MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	GC	3	6	239	244	0 %	0 %	50 %	50 %	378448041
2	NC_016855	GA	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	378448045
3	NC_016855	GT	3	6	4163	4168	0 %	50 %	50 %	0 %	378448047
4	NC_016855	TC	3	6	4397	4402	0 %	50 %	0 %	50 %	378448047
5	NC_016855	GT	3	6	5911	5916	0 %	50 %	50 %	0 %	378448049
6	NC_016855	GC	3	6	8046	8051	0 %	0 %	50 %	50 %	378448052
7	NC_016855	TA	3	6	9057	9062	50 %	50 %	0 %	0 %	378448053
8	NC_016855	CA	4	8	10187	10194	50 %	0 %	0 %	50 %	378448054
9	NC_016855	GC	3	6	11036	11041	0 %	0 %	50 %	50 %	378448056
10	NC_016855	GC	3	6	11108	11113	0 %	0 %	50 %	50 %	378448056
11	NC_016855	GC	3	6	11379	11384	0 %	0 %	50 %	50 %	378448056
12	NC_016855	AC	3	6	11786	11791	50 %	0 %	0 %	50 %	378448056
13	NC_016855	AC	3	6	14477	14482	50 %	0 %	0 %	50 %	378448058
14	NC_016855	CT	3	6	16978	16983	0 %	50 %	0 %	50 %	378448060
15	NC_016855	GA	3	6	17436	17441	50 %	0 %	50 %	0 %	378448060
16	NC_016855	GA	3	6	19164	19169	50 %	0 %	50 %	0 %	378448063
17	NC_016855	TG	3	6	20670	20675	0 %	50 %	50 %	0 %	378448066
18	NC_016855	GC	3	6	21217	21222	0 %	0 %	50 %	50 %	378448067
19	NC_016855	GC	3	6	21939	21944	0 %	0 %	50 %	50 %	378448068
20	NC_016855	GC	3	6	22778	22783	0 %	0 %	50 %	50 %	378448069
21	NC_016855	TC	3	6	23844	23849	0 %	50 %	0 %	50 %	378448070
22	NC_016855	TG	3	6	23870	23875	0 %	50 %	50 %	0 %	378448070
23	NC_016855	CG	3	6	23895	23900	0 %	0 %	50 %	50 %	378448070
24	NC_016855	GC	3	6	23953	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	378448070
25	NC_016855	GC	3	6	25043	25048	0 %	0 %	50 %	50 %	378448071
26	NC_016855	AT	3	6	25629	25634	50 %	50 %	0 %	0 %	378448072
27	NC_016855	AT	3	6	26646	26651	50 %	50 %	0 %	0 %	378448074
28	NC_016855	TC	3	6	26788	26793	0 %	50 %	0 %	50 %	378448074
29	NC_016855	TA	3	6	27426	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	378448075
30	NC_016855	TA	3	6	28606	28611	50 %	50 %	0 %	0 %	378448076
31	NC_016855	CT	3	6	32178	32183	0 %	50 %	0 %	50 %	378448078
32	NC_016855	AT	3	6	34517	34522	50 %	50 %	0 %	0 %	378448080
33	NC_016855	AC	4	8	36136	36143	50 %	0 %	0 %	50 %	378448081
34	NC_016855	GT	3	6	37809	37814	0 %	50 %	50 %	0 %	378448083
35	NC_016855	GC	4	8	40481	40488	0 %	0 %	50 %	50 %	378448085
36	NC_016855	CA	3	6	40615	40620	50 %	0 %	0 %	50 %	378448085
37	NC_016855	GC	3	6	41122	41127	0 %	0 %	50 %	50 %	378448086
38	NC_016855	TA	3	6	42744	42749	50 %	50 %	0 %	0 %	378448088
39	NC_016855	AT	3	6	43162	43167	50 %	50 %	0 %	0 %	378448088
40	NC_016855	TA	3	6	43945	43950	50 %	50 %	0 %	0 %	378448089
41	NC_016855	TG	3	6	44464	44469	0 %	50 %	50 %	0 %	378448089
42	NC_016855	AC	3	6	44714	44719	50 %	0 %	0 %	50 %	378448089
43	NC_016855	GA	3	6	45023	45028	50 %	0 %	50 %	0 %	378448090
44	NC_016855	CG	3	6	45868	45873	0 %	0 %	50 %	50 %	378448090
45	NC_016855	GA	3	6	45968	45973	50 %	0 %	50 %	0 %	378448090
46	NC_016855	TC	3	6	46670	46675	0 %	50 %	0 %	50 %	378448091
47	NC_016855	CG	3	6	46715	46720	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
48	NC_016855	GC	3	6	46897	46902	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
49	NC_016855	GC	3	6	47225	47230	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
50	NC_016855	GC	3	6	49531	49536	0 %	0 %	50 %	50 %	378448095
51	NC_016855	CA	4	8	49957	49964	50 %	0 %	0 %	50 %	378448095
52	NC_016855	AT	3	6	50038	50043	50 %	50 %	0 %	0 %	378448095
53	NC_016855	GC	3	6	50104	50109	0 %	0 %	50 %	50 %	378448095
54	NC_016855	GC	3	6	50226	50231	0 %	0 %	50 %	50 %	378448096
55	NC_016855	GC	3	6	52830	52835	0 %	0 %	50 %	50 %	378448099
56	NC_016855	GA	3	6	53497	53502	50 %	0 %	50 %	0 %	378448100
57	NC_016855	GT	3	6	53667	53672	0 %	50 %	50 %	0 %	378448100
58	NC_016855	AC	3	6	54527	54532	50 %	0 %	0 %	50 %	378448101
59	NC_016855	AG	3	6	55438	55443	50 %	0 %	50 %	0 %	378448103
60	NC_016855	CG	3	6	55706	55711	0 %	0 %	50 %	50 %	378448103
61	NC_016855	GC	3	6	56398	56403	0 %	0 %	50 %	50 %	378448103
62	NC_016855	TG	3	6	56568	56573	0 %	50 %	50 %	0 %	378448103
63	NC_016855	GC	3	6	57166	57171	0 %	0 %	50 %	50 %	378448103
64	NC_016855	CG	3	6	58062	58067	0 %	0 %	50 %	50 %	378448105
65	NC_016855	CG	3	6	58251	58256	0 %	0 %	50 %	50 %	378448105
66	NC_016855	TC	3	6	60488	60493	0 %	50 %	0 %	50 %	378448106
67	NC_016855	TA	4	8	61004	61011	50 %	50 %	0 %	0 %	378448107
68	NC_016855	GA	3	6	61071	61076	50 %	0 %	50 %	0 %	378448107
69	NC_016855	TC	3	6	61252	61257	0 %	50 %	0 %	50 %	378448107
70	NC_016855	TC	4	8	61981	61988	0 %	50 %	0 %	50 %	378448108
71	NC_016855	GC	3	6	62260	62265	0 %	0 %	50 %	50 %	378448109
72	NC_016855	AG	3	6	62359	62364	50 %	0 %	50 %	0 %	378448109
73	NC_016855	AT	3	6	63613	63618	50 %	50 %	0 %	0 %	378448112
74	NC_016855	TG	3	6	64421	64426	0 %	50 %	50 %	0 %	378448113
75	NC_016855	CG	3	6	65438	65443	0 %	0 %	50 %	50 %	378448114
76	NC_016855	GC	3	6	66874	66879	0 %	0 %	50 %	50 %	378448117
77	NC_016855	TC	3	6	67198	67203	0 %	50 %	0 %	50 %	378448117
78	NC_016855	TG	3	6	67659	67664	0 %	50 %	50 %	0 %	378448118
79	NC_016855	TG	3	6	67873	67878	0 %	50 %	50 %	0 %	378448119
80	NC_016855	CG	3	6	68838	68843	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
81	NC_016855	TG	3	6	68853	68858	0 %	50 %	50 %	0 %	378448120
82	NC_016855	GC	3	6	69060	69065	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
83	NC_016855	CA	3	6	69154	69159	50 %	0 %	0 %	50 %	378448120
84	NC_016855	CG	3	6	69355	69360	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
85	NC_016855	CG	3	6	70805	70810	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
86	NC_016855	GC	3	6	71512	71517	0 %	0 %	50 %	50 %	378448121
87	NC_016855	GC	3	6	71803	71808	0 %	0 %	50 %	50 %	378448122
88	NC_016855	TG	3	6	72221	72226	0 %	50 %	50 %	0 %	378448123
89	NC_016855	GC	3	6	74994	74999	0 %	0 %	50 %	50 %	378448126
90	NC_016855	GA	4	8	75097	75104	50 %	0 %	50 %	0 %	378448126
91	NC_016855	CA	3	6	75226	75231	50 %	0 %	0 %	50 %	378448126
92	NC_016855	GC	3	6	76362	76367	0 %	0 %	50 %	50 %	378448126
93	NC_016855	TC	3	6	77907	77912	0 %	50 %	0 %	50 %	378448129
94	NC_016855	TA	3	6	77989	77994	50 %	50 %	0 %	0 %	378448130
95	NC_016855	AC	3	6	78346	78351	50 %	0 %	0 %	50 %	378448130
96	NC_016855	CA	3	6	78576	78581	50 %	0 %	0 %	50 %	378448131
97	NC_016855	TG	3	6	80310	80315	0 %	50 %	50 %	0 %	378448132
98	NC_016855	CT	3	6	81009	81014	0 %	50 %	0 %	50 %	378448132
99	NC_016855	TC	3	6	81059	81064	0 %	50 %	0 %	50 %	378448132
100	NC_016855	GC	3	6	81559	81564	0 %	0 %	50 %	50 %	378448132
101	NC_016855	TG	3	6	84645	84650	0 %	50 %	50 %	0 %	378448135
102	NC_016855	CG	3	6	85022	85027	0 %	0 %	50 %	50 %	378448135
103	NC_016855	AC	3	6	85462	85467	50 %	0 %	0 %	50 %	378448135
104	NC_016855	GA	3	6	85534	85539	50 %	0 %	50 %	0 %	378448135
105	NC_016855	CA	3	6	87488	87493	50 %	0 %	0 %	50 %	378448139
106	NC_016855	CG	3	6	87775	87780	0 %	0 %	50 %	50 %	378448139
107	NC_016855	GC	3	6	88805	88810	0 %	0 %	50 %	50 %	378448139
108	NC_016855	AG	3	6	88956	88961	50 %	0 %	50 %	0 %	378448139
109	NC_016855	GA	3	6	89234	89239	50 %	0 %	50 %	0 %	378448139
110	NC_016855	CA	3	6	89547	89552	50 %	0 %	0 %	50 %	378448139
111	NC_016855	AG	3	6	92541	92546	50 %	0 %	50 %	0 %	378448140
112	NC_016855	CA	3	6	93594	93599	50 %	0 %	0 %	50 %	378448141
113	NC_016855	CG	3	6	93785	93790	0 %	0 %	50 %	50 %	378448141

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.