MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016832	CCCG	2	8	157698	157705	0 %	0 %	25 %	75 %	378958280
3002	NC_016832	TGA	2	6	157710	157715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958280
3003	NC_016832	ATG	2	6	157766	157771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958280
3004	NC_016832	GAA	2	6	157805	157810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958280
3005	NC_016832	TCT	2	6	157829	157834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958280
3006	NC_016832	GCT	2	6	157837	157842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958280
3007	NC_016832	GC	4	8	157863	157870	0 %	0 %	50 %	50 %	378958280
3008	NC_016832	CGG	2	6	157890	157895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958280
3009	NC_016832	CT	3	6	157984	157989	0 %	50 %	0 %	50 %	378958280
3010	NC_016832	ACG	2	6	158004	158009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958280
3011	NC_016832	GTT	2	6	158024	158029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958280
3012	NC_016832	GCA	2	6	158089	158094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958280
3013	NC_016832	CAG	2	6	158114	158119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958280
3014	NC_016832	A	6	6	158148	158153	100 %	0 %	0 %	0 %	378958280
3015	NC_016832	GGC	2	6	158188	158193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958280
3016	NC_016832	AAGC	2	8	158234	158241	50 %	0 %	25 %	25 %	378958280
3017	NC_016832	GAT	2	6	158348	158353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958281
3018	NC_016832	CAAA	2	8	158354	158361	75 %	0 %	0 %	25 %	378958281
3019	NC_016832	AC	3	6	158402	158407	50 %	0 %	0 %	50 %	378958281
3020	NC_016832	A	6	6	158412	158417	100 %	0 %	0 %	0 %	378958281
3021	NC_016832	TCG	2	6	158465	158470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958281
3022	NC_016832	ATG	2	6	158557	158562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958281
3023	NC_016832	GCT	2	6	158592	158597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958281
3024	NC_016832	ATGG	2	8	158658	158665	25 %	25 %	50 %	0 %	378958281
3025	NC_016832	CTG	2	6	158688	158693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958281
3026	NC_016832	A	6	6	158727	158732	100 %	0 %	0 %	0 %	378958281
3027	NC_016832	CGAT	2	8	158842	158849	25 %	25 %	25 %	25 %	378958281
3028	NC_016832	CAG	2	6	158852	158857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958281
3029	NC_016832	GGC	2	6	158973	158978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958281
3030	NC_016832	GTT	2	6	158997	159002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958281
3031	NC_016832	TTCG	2	8	159051	159058	0 %	50 %	25 %	25 %	378958281
3032	NC_016832	TG	3	6	159094	159099	0 %	50 %	50 %	0 %	378958281
3033	NC_016832	ATT	2	6	159108	159113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958281
3034	NC_016832	GAC	2	6	159213	159218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958281
3035	NC_016832	TTA	2	6	159608	159613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958282
3036	NC_016832	CGC	2	6	159655	159660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958282
3037	NC_016832	GAC	2	6	159682	159687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958282
3038	NC_016832	CGT	2	6	159746	159751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958282
3039	NC_016832	CTTT	2	8	159809	159816	0 %	75 %	0 %	25 %	378958282
3040	NC_016832	CAT	2	6	159872	159877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958282
3041	NC_016832	AGG	2	6	159915	159920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958282
3042	NC_016832	CGC	2	6	159924	159929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958282
3043	NC_016832	CGC	2	6	159941	159946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958282
3044	NC_016832	TAT	2	6	160103	160108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958283
3045	NC_016832	ATT	2	6	160118	160123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958283
3046	NC_016832	CGT	2	6	160161	160166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958283
3047	NC_016832	TTA	2	6	160186	160191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958283
3048	NC_016832	AG	3	6	160286	160291	50 %	0 %	50 %	0 %	378958283
3049	NC_016832	GGT	2	6	160313	160318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958283
3050	NC_016832	AAC	2	6	160530	160535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958283
3051	NC_016832	GCCA	2	8	160595	160602	25 %	0 %	25 %	50 %	378958283
3052	NC_016832	AAC	2	6	160641	160646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958283
3053	NC_016832	ACA	2	6	160672	160677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958283
3054	NC_016832	TGG	2	6	160726	160731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958283
3055	NC_016832	CGC	2	6	160768	160773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958283
3056	NC_016832	ATT	2	6	160776	160781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958283
3057	NC_016832	CCGGC	2	10	160783	160792	0 %	0 %	40 %	60 %	378958283
3058	NC_016832	A	6	6	160815	160820	100 %	0 %	0 %	0 %	378958283
3059	NC_016832	AGA	2	6	160859	160864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958283
3060	NC_016832	TGA	2	6	160901	160906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958283
3061	NC_016832	GC	3	6	160911	160916	0 %	0 %	50 %	50 %	378958283
3062	NC_016832	AAG	2	6	160969	160974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958283
3063	NC_016832	CCG	2	6	161038	161043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958283
3064	NC_016832	GC	4	8	161048	161055	0 %	0 %	50 %	50 %	378958283
3065	NC_016832	TCA	2	6	161104	161109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958283
3066	NC_016832	TTG	2	6	161110	161115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958283
3067	NC_016832	AAG	2	6	161185	161190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958283
3068	NC_016832	ACT	2	6	161242	161247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958283
3069	NC_016832	CGG	2	6	161284	161289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958283
3070	NC_016832	TCTA	2	8	161313	161320	25 %	50 %	0 %	25 %	378958283
3071	NC_016832	CGT	2	6	161333	161338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958283
3072	NC_016832	GAT	2	6	161357	161362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958283
3073	NC_016832	A	6	6	161404	161409	100 %	0 %	0 %	0 %	378958283
3074	NC_016832	AG	3	6	161505	161510	50 %	0 %	50 %	0 %	378958283
3075	NC_016832	GCG	2	6	161598	161603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958283
3076	NC_016832	CGCTG	2	10	161675	161684	0 %	20 %	40 %	40 %	378958283
3077	NC_016832	GAA	2	6	161697	161702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958283
3078	NC_016832	CGG	2	6	161759	161764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958283
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3080	NC_016832	TTC	2	6	161852	161857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958283
3081	NC_016832	ATG	2	6	161922	161927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958283
3082	NC_016832	CTG	2	6	162039	162044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958283
3083	NC_016832	ATG	3	9	162049	162057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958283
3084	NC_016832	CTG	2	6	162102	162107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958283
3085	NC_016832	CCG	2	6	162183	162188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958283
3086	NC_016832	GAG	2	6	162300	162305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958283
3087	NC_016832	AGA	2	6	162356	162361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958283
3088	NC_016832	GGT	2	6	162362	162367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958283
3089	NC_016832	ATG	2	6	162378	162383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958283
3090	NC_016832	TGC	2	6	162406	162411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958283
3091	NC_016832	GGC	2	6	162443	162448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958283
3092	NC_016832	CGC	2	6	162539	162544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958283
3093	NC_016832	GCA	2	6	162668	162673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958283
3094	NC_016832	GCC	2	6	162696	162701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958283
3095	NC_016832	GCC	2	6	162717	162722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958283
3096	NC_016832	A	6	6	162971	162976	100 %	0 %	0 %	0 %	378958284
3097	NC_016832	ACG	2	6	163011	163016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958284
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3100	NC_016832	CGG	2	6	163075	163080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958284
3101	NC_016832	ATT	2	6	163165	163170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958284
3102	NC_016832	AAG	2	6	163257	163262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958284
3103	NC_016832	CCG	2	6	163313	163318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958284
3104	NC_016832	ATT	2	6	163331	163336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958284
3105	NC_016832	TTA	2	6	163394	163399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958285
3106	NC_016832	GCG	2	6	163446	163451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958285
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3108	NC_016832	CAG	2	6	163583	163588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958285
3109	NC_016832	GCA	2	6	163719	163724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958285
3110	NC_016832	TCT	2	6	163728	163733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958285
3111	NC_016832	CGA	2	6	163783	163788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958285
3112	NC_016832	TCT	2	6	163983	163988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958285
3113	NC_016832	TCG	2	6	164146	164151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958285
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3116	NC_016832	GTC	2	6	164291	164296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958285
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3119	NC_016832	GCG	2	6	164562	164567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958286
3120	NC_016832	GGA	2	6	164615	164620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958286
3121	NC_016832	ATT	2	6	164636	164641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958286
3122	NC_016832	GAACC	2	10	164642	164651	40 %	0 %	20 %	40 %	378958286
3123	NC_016832	TGA	2	6	164723	164728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958286
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3125	NC_016832	CGG	2	6	164797	164802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958286
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3127	NC_016832	CGC	2	6	165028	165033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958286
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3135	NC_016832	TATT	2	8	165352	165359	25 %	75 %	0 %	0 %	378958286
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3227	NC_016832	ACC	2	6	170763	170768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958293
3228	NC_016832	TGA	2	6	170811	170816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958293
3229	NC_016832	TGAGC	2	10	170833	170842	20 %	20 %	40 %	20 %	378958293
3230	NC_016832	TGT	2	6	170898	170903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958294
3231	NC_016832	GGCG	2	8	170969	170976	0 %	0 %	75 %	25 %	378958294
3232	NC_016832	ATG	2	6	170979	170984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958294
3233	NC_016832	TGA	2	6	171022	171027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958294
3234	NC_016832	TGA	2	6	171064	171069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958294
3235	NC_016832	CGCAT	2	10	171095	171104	20 %	20 %	20 %	40 %	378958294
3236	NC_016832	CCA	2	6	171114	171119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958294
3237	NC_016832	GAT	2	6	171242	171247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958294
3238	NC_016832	GTT	2	6	171286	171291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958294
3239	NC_016832	GA	3	6	171536	171541	50 %	0 %	50 %	0 %	378958295
3240	NC_016832	GC	4	8	171546	171553	0 %	0 %	50 %	50 %	378958295
3241	NC_016832	GC	3	6	171567	171572	0 %	0 %	50 %	50 %	378958295
3242	NC_016832	ATG	2	6	171713	171718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958295
3243	NC_016832	CGAAC	2	10	171824	171833	40 %	0 %	20 %	40 %	378958295
3244	NC_016832	GAT	2	6	171841	171846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958295
3245	NC_016832	GAT	2	6	171888	171893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958295
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3249	NC_016832	GTTCA	2	10	172090	172099	20 %	40 %	20 %	20 %	378958295
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3364	NC_016832	TGC	2	6	177881	177886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958301
3365	NC_016832	CAT	2	6	177895	177900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958301
3366	NC_016832	CCAA	2	8	178483	178490	50 %	0 %	0 %	50 %	378958302
3367	NC_016832	AGC	3	9	178509	178517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958302
3368	NC_016832	CCT	2	6	178608	178613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958302
3369	NC_016832	CGAAG	2	10	178636	178645	40 %	0 %	40 %	20 %	378958302
3370	NC_016832	TTG	2	6	178649	178654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958302
3371	NC_016832	TCG	2	6	178657	178662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958302
3372	NC_016832	GCG	2	6	178668	178673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958302
3373	NC_016832	AGC	2	6	178688	178693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958302
3374	NC_016832	TGG	2	6	178719	178724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958302
3375	NC_016832	TTA	2	6	178798	178803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958302
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3378	NC_016832	CAC	2	6	178853	178858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958302
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3380	NC_016832	TGC	2	6	179043	179048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958302
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3383	NC_016832	CGT	2	6	179183	179188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958302
3384	NC_016832	CGC	2	6	179201	179206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958302
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3388	NC_016832	CAT	2	6	179656	179661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958303
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3390	NC_016832	GC	3	6	179671	179676	0 %	0 %	50 %	50 %	378958303
3391	NC_016832	A	6	6	179681	179686	100 %	0 %	0 %	0 %	378958303
3392	NC_016832	GGC	2	6	179699	179704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958303
3393	NC_016832	ATG	2	6	179739	179744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958303
3394	NC_016832	TTC	2	6	179759	179764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958303
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3396	NC_016832	GGC	2	6	179786	179791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958303
3397	NC_016832	TC	3	6	179817	179822	0 %	50 %	0 %	50 %	378958303
3398	NC_016832	CG	3	6	179837	179842	0 %	0 %	50 %	50 %	378958303
3399	NC_016832	GTC	2	6	179853	179858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958303
3400	NC_016832	CT	3	6	179909	179914	0 %	50 %	0 %	50 %	378958303
3401	NC_016832	CGGCGA	2	12	180073	180084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378958303
3402	NC_016832	GATG	2	8	180085	180092	25 %	25 %	50 %	0 %	378958303
3403	NC_016832	GCTG	2	8	180242	180249	0 %	25 %	50 %	25 %	378958303
3404	NC_016832	CTG	2	6	180290	180295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958303
3405	NC_016832	TGA	2	6	180327	180332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958303
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3407	NC_016832	CTT	2	6	180397	180402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958303
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3417	NC_016832	CGTG	2	8	180883	180890	0 %	25 %	50 %	25 %	378958303
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3425	NC_016832	GCG	2	6	181130	181135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958303
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3430	NC_016832	GCA	2	6	181303	181308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958303
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3435	NC_016832	CAG	2	6	181494	181499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958303
3436	NC_016832	GCT	2	6	181570	181575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958303
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3465	NC_016832	ACG	2	6	183029	183034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958304
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3467	NC_016832	CG	3	6	183172	183177	0 %	0 %	50 %	50 %	378958304
3468	NC_016832	GCT	2	6	183190	183195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958304
3469	NC_016832	GCGG	2	8	183196	183203	0 %	0 %	75 %	25 %	378958304
3470	NC_016832	TGC	2	6	183218	183223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958304
3471	NC_016832	GAA	2	6	183262	183267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958304
3472	NC_016832	TGA	2	6	183323	183328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958304
3473	NC_016832	CAG	2	6	183388	183393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958304
3474	NC_016832	TCA	2	6	183446	183451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958304
3475	NC_016832	GCT	2	6	183466	183471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958304
3476	NC_016832	CT	3	6	183498	183503	0 %	50 %	0 %	50 %	378958304
3477	NC_016832	A	6	6	183532	183537	100 %	0 %	0 %	0 %	378958304
3478	NC_016832	TGG	2	6	183578	183583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958304
3479	NC_016832	AAG	2	6	183607	183612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958304
3480	NC_016832	ACC	2	6	183640	183645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958304
3481	NC_016832	A	6	6	183652	183657	100 %	0 %	0 %	0 %	378958304
3482	NC_016832	GGT	2	6	183694	183699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958304
3483	NC_016832	CGG	2	6	183720	183725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958304
3484	NC_016832	TGA	2	6	183839	183844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958304
3485	NC_016832	TC	3	6	183851	183856	0 %	50 %	0 %	50 %	378958304
3486	NC_016832	TTTC	2	8	183857	183864	0 %	75 %	0 %	25 %	378958304
3487	NC_016832	ACC	2	6	183866	183871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958304
3488	NC_016832	CAA	2	6	183915	183920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958304
3489	NC_016832	TGT	2	6	183923	183928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958304
3490	NC_016832	ATG	2	6	184153	184158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958305
3491	NC_016832	GGGC	2	8	184193	184200	0 %	0 %	75 %	25 %	378958305
3492	NC_016832	ACA	2	6	184268	184273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958305
3493	NC_016832	GCT	2	6	184320	184325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958305
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3495	NC_016832	GCTG	2	8	184359	184366	0 %	25 %	50 %	25 %	378958305
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3497	NC_016832	CTGG	2	8	184456	184463	0 %	25 %	50 %	25 %	378958305
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