MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016832	CGACAC	2	12	260457	260468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378958371
5002	NC_016832	GCG	2	6	260570	260575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958371
5003	NC_016832	CAG	2	6	260596	260601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958371
5004	NC_016832	GGT	2	6	260719	260724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958371
5005	NC_016832	TCT	2	6	260729	260734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958371
5006	NC_016832	GAT	2	6	260752	260757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958371
5007	NC_016832	CAA	2	6	260778	260783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958371
5008	NC_016832	TACGG	2	10	260788	260797	20 %	20 %	40 %	20 %	378958371
5009	NC_016832	ACA	2	6	260828	260833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958371
5010	NC_016832	GAC	2	6	260950	260955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958371
5011	NC_016832	GACG	2	8	261009	261016	25 %	0 %	50 %	25 %	378958371
5012	NC_016832	TAC	2	6	261070	261075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958371
5013	NC_016832	GTGG	2	8	261126	261133	0 %	25 %	75 %	0 %	378958371
5014	NC_016832	GGC	2	6	261172	261177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958371
5015	NC_016832	GGT	2	6	261211	261216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958371
5016	NC_016832	CGTG	2	8	261225	261232	0 %	25 %	50 %	25 %	378958371
5017	NC_016832	GAT	4	12	261298	261309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958371
5018	NC_016832	GAT	2	6	261346	261351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958371
5019	NC_016832	GGT	2	6	261358	261363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958371
5020	NC_016832	TTA	2	6	261392	261397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958371
5021	NC_016832	TCA	2	6	261410	261415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958371
5022	NC_016832	CCT	2	6	261443	261448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958371
5023	NC_016832	TCT	2	6	261449	261454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958371
5024	NC_016832	TCT	2	6	261593	261598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958371
5025	NC_016832	TTA	2	6	261810	261815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958372
5026	NC_016832	GCT	2	6	261855	261860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958372
5027	NC_016832	AGA	2	6	261910	261915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958372
5028	NC_016832	A	6	6	261970	261975	100 %	0 %	0 %	0 %	378958372
5029	NC_016832	TCG	2	6	262115	262120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958372
5030	NC_016832	GAA	2	6	262128	262133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958372
5031	NC_016832	CAA	2	6	262136	262141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958372
5032	NC_016832	A	6	6	262170	262175	100 %	0 %	0 %	0 %	378958372
5033	NC_016832	TGG	2	6	262201	262206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958372
5034	NC_016832	ACA	2	6	262228	262233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958372
5035	NC_016832	TCA	2	6	262357	262362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958373
5036	NC_016832	CAA	2	6	262387	262392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958373
5037	NC_016832	GCG	2	6	262500	262505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958373
5038	NC_016832	CG	3	6	262535	262540	0 %	0 %	50 %	50 %	378958373
5039	NC_016832	TAC	2	6	262559	262564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958373
5040	NC_016832	TGAT	2	8	262600	262607	25 %	50 %	25 %	0 %	378958373
5041	NC_016832	TCG	2	6	262708	262713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958373
5042	NC_016832	A	6	6	262715	262720	100 %	0 %	0 %	0 %	378958373
5043	NC_016832	TCCAG	2	10	262801	262810	20 %	20 %	20 %	40 %	378958373
5044	NC_016832	ATT	2	6	262890	262895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958373
5045	NC_016832	ACC	2	6	262923	262928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958373
5046	NC_016832	GAT	2	6	262947	262952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958373
5047	NC_016832	ATT	2	6	262974	262979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958373
5048	NC_016832	CGT	2	6	263006	263011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958373
5049	NC_016832	GGC	2	6	263088	263093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958373
5050	NC_016832	CTC	2	6	263189	263194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958373
5051	NC_016832	CAA	2	6	263213	263218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958373
5052	NC_016832	CTG	2	6	263233	263238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958373
5053	NC_016832	TGA	2	6	263245	263250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958373
5054	NC_016832	TGA	2	6	263255	263260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958373
5055	NC_016832	CAA	2	6	263301	263306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958373
5056	NC_016832	ACT	2	6	263421	263426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958374
5057	NC_016832	GAA	2	6	263514	263519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958374
5058	NC_016832	TGCG	2	8	263530	263537	0 %	25 %	50 %	25 %	378958374
5059	NC_016832	TAT	2	6	263688	263693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958374
5060	NC_016832	TGA	2	6	263705	263710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958374
5061	NC_016832	GC	3	6	263712	263717	0 %	0 %	50 %	50 %	378958374
5062	NC_016832	GGT	2	6	263729	263734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958374
5063	NC_016832	GAT	2	6	263747	263752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958374
5064	NC_016832	TG	3	6	263828	263833	0 %	50 %	50 %	0 %	378958374
5065	NC_016832	ATG	2	6	263844	263849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958374
5066	NC_016832	TG	3	6	263848	263853	0 %	50 %	50 %	0 %	378958374
5067	NC_016832	TGAT	2	8	263878	263885	25 %	50 %	25 %	0 %	378958375
5068	NC_016832	TTG	2	6	263968	263973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958375
5069	NC_016832	GTGAA	2	10	264082	264091	40 %	20 %	40 %	0 %	378958375
5070	NC_016832	CTG	2	6	264222	264227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958375
5071	NC_016832	GGTA	2	8	264260	264267	25 %	25 %	50 %	0 %	378958375
5072	NC_016832	CAA	2	6	264284	264289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958375
5073	NC_016832	GAT	2	6	264318	264323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958375
5074	NC_016832	ATC	2	6	264330	264335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958375
5075	NC_016832	TCA	2	6	264353	264358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958375
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5077	NC_016832	TGG	2	6	264511	264516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958375
5078	NC_016832	TGT	2	6	264538	264543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958375
5079	NC_016832	CGA	2	6	264563	264568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958375
5080	NC_016832	CG	3	6	264646	264651	0 %	0 %	50 %	50 %	378958375
5081	NC_016832	GGC	2	6	264667	264672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958376
5082	NC_016832	GC	3	6	264755	264760	0 %	0 %	50 %	50 %	378958376
5083	NC_016832	TTG	2	6	264858	264863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958376
5084	NC_016832	TTG	2	6	264887	264892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958376
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5087	NC_016832	CATT	2	8	265015	265022	25 %	50 %	0 %	25 %	378958376
5088	NC_016832	CCGT	2	8	265031	265038	0 %	25 %	25 %	50 %	378958376
5089	NC_016832	ATGCC	2	10	265173	265182	20 %	20 %	20 %	40 %	378958376
5090	NC_016832	GCG	2	6	265202	265207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958376
5091	NC_016832	CG	3	6	265206	265211	0 %	0 %	50 %	50 %	378958376
5092	NC_016832	TGC	2	6	265317	265322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958376
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5094	NC_016832	A	6	6	265389	265394	100 %	0 %	0 %	0 %	378958376
5095	NC_016832	GC	3	6	265445	265450	0 %	0 %	50 %	50 %	378958376
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5099	NC_016832	CTG	2	6	265613	265618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958376
5100	NC_016832	CAG	2	6	265751	265756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958376
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5102	NC_016832	CA	3	6	265829	265834	50 %	0 %	0 %	50 %	378958377
5103	NC_016832	TGG	2	6	265877	265882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958377
5104	NC_016832	CCG	3	9	265895	265903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958377
5105	NC_016832	TCG	2	6	265928	265933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958377
5106	NC_016832	A	6	6	265948	265953	100 %	0 %	0 %	0 %	378958377
5107	NC_016832	CGT	2	6	265966	265971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958377
5108	NC_016832	CG	3	6	266023	266028	0 %	0 %	50 %	50 %	378958377
5109	NC_016832	TGA	2	6	266043	266048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958377
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5111	NC_016832	GC	3	6	266085	266090	0 %	0 %	50 %	50 %	378958377
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5121	NC_016832	GGC	2	6	266690	266695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958378
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5185	NC_016832	TGA	2	6	269708	269713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958378
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5238	NC_016832	T	6	6	274120	274125	0 %	100 %	0 %	0 %	378958381
5239	NC_016832	GGC	2	6	274126	274131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958381
5240	NC_016832	GCT	2	6	274179	274184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958381
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5242	NC_016832	TGA	3	9	274367	274375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958381
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5359	NC_016832	ATTA	2	8	281488	281495	50 %	50 %	0 %	0 %	378958390
5360	NC_016832	TCT	2	6	281507	281512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958390
5361	NC_016832	TTCA	2	8	281566	281573	25 %	50 %	0 %	25 %	378958390
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5486	NC_016832	TGG	2	6	293407	293412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958398
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5490	NC_016832	GCG	2	6	293635	293640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958399
5491	NC_016832	GCTC	2	8	293715	293722	0 %	25 %	25 %	50 %	378958399
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5499	NC_016832	AT	3	6	294025	294030	50 %	50 %	0 %	0 %	378958399
5500	NC_016832	CGT	2	6	294069	294074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958399

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