MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103b complete sequence

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016836	GCG	2	6	34100	34105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828610
502	NC_016836	CG	3	6	34113	34118	0 %	0 %	50 %	50 %	378828610
503	NC_016836	CGT	2	6	34126	34131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828610
504	NC_016836	GCG	2	6	34229	34234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828610
505	NC_016836	TCG	2	6	34437	34442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828610
506	NC_016836	CGG	2	6	34533	34538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828611
507	NC_016836	GCCG	2	8	34552	34559	0 %	0 %	50 %	50 %	378828611
508	NC_016836	GC	3	6	34567	34572	0 %	0 %	50 %	50 %	378828611
509	NC_016836	GCTG	2	8	34591	34598	0 %	25 %	50 %	25 %	378828611
510	NC_016836	GCG	2	6	34602	34607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828611
511	NC_016836	CGC	2	6	34656	34661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828611
512	NC_016836	CGG	3	9	34704	34712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828611
513	NC_016836	TCG	2	6	34746	34751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828611
514	NC_016836	CCG	2	6	34752	34757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828611
515	NC_016836	CTG	2	6	34758	34763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828611
516	NC_016836	GTCA	2	8	34793	34800	25 %	25 %	25 %	25 %	378828611
517	NC_016836	CAT	2	6	34819	34824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828611
518	NC_016836	CGG	3	9	34834	34842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828611
519	NC_016836	TCGA	2	8	34872	34879	25 %	25 %	25 %	25 %	378828611
520	NC_016836	TCA	2	6	34890	34895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828611
521	NC_016836	CCG	2	6	34898	34903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828611
522	NC_016836	TGC	2	6	34920	34925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828611
523	NC_016836	GACTG	2	10	35638	35647	20 %	20 %	40 %	20 %	378828612
524	NC_016836	GAA	2	6	35666	35671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828612
525	NC_016836	GGA	2	6	35698	35703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828612
526	NC_016836	TGC	2	6	35738	35743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828612
527	NC_016836	TGA	2	6	35744	35749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828612
528	NC_016836	ACG	3	9	35766	35774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828613
529	NC_016836	CGC	2	6	35795	35800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828613
530	NC_016836	GCA	2	6	35998	36003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828613
531	NC_016836	GCA	2	6	36093	36098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828613
532	NC_016836	GGACGT	2	12	36140	36151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378828613
533	NC_016836	TTCG	2	8	36155	36162	0 %	50 %	25 %	25 %	378828613
534	NC_016836	ACGTCA	2	12	36196	36207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378828613
535	NC_016836	GGA	2	6	36242	36247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828613
536	NC_016836	GC	3	6	36251	36256	0 %	0 %	50 %	50 %	378828613
537	NC_016836	AGA	2	6	36320	36325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828613
538	NC_016836	CGGAGC	2	12	37549	37560	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378828614
539	NC_016836	AAC	2	6	37571	37576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378828614
540	NC_016836	GAT	2	6	37628	37633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828614
541	NC_016836	GAAA	2	8	37683	37690	75 %	0 %	25 %	0 %	378828614
542	NC_016836	TGT	2	6	37708	37713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378828614
543	NC_016836	CTTG	2	8	37740	37747	0 %	50 %	25 %	25 %	378828614
544	NC_016836	GCG	2	6	37776	37781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828614
545	NC_016836	CGG	2	6	37903	37908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828614
546	NC_016836	TGTGG	2	10	37961	37970	0 %	40 %	60 %	0 %	378828614
547	NC_016836	AAC	2	6	37989	37994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378828614
548	NC_016836	TTGG	2	8	38042	38049	0 %	50 %	50 %	0 %	378828614
549	NC_016836	CGG	2	6	38056	38061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828614
550	NC_016836	TGG	2	6	38068	38073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828614
551	NC_016836	CGAA	2	8	38117	38124	50 %	0 %	25 %	25 %	378828614
552	NC_016836	CAA	2	6	38207	38212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378828614
553	NC_016836	GAAC	2	8	38237	38244	50 %	0 %	25 %	25 %	378828614
554	NC_016836	GCG	2	6	38281	38286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828614
555	NC_016836	GGA	2	6	38508	38513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828614
556	NC_016836	GC	3	6	38568	38573	0 %	0 %	50 %	50 %	378828614
557	NC_016836	GCGCG	2	10	38642	38651	0 %	0 %	60 %	40 %	378828614
558	NC_016836	TTGC	2	8	38688	38695	0 %	50 %	25 %	25 %	378828614
559	NC_016836	GAC	2	6	38723	38728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828614
560	NC_016836	GC	4	8	38751	38758	0 %	0 %	50 %	50 %	378828614
561	NC_016836	ACGGCG	2	12	38767	38778	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378828614
562	NC_016836	T	6	6	38790	38795	0 %	100 %	0 %	0 %	378828614
563	NC_016836	TCG	2	6	38815	38820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828614
564	NC_016836	TCC	2	6	38822	38827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828614
565	NC_016836	CGACC	2	10	38828	38837	20 %	0 %	20 %	60 %	378828614
566	NC_016836	GCG	2	6	38850	38855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828614
567	NC_016836	AAC	2	6	38917	38922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378828614
568	NC_016836	GGC	2	6	39149	39154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828615
569	NC_016836	CGG	2	6	39188	39193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828615
570	NC_016836	CGG	2	6	39196	39201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828615
571	NC_016836	GGC	2	6	39219	39224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828615
572	NC_016836	AGT	2	6	39281	39286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828615
573	NC_016836	GTG	2	6	39444	39449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828615
574	NC_016836	CG	3	6	39518	39523	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
575	NC_016836	TTG	2	6	39547	39552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378828615
576	NC_016836	TCG	3	9	39628	39636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828615
577	NC_016836	GGC	2	6	39710	39715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828615
578	NC_016836	T	6	6	39741	39746	0 %	100 %	0 %	0 %	378828615
579	NC_016836	CAG	2	6	39845	39850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828615
580	NC_016836	CCG	2	6	39879	39884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828615
581	NC_016836	GC	3	6	39907	39912	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
582	NC_016836	GA	3	6	40021	40026	50 %	0 %	50 %	0 %	378828615
583	NC_016836	TGC	2	6	40049	40054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828615
584	NC_016836	GAT	2	6	40070	40075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828615
585	NC_016836	GTT	2	6	40131	40136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378828615
586	NC_016836	TGC	2	6	40147	40152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828615
587	NC_016836	CG	3	6	40172	40177	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
588	NC_016836	GC	3	6	40201	40206	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
589	NC_016836	ATC	2	6	40236	40241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828615
590	NC_016836	CG	3	6	40340	40345	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
591	NC_016836	CAA	2	6	40433	40438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378828615
592	NC_016836	GC	3	6	40503	40508	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
593	NC_016836	GCC	2	6	40564	40569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828615
594	NC_016836	T	6	6	40597	40602	0 %	100 %	0 %	0 %	378828615
595	NC_016836	GCA	2	6	40656	40661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828615
596	NC_016836	TAG	2	6	40666	40671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828615
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598	NC_016836	GCC	2	6	41197	41202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828616
599	NC_016836	CTT	2	6	41216	41221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828616
600	NC_016836	CCT	2	6	41276	41281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828616
601	NC_016836	GGA	2	6	41326	41331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828616
602	NC_016836	CG	3	6	41421	41426	0 %	0 %	50 %	50 %	378828616
603	NC_016836	ATC	2	6	41456	41461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828616
604	NC_016836	CGG	2	6	41473	41478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828616
605	NC_016836	GTGG	2	8	41485	41492	0 %	25 %	75 %	0 %	378828616
606	NC_016836	ATC	2	6	41577	41582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828616
607	NC_016836	GAAC	2	8	41607	41614	50 %	0 %	25 %	25 %	378828616
608	NC_016836	GTC	2	6	41672	41677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828616
609	NC_016836	GTTG	2	8	41683	41690	0 %	50 %	50 %	0 %	378828616
610	NC_016836	ACG	2	6	41718	41723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828616
611	NC_016836	ATG	2	6	41732	41737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828616
612	NC_016836	ACC	2	6	41741	41746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378828616
613	NC_016836	GCAT	2	8	41785	41792	25 %	25 %	25 %	25 %	378828616
614	NC_016836	GTG	2	6	41837	41842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828616
615	NC_016836	GCC	2	6	41852	41857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828616
616	NC_016836	CGG	3	9	41914	41922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828616
617	NC_016836	CTGG	2	8	41939	41946	0 %	25 %	50 %	25 %	378828616
618	NC_016836	AGG	2	6	41949	41954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828616
619	NC_016836	TTC	2	6	41990	41995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828616
620	NC_016836	CGG	3	9	42039	42047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828616
621	NC_016836	ACC	2	6	42056	42061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378828616
622	NC_016836	CGG	2	6	42064	42069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828616
623	NC_016836	AC	3	6	42070	42075	50 %	0 %	0 %	50 %	378828616
624	NC_016836	ACG	2	6	42096	42101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828616
625	NC_016836	GCG	2	6	42145	42150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828616
626	NC_016836	GGC	2	6	42161	42166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828616
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628	NC_016836	GCC	2	6	42233	42238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828616
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751	NC_016836	ATG	2	6	48068	48073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828621
752	NC_016836	CGA	2	6	48117	48122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828621
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