MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59118	NC_016832	CTG	2	6	3310229	3310234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961408
59119	NC_016832	TAA	2	6	3310279	3310284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378961408
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59232	NC_016832	CTA	2	6	3316980	3316985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378961418
59233	NC_016832	TTA	2	6	3317031	3317036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378961418
59234	NC_016832	GC	3	6	3317099	3317104	0 %	0 %	50 %	50 %	378961418
59235	NC_016832	CGC	2	6	3317127	3317132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961418
59236	NC_016832	GCG	2	6	3317166	3317171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378961418
59237	NC_016832	A	6	6	3317179	3317184	100 %	0 %	0 %	0 %	378961418
59238	NC_016832	CTG	2	6	3317197	3317202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961418
59239	NC_016832	GGT	2	6	3317280	3317285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378961418
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59241	NC_016832	ATTA	2	8	3317543	3317550	50 %	50 %	0 %	0 %	378961419
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59245	NC_016832	CCG	2	6	3318023	3318028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961419
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59247	NC_016832	CCG	2	6	3318143	3318148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961419
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59252	NC_016832	GCC	2	6	3318318	3318323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961420
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59261	NC_016832	CGC	2	6	3318886	3318891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961420
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59263	NC_016832	T	8	8	3319152	3319159	0 %	100 %	0 %	0 %	378961421
59264	NC_016832	TGC	2	6	3319198	3319203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961421
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59271	NC_016832	CAAC	2	8	3319454	3319461	50 %	0 %	0 %	50 %	378961421
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59301	NC_016832	CGTC	2	8	3320773	3320780	0 %	25 %	25 %	50 %	378961421
59302	NC_016832	CCG	2	6	3320858	3320863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961421
59303	NC_016832	A	6	6	3320978	3320983	100 %	0 %	0 %	0 %	378961421
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59309	NC_016832	A	6	6	3321303	3321308	100 %	0 %	0 %	0 %	378961421
59310	NC_016832	GCA	2	6	3321347	3321352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378961421
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59313	NC_016832	CGCTA	2	10	3321576	3321585	20 %	20 %	20 %	40 %	378961422
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59318	NC_016832	CGG	2	6	3321746	3321751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378961422
59319	NC_016832	ATC	2	6	3321762	3321767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378961422
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59324	NC_016832	GC	3	6	3321961	3321966	0 %	0 %	50 %	50 %	378961422
59325	NC_016832	GGT	2	6	3321998	3322003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378961422
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59327	NC_016832	CTA	2	6	3322126	3322131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378961422
59328	NC_016832	CTGC	2	8	3322132	3322139	0 %	25 %	25 %	50 %	378961422
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59330	NC_016832	CTGGC	2	10	3322182	3322191	0 %	20 %	40 %	40 %	378961422
59331	NC_016832	GCA	2	6	3322216	3322221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378961422
59332	NC_016832	GCT	2	6	3322309	3322314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961422
59333	NC_016832	ATG	2	6	3322325	3322330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378961422
59334	NC_016832	CTG	2	6	3322331	3322336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961422
59335	NC_016832	CCA	2	6	3322473	3322478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378961422
59336	NC_016832	TGT	2	6	3323179	3323184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378961423
59337	NC_016832	GCA	2	6	3323294	3323299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378961423
59338	NC_016832	TTTC	2	8	3323369	3323376	0 %	75 %	0 %	25 %	378961423
59339	NC_016832	GAT	2	6	3323429	3323434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378961423
59340	NC_016832	GCC	2	6	3323460	3323465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961423
59341	NC_016832	GAA	3	9	3323484	3323492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378961423
59342	NC_016832	CAG	2	6	3323496	3323501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378961423
59343	NC_016832	CCAA	2	8	3323535	3323542	50 %	0 %	0 %	50 %	378961423
59344	NC_016832	CTC	2	6	3323570	3323575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378961423
59345	NC_016832	CGG	2	6	3323611	3323616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378961423
59346	NC_016832	CG	3	6	3323626	3323631	0 %	0 %	50 %	50 %	378961423
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59348	NC_016832	GAC	2	6	3323685	3323690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378961423
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59464	NC_016832	GCA	2	6	3329810	3329815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378961425
59465	NC_016832	CCG	2	6	3329824	3329829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961425
59466	NC_016832	GCT	2	6	3329927	3329932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961425
59467	NC_016832	GCC	2	6	3329986	3329991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961425
59468	NC_016832	CTG	2	6	3330033	3330038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961425
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59470	NC_016832	TCG	2	6	3330047	3330052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961425
59471	NC_016832	CAT	2	6	3330248	3330253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378961425
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59473	NC_016832	CGA	2	6	3330281	3330286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378961425
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59475	NC_016832	ACTCA	2	10	3330333	3330342	40 %	20 %	0 %	40 %	378961425
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59482	NC_016832	TCC	2	6	3330675	3330680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378961426
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59486	NC_016832	CTG	2	6	3330902	3330907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378961426
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59488	NC_016832	CTGG	2	8	3331000	3331007	0 %	25 %	50 %	25 %	378961426
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59490	NC_016832	TGGG	2	8	3331020	3331027	0 %	25 %	75 %	0 %	378961426
59491	NC_016832	CGC	2	6	3331059	3331064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961426
59492	NC_016832	GC	3	6	3331077	3331082	0 %	0 %	50 %	50 %	378961426
59493	NC_016832	TGG	3	9	3331089	3331097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378961426
59494	NC_016832	CCG	2	6	3331125	3331130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961426
59495	NC_016832	T	6	6	3331186	3331191	0 %	100 %	0 %	0 %	378961426
59496	NC_016832	GCC	2	6	3331235	3331240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378961426
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