MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016832	TGC	2	6	107019	107024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
2003	NC_016832	ATA	2	6	107157	107162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958235
2004	NC_016832	CGG	2	6	107169	107174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958235
2005	NC_016832	TGG	2	6	107194	107199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958235
2006	NC_016832	TTC	2	6	107390	107395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958235
2007	NC_016832	CAC	2	6	107420	107425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958235
2008	NC_016832	AGG	2	6	107452	107457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958235
2009	NC_016832	GCT	2	6	107500	107505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
2010	NC_016832	CCA	2	6	107539	107544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958235
2011	NC_016832	TCA	2	6	107628	107633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958235
2012	NC_016832	TGA	2	6	107697	107702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958235
2013	NC_016832	GGC	2	6	107725	107730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958235
2014	NC_016832	TGA	2	6	107907	107912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958235
2015	NC_016832	TGG	2	6	107935	107940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958235
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2017	NC_016832	T	6	6	107960	107965	0 %	100 %	0 %	0 %	378958235
2018	NC_016832	TATT	2	8	107975	107982	25 %	75 %	0 %	0 %	378958236
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2022	NC_016832	CTG	2	6	108300	108305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958237
2023	NC_016832	T	6	6	108381	108386	0 %	100 %	0 %	0 %	378958237
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2044	NC_016832	TAT	2	6	109344	109349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958238
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2050	NC_016832	CG	3	6	109491	109496	0 %	0 %	50 %	50 %	378958238
2051	NC_016832	CGC	2	6	109581	109586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958238
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2055	NC_016832	ACC	2	6	109712	109717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958238
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2063	NC_016832	GC	3	6	109986	109991	0 %	0 %	50 %	50 %	378958239
2064	NC_016832	ATCA	2	8	109995	110002	50 %	25 %	0 %	25 %	378958239
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2093	NC_016832	CGGCAG	2	12	111384	111395	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378958239
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2117	NC_016832	CGA	2	6	112204	112209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958239
2118	NC_016832	CAT	2	6	112214	112219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958239
2119	NC_016832	GCTC	2	8	112292	112299	0 %	25 %	25 %	50 %	378958239
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2121	NC_016832	TCGA	2	8	112341	112348	25 %	25 %	25 %	25 %	378958239
2122	NC_016832	TTC	2	6	112431	112436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958239
2123	NC_016832	TCT	2	6	112477	112482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958239
2124	NC_016832	GC	3	6	112572	112577	0 %	0 %	50 %	50 %	378958239
2125	NC_016832	CATC	2	8	112628	112635	25 %	25 %	0 %	50 %	378958239
2126	NC_016832	CAA	2	6	112637	112642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958239
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2138	NC_016832	CCGCG	2	10	113404	113413	0 %	0 %	40 %	60 %	378958240
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2232	NC_016832	GT	3	6	119065	119070	0 %	50 %	50 %	0 %	378958245
2233	NC_016832	TGC	2	6	119075	119080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958245
2234	NC_016832	GAC	2	6	119128	119133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958245
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2236	NC_016832	CGC	2	6	119240	119245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958245
2237	NC_016832	TCT	2	6	119341	119346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958245
2238	NC_016832	CAGCG	2	10	119523	119532	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
2239	NC_016832	ATCA	2	8	119564	119571	50 %	25 %	0 %	25 %	378958246
2240	NC_016832	GC	3	6	119650	119655	0 %	0 %	50 %	50 %	378958246
2241	NC_016832	GCCA	2	8	119657	119664	25 %	0 %	25 %	50 %	378958246
2242	NC_016832	GCG	2	6	119746	119751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958246
2243	NC_016832	CAG	2	6	119777	119782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2244	NC_016832	CGA	2	6	119815	119820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2245	NC_016832	GCCGG	2	10	119823	119832	0 %	0 %	60 %	40 %	378958246
2246	NC_016832	GCC	2	6	119870	119875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2247	NC_016832	AC	3	6	119930	119935	50 %	0 %	0 %	50 %	378958246
2248	NC_016832	CGAGC	2	10	119948	119957	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
2249	NC_016832	TCC	2	6	119994	119999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958246
2250	NC_016832	GCC	2	6	120011	120016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2251	NC_016832	GCG	2	6	120057	120062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958246
2252	NC_016832	CTG	2	6	120098	120103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2253	NC_016832	GTT	2	6	120133	120138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958246
2254	NC_016832	AGT	3	9	120161	120169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958246
2255	NC_016832	GCC	2	6	120182	120187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2256	NC_016832	GC	3	6	120221	120226	0 %	0 %	50 %	50 %	378958246
2257	NC_016832	GGCG	2	8	120269	120276	0 %	0 %	75 %	25 %	378958246
2258	NC_016832	GCT	2	6	120287	120292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2259	NC_016832	TCGCCG	2	12	120321	120332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378958246
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2261	NC_016832	ATTTG	2	10	120391	120400	20 %	60 %	20 %	0 %	378958246
2262	NC_016832	GTCA	2	8	120419	120426	25 %	25 %	25 %	25 %	378958246
2263	NC_016832	GAC	2	6	120554	120559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2264	NC_016832	TGC	2	6	120564	120569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2265	NC_016832	CG	3	6	120579	120584	0 %	0 %	50 %	50 %	378958246
2266	NC_016832	GCC	2	6	120605	120610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2267	NC_016832	GGTTCA	2	12	120622	120633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378958246
2268	NC_016832	GCG	2	6	120666	120671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958246
2269	NC_016832	AGT	2	6	120693	120698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958246
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2272	NC_016832	TGT	2	6	121069	121074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958247
2273	NC_016832	CTG	2	6	121092	121097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
2274	NC_016832	GCG	2	6	121101	121106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2275	NC_016832	GGC	2	6	121185	121190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2276	NC_016832	CGG	2	6	121220	121225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2277	NC_016832	GCG	2	6	121234	121239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2278	NC_016832	CGA	2	6	121265	121270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958247
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2280	NC_016832	GCC	2	6	121335	121340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958247
2281	NC_016832	GC	5	10	121396	121405	0 %	0 %	50 %	50 %	378958247
2282	NC_016832	CAC	2	6	121533	121538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958247
2283	NC_016832	GCT	2	6	121595	121600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
2284	NC_016832	CTGG	2	8	121602	121609	0 %	25 %	50 %	25 %	378958247
2285	NC_016832	TGC	2	6	121636	121641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
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2289	NC_016832	CAC	2	6	121914	121919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958247
2290	NC_016832	CGG	2	6	121979	121984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
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2310	NC_016832	TCG	2	6	122638	122643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
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2312	NC_016832	CAATTG	2	12	122699	122710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378958247
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2314	NC_016832	ATCG	2	8	123160	123167	25 %	25 %	25 %	25 %	378958248
2315	NC_016832	AT	3	6	123186	123191	50 %	50 %	0 %	0 %	378958248
2316	NC_016832	TAA	3	9	123225	123233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958248
2317	NC_016832	TGTC	2	8	123246	123253	0 %	50 %	25 %	25 %	378958248
2318	NC_016832	AT	3	6	123263	123268	50 %	50 %	0 %	0 %	378958248
2319	NC_016832	CCG	2	6	123277	123282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958248
2320	NC_016832	TCA	2	6	123291	123296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958248
2321	NC_016832	GGT	2	6	123323	123328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958248
2322	NC_016832	GC	3	6	123427	123432	0 %	0 %	50 %	50 %	378958248
2323	NC_016832	ATC	2	6	123463	123468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958248
2324	NC_016832	CTG	2	6	123517	123522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958248
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2329	NC_016832	CAG	2	6	123703	123708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958248
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2332	NC_016832	CTG	2	6	124028	124033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958249
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2338	NC_016832	TAT	2	6	124207	124212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958249
2339	NC_016832	CTGG	2	8	124243	124250	0 %	25 %	50 %	25 %	378958249
2340	NC_016832	GCT	2	6	124306	124311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958249
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2345	NC_016832	GCT	3	9	124555	124563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958249
2346	NC_016832	TGC	2	6	124575	124580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958249
2347	NC_016832	GGCT	2	8	124592	124599	0 %	25 %	50 %	25 %	378958249
2348	NC_016832	GGC	2	6	124605	124610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958249
2349	NC_016832	TGG	2	6	124716	124721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958249
2350	NC_016832	TAG	2	6	124879	124884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958250
2351	NC_016832	TTGCC	2	10	124895	124904	0 %	40 %	20 %	40 %	378958250
2352	NC_016832	CGTC	2	8	124913	124920	0 %	25 %	25 %	50 %	378958250
2353	NC_016832	CGA	3	9	124923	124931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958250
2354	NC_016832	CGC	2	6	124951	124956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958250
2355	NC_016832	TCGC	2	8	124996	125003	0 %	25 %	25 %	50 %	378958250
2356	NC_016832	CAG	3	9	125074	125082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958250
2357	NC_016832	GC	3	6	125107	125112	0 %	0 %	50 %	50 %	378958250
2358	NC_016832	CCG	2	6	125135	125140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958250
2359	NC_016832	GCTG	2	8	125214	125221	0 %	25 %	50 %	25 %	378958250
2360	NC_016832	TGC	2	6	125264	125269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958250
2361	NC_016832	ATT	2	6	125290	125295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958250
2362	NC_016832	GCG	2	6	125331	125336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958250
2363	NC_016832	CAA	2	6	125407	125412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958250
2364	NC_016832	CGC	2	6	125427	125432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958250
2365	NC_016832	CGC	2	6	125457	125462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958250
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2486	NC_016832	CGG	2	6	131125	131130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958258
2487	NC_016832	GCG	2	6	131133	131138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958258
2488	NC_016832	TGCG	2	8	131160	131167	0 %	25 %	50 %	25 %	378958258
2489	NC_016832	GAC	2	6	131182	131187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958258
2490	NC_016832	TGG	2	6	131206	131211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958258
2491	NC_016832	ATT	2	6	131243	131248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958258
2492	NC_016832	CTTCCG	2	12	131320	131331	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378958258
2493	NC_016832	CAC	2	6	131360	131365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958258
2494	NC_016832	CCG	3	9	131410	131418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958258
2495	NC_016832	CG	3	6	131417	131422	0 %	0 %	50 %	50 %	378958258
2496	NC_016832	GC	3	6	131538	131543	0 %	0 %	50 %	50 %	378958258
2497	NC_016832	GAT	2	6	131576	131581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958258
2498	NC_016832	GCG	2	6	131629	131634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958258
2499	NC_016832	TCT	2	6	131640	131645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958258
2500	NC_016832	GAC	2	6	131657	131662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958258

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