MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	AATCCG	2	12	1964	1975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378448045
2	NC_016855	CTGACA	2	12	4207	4218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378448047
3	NC_016855	ACATCC	2	12	4519	4530	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378448047
4	NC_016855	ACCGGC	2	12	5201	5212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378448048
5	NC_016855	ACCACG	2	12	5807	5818	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378448049
6	NC_016855	TCCCCG	2	12	6010	6021	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378448049
7	NC_016855	CCGCTC	2	12	6136	6147	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378448049
8	NC_016855	TTGGTA	2	12	9306	9317	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378448053
9	NC_016855	CACCGT	2	12	10295	10306	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378448055
10	NC_016855	TATCCA	2	12	17378	17389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448060
11	NC_016855	TTGTCC	2	12	17641	17652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378448061
12	NC_016855	TCTGTT	2	12	18365	18376	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378448062
13	NC_016855	ACAGTG	2	12	20110	20121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378448064
14	NC_016855	GACAGC	2	12	20122	20133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448064
15	NC_016855	AGCCTG	2	12	22544	22555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378448069
16	NC_016855	TTTAGA	2	12	27871	27882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378448075
17	NC_016855	ATTTTG	2	12	28803	28814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378448076
18	NC_016855	GGCGGT	2	12	28847	28858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378448076
19	NC_016855	CAGCGC	2	12	29791	29802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378448076
20	NC_016855	ATTCAT	2	12	30896	30907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378448077
21	NC_016855	ATGCTG	2	12	33020	33031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378448079
22	NC_016855	CTTACC	2	12	34480	34491	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378448080
23	NC_016855	CGCTGG	2	12	40095	40106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448085
24	NC_016855	TTTTTC	2	12	43381	43392	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378448088
25	NC_016855	AGGACG	2	12	51455	51466	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378448097
26	NC_016855	GGCGCT	2	12	55861	55872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448103
27	NC_016855	CAGGTG	2	12	55892	55903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378448103
28	NC_016855	TTTTAT	2	12	63367	63378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378448112
29	NC_016855	GCTGCC	2	12	64679	64690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378448114
30	NC_016855	GTGCCG	2	12	65168	65179	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448114
31	NC_016855	ACAGTT	2	12	80587	80598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378448132
32	NC_016855	ATGAAA	2	12	83189	83200	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378448134
33	NC_016855	TAACTC	2	12	83587	83598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448134
34	NC_016855	ACAGCC	2	12	86165	86176	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378448135
35	NC_016855	AGCGGG	2	12	88505	88516	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378448139
36	NC_016855	ATGTGG	2	12	89927	89938	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378448139
37	NC_016855	ACGATG	2	12	92450	92461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378448140
38	NC_016855	GTGCTG	2	12	92927	92938	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378448140

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.