MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016832	TGA	2	6	53732	53737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958182
1003	NC_016832	T	6	6	53781	53786	0 %	100 %	0 %	0 %	378958182
1004	NC_016832	TGA	2	6	53850	53855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1005	NC_016832	GCG	2	6	53904	53909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958183
1006	NC_016832	GAT	3	9	53951	53959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1007	NC_016832	CAT	2	6	53968	53973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958183
1008	NC_016832	A	6	6	53984	53989	100 %	0 %	0 %	0 %	378958183
1009	NC_016832	A	7	7	53993	53999	100 %	0 %	0 %	0 %	378958183
1010	NC_016832	ATG	2	6	54012	54017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1011	NC_016832	GCA	2	6	54036	54041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1012	NC_016832	CCG	2	6	54204	54209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958183
1013	NC_016832	GCC	2	6	54239	54244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958183
1014	NC_016832	CAT	2	6	54343	54348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958183
1015	NC_016832	CG	3	6	54350	54355	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
1016	NC_016832	GT	3	6	54412	54417	0 %	50 %	50 %	0 %	378958183
1017	NC_016832	GCGGAA	2	12	54437	54448	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378958183
1018	NC_016832	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	378958183
1019	NC_016832	ACC	2	6	54572	54577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958183
1020	NC_016832	CTG	2	6	54758	54763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1021	NC_016832	GAC	2	6	54872	54877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1022	NC_016832	CTG	2	6	55007	55012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1023	NC_016832	GC	3	6	55023	55028	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
1024	NC_016832	A	6	6	55041	55046	100 %	0 %	0 %	0 %	378958183
1025	NC_016832	GCA	2	6	55048	55053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1026	NC_016832	CG	3	6	55097	55102	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
1027	NC_016832	AAG	2	6	55131	55136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958183
1028	NC_016832	GCT	2	6	55303	55308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1029	NC_016832	GGC	2	6	55327	55332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958183
1030	NC_016832	GTG	2	6	55378	55383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958183
1031	NC_016832	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	378958183
1032	NC_016832	CCA	2	6	55473	55478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958183
1033	NC_016832	TCC	2	6	55571	55576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958183
1034	NC_016832	TGA	2	6	55578	55583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1035	NC_016832	CGC	2	6	55692	55697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958183
1036	NC_016832	TGA	2	6	55704	55709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1037	NC_016832	TGC	2	6	55798	55803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1038	NC_016832	TCG	2	6	55813	55818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1039	NC_016832	CG	3	6	55831	55836	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
1040	NC_016832	CTG	2	6	55841	55846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1041	NC_016832	TGG	2	6	55899	55904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958183
1042	NC_016832	GCA	2	6	55942	55947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1043	NC_016832	CAT	2	6	56044	56049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958183
1044	NC_016832	CG	3	6	56086	56091	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
1045	NC_016832	TGA	2	6	56170	56175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1046	NC_016832	ACG	2	6	56232	56237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958183
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1049	NC_016832	CAA	2	6	56314	56319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958183
1050	NC_016832	AAG	2	6	56411	56416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958183
1051	NC_016832	G	6	6	56485	56490	0 %	0 %	100 %	0 %	378958183
1052	NC_016832	TGA	3	9	56494	56502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1053	NC_016832	GCT	2	6	56577	56582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958183
1054	NC_016832	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	378958183
1055	NC_016832	AAC	2	6	56667	56672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958183
1056	NC_016832	TGA	2	6	56684	56689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958183
1057	NC_016832	GTA	2	6	56731	56736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958184
1058	NC_016832	GCA	2	6	56759	56764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958184
1059	NC_016832	TCC	2	6	56774	56779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958184
1060	NC_016832	TGA	2	6	56939	56944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958184
1061	NC_016832	ATT	2	6	56995	57000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958184
1062	NC_016832	GGC	2	6	57001	57006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958184
1063	NC_016832	GC	3	6	57005	57010	0 %	0 %	50 %	50 %	378958184
1064	NC_016832	TGC	2	6	57126	57131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958184
1065	NC_016832	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	378958185
1066	NC_016832	GAT	2	6	57398	57403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958185
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1071	NC_016832	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	378958185
1072	NC_016832	CGC	2	6	57544	57549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958185
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1081	NC_016832	TGG	2	6	58220	58225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958186
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1083	NC_016832	TCG	2	6	58355	58360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958186
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1089	NC_016832	CGA	2	6	58527	58532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958186
1090	NC_016832	GCG	2	6	58534	58539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958186
1091	NC_016832	AGG	2	6	58547	58552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958186
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1094	NC_016832	GAA	2	6	58681	58686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958186
1095	NC_016832	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	378958187
1096	NC_016832	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	378958188
1097	NC_016832	GAA	2	6	59195	59200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958188
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1100	NC_016832	CACGAA	2	12	59347	59358	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378958188
1101	NC_016832	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	378958188
1102	NC_016832	G	6	6	59505	59510	0 %	0 %	100 %	0 %	378958188
1103	NC_016832	AGC	2	6	59607	59612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958188
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1105	NC_016832	TGC	2	6	59705	59710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958188
1106	NC_016832	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	378958188
1107	NC_016832	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	378958188
1108	NC_016832	TAT	2	6	59848	59853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958188
1109	NC_016832	CGC	2	6	59886	59891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958188
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1111	NC_016832	TGA	2	6	60205	60210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958189
1112	NC_016832	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	378958189
1113	NC_016832	C	6	6	60240	60245	0 %	0 %	0 %	100 %	378958189
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1115	NC_016832	A	6	6	60294	60299	100 %	0 %	0 %	0 %	378958189
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1120	NC_016832	TG	3	6	60720	60725	0 %	50 %	50 %	0 %	378958189
1121	NC_016832	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	378958189
1122	NC_016832	GTA	2	6	60837	60842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958189
1123	NC_016832	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	378958189
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1125	NC_016832	TGGCGC	2	12	61014	61025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378958189
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1500	NC_016832	CTGAAG	2	12	78912	78923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378958205

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