MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016832	CG	3	6	184634	184639	0 %	0 %	50 %	50 %	378958305
3503	NC_016832	AAG	2	6	184670	184675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958305
3504	NC_016832	GCG	2	6	184700	184705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958305
3505	NC_016832	ATC	2	6	184708	184713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958305
3506	NC_016832	CGG	2	6	184790	184795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958305
3507	NC_016832	AGA	2	6	184887	184892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958305
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3509	NC_016832	ATG	2	6	184946	184951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958305
3510	NC_016832	TGG	2	6	184958	184963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958305
3511	NC_016832	GAC	2	6	185023	185028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958305
3512	NC_016832	TCG	2	6	185096	185101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958305
3513	NC_016832	GAA	2	6	185166	185171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958305
3514	NC_016832	ACT	2	6	185174	185179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958305
3515	NC_016832	GAAA	2	8	185256	185263	75 %	0 %	25 %	0 %	378958305
3516	NC_016832	CGG	2	6	185382	185387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958305
3517	NC_016832	CGG	2	6	185406	185411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958305
3518	NC_016832	GCT	2	6	185415	185420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958305
3519	NC_016832	CCAT	2	8	185477	185484	25 %	25 %	0 %	50 %	378958305
3520	NC_016832	GGC	2	6	185517	185522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958305
3521	NC_016832	GAA	3	9	185568	185576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958305
3522	NC_016832	ATG	2	6	185667	185672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958306
3523	NC_016832	GCA	2	6	185709	185714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958306
3524	NC_016832	TGTC	2	8	185752	185759	0 %	50 %	25 %	25 %	378958306
3525	NC_016832	AT	3	6	185865	185870	50 %	50 %	0 %	0 %	378958307
3526	NC_016832	GGCAT	2	10	185917	185926	20 %	20 %	40 %	20 %	378958307
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3530	NC_016832	GGC	2	6	186054	186059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958307
3531	NC_016832	GCA	2	6	186068	186073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958307
3532	NC_016832	TGA	2	6	186081	186086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958307
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3534	NC_016832	GCC	2	6	186108	186113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958307
3535	NC_016832	TCA	2	6	186310	186315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958308
3536	NC_016832	GGCCA	2	10	186339	186348	20 %	0 %	40 %	40 %	378958308
3537	NC_016832	CGT	2	6	186367	186372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958308
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3539	NC_016832	TTGG	2	8	186468	186475	0 %	50 %	50 %	0 %	378958308
3540	NC_016832	GTAA	2	8	186538	186545	50 %	25 %	25 %	0 %	378958308
3541	NC_016832	CTG	2	6	186551	186556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958308
3542	NC_016832	GCAT	2	8	186570	186577	25 %	25 %	25 %	25 %	378958308
3543	NC_016832	GCC	2	6	186639	186644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958308
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3545	NC_016832	TCT	2	6	186699	186704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958308
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3547	NC_016832	GCC	2	6	186820	186825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958308
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3551	NC_016832	GGC	2	6	186893	186898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958308
3552	NC_016832	GGGGA	2	10	186906	186915	20 %	0 %	80 %	0 %	378958308
3553	NC_016832	ATG	2	6	187013	187018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958309
3554	NC_016832	CG	3	6	187035	187040	0 %	0 %	50 %	50 %	378958309
3555	NC_016832	GCG	3	9	187038	187046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958309
3556	NC_016832	GCT	2	6	187177	187182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
3557	NC_016832	GGCG	2	8	187207	187214	0 %	0 %	75 %	25 %	378958309
3558	NC_016832	TC	3	6	187218	187223	0 %	50 %	0 %	50 %	378958309
3559	NC_016832	TGT	2	6	187227	187232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958309
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3563	NC_016832	CTG	2	6	187304	187309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
3564	NC_016832	CGC	2	6	187310	187315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958309
3565	NC_016832	CGA	2	6	187320	187325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958309
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3591	NC_016832	TGA	2	6	187981	187986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958309
3592	NC_016832	TGG	2	6	188020	188025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958309
3593	NC_016832	GTC	2	6	188028	188033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
3594	NC_016832	CGG	2	6	188038	188043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958309
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3597	NC_016832	TGGC	2	8	188268	188275	0 %	25 %	50 %	25 %	378958309
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3607	NC_016832	ACC	2	6	189231	189236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958310
3608	NC_016832	CTG	2	6	189270	189275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
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3618	NC_016832	CAAA	2	8	189665	189672	75 %	0 %	0 %	25 %	378958310
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3620	NC_016832	GTG	2	6	189720	189725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958310
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3983	NC_016832	GAT	2	6	208079	208084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958328
3984	NC_016832	CTTGC	2	10	208259	208268	0 %	40 %	20 %	40 %	378958328
3985	NC_016832	GGC	2	6	208434	208439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958329
3986	NC_016832	CAG	2	6	208479	208484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958329
3987	NC_016832	GTC	2	6	208509	208514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958329
3988	NC_016832	TTCA	2	8	208530	208537	25 %	50 %	0 %	25 %	378958329
3989	NC_016832	GGCAAT	2	12	208548	208559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378958329
3990	NC_016832	TCA	2	6	208610	208615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958329
3991	NC_016832	GCT	2	6	208643	208648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958329
3992	NC_016832	TGAGC	2	10	208671	208680	20 %	20 %	40 %	20 %	378958329
3993	NC_016832	AAT	2	6	208701	208706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958329
3994	NC_016832	CGA	2	6	208715	208720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958329
3995	NC_016832	CCA	2	6	208745	208750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958329
3996	NC_016832	GCT	2	6	208769	208774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958329
3997	NC_016832	CGC	2	6	208847	208852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958329
3998	NC_016832	AG	3	6	208890	208895	50 %	0 %	50 %	0 %	378958329
3999	NC_016832	TGTC	2	8	208914	208921	0 %	50 %	25 %	25 %	378958329
4000	NC_016832	CGT	2	6	209129	209134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958329

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