MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016856	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	378448325
1002	NC_016856	CAT	2	6	50859	50864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448325
1003	NC_016856	CGC	2	6	50867	50872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448325
1004	NC_016856	CAG	2	6	50886	50891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1005	NC_016856	AAG	2	6	50932	50937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448325
1006	NC_016856	GAT	2	6	50946	50951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448325
1007	NC_016856	TCG	2	6	50966	50971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1008	NC_016856	ATA	2	6	51024	51029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448325
1009	NC_016856	GCT	2	6	51047	51052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1010	NC_016856	AGA	2	6	51065	51070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448325
1011	NC_016856	CGC	2	6	51117	51122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448325
1012	NC_016856	T	7	7	51128	51134	0 %	100 %	0 %	0 %	378448325
1013	NC_016856	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	378448325
1014	NC_016856	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	378448325
1015	NC_016856	ATC	2	6	51261	51266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448325
1016	NC_016856	A	6	6	51277	51282	100 %	0 %	0 %	0 %	378448325
1017	NC_016856	TAA	2	6	51312	51317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448325
1018	NC_016856	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	378448325
1019	NC_016856	TCA	2	6	51383	51388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448325
1020	NC_016856	GTG	2	6	51407	51412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448325
1021	NC_016856	TGC	2	6	51456	51461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1022	NC_016856	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	378448325
1023	NC_016856	GAC	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1024	NC_016856	GAT	3	9	51588	51596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448325
1025	NC_016856	ATA	2	6	51625	51630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448325
1026	NC_016856	CAG	3	9	51636	51644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1027	NC_016856	CAG	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1028	NC_016856	GTA	2	6	51767	51772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448325
1029	NC_016856	ATG	2	6	51779	51784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448325
1030	NC_016856	TTG	2	6	52290	52295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448326
1031	NC_016856	AGC	2	6	52355	52360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448326
1032	NC_016856	GCA	2	6	52404	52409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448326
1033	NC_016856	TGA	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448326
1034	NC_016856	CAT	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448326
1035	NC_016856	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	378448326
1036	NC_016856	GCA	2	6	52651	52656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448327
1037	NC_016856	GCG	2	6	52737	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448327
1038	NC_016856	TCT	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448327
1039	NC_016856	TCA	2	6	52795	52800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448327
1040	NC_016856	TTAACC	2	12	52814	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448327
1041	NC_016856	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	378448328
1042	NC_016856	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	378448328
1043	NC_016856	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	378448328
1044	NC_016856	GAA	2	6	52989	52994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448328
1045	NC_016856	GGT	3	9	53015	53023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448328
1046	NC_016856	GCG	2	6	53122	53127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448328
1047	NC_016856	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	378448328
1048	NC_016856	CGC	2	6	53157	53162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448328
1049	NC_016856	CTG	2	6	53199	53204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448328
1050	NC_016856	GAT	2	6	53241	53246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448328
1051	NC_016856	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	378448328
1052	NC_016856	TTA	2	6	53283	53288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448328
1053	NC_016856	GGC	2	6	53346	53351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448328
1054	NC_016856	AGT	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448328
1055	NC_016856	CTG	2	6	53418	53423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448328
1056	NC_016856	CGA	2	6	53462	53467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448328
1057	NC_016856	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	378448328
1058	NC_016856	CAA	2	6	53628	53633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448328
1059	NC_016856	CTG	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448328
1060	NC_016856	AGC	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448328
1061	NC_016856	TGA	2	6	53735	53740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448328
1062	NC_016856	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	378448328
1063	NC_016856	TGA	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448329
1064	NC_016856	GCG	2	6	53907	53912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448329
1065	NC_016856	GAT	3	9	53954	53962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448329
1066	NC_016856	CAT	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448329
1067	NC_016856	A	6	6	53987	53992	100 %	0 %	0 %	0 %	378448329
1068	NC_016856	A	7	7	53996	54002	100 %	0 %	0 %	0 %	378448329
1069	NC_016856	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448329
1070	NC_016856	GCA	2	6	54039	54044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448329
1071	NC_016856	CAT	2	6	54346	54351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448329
1072	NC_016856	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
1073	NC_016856	GCGGAA	2	12	54440	54451	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378448329
1074	NC_016856	ACC	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448329
1075	NC_016856	CTG	2	6	54761	54766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448329
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1077	NC_016856	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
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1079	NC_016856	GCA	2	6	55051	55056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448329
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1081	NC_016856	AAG	2	6	55134	55139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448329
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1083	NC_016856	GGC	2	6	55330	55335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448329
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1085	NC_016856	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	378448329
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1089	NC_016856	TGA	2	6	55581	55586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448329
1090	NC_016856	TGA	2	6	55707	55712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448329
1091	NC_016856	TGC	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448329
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1093	NC_016856	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
1094	NC_016856	CTG	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448329
1095	NC_016856	TGG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448329
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1097	NC_016856	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	378448329
1098	NC_016856	CAT	2	6	56047	56052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448329
1099	NC_016856	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
1100	NC_016856	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448329
1101	NC_016856	ACG	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448329
1102	NC_016856	GTT	2	6	56242	56247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448329
1103	NC_016856	GAA	2	6	56264	56269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448329
1104	NC_016856	CAA	2	6	56317	56322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448329
1105	NC_016856	AAG	2	6	56414	56419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448329
1106	NC_016856	G	6	6	56488	56493	0 %	0 %	100 %	0 %	378448329
1107	NC_016856	TGA	3	9	56497	56505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448329
1108	NC_016856	GCT	2	6	56580	56585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448329
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1112	NC_016856	GTA	2	6	56734	56739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448330
1113	NC_016856	GCA	2	6	56762	56767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448330
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1115	NC_016856	GCG	2	6	56879	56884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448330
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1119	NC_016856	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	378448330
1120	NC_016856	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448330
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1122	NC_016856	AGCGC	2	10	57234	57243	20 %	0 %	40 %	40 %	378448331
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1124	NC_016856	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	378448332
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