MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_016856	ATG	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448302
503	NC_016856	A	8	8	25115	25122	100 %	0 %	0 %	0 %	410023154
504	NC_016856	ATT	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023154
505	NC_016856	CTG	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410023154
506	NC_016856	CGG	2	6	25158	25163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023154
507	NC_016856	CCT	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410023154
508	NC_016856	ATT	2	6	25256	25261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023154
509	NC_016856	TTC	2	6	25264	25269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023154
510	NC_016856	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	410023154
511	NC_016856	CGC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023154
512	NC_016856	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	410023154
513	NC_016856	A	6	6	25370	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	410023154
514	NC_016856	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	410023154
515	NC_016856	TAT	2	6	25390	25395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023154
516	NC_016856	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	410023154
517	NC_016856	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	410023154
518	NC_016856	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	410023154
519	NC_016856	TAC	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023154
520	NC_016856	A	6	6	25667	25672	100 %	0 %	0 %	0 %	410023154
521	NC_016856	CCG	2	6	25691	25696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023154
522	NC_016856	ACG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023154
523	NC_016856	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023154
524	NC_016856	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	378448304
525	NC_016856	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
526	NC_016856	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448304
527	NC_016856	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
528	NC_016856	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	378448304
529	NC_016856	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
530	NC_016856	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448304
531	NC_016856	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448304
532	NC_016856	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
533	NC_016856	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
534	NC_016856	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448304
535	NC_016856	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
536	NC_016856	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448304
537	NC_016856	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448304
538	NC_016856	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448304
539	NC_016856	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	378448304
540	NC_016856	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448304
541	NC_016856	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448304
542	NC_016856	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448304
543	NC_016856	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448304
544	NC_016856	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
545	NC_016856	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448304
546	NC_016856	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
547	NC_016856	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
548	NC_016856	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448304
549	NC_016856	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	378448304
550	NC_016856	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
551	NC_016856	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448304
552	NC_016856	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448304
553	NC_016856	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448304
554	NC_016856	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448304
555	NC_016856	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448304
556	NC_016856	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	378448304
557	NC_016856	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448304
558	NC_016856	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	378448304
559	NC_016856	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448304
560	NC_016856	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448304
561	NC_016856	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448304
562	NC_016856	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448304
563	NC_016856	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448304
564	NC_016856	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448304
565	NC_016856	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
566	NC_016856	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448304
567	NC_016856	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448304
568	NC_016856	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448304
569	NC_016856	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	378448304
570	NC_016856	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
571	NC_016856	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448304
572	NC_016856	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448304
573	NC_016856	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448304
574	NC_016856	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448304
575	NC_016856	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	378448304
576	NC_016856	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
577	NC_016856	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
578	NC_016856	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378448304
579	NC_016856	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448304
580	NC_016856	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	378448304
581	NC_016856	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448304
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583	NC_016856	TCC	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448304
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585	NC_016856	CTG	2	6	28449	28454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448305
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587	NC_016856	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	378448305
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589	NC_016856	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	378448305
590	NC_016856	CCG	2	6	28627	28632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448305
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592	NC_016856	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	378448305
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595	NC_016856	CCG	2	6	28945	28950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448305
596	NC_016856	A	6	6	29118	29123	100 %	0 %	0 %	0 %	378448305
597	NC_016856	ATG	2	6	29284	29289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448305
598	NC_016856	ACA	2	6	29364	29369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448305
599	NC_016856	GAC	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448306
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601	NC_016856	ATG	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448306
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608	NC_016856	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	378448307
609	NC_016856	GCA	2	6	30223	30228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448307
610	NC_016856	GCG	2	6	30235	30240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448307
611	NC_016856	GCG	2	6	30261	30266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448307
612	NC_016856	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	378448307
613	NC_016856	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	378448307
614	NC_016856	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448307
615	NC_016856	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	378448308
616	NC_016856	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	378448308
617	NC_016856	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	378448308
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623	NC_016856	GGT	2	6	30786	30791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448308
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