MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016832	GAA	2	6	321927	321932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958428
6002	NC_016832	AGC	2	6	321933	321938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958428
6003	NC_016832	CGG	2	6	321987	321992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958428
6004	NC_016832	TGA	2	6	322038	322043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958428
6005	NC_016832	TGC	2	6	322056	322061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958428
6006	NC_016832	TGA	2	6	322094	322099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958428
6007	NC_016832	GAA	2	6	322107	322112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958428
6008	NC_016832	CCA	2	6	322137	322142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958428
6009	NC_016832	AC	3	6	322253	322258	50 %	0 %	0 %	50 %	378958428
6010	NC_016832	AAG	2	6	322283	322288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958428
6011	NC_016832	T	7	7	322344	322350	0 %	100 %	0 %	0 %	378958429
6012	NC_016832	TGT	2	6	322399	322404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958429
6013	NC_016832	CAT	2	6	322434	322439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958429
6014	NC_016832	GAG	2	6	322453	322458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958429
6015	NC_016832	GCG	2	6	322462	322467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958429
6016	NC_016832	ACAG	2	8	322499	322506	50 %	0 %	25 %	25 %	378958429
6017	NC_016832	GC	3	6	322513	322518	0 %	0 %	50 %	50 %	378958429
6018	NC_016832	TGC	2	6	322519	322524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958429
6019	NC_016832	CCG	2	6	322586	322591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958429
6020	NC_016832	CGC	2	6	322606	322611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958429
6021	NC_016832	CAG	3	9	322632	322640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958429
6022	NC_016832	TCC	2	6	322642	322647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958429
6023	NC_016832	CAG	2	6	322671	322676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958429
6024	NC_016832	ACC	2	6	322696	322701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958429
6025	NC_016832	CCA	2	6	322745	322750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958429
6026	NC_016832	CGG	2	6	322783	322788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958429
6027	NC_016832	GCA	2	6	322796	322801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958429
6028	NC_016832	TTC	2	6	322824	322829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958429
6029	NC_016832	GCGTG	2	10	322844	322853	0 %	20 %	60 %	20 %	378958429
6030	NC_016832	CGC	2	6	322857	322862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958429
6031	NC_016832	TAAT	2	8	322874	322881	50 %	50 %	0 %	0 %	378958429
6032	NC_016832	TCG	2	6	322906	322911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958429
6033	NC_016832	GAACGG	2	12	322928	322939	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378958429
6034	NC_016832	GCC	2	6	323059	323064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958429
6035	NC_016832	TGC	2	6	323068	323073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958429
6036	NC_016832	TGC	3	9	323457	323465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958430
6037	NC_016832	GGC	2	6	323466	323471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958430
6038	NC_016832	ATC	2	6	323491	323496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958430
6039	NC_016832	GGGC	2	8	323504	323511	0 %	0 %	75 %	25 %	378958430
6040	NC_016832	C	6	6	323550	323555	0 %	0 %	0 %	100 %	378958430
6041	NC_016832	GTC	2	6	323581	323586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958430
6042	NC_016832	CGG	2	6	323598	323603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958430
6043	NC_016832	CAGG	2	8	323650	323657	25 %	0 %	50 %	25 %	378958430
6044	NC_016832	TGG	2	6	323742	323747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958430
6045	NC_016832	TGG	2	6	323969	323974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958430
6046	NC_016832	CCA	2	6	323984	323989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958430
6047	NC_016832	CG	3	6	324007	324012	0 %	0 %	50 %	50 %	378958430
6048	NC_016832	TGC	2	6	324126	324131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958430
6049	NC_016832	GCC	2	6	324133	324138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958430
6050	NC_016832	CGC	2	6	324150	324155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958430
6051	NC_016832	TCA	2	6	324156	324161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958430
6052	NC_016832	GCG	2	6	324175	324180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958430
6053	NC_016832	CGG	2	6	324247	324252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958431
6054	NC_016832	GAC	2	6	324311	324316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6055	NC_016832	GGT	2	6	324421	324426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958431
6056	NC_016832	GATGC	2	10	324428	324437	20 %	20 %	40 %	20 %	378958431
6057	NC_016832	GGT	2	6	324455	324460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958431
6058	NC_016832	TGCGT	2	10	324532	324541	0 %	40 %	40 %	20 %	378958431
6059	NC_016832	TCG	2	6	324633	324638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6060	NC_016832	CTG	2	6	324665	324670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6061	NC_016832	GGC	2	6	324767	324772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958431
6062	NC_016832	GCG	2	6	324849	324854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958431
6063	NC_016832	CTG	2	6	324866	324871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6064	NC_016832	GTG	2	6	324872	324877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958431
6065	NC_016832	GCT	2	6	324913	324918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6066	NC_016832	GAC	2	6	324955	324960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6067	NC_016832	GGC	2	6	325004	325009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958431
6068	NC_016832	ATCG	2	8	325049	325056	25 %	25 %	25 %	25 %	378958431
6069	NC_016832	CGG	2	6	325057	325062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958431
6070	NC_016832	TGG	2	6	325068	325073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958431
6071	NC_016832	TGA	2	6	325236	325241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958431
6072	NC_016832	GC	3	6	325278	325283	0 %	0 %	50 %	50 %	378958431
6073	NC_016832	CTG	2	6	325295	325300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6074	NC_016832	CGG	2	6	325369	325374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958431
6075	NC_016832	TTG	2	6	325461	325466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958431
6076	NC_016832	GCT	2	6	325534	325539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958431
6077	NC_016832	CGT	2	6	325583	325588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958432
6078	NC_016832	GTC	2	6	325589	325594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958432
6079	NC_016832	T	6	6	325595	325600	0 %	100 %	0 %	0 %	378958432
6080	NC_016832	TGGA	2	8	325605	325612	25 %	25 %	50 %	0 %	378958432
6081	NC_016832	TGC	2	6	325656	325661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958432
6082	NC_016832	GCT	2	6	325681	325686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958432
6083	NC_016832	GTT	2	6	325696	325701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958432
6084	NC_016832	TATCGG	2	12	325708	325719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378958432
6085	NC_016832	ACC	2	6	325880	325885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958432
6086	NC_016832	TTA	2	6	325917	325922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958432
6087	NC_016832	GCCA	2	8	325994	326001	25 %	0 %	25 %	50 %	378958432
6088	NC_016832	GGC	2	6	326018	326023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958432
6089	NC_016832	GCT	2	6	326137	326142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958432
6090	NC_016832	CGC	2	6	326172	326177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958432
6091	NC_016832	GCA	2	6	326188	326193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958432
6092	NC_016832	GCC	2	6	326409	326414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958433
6093	NC_016832	AAT	2	6	326437	326442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958433
6094	NC_016832	TG	3	6	326519	326524	0 %	50 %	50 %	0 %	378958433
6095	NC_016832	GC	4	8	326574	326581	0 %	0 %	50 %	50 %	378958433
6096	NC_016832	TGC	2	6	326619	326624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958433
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6099	NC_016832	GCT	2	6	326689	326694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958433
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6101	NC_016832	CGT	2	6	326714	326719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958433
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6104	NC_016832	GCTTCC	2	12	326981	326992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378958434
6105	NC_016832	CTTTT	2	10	326995	327004	0 %	80 %	0 %	20 %	378958434
6106	NC_016832	CCA	2	6	327018	327023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958434
6107	NC_016832	CATAAG	2	12	327054	327065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378958434
6108	NC_016832	CG	3	6	327077	327082	0 %	0 %	50 %	50 %	378958434
6109	NC_016832	GCT	2	6	327135	327140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958434
6110	NC_016832	GGC	2	6	327226	327231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958434
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6114	NC_016832	CAT	2	6	327379	327384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958434
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6118	NC_016832	ATC	2	6	327562	327567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958434
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6120	NC_016832	AGC	2	6	327638	327643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958434
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6237	NC_016832	CG	3	6	333642	333647	0 %	0 %	50 %	50 %	378958437
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6364	NC_016832	AATG	2	8	339837	339844	50 %	25 %	25 %	0 %	378958442
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6393	NC_016832	CGT	2	6	341326	341331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958443
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6485	NC_016832	GGC	2	6	346607	346612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958447
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