MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016832	GCG	2	6	234854	234859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958349
4502	NC_016832	CGA	2	6	234890	234895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
4503	NC_016832	CGC	2	6	234930	234935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
4504	NC_016832	GC	3	6	234934	234939	0 %	0 %	50 %	50 %	378958349
4505	NC_016832	GC	3	6	235028	235033	0 %	0 %	50 %	50 %	378958349
4506	NC_016832	CAG	2	6	235050	235055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
4507	NC_016832	AGC	2	6	235076	235081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
4508	NC_016832	TCG	2	6	235142	235147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958349
4509	NC_016832	GC	3	6	235238	235243	0 %	0 %	50 %	50 %	378958349
4510	NC_016832	AT	3	6	235342	235347	50 %	50 %	0 %	0 %	378958349
4511	NC_016832	GCC	2	6	235407	235412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
4512	NC_016832	CGC	2	6	235445	235450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
4513	NC_016832	TCG	2	6	235734	235739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958350
4514	NC_016832	CGC	2	6	235760	235765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958350
4515	NC_016832	GGC	2	6	235782	235787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4516	NC_016832	GC	3	6	235865	235870	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
4517	NC_016832	T	6	6	235950	235955	0 %	100 %	0 %	0 %	378958350
4518	NC_016832	CGG	2	6	235980	235985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4519	NC_016832	GC	3	6	236009	236014	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
4520	NC_016832	GGA	2	6	236016	236021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958350
4521	NC_016832	TGG	2	6	236038	236043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958350
4522	NC_016832	CGG	2	6	236067	236072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4523	NC_016832	CGGCG	2	10	236208	236217	0 %	0 %	60 %	40 %	378958350
4524	NC_016832	CT	3	6	236224	236229	0 %	50 %	0 %	50 %	378958350
4525	NC_016832	GCG	2	6	236230	236235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4526	NC_016832	CGC	2	6	236243	236248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958350
4527	NC_016832	TAT	2	6	236265	236270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
4528	NC_016832	TCA	2	6	236333	236338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958350
4529	NC_016832	ATT	2	6	236380	236385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
4530	NC_016832	TAT	2	6	236445	236450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
4531	NC_016832	TGC	2	6	236486	236491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958350
4532	NC_016832	GGC	2	6	236521	236526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4533	NC_016832	A	6	6	236533	236538	100 %	0 %	0 %	0 %	378958350
4534	NC_016832	GCG	2	6	236552	236557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4535	NC_016832	CGG	2	6	236562	236567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4536	NC_016832	TTGA	2	8	236587	236594	25 %	50 %	25 %	0 %	378958350
4537	NC_016832	CGGCAG	2	12	236597	236608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378958350
4538	NC_016832	GCG	2	6	236609	236614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4539	NC_016832	CGC	2	6	236634	236639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958350
4540	NC_016832	CTG	2	6	236665	236670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958350
4541	NC_016832	TTA	2	6	236678	236683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
4542	NC_016832	ACG	2	6	236695	236700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958350
4543	NC_016832	TGCTT	2	10	236702	236711	0 %	60 %	20 %	20 %	378958350
4544	NC_016832	TTC	2	6	236712	236717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958350
4545	NC_016832	GC	3	6	236720	236725	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
4546	NC_016832	G	6	6	236727	236732	0 %	0 %	100 %	0 %	378958350
4547	NC_016832	GCT	2	6	236763	236768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958350
4548	NC_016832	GGC	3	9	236787	236795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4549	NC_016832	GGC	2	6	236862	236867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4550	NC_016832	GC	3	6	236874	236879	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
4551	NC_016832	TGCTGG	2	12	236897	236908	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378958350
4552	NC_016832	GC	3	6	237016	237021	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
4553	NC_016832	GGC	2	6	237048	237053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
4554	NC_016832	TGA	2	6	237177	237182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958351
4555	NC_016832	GCA	2	6	237211	237216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958351
4556	NC_016832	CGG	2	6	237285	237290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958351
4557	NC_016832	TGG	2	6	237377	237382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958351
4558	NC_016832	TGG	2	6	237407	237412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958351
4559	NC_016832	AACC	2	8	237462	237469	50 %	0 %	0 %	50 %	378958351
4560	NC_016832	CTTC	2	8	237500	237507	0 %	50 %	0 %	50 %	378958351
4561	NC_016832	GCC	2	6	237672	237677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958352
4562	NC_016832	GAC	2	6	237695	237700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958352
4563	NC_016832	CAT	2	6	237707	237712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958352
4564	NC_016832	ATA	2	6	237774	237779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958352
4565	NC_016832	AAT	2	6	237842	237847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958352
4566	NC_016832	CGC	2	6	237850	237855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958352
4567	NC_016832	CAG	2	6	238007	238012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958352
4568	NC_016832	CGA	2	6	238039	238044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958352
4569	NC_016832	CGC	2	6	238111	238116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958352
4570	NC_016832	ACG	2	6	238128	238133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958352
4571	NC_016832	GTT	2	6	238306	238311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958353
4572	NC_016832	GCG	2	6	238314	238319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958353
4573	NC_016832	ATA	2	6	238323	238328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958353
4574	NC_016832	CCG	2	6	238524	238529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958353
4575	NC_016832	GTC	2	6	238533	238538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958353
4576	NC_016832	GAA	2	6	238597	238602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958353
4577	NC_016832	GCG	2	6	238644	238649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958353
4578	NC_016832	CTGC	2	8	238672	238679	0 %	25 %	25 %	50 %	378958353
4579	NC_016832	GGC	2	6	238706	238711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958353
4580	NC_016832	CCAC	2	8	238756	238763	25 %	0 %	0 %	75 %	378958353
4581	NC_016832	CCG	2	6	238815	238820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958353
4582	NC_016832	CGA	2	6	238828	238833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958353
4583	NC_016832	ATTC	2	8	238868	238875	25 %	50 %	0 %	25 %	378958353
4584	NC_016832	T	6	6	238900	238905	0 %	100 %	0 %	0 %	378958353
4585	NC_016832	CGGG	2	8	238912	238919	0 %	0 %	75 %	25 %	378958353
4586	NC_016832	GCT	2	6	238931	238936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958353
4587	NC_016832	CGG	2	6	238957	238962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958353
4588	NC_016832	AAGC	2	8	238966	238973	50 %	0 %	25 %	25 %	378958353
4589	NC_016832	GA	3	6	238987	238992	50 %	0 %	50 %	0 %	378958353
4590	NC_016832	CG	3	6	239002	239007	0 %	0 %	50 %	50 %	378958353
4591	NC_016832	AGC	2	6	239037	239042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958353
4592	NC_016832	CGC	2	6	239124	239129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958354
4593	NC_016832	ACC	2	6	239194	239199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958354
4594	NC_016832	TAA	2	6	239312	239317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958354
4595	NC_016832	CGC	2	6	239324	239329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958354
4596	NC_016832	CGG	2	6	239384	239389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958354
4597	NC_016832	ATC	2	6	239400	239405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958354
4598	NC_016832	CCGG	2	8	239416	239423	0 %	0 %	50 %	50 %	378958354
4599	NC_016832	CGT	2	6	239471	239476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958354
4600	NC_016832	GAC	2	6	239496	239501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958354
4601	NC_016832	TGA	2	6	239552	239557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958354
4602	NC_016832	GCC	2	6	239602	239607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958354
4603	NC_016832	GCC	2	6	239679	239684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958354
4604	NC_016832	GCA	2	6	239720	239725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958354
4605	NC_016832	CTT	3	9	239732	239740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958354
4606	NC_016832	ATG	2	6	239752	239757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958354
4607	NC_016832	ATCG	2	8	239858	239865	25 %	25 %	25 %	25 %	378958355
4608	NC_016832	TCG	2	6	239891	239896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958355
4609	NC_016832	GCA	2	6	239996	240001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958355
4610	NC_016832	A	6	6	240001	240006	100 %	0 %	0 %	0 %	378958355
4611	NC_016832	GCA	2	6	240071	240076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958355
4612	NC_016832	GCC	2	6	240109	240114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958355
4613	NC_016832	GGA	2	6	240134	240139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958355
4614	NC_016832	CCG	2	6	240216	240221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958355
4615	NC_016832	GGC	2	6	240239	240244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958355
4616	NC_016832	AGCC	2	8	240291	240298	25 %	0 %	25 %	50 %	378958355
4617	NC_016832	TG	3	6	240315	240320	0 %	50 %	50 %	0 %	378958355
4618	NC_016832	GAA	2	6	240348	240353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958355
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4620	NC_016832	TGG	2	6	240501	240506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958355
4621	NC_016832	GAA	2	6	240542	240547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958355
4622	NC_016832	TAT	2	6	240555	240560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958355
4623	NC_016832	GAT	2	6	240654	240659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958355
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4742	NC_016832	CG	3	6	246563	246568	0 %	0 %	50 %	50 %	378958360
4743	NC_016832	ATG	2	6	246590	246595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958360
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4745	NC_016832	CGC	2	6	246639	246644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958360
4746	NC_016832	ACG	2	6	246806	246811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958360
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4748	NC_016832	TCG	2	6	246839	246844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958360
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4853	NC_016832	GCT	2	6	252332	252337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958364
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4982	NC_016832	AG	3	6	259232	259237	50 %	0 %	50 %	0 %	378958370
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4988	NC_016832	CAC	2	6	259644	259649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958371
4989	NC_016832	GTC	2	6	259723	259728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958371
4990	NC_016832	CGC	2	6	259730	259735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958371
4991	NC_016832	AGG	2	6	259772	259777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958371
4992	NC_016832	TCG	2	6	259808	259813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958371
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5000	NC_016832	CTT	2	6	260442	260447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958371

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