MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103b complete sequence

Total Repeats: 712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016836	CGT	2	6	998	1003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828573
2	NC_016836	CGC	2	6	1080	1085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828573
3	NC_016836	GCC	2	6	1182	1187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828573
4	NC_016836	ACG	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828573
5	NC_016836	GAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828573
6	NC_016836	CGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828573
7	NC_016836	ATC	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828574
8	NC_016836	TGG	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828574
9	NC_016836	GTG	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828574
10	NC_016836	CGA	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828574
11	NC_016836	GCC	2	6	1668	1673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828574
12	NC_016836	TGA	2	6	1763	1768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828575
13	NC_016836	GCT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828575
14	NC_016836	TCT	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828575
15	NC_016836	CCG	2	6	2216	2221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828576
16	NC_016836	CGG	3	9	2228	2236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828576
17	NC_016836	CCG	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828576
18	NC_016836	TCC	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828576
19	NC_016836	GGC	2	6	2398	2403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828576
20	NC_016836	GAT	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828576
21	NC_016836	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828577
22	NC_016836	CAG	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828577
23	NC_016836	TCA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828578
24	NC_016836	GCG	2	6	3665	3670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828578
25	NC_016836	GCG	2	6	3699	3704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828578
26	NC_016836	GCA	3	9	3741	3749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828578
27	NC_016836	CCT	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828578
28	NC_016836	CCG	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828578
29	NC_016836	TCG	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828578
30	NC_016836	GCG	2	6	4226	4231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828578
31	NC_016836	CCA	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378828579
32	NC_016836	CGA	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828579
33	NC_016836	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828579
34	NC_016836	ATC	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828580
35	NC_016836	CGC	2	6	4930	4935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828580
36	NC_016836	CCT	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828580
37	NC_016836	GGC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828581
38	NC_016836	AGC	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828581
39	NC_016836	ACG	2	6	5344	5349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828581
40	NC_016836	GCA	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828581
41	NC_016836	TGG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828581
42	NC_016836	GGC	2	6	5686	5691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828581
43	NC_016836	GGC	2	6	5856	5861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828581
44	NC_016836	GGC	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828581
45	NC_016836	TCG	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828581
46	NC_016836	TCC	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828581
47	NC_016836	CGG	2	6	6278	6283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828581
48	NC_016836	GAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828581
49	NC_016836	CAG	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828581
50	NC_016836	CTT	2	6	6437	6442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828581
51	NC_016836	GTC	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828581
52	NC_016836	TGA	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828581
53	NC_016836	GGC	2	6	6534	6539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828581
54	NC_016836	AGC	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828581
55	NC_016836	GGA	2	6	6608	6613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828581
56	NC_016836	GCC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828581
57	NC_016836	GAT	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828581
58	NC_016836	AGC	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828581
59	NC_016836	CGA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828581
60	NC_016836	GCC	3	9	6739	6747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828581
61	NC_016836	CCT	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828582
62	NC_016836	GGA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828582
63	NC_016836	GCG	2	6	6989	6994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828582
64	NC_016836	GTT	2	6	7069	7074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378828582
65	NC_016836	GGA	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828583
66	NC_016836	CTT	2	6	7225	7230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828583
67	NC_016836	TTG	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378828583
68	NC_016836	CTA	2	6	7383	7388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828583
69	NC_016836	GCG	2	6	7428	7433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828583
70	NC_016836	CGA	2	6	7447	7452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828583
71	NC_016836	AAG	2	6	7484	7489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828583
72	NC_016836	GAG	2	6	7490	7495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828583
73	NC_016836	TCG	2	6	7732	7737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828583
74	NC_016836	CGA	2	6	7933	7938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828584
75	NC_016836	CGG	2	6	8056	8061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828584
76	NC_016836	TCG	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828584
77	NC_016836	CTT	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828584
78	NC_016836	GCG	2	6	8130	8135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828584
79	NC_016836	CGC	2	6	8270	8275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828584
80	NC_016836	GAT	2	6	8354	8359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828584
81	NC_016836	CTG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828584
82	NC_016836	GAT	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828584
83	NC_016836	AGT	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828584
84	NC_016836	CGG	2	6	9315	9320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
85	NC_016836	GCG	3	9	9560	9568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
86	NC_016836	TGA	3	9	9672	9680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828585
87	NC_016836	TGT	2	6	9747	9752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378828585
88	NC_016836	CGA	2	6	9765	9770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
89	NC_016836	GGC	2	6	9976	9981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
90	NC_016836	ATC	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828585
91	NC_016836	ACG	2	6	10098	10103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
92	NC_016836	GCC	2	6	10130	10135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828585
93	NC_016836	CGG	2	6	10313	10318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
94	NC_016836	CGA	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
95	NC_016836	GCG	2	6	10402	10407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
96	NC_016836	GTC	2	6	10448	10453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828585
97	NC_016836	CCA	2	6	10476	10481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378828585
98	NC_016836	GGC	2	6	10552	10557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
99	NC_016836	GGA	2	6	10567	10572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828585
100	NC_016836	GAT	2	6	10636	10641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828585
101	NC_016836	CGA	2	6	10666	10671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
102	NC_016836	TGG	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828585
103	NC_016836	AGC	2	6	10722	10727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
104	NC_016836	AGC	2	6	10761	10766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
105	NC_016836	CGC	2	6	10841	10846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828585
106	NC_016836	GGC	2	6	10912	10917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
107	NC_016836	CGA	2	6	10957	10962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
108	NC_016836	AGC	2	6	11004	11009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
109	NC_016836	GAA	2	6	11215	11220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828585
110	NC_016836	CAT	2	6	11260	11265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828585
111	NC_016836	CGA	3	9	11343	11351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
112	NC_016836	AAG	2	6	11492	11497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828585
113	NC_016836	TGG	2	6	11508	11513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828585
114	NC_016836	AGG	2	6	11541	11546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828585
115	NC_016836	CAC	2	6	11599	11604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378828585
116	NC_016836	CGA	2	6	11658	11663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
117	NC_016836	TTC	3	9	11694	11702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828585
118	NC_016836	GCC	2	6	11778	11783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828585
119	NC_016836	ACG	2	6	11807	11812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
120	NC_016836	GCG	2	6	11839	11844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
121	NC_016836	CGG	2	6	11886	11891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828585
122	NC_016836	GAG	2	6	12029	12034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828585
123	NC_016836	GAC	2	6	12119	12124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
124	NC_016836	CAT	2	6	12148	12153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828585
125	NC_016836	AGC	2	6	12198	12203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
126	NC_016836	ACA	2	6	12249	12254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378828585
127	NC_016836	AGG	2	6	12264	12269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828585
128	NC_016836	AGC	2	6	12591	12596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828585
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499	NC_016836	GCG	2	6	46086	46091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828621
500	NC_016836	CGA	2	6	46116	46121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828621

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