MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016831	ACG	2	6	200018	200023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953977
3502	NC_016831	ATG	2	6	200083	200088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953977
3503	NC_016831	CGT	2	6	200192	200197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953978
3504	NC_016831	CGG	2	6	200321	200326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3505	NC_016831	GC	3	6	200371	200376	0 %	0 %	50 %	50 %	378953978
3506	NC_016831	CGG	2	6	200387	200392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3507	NC_016831	CGG	2	6	200417	200422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3508	NC_016831	GCCC	2	8	200432	200439	0 %	0 %	25 %	75 %	378953978
3509	NC_016831	CG	3	6	200498	200503	0 %	0 %	50 %	50 %	378953978
3510	NC_016831	TTC	2	6	200518	200523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953978
3511	NC_016831	GTT	2	6	200576	200581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953978
3512	NC_016831	CGG	2	6	200688	200693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3513	NC_016831	TAGCGA	2	12	200756	200767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378953978
3514	NC_016831	CGG	2	6	200850	200855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3515	NC_016831	TGG	2	6	200881	200886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953978
3516	NC_016831	GA	3	6	200944	200949	50 %	0 %	50 %	0 %	378953978
3517	NC_016831	T	6	6	200952	200957	0 %	100 %	0 %	0 %	378953978
3518	NC_016831	GGGC	2	8	201041	201048	0 %	0 %	75 %	25 %	378953978
3519	NC_016831	GTA	2	6	201124	201129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953978
3520	NC_016831	GGT	2	6	201225	201230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953978
3521	NC_016831	CAT	2	6	201344	201349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953978
3522	NC_016831	GGC	2	6	201351	201356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3523	NC_016831	CGG	2	6	201558	201563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3524	NC_016831	TTG	2	6	201628	201633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953978
3525	NC_016831	CA	3	6	201644	201649	50 %	0 %	0 %	50 %	378953978
3526	NC_016831	CGT	2	6	201686	201691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953978
3527	NC_016831	ATA	2	6	201703	201708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953978
3528	NC_016831	CGC	2	6	201773	201778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953978
3529	NC_016831	GGC	2	6	201849	201854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3530	NC_016831	GTT	2	6	201953	201958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953978
3531	NC_016831	CTT	2	6	201986	201991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953978
3532	NC_016831	GCG	2	6	202028	202033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3533	NC_016831	GGCC	2	8	202065	202072	0 %	0 %	50 %	50 %	378953978
3534	NC_016831	TCG	2	6	202078	202083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953978
3535	NC_016831	CGA	2	6	202089	202094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953978
3536	NC_016831	TTG	2	6	202097	202102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953978
3537	NC_016831	CGG	2	6	202103	202108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3538	NC_016831	GCC	2	6	202176	202181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953978
3539	NC_016831	CAG	2	6	202188	202193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953978
3540	NC_016831	GCC	2	6	202207	202212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953978
3541	NC_016831	GGAA	2	8	202224	202231	50 %	0 %	50 %	0 %	378953978
3542	NC_016831	CCA	2	6	202232	202237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953978
3543	NC_016831	CAG	3	9	202356	202364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953978
3544	NC_016831	GGC	2	6	202365	202370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953978
3545	NC_016831	GTC	2	6	202844	202849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953979
3546	NC_016831	TTTATG	2	12	202915	202926	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378953979
3547	NC_016831	CCA	2	6	203003	203008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953979
3548	NC_016831	ATT	2	6	203080	203085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953979
3549	NC_016831	GCT	2	6	203160	203165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953979
3550	NC_016831	CGC	2	6	203179	203184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953979
3551	NC_016831	GTG	2	6	203296	203301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953979
3552	NC_016831	CTG	2	6	203302	203307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953979
3553	NC_016831	TGG	2	6	203378	203383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953980
3554	NC_016831	TGG	2	6	203448	203453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953980
3555	NC_016831	GCA	2	6	203472	203477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953980
3556	NC_016831	CAT	2	6	203481	203486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953980
3557	NC_016831	TGG	2	6	203550	203555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953980
3558	NC_016831	GCA	2	6	203673	203678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953980
3559	NC_016831	TTA	2	6	203684	203689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953980
3560	NC_016831	CCG	2	6	203729	203734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953980
3561	NC_016831	ATA	2	6	203756	203761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953980
3562	NC_016831	GA	3	6	203801	203806	50 %	0 %	50 %	0 %	378953980
3563	NC_016831	AACA	2	8	203851	203858	75 %	0 %	0 %	25 %	378953980
3564	NC_016831	ATCCA	2	10	203913	203922	40 %	20 %	0 %	40 %	378953980
3565	NC_016831	TTGCGC	2	12	203938	203949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953980
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3567	NC_016831	CCA	2	6	203979	203984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953980
3568	NC_016831	TTG	2	6	204005	204010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953980
3569	NC_016831	TGA	2	6	204012	204017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953980
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3571	NC_016831	A	7	7	204175	204181	100 %	0 %	0 %	0 %	378953981
3572	NC_016831	CGG	2	6	204189	204194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953981
3573	NC_016831	ACC	2	6	204280	204285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953981
3574	NC_016831	TAT	2	6	204291	204296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953981
3575	NC_016831	TAA	2	6	204309	204314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953981
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3577	NC_016831	TTA	2	6	204456	204461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953981
3578	NC_016831	CG	4	8	204541	204548	0 %	0 %	50 %	50 %	378953981
3579	NC_016831	GCC	2	6	204572	204577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953981
3580	NC_016831	TGA	2	6	204578	204583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953981
3581	NC_016831	CG	3	6	204589	204594	0 %	0 %	50 %	50 %	378953981
3582	NC_016831	CGG	2	6	204635	204640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953981
3583	NC_016831	CAC	2	6	204702	204707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953981
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3585	NC_016831	CAC	2	6	204717	204722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953981
3586	NC_016831	TAT	2	6	204765	204770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953981
3587	NC_016831	TGG	2	6	204785	204790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953981
3588	NC_016831	TGG	2	6	204899	204904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953981
3589	NC_016831	GAGC	2	8	204969	204976	25 %	0 %	50 %	25 %	378953981
3590	NC_016831	TAA	2	6	205002	205007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953981
3591	NC_016831	GAA	2	6	205021	205026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953981
3592	NC_016831	ATG	2	6	205068	205073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953981
3593	NC_016831	GCC	2	6	205154	205159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953982
3594	NC_016831	TCA	2	6	205162	205167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953982
3595	NC_016831	TAT	2	6	205184	205189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953982
3596	NC_016831	ATG	2	6	205269	205274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953982
3597	NC_016831	CGT	2	6	205306	205311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953982
3598	NC_016831	T	6	6	205314	205319	0 %	100 %	0 %	0 %	378953982
3599	NC_016831	CTG	2	6	205350	205355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953982
3600	NC_016831	ATC	2	6	205380	205385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953982
3601	NC_016831	CGG	3	9	205397	205405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953982
3602	NC_016831	GC	3	6	205410	205415	0 %	0 %	50 %	50 %	378953982
3603	NC_016831	CTG	2	6	205539	205544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953982
3604	NC_016831	CGC	2	6	205603	205608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953982
3605	NC_016831	ACCT	2	8	205611	205618	25 %	25 %	0 %	50 %	378953982
3606	NC_016831	CGG	2	6	205619	205624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953982
3607	NC_016831	GCT	2	6	205643	205648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953982
3608	NC_016831	GCC	2	6	205649	205654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953982
3609	NC_016831	ATG	2	6	205732	205737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953982
3610	NC_016831	GCT	2	6	205779	205784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953982
3611	NC_016831	CTG	2	6	205791	205796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953982
3612	NC_016831	GCGCGG	2	12	205814	205825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953982
3613	NC_016831	TC	3	6	205954	205959	0 %	50 %	0 %	50 %	378953983
3614	NC_016831	GAATCT	2	12	205963	205974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378953983
3615	NC_016831	GGT	2	6	206021	206026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953983
3616	NC_016831	CGGCG	2	10	206033	206042	0 %	0 %	60 %	40 %	378953983
3617	NC_016831	TGC	2	6	206053	206058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953983
3618	NC_016831	GCC	2	6	206099	206104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953983
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3620	NC_016831	GTG	2	6	206262	206267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953983
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3984	NC_016831	TTCAA	2	10	226270	226279	40 %	40 %	0 %	20 %	378954000
3985	NC_016831	GGAC	2	8	226285	226292	25 %	0 %	50 %	25 %	378954000
3986	NC_016831	AGC	2	6	226387	226392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954000
3987	NC_016831	TGA	2	6	226448	226453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954000
3988	NC_016831	GAAC	2	8	226487	226494	50 %	0 %	25 %	25 %	378954000
3989	NC_016831	CTA	2	6	226505	226510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954000
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3991	NC_016831	TGG	2	6	226621	226626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954000
3992	NC_016831	A	6	6	226705	226710	100 %	0 %	0 %	0 %	378954000
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4000	NC_016831	AT	3	6	227120	227125	50 %	50 %	0 %	0 %	378954000

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