MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 8454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016831	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378953806
2	NC_016831	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378953806
3	NC_016831	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378953807
4	NC_016831	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378953808
5	NC_016831	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378953808
6	NC_016831	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378953808
7	NC_016831	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	378953808
8	NC_016831	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378953808
9	NC_016831	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	378953810
10	NC_016831	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	378953810
11	NC_016831	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	378953811
12	NC_016831	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	378953811
13	NC_016831	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	378953813
14	NC_016831	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	378953814
15	NC_016831	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	378953815
16	NC_016831	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	378953815
17	NC_016831	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	378953816
18	NC_016831	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	378953816
19	NC_016831	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	378953816
20	NC_016831	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	378953816
21	NC_016831	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	378953816
22	NC_016831	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	378953816
23	NC_016831	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	378953817
24	NC_016831	TCAG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	378953819
25	NC_016831	TTTG	2	8	15535	15542	0 %	75 %	25 %	0 %	378953819
26	NC_016831	CGAA	2	8	15750	15757	50 %	0 %	25 %	25 %	378953819
27	NC_016831	ATTG	2	8	15762	15769	25 %	50 %	25 %	0 %	378953819
28	NC_016831	ATTA	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	378953820
29	NC_016831	ATAA	2	8	16522	16529	75 %	25 %	0 %	0 %	378953821
30	NC_016831	AATA	2	8	17998	18005	75 %	25 %	0 %	0 %	378953823
31	NC_016831	GGGC	2	8	18584	18591	0 %	0 %	75 %	25 %	378953823
32	NC_016831	CGTG	2	8	19284	19291	0 %	25 %	50 %	25 %	378953823
33	NC_016831	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	378953824
34	NC_016831	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	378953824
35	NC_016831	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	378953825
36	NC_016831	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	378953825
37	NC_016831	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	378953826
38	NC_016831	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	378953826
39	NC_016831	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	378953827
40	NC_016831	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	378953827
41	NC_016831	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	378953827
42	NC_016831	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	378953827
43	NC_016831	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	378953827
44	NC_016831	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
45	NC_016831	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
46	NC_016831	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
47	NC_016831	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	378953828
48	NC_016831	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	378953828
49	NC_016831	ATGA	2	8	29973	29980	50 %	25 %	25 %	0 %	378953829
50	NC_016831	TATC	2	8	30599	30606	25 %	50 %	0 %	25 %	378953831
51	NC_016831	GTAA	2	8	30636	30643	50 %	25 %	25 %	0 %	378953831
52	NC_016831	TTCG	2	8	30898	30905	0 %	50 %	25 %	25 %	378953831
53	NC_016831	GTCA	2	8	31407	31414	25 %	25 %	25 %	25 %	378953832
54	NC_016831	ACCG	2	8	32227	32234	25 %	0 %	25 %	50 %	378953833
55	NC_016831	AGGC	2	8	32265	32272	25 %	0 %	50 %	25 %	378953833
56	NC_016831	CCTG	2	8	32701	32708	0 %	25 %	25 %	50 %	378953834
57	NC_016831	AACA	2	8	32717	32724	75 %	0 %	0 %	25 %	378953834
58	NC_016831	CGCA	2	8	32891	32898	25 %	0 %	25 %	50 %	378953834
59	NC_016831	TAAA	2	8	32961	32968	75 %	25 %	0 %	0 %	378953834
60	NC_016831	TTAT	2	8	33530	33537	25 %	75 %	0 %	0 %	378953835
61	NC_016831	TTGG	2	8	33914	33921	0 %	50 %	50 %	0 %	378953835
62	NC_016831	CTTT	2	8	34294	34301	0 %	75 %	0 %	25 %	378953835
63	NC_016831	GAAG	2	8	34334	34341	50 %	0 %	50 %	0 %	378953835
64	NC_016831	ATAA	2	8	34665	34672	75 %	25 %	0 %	0 %	378953836
65	NC_016831	GTGC	2	8	34788	34795	0 %	25 %	50 %	25 %	378953836
66	NC_016831	TTAA	2	8	34798	34805	50 %	50 %	0 %	0 %	378953836
67	NC_016831	TGGA	2	8	35550	35557	25 %	25 %	50 %	0 %	378953838
68	NC_016831	GGGA	2	8	36494	36501	25 %	0 %	75 %	0 %	378953838
69	NC_016831	ATAC	2	8	37479	37486	50 %	25 %	0 %	25 %	378953839
70	NC_016831	GAAG	2	8	37551	37558	50 %	0 %	50 %	0 %	378953839
71	NC_016831	CACG	2	8	38114	38121	25 %	0 %	25 %	50 %	378953839
72	NC_016831	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	378953839
73	NC_016831	CCAT	2	8	38672	38679	25 %	25 %	0 %	50 %	378953839
74	NC_016831	GCGG	2	8	40537	40544	0 %	0 %	75 %	25 %	378953841
75	NC_016831	CTGG	2	8	40755	40762	0 %	25 %	50 %	25 %	378953841
76	NC_016831	CCGA	2	8	41272	41279	25 %	0 %	25 %	50 %	378953841
77	NC_016831	ATCG	2	8	41428	41435	25 %	25 %	25 %	25 %	378953841
78	NC_016831	TCAA	2	8	41489	41496	50 %	25 %	0 %	25 %	378953841
79	NC_016831	AACC	2	8	41755	41762	50 %	0 %	0 %	50 %	378953842
80	NC_016831	GAAA	2	8	41807	41814	75 %	0 %	25 %	0 %	378953842
81	NC_016831	GGTC	2	8	42379	42386	0 %	25 %	50 %	25 %	378953842
82	NC_016831	TTTG	2	8	42903	42910	0 %	75 %	25 %	0 %	378953842
83	NC_016831	GTAT	2	8	43198	43205	25 %	50 %	25 %	0 %	378953843
84	NC_016831	TCCG	2	8	43592	43599	0 %	25 %	25 %	50 %	378953843
85	NC_016831	GAAA	2	8	46904	46911	75 %	0 %	25 %	0 %	378953844
86	NC_016831	TCGC	2	8	46919	46926	0 %	25 %	25 %	50 %	378953844
87	NC_016831	GCTG	2	8	47110	47117	0 %	25 %	50 %	25 %	378953844
88	NC_016831	CACG	2	8	47808	47815	25 %	0 %	25 %	50 %	378953845
89	NC_016831	CAGC	2	8	47835	47842	25 %	0 %	25 %	50 %	378953845
90	NC_016831	CTGC	2	8	47972	47979	0 %	25 %	25 %	50 %	378953845
91	NC_016831	CATG	2	8	48540	48547	25 %	25 %	25 %	25 %	378953846
92	NC_016831	AAGT	2	8	49334	49341	50 %	25 %	25 %	0 %	378953846
93	NC_016831	CCAG	2	8	49392	49399	25 %	0 %	25 %	50 %	378953846
94	NC_016831	TTGA	2	8	50173	50180	25 %	50 %	25 %	0 %	378953846
95	NC_016831	GCCC	2	8	53068	53075	0 %	0 %	25 %	75 %	378953849
96	NC_016831	TGGC	2	8	53610	53617	0 %	25 %	50 %	25 %	378953849
97	NC_016831	AGCC	2	8	57437	57444	25 %	0 %	25 %	50 %	378953852
98	NC_016831	AAAG	2	8	57516	57523	75 %	0 %	25 %	0 %	378953852
99	NC_016831	ATGG	2	8	57649	57656	25 %	25 %	50 %	0 %	378953852
100	NC_016831	TGAT	2	8	58321	58328	25 %	50 %	25 %	0 %	378953853
101	NC_016831	TGGA	2	8	58990	58997	25 %	25 %	50 %	0 %	378953854
102	NC_016831	GATT	2	8	59388	59395	25 %	50 %	25 %	0 %	378953855
103	NC_016831	GATC	2	8	59757	59764	25 %	25 %	25 %	25 %	378953855
104	NC_016831	CTGG	2	8	60882	60889	0 %	25 %	50 %	25 %	378953856
105	NC_016831	GTGG	2	8	61047	61054	0 %	25 %	75 %	0 %	378953856
106	NC_016831	CTGC	2	8	61257	61264	0 %	25 %	25 %	50 %	378953857
107	NC_016831	ACCA	2	8	61893	61900	50 %	0 %	0 %	50 %	378953858
108	NC_016831	CATT	2	8	62118	62125	25 %	50 %	0 %	25 %	378953858
109	NC_016831	TCAA	2	8	63159	63166	50 %	25 %	0 %	25 %	378953858
110	NC_016831	GCCA	2	8	64745	64752	25 %	0 %	25 %	50 %	378953859
111	NC_016831	GCTG	2	8	65127	65134	0 %	25 %	50 %	25 %	378953860
112	NC_016831	ACGT	2	8	66034	66041	25 %	25 %	25 %	25 %	378953860
113	NC_016831	CCAG	2	8	66159	66166	25 %	0 %	25 %	50 %	378953860
114	NC_016831	TTCA	2	8	66875	66882	25 %	50 %	0 %	25 %	378953861
115	NC_016831	GAAG	2	8	67627	67634	50 %	0 %	50 %	0 %	378953862
116	NC_016831	CAGA	2	8	67800	67807	50 %	0 %	25 %	25 %	378953862
117	NC_016831	TTTC	2	8	68073	68080	0 %	75 %	0 %	25 %	378953862
118	NC_016831	AGTC	2	8	68232	68239	25 %	25 %	25 %	25 %	378953862
119	NC_016831	TAAT	2	8	68274	68281	50 %	50 %	0 %	0 %	378953862
120	NC_016831	ATTT	2	8	68660	68667	25 %	75 %	0 %	0 %	378953863
121	NC_016831	GTCG	2	8	68692	68699	0 %	25 %	50 %	25 %	378953863
122	NC_016831	GCAG	2	8	68977	68984	25 %	0 %	50 %	25 %	378953863
123	NC_016831	ACCG	2	8	69203	69210	25 %	0 %	25 %	50 %	378953863
124	NC_016831	GATC	2	8	69349	69356	25 %	25 %	25 %	25 %	378953863
125	NC_016831	GGCA	2	8	69723	69730	25 %	0 %	50 %	25 %	378953864
126	NC_016831	TCCA	2	8	69765	69772	25 %	25 %	0 %	50 %	378953864
127	NC_016831	CTGA	2	8	71391	71398	25 %	25 %	25 %	25 %	378953865
128	NC_016831	CAAT	2	8	71825	71832	50 %	25 %	0 %	25 %	378953865
129	NC_016831	ATGG	2	8	72589	72596	25 %	25 %	50 %	0 %	378953866
130	NC_016831	GTTG	2	8	72914	72921	0 %	50 %	50 %	0 %	378953867
131	NC_016831	TGGA	2	8	73047	73054	25 %	25 %	50 %	0 %	378953867
132	NC_016831	CGGG	2	8	74564	74571	0 %	0 %	75 %	25 %	378953868
133	NC_016831	ACTT	2	8	75433	75440	25 %	50 %	0 %	25 %	378953870
134	NC_016831	TCCT	2	8	75748	75755	0 %	50 %	0 %	50 %	378953871
135	NC_016831	CTTA	2	8	75776	75783	25 %	50 %	0 %	25 %	378953871
136	NC_016831	GACC	2	8	76945	76952	25 %	0 %	25 %	50 %	378953872
137	NC_016831	CCGT	2	8	77284	77291	0 %	25 %	25 %	50 %	378953872
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