434
3103	NC_016856	A	6	6	158025	158030	100 %	0 %	0 %	0 %	378448434
3104	NC_016856	CGAT	2	8	158140	158147	25 %	25 %	25 %	25 %	378448434
3105	NC_016856	CAG	2	6	158150	158155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448434
3106	NC_016856	GGC	2	6	158271	158276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448434
3107	NC_016856	GTT	2	6	158295	158300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448434
3108	NC_016856	TTCG	2	8	158349	158356	0 %	50 %	25 %	25 %	378448434
3109	NC_016856	TG	3	6	158392	158397	0 %	50 %	50 %	0 %	378448434
3110	NC_016856	ATT	2	6	158406	158411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448434
3111	NC_016856	AAT	2	6	158448	158453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448434
3112	NC_016856	GAC	2	6	158511	158516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448434
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3118	NC_016856	CAT	2	6	159167	159172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448435
3119	NC_016856	AGG	2	6	159210	159215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448435
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3121	NC_016856	TCG	2	6	159235	159240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448435
3122	NC_016856	TAT	2	6	159398	159403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448436
3123	NC_016856	ATT	2	6	159413	159418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448436
3124	NC_016856	CGT	2	6	159456	159461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448436
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3149	NC_016856	CGT	2	6	160628	160633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448436
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3152	NC_016856	AG	3	6	160800	160805	50 %	0 %	50 %	0 %	378448436
3153	NC_016856	GCG	2	6	160893	160898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448436
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3213	NC_016856	CTG	2	6	164259	164264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448441
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3225	NC_016856	TCG	2	6	165187	165192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448442
3226	NC_016856	ACG	2	6	165324	165329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448442
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3229	NC_016856	GGC	3	9	165462	165470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
3230	NC_016856	GGC	2	6	165489	165494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
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3232	NC_016856	CGG	2	6	165518	165523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
3233	NC_016856	AGA	2	6	165533	165538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448442
3234	NC_016856	CGG	2	6	165602	165607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
3235	NC_016856	CG	3	6	165621	165626	0 %	0 %	50 %	50 %	378448442
3236	NC_016856	CAC	2	6	165755	165760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448442
3237	NC_016856	ATCCC	2	10	165842	165851	20 %	20 %	0 %	60 %	378448443
3238	NC_016856	TGA	2	6	165923	165928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448443
3239	NC_016856	GCCAGC	2	12	165967	165978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378448443
3240	NC_016856	GCA	2	6	166010	166015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448443
3241	NC_016856	T	6	6	166087	166092	0 %	100 %	0 %	0 %	378448443
3242	NC_016856	GAA	2	6	166199	166204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448443
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3484	NC_016856	CAG	2	6	178804	178809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3485	NC_016856	CGG	2	6	178827	178832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448456
3486	NC_016856	TAC	2	6	178845	178850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448456
3487	NC_016856	GCA	2	6	178869	178874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3488	NC_016856	GCTTAC	2	12	178936	178947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378448456
3489	NC_016856	TCA	2	6	178958	178963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448456
3490	NC_016856	ATG	2	6	178967	178972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448456
3491	NC_016856	TAC	3	9	179011	179019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448456
3492	NC_016856	CAC	2	6	179022	179027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448456
3493	NC_016856	CAG	2	6	179060	179065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3494	NC_016856	GCT	2	6	179136	179141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3495	NC_016856	CGTG	2	8	179166	179173	0 %	25 %	50 %	25 %	378448456
3496	NC_016856	AGC	2	6	179175	179180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3497	NC_016856	TA	3	6	179219	179224	50 %	50 %	0 %	0 %	378448456
3498	NC_016856	CCT	2	6	179231	179236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448456
3499	NC_016856	TGC	2	6	179282	179287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3500	NC_016856	CG	3	6	179303	179308	0 %	0 %	50 %	50 %	378448456

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