MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016831	ACC	2	6	227137	227142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954000
4002	NC_016831	GTT	3	9	227325	227333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954000
4003	NC_016831	CCG	2	6	227374	227379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954000
4004	NC_016831	CCAA	2	8	227382	227389	50 %	0 %	0 %	50 %	378954000
4005	NC_016831	AGC	2	6	227450	227455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954000
4006	NC_016831	CGT	2	6	227566	227571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954000
4007	NC_016831	GCAGC	2	10	227683	227692	20 %	0 %	40 %	40 %	378954000
4008	NC_016831	GATG	2	8	227696	227703	25 %	25 %	50 %	0 %	378954000
4009	NC_016831	GTC	2	6	227706	227711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954000
4010	NC_016831	TAA	2	6	227765	227770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954000
4011	NC_016831	GCT	2	6	227797	227802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954000
4012	NC_016831	CATT	2	8	227933	227940	25 %	50 %	0 %	25 %	378954001
4013	NC_016831	ACC	2	6	227946	227951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954001
4014	NC_016831	GCC	2	6	228091	228096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954001
4015	NC_016831	GCC	2	6	228101	228106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954001
4016	NC_016831	AGC	2	6	228153	228158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954001
4017	NC_016831	CAA	2	6	228192	228197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954001
4018	NC_016831	GGAA	2	8	228209	228216	50 %	0 %	50 %	0 %	378954001
4019	NC_016831	TGG	2	6	228232	228237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954001
4020	NC_016831	GC	3	6	228262	228267	0 %	0 %	50 %	50 %	378954001
4021	NC_016831	CGG	2	6	228365	228370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954001
4022	NC_016831	GC	3	6	228380	228385	0 %	0 %	50 %	50 %	378954001
4023	NC_016831	CTG	3	9	228423	228431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954001
4024	NC_016831	GGT	2	6	228518	228523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954001
4025	NC_016831	TGC	2	6	228529	228534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954001
4026	NC_016831	GGC	2	6	228548	228553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954001
4027	NC_016831	ATT	2	6	228565	228570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954001
4028	NC_016831	CGG	2	6	228584	228589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954001
4029	NC_016831	CGG	2	6	228682	228687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954001
4030	NC_016831	CGC	2	6	228740	228745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954002
4031	NC_016831	TTA	2	6	228749	228754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954002
4032	NC_016831	CGC	2	6	228771	228776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954002
4033	NC_016831	CCG	2	6	228820	228825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954002
4034	NC_016831	GCT	3	9	228856	228864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954002
4035	NC_016831	TGGCG	2	10	228886	228895	0 %	20 %	60 %	20 %	378954002
4036	NC_016831	CCG	2	6	228929	228934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954002
4037	NC_016831	TGAT	2	8	228948	228955	25 %	50 %	25 %	0 %	378954002
4038	NC_016831	CTG	2	6	228986	228991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954002
4039	NC_016831	CGT	2	6	229005	229010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954002
4040	NC_016831	TGGTC	2	10	229014	229023	0 %	40 %	40 %	20 %	378954002
4041	NC_016831	CGCT	2	8	229121	229128	0 %	25 %	25 %	50 %	378954002
4042	NC_016831	GCCA	2	8	229202	229209	25 %	0 %	25 %	50 %	378954002
4043	NC_016831	CCG	2	6	229225	229230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954002
4044	NC_016831	G	6	6	229232	229237	0 %	0 %	100 %	0 %	378954002
4045	NC_016831	TGA	2	6	229248	229253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954002
4046	NC_016831	AGG	2	6	229308	229313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954002
4047	NC_016831	CGG	2	6	229374	229379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954002
4048	NC_016831	ATCG	2	8	229385	229392	25 %	25 %	25 %	25 %	378954002
4049	NC_016831	AAG	2	6	229407	229412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954002
4050	NC_016831	CGC	2	6	229470	229475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954002
4051	NC_016831	CCG	2	6	229524	229529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954002
4052	NC_016831	GCC	2	6	229694	229699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954003
4053	NC_016831	GTTG	2	8	229725	229732	0 %	50 %	50 %	0 %	378954003
4054	NC_016831	CTG	2	6	229737	229742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4055	NC_016831	CAGT	2	8	229779	229786	25 %	25 %	25 %	25 %	378954003
4056	NC_016831	CAT	2	6	229818	229823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954003
4057	NC_016831	GAT	2	6	229830	229835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954003
4058	NC_016831	CAGC	2	8	229845	229852	25 %	0 %	25 %	50 %	378954003
4059	NC_016831	GCT	2	6	229872	229877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4060	NC_016831	GC	3	6	229970	229975	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4061	NC_016831	GC	3	6	230015	230020	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4062	NC_016831	GCC	2	6	230035	230040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954003
4063	NC_016831	TCG	2	6	230057	230062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4064	NC_016831	GC	3	6	230063	230068	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4065	NC_016831	GGCGT	2	10	230077	230086	0 %	20 %	60 %	20 %	378954003
4066	NC_016831	TGG	2	6	230129	230134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954003
4067	NC_016831	CAC	2	6	230179	230184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954003
4068	NC_016831	GCG	2	6	230243	230248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4069	NC_016831	GCG	2	6	230276	230281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4070	NC_016831	TTG	2	6	230296	230301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954003
4071	NC_016831	GGC	2	6	230379	230384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4072	NC_016831	CTG	2	6	230413	230418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4073	NC_016831	GCT	2	6	230463	230468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4074	NC_016831	CTG	2	6	230494	230499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4075	NC_016831	ATGG	2	8	230580	230587	25 %	25 %	50 %	0 %	378954003
4076	NC_016831	GC	3	6	230621	230626	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4077	NC_016831	GCT	2	6	230628	230633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4078	NC_016831	GCT	2	6	230640	230645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4079	NC_016831	GC	3	6	230666	230671	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4080	NC_016831	GC	3	6	230741	230746	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4081	NC_016831	CTG	3	9	230749	230757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4082	NC_016831	CT	3	6	230773	230778	0 %	50 %	0 %	50 %	378954003
4083	NC_016831	GCT	2	6	230820	230825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
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4086	NC_016831	GGCG	2	8	230874	230881	0 %	0 %	75 %	25 %	378954003
4087	NC_016831	TGGCGG	2	12	230888	230899	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378954003
4088	NC_016831	ATT	2	6	230905	230910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954003
4089	NC_016831	GTG	2	6	230980	230985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954003
4090	NC_016831	CTGC	2	8	231028	231035	0 %	25 %	25 %	50 %	378954003
4091	NC_016831	GCG	3	9	231049	231057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4092	NC_016831	CTG	2	6	231061	231066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4093	NC_016831	ATT	2	6	231067	231072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954003
4094	NC_016831	GCC	2	6	231079	231084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954003
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4100	NC_016831	CGC	2	6	231301	231306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954003
4101	NC_016831	GCG	2	6	231329	231334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4102	NC_016831	CG	5	10	231339	231348	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4103	NC_016831	GCT	2	6	231381	231386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4104	NC_016831	GGC	2	6	231393	231398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4105	NC_016831	CGA	2	6	231416	231421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4106	NC_016831	CGG	2	6	231590	231595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4107	NC_016831	GC	3	6	231617	231622	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4108	NC_016831	A	8	8	231659	231666	100 %	0 %	0 %	0 %	378954003
4109	NC_016831	CAATAT	2	12	231723	231734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378954004
4110	NC_016831	CTGTC	2	10	231790	231799	0 %	40 %	20 %	40 %	378954004
4111	NC_016831	AAG	2	6	231836	231841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954004
4112	NC_016831	GC	3	6	231885	231890	0 %	0 %	50 %	50 %	378954004
4113	NC_016831	CAG	2	6	232606	232611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954005
4114	NC_016831	TGC	2	6	232625	232630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954005
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4116	NC_016831	CGA	2	6	232739	232744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954005
4117	NC_016831	CAC	2	6	232847	232852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954005
4118	NC_016831	AAG	2	6	232858	232863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954005
4119	NC_016831	CGG	3	9	232934	232942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954005
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4121	NC_016831	GCG	3	9	233043	233051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954005
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4242	NC_016831	ATA	2	6	243261	243266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954014
4243	NC_016831	CCG	2	6	243462	243467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954014
4244	NC_016831	GTC	2	6	243471	243476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954014
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4246	NC_016831	GCG	2	6	243582	243587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954014
4247	NC_016831	CTGC	2	8	243610	243617	0 %	25 %	25 %	50 %	378954014
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4336	NC_016831	TGGC	3	12	248019	248030	0 %	25 %	50 %	25 %	378954018
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4351	NC_016831	TGG	2	6	248643	248648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954018
4352	NC_016831	ATC	2	6	248694	248699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954018
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4354	NC_016831	CCGGG	2	10	248781	248790	0 %	0 %	60 %	40 %	378954018
4355	NC_016831	GC	3	6	248816	248821	0 %	0 %	50 %	50 %	378954018
4356	NC_016831	GAT	2	6	248827	248832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954018
4357	NC_016831	AG	3	6	248854	248859	50 %	0 %	50 %	0 %	378954018
4358	NC_016831	TGC	2	6	248886	248891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954018
4359	NC_016831	GGC	2	6	248915	248920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954018
4360	NC_016831	GC	3	6	248939	248944	0 %	0 %	50 %	50 %	378954018
4361	NC_016831	AAC	2	6	248972	248977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954018
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4363	NC_016831	CTTA	2	8	249263	249270	25 %	50 %	0 %	25 %	378954019
4364	NC_016831	CGA	2	6	249317	249322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954019
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4485	NC_016831	CCAG	2	8	254620	254627	25 %	0 %	25 %	50 %	378954022
4486	NC_016831	GC	3	6	254676	254681	0 %	0 %	50 %	50 %	378954022
4487	NC_016831	AGGG	2	8	254711	254718	25 %	0 %	75 %	0 %	378954022
4488	NC_016831	ATT	2	6	254998	255003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954023
4489	NC_016831	CGT	2	6	255004	255009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954023
4490	NC_016831	GT	3	6	255008	255013	0 %	50 %	50 %	0 %	378954023
4491	NC_016831	GAT	2	6	255014	255019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954023
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4496	NC_016831	CCTTCG	2	12	255312	255323	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378954023
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4499	NC_016831	CGA	2	6	255448	255453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954023
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