MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580

Total Repeats: 2770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016854	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378443456
2	NC_016854	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378443457
3	NC_016854	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378443458
4	NC_016854	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378443460
5	NC_016854	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	378443462
6	NC_016854	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	378443467
7	NC_016854	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	378443468
8	NC_016854	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	378443472
9	NC_016854	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	378443472
10	NC_016854	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	378443472
11	NC_016854	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	378443473
12	NC_016854	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	378443473
13	NC_016854	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	378443474
14	NC_016854	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	378443475
15	NC_016854	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	378443475
16	NC_016854	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	378443476
17	NC_016854	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	378443477
18	NC_016854	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	378443481
19	NC_016854	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	378443481
20	NC_016854	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	378443482
21	NC_016854	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	378443483
22	NC_016854	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	378443484
23	NC_016854	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	378443485
24	NC_016854	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	378443487
25	NC_016854	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	378443487
26	NC_016854	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	378443488
27	NC_016854	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	378443489
28	NC_016854	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	378443490
29	NC_016854	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	378443493
30	NC_016854	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	378443493
31	NC_016854	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	378443494
32	NC_016854	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	378443496
33	NC_016854	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	378443496
34	NC_016854	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	378443496
35	NC_016854	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	378443496
36	NC_016854	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	378443500
37	NC_016854	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	378443501
38	NC_016854	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	378443501
39	NC_016854	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	378443502
40	NC_016854	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	378443503
41	NC_016854	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	378443505
42	NC_016854	GGAAA	2	10	59739	59748	60 %	0 %	40 %	0 %	378443505
43	NC_016854	CGCTG	2	10	60229	60238	0 %	20 %	40 %	40 %	378443506
44	NC_016854	GCCTG	2	10	64788	64797	0 %	20 %	40 %	40 %	378443509
45	NC_016854	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	378443510
46	NC_016854	CGTGC	2	10	71365	71374	0 %	20 %	40 %	40 %	378443516
47	NC_016854	TTGAT	2	10	71535	71544	20 %	60 %	20 %	0 %	378443516
48	NC_016854	ACCGC	2	10	72095	72104	20 %	0 %	20 %	60 %	378443516
49	NC_016854	CGATG	2	10	77758	77767	20 %	20 %	40 %	20 %	378443521
50	NC_016854	GCGAA	2	10	78699	78708	40 %	0 %	40 %	20 %	378443521
51	NC_016854	CGTAC	2	10	79589	79598	20 %	20 %	20 %	40 %	378443521
52	NC_016854	TTGCC	2	10	81225	81234	0 %	40 %	20 %	40 %	378443523
53	NC_016854	CGTCC	2	10	81335	81344	0 %	20 %	20 %	60 %	378443523
54	NC_016854	TTCAG	2	10	84452	84461	20 %	40 %	20 %	20 %	378443526
55	NC_016854	GGCCA	2	10	84601	84610	20 %	0 %	40 %	40 %	378443526
56	NC_016854	GTACG	2	10	87172	87181	20 %	20 %	40 %	20 %	378443528
57	NC_016854	CAGAA	2	10	87885	87894	60 %	0 %	20 %	20 %	378443528
58	NC_016854	CCGCA	2	10	90004	90013	20 %	0 %	20 %	60 %	378443530
59	NC_016854	CGGTT	2	10	90509	90518	0 %	40 %	40 %	20 %	378443531
60	NC_016854	GCTCC	2	10	91645	91654	0 %	20 %	20 %	60 %	378443531
61	NC_016854	TGGCG	2	10	92289	92298	0 %	20 %	60 %	20 %	378443533
62	NC_016854	TTTCC	2	10	96203	96212	0 %	60 %	0 %	40 %	378443538
63	NC_016854	GTGGC	2	10	96772	96781	0 %	20 %	60 %	20 %	378443538
64	NC_016854	TGCAC	2	10	98689	98698	20 %	20 %	20 %	40 %	378443539
65	NC_016854	TGGCA	2	10	98758	98767	20 %	20 %	40 %	20 %	378443539
66	NC_016854	TCTGT	2	10	99084	99093	0 %	60 %	20 %	20 %	378443540
67	NC_016854	GCGCT	2	10	99394	99403	0 %	20 %	40 %	40 %	378443540
68	NC_016854	GGCGC	2	10	99808	99817	0 %	0 %	60 %	40 %	378443540
69	NC_016854	GCGAC	2	10	100121	100130	20 %	0 %	40 %	40 %	378443540
70	NC_016854	AACGT	2	10	102578	102587	40 %	20 %	20 %	20 %	378443543
71	NC_016854	CCCAA	2	10	104728	104737	40 %	0 %	0 %	60 %	378443546
72	NC_016854	TTGTT	2	10	105435	105444	0 %	80 %	20 %	0 %	378443546
73	NC_016854	GCTTC	2	10	106815	106824	0 %	40 %	20 %	40 %	378443547
74	NC_016854	TGCGT	2	10	107102	107111	0 %	40 %	40 %	20 %	378443547
75	NC_016854	TGATC	2	10	108802	108811	20 %	40 %	20 %	20 %	378443548
76	NC_016854	TGGCG	2	10	111962	111971	0 %	20 %	60 %	20 %	378443550
77	NC_016854	AGCGC	2	10	112522	112531	20 %	0 %	40 %	40 %	378443550
78	NC_016854	ACGTT	2	10	113339	113348	20 %	40 %	20 %	20 %	378443551
79	NC_016854	CCGCG	2	10	113607	113616	0 %	0 %	40 %	60 %	378443551
80	NC_016854	ACAGA	2	10	116934	116943	60 %	0 %	20 %	20 %	378443554
81	NC_016854	CAGCG	2	10	118109	118118	20 %	0 %	40 %	40 %	378443556
82	NC_016854	GCCGG	2	10	118409	118418	0 %	0 %	60 %	40 %	378443556
83	NC_016854	CGAGC	2	10	118534	118543	20 %	0 %	40 %	40 %	378443556
84	NC_016854	ATTTG	2	10	118977	118986	20 %	60 %	20 %	0 %	378443556
85	NC_016854	TTGCC	2	10	123481	123490	0 %	40 %	20 %	40 %	378443560
86	NC_016854	AGCAG	2	10	124158	124167	40 %	0 %	40 %	20 %	378443561
87	NC_016854	AGTTT	2	10	126388	126397	20 %	60 %	20 %	0 %	378443562
88	NC_016854	TCGAT	2	10	128236	128245	20 %	40 %	20 %	20 %	378443563
89	NC_016854	CGGCG	2	10	130547	130556	0 %	0 %	60 %	40 %	378443565
90	NC_016854	CGTTT	2	10	131009	131018	0 %	60 %	20 %	20 %	378443565
91	NC_016854	GACCG	2	10	132453	132462	20 %	0 %	40 %	40 %	378443567
92	NC_016854	ATTCC	2	10	136110	136119	20 %	40 %	0 %	40 %	378443570
93	NC_016854	AAAGC	2	10	138407	138416	60 %	0 %	20 %	20 %	378443572
94	NC_016854	CCGCA	2	10	138940	138949	20 %	0 %	20 %	60 %	378443572
95	NC_016854	AGTTC	2	10	141311	141320	20 %	40 %	20 %	20 %	378443574
96	NC_016854	TGCCT	2	10	141411	141420	0 %	40 %	20 %	40 %	378443575
97	NC_016854	AAGCG	2	10	146064	146073	40 %	0 %	40 %	20 %	378443578
98	NC_016854	GTTTG	2	10	147967	147976	0 %	60 %	40 %	0 %	378443580
99	NC_016854	CGTAT	2	10	149438	149447	20 %	40 %	20 %	20 %	378443581
100	NC_016854	ATCAG	2	10	151274	151283	40 %	20 %	20 %	20 %	378443583
101	NC_016854	CTGCC	2	10	153283	153292	0 %	20 %	20 %	60 %	378443584
102	NC_016854	CGGCG	2	10	156013	156022	0 %	0 %	60 %	40 %	378443587
103	NC_016854	CCGGC	2	10	159367	159376	0 %	0 %	40 %	60 %	378443590
104	NC_016854	GATCA	2	10	162685	162694	40 %	20 %	20 %	20 %	378443593
105	NC_016854	CGTCA	2	10	163431	163440	20 %	20 %	20 %	40 %	378443594
106	NC_016854	ATCCC	2	10	165131	165140	20 %	20 %	0 %	60 %	378443596
107	NC_016854	AGCGC	2	10	165839	165848	20 %	0 %	40 %	40 %	378443596
108	NC_016854	TGAGC	2	10	167688	167697	20 %	20 %	40 %	20 %	378443597
109	NC_016854	CGCAT	2	10	167950	167959	20 %	20 %	20 %	40 %	378443598
110	NC_016854	CGAAC	2	10	168679	168688	40 %	0 %	20 %	40 %	378443599
111	NC_016854	GTTCA	2	10	168945	168954	20 %	40 %	20 %	20 %	378443599
112	NC_016854	ATGAC	2	10	169911	169920	40 %	20 %	20 %	20 %	378443600
113	NC_016854	CTGGA	2	10	170501	170510	20 %	20 %	40 %	20 %	378443601
114	NC_016854	CAGAA	2	10	172620	172629	60 %	0 %	20 %	20 %	378443603
115	NC_016854	CGAAG	2	10	175491	175500	40 %	0 %	40 %	20 %	378443605
116	NC_016854	GGCAT	2	10	182770	182779	20 %	20 %	40 %	20 %	378443609
117	NC_016854	GGCCA	2	10	183192	183201	20 %	0 %	40 %	40 %	378443610
118	NC_016854	GCGCC	2	10	183205	183214	0 %	0 %	40 %	60 %	378443610
119	NC_016854	CGTTT	2	10	183707	183716	0 %	60 %	20 %	20 %	378443610
120	NC_016854	GGGGA	2	10	183759	183768	20 %	0 %	80 %	0 %	378443610
121	NC_016854	TCTGG	2	10	187384	187393	0 %	40 %	40 %	20 %	378443611
122	NC_016854	CCGCT	2	10	191035	191044	0 %	20 %	20 %	60 %	378443614
123	NC_016854	GCCCA	2	10	193587	193596	20 %	0 %	20 %	60 %	378443617
124	NC_016854	GCGCA	2	10	193992	194001	20 %	0 %	40 %	40 %	378443617
125	NC_016854	ATCGG	2	10	195383	195392	20 %	20 %	40 %	20 %	378443619
126	NC_016854	GCCGC	2	10	196593	196602	0 %	0 %	40 %	60 %	378443621
127	NC_016854	ATCCA	2	10	201943	201952	40 %	20 %	0 %	40 %	378443624
128	NC_016854	CGGCG	2	10	204060	204069	0 %	0 %	60 %	40 %	378443627
129	NC_016854	TGGTC	2	10	204926	204935	0 %	40 %	40 %	20 %	378443627
130	NC_016854	CGTCA	2	10	206624	206633	20 %	20 %	20 %	40 %	378443628
131	NC_016854	AGCGC	2	10	207575	207584	20 %	0 %	40 %	40 %	378443628
132	NC_016854	CGGCG	2	10	209489	209498	0 %	0 %	60 %	40 %	378443631
133	NC_016854	TTCGG	2	10	210369	210378	0 %	40 %	40 %	20 %	378443632
134	NC_016854	CTTGC	2	10	211378	211387	0 %	40 %	20 %	40 %	378443633
135	NC_016854	TGAGC	2	10	211790	211799	20 %	20 %	40 %	20 %	378443634
136	NC_016854	AGATC	2	10	213459	213468	40 %	20 %	20 %	20 %	378443636
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138	NC_016854	CGCGG	2	10	214065	214074	0 %	0 %	60 %	40 %	378443637
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259	NC_016854	ATTTT	2	10	424434	424443	20 %	80 %	0 %	0 %	378443843
260	NC_016854	TCCTG	2	10	428940	428949	0 %	40 %	20 %	40 %	378443847
261	NC_016854	TTGGC	2	10	429105	429114	0 %	40 %	40 %	20 %	378443847
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