MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016831	CAT	2	6	84494	84499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953877
1502	NC_016831	GCA	2	6	84517	84522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953877
1503	NC_016831	GCC	2	6	84585	84590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953877
1504	NC_016831	GTC	2	6	84600	84605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953877
1505	NC_016831	CGG	2	6	84628	84633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953877
1506	NC_016831	CTC	2	6	84734	84739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953877
1507	NC_016831	TCA	2	6	84807	84812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953877
1508	NC_016831	CGG	2	6	84822	84827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953877
1509	NC_016831	GCG	2	6	84941	84946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953877
1510	NC_016831	A	6	6	85075	85080	100 %	0 %	0 %	0 %	378953877
1511	NC_016831	TCA	2	6	85129	85134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953877
1512	NC_016831	T	6	6	85149	85154	0 %	100 %	0 %	0 %	378953877
1513	NC_016831	TCA	2	6	85293	85298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953878
1514	NC_016831	ACC	2	6	85301	85306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953878
1515	NC_016831	GGT	2	6	85351	85356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953878
1516	NC_016831	CAG	2	6	85493	85498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953878
1517	NC_016831	CGA	2	6	85654	85659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953878
1518	NC_016831	CTT	2	6	85681	85686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953878
1519	NC_016831	CCGA	2	8	85712	85719	25 %	0 %	25 %	50 %	378953878
1520	NC_016831	CGT	2	6	85744	85749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953878
1521	NC_016831	CAG	2	6	85764	85769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953878
1522	NC_016831	TTG	2	6	85800	85805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953878
1523	NC_016831	TC	3	6	85875	85880	0 %	50 %	0 %	50 %	378953878
1524	NC_016831	CCT	2	6	86109	86114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953878
1525	NC_016831	ACA	2	6	86125	86130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953878
1526	NC_016831	GC	3	6	86140	86145	0 %	0 %	50 %	50 %	378953878
1527	NC_016831	CGG	2	6	86170	86175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953878
1528	NC_016831	CCG	2	6	86202	86207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953878
1529	NC_016831	TTC	2	6	86210	86215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953878
1530	NC_016831	CAG	2	6	86222	86227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953878
1531	NC_016831	TAA	2	6	86453	86458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953879
1532	NC_016831	GAA	2	6	86484	86489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953879
1533	NC_016831	TCC	2	6	86499	86504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953879
1534	NC_016831	ACCC	2	8	86534	86541	25 %	0 %	0 %	75 %	378953879
1535	NC_016831	CAG	2	6	86547	86552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953879
1536	NC_016831	GAT	2	6	86562	86567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953879
1537	NC_016831	GGC	2	6	86605	86610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953879
1538	NC_016831	GAA	2	6	86703	86708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953879
1539	NC_016831	TGG	2	6	86717	86722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953879
1540	NC_016831	GGC	2	6	86739	86744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953879
1541	NC_016831	GC	4	8	86761	86768	0 %	0 %	50 %	50 %	378953879
1542	NC_016831	ACG	2	6	86770	86775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953879
1543	NC_016831	CAG	3	9	86820	86828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953879
1544	NC_016831	TGC	2	6	86834	86839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953879
1545	NC_016831	GTACG	2	10	86906	86915	20 %	20 %	40 %	20 %	378953879
1546	NC_016831	TA	3	6	86959	86964	50 %	50 %	0 %	0 %	378953879
1547	NC_016831	CAC	2	6	86968	86973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953879
1548	NC_016831	GCC	2	6	87006	87011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953879
1549	NC_016831	AGT	2	6	87083	87088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953879
1550	NC_016831	ATG	2	6	87091	87096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953879
1551	NC_016831	CAG	2	6	87223	87228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953879
1552	NC_016831	ATG	3	9	87232	87240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953879
1553	NC_016831	CCA	2	6	87344	87349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953879
1554	NC_016831	CGA	2	6	87362	87367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953879
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1556	NC_016831	CGA	2	6	87401	87406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953879
1557	NC_016831	CATC	2	8	87437	87444	25 %	25 %	0 %	50 %	378953879
1558	NC_016831	AGA	2	6	87455	87460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953879
1559	NC_016831	CGG	2	6	87579	87584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953879
1560	NC_016831	TAG	3	9	87595	87603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953879
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1562	NC_016831	AGG	2	6	87644	87649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953879
1563	NC_016831	CAT	2	6	87654	87659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953879
1564	NC_016831	CCAG	2	8	87731	87738	25 %	0 %	25 %	50 %	378953879
1565	NC_016831	GAC	2	6	87756	87761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953879
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1581	NC_016831	TGA	2	6	88661	88666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953881
1582	NC_016831	AC	3	6	88712	88717	50 %	0 %	0 %	50 %	378953881
1583	NC_016831	GCC	2	6	88731	88736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953881
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1586	NC_016831	TTC	2	6	88781	88786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953881
1587	NC_016831	CAG	2	6	88800	88805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953881
1588	NC_016831	TGG	2	6	88816	88821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953881
1589	NC_016831	CT	4	8	88866	88873	0 %	50 %	0 %	50 %	378953881
1590	NC_016831	CGG	2	6	88942	88947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953881
1591	NC_016831	GCG	2	6	89010	89015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953881
1592	NC_016831	A	6	6	89016	89021	100 %	0 %	0 %	0 %	378953881
1593	NC_016831	CA	3	6	89078	89083	50 %	0 %	0 %	50 %	378953881
1594	NC_016831	AGC	2	6	89101	89106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953881
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1599	NC_016831	GC	3	6	89272	89277	0 %	0 %	50 %	50 %	378953882
1600	NC_016831	GCT	2	6	89363	89368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953882
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1602	NC_016831	GCT	2	6	89406	89411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953882
1603	NC_016831	GCG	2	6	89446	89451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953882
1604	NC_016831	TGC	3	9	89455	89463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953882
1605	NC_016831	GGC	2	6	89489	89494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953882
1606	NC_016831	ACG	2	6	89530	89535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953882
1607	NC_016831	GCG	2	6	89565	89570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953882
1608	NC_016831	CGG	2	6	89588	89593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953882
1609	NC_016831	CAG	2	6	89645	89650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953882
1610	NC_016831	GCG	2	6	89689	89694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953882
1611	NC_016831	CCGCA	2	10	89738	89747	20 %	0 %	20 %	60 %	378953882
1612	NC_016831	TGG	2	6	89794	89799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953882
1613	NC_016831	GCA	2	6	89821	89826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953882
1614	NC_016831	CCCG	2	8	89887	89894	0 %	0 %	25 %	75 %	378953882
1615	NC_016831	TGGA	2	8	89913	89920	25 %	25 %	50 %	0 %	378953882
1616	NC_016831	GC	3	6	90022	90027	0 %	0 %	50 %	50 %	378953882
1617	NC_016831	CAA	2	6	90044	90049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953882
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1621	NC_016831	GCG	2	6	90253	90258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953883
1622	NC_016831	TGCT	2	8	90263	90270	0 %	50 %	25 %	25 %	378953883
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1751	NC_016831	TGG	2	6	99784	99789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953890
1752	NC_016831	T	6	6	99844	99849	0 %	100 %	0 %	0 %	378953890
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1992	NC_016831	GCA	2	6	115399	115404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953902
1993	NC_016831	TTG	3	9	115442	115450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953902
1994	NC_016831	CG	3	6	115483	115488	0 %	0 %	50 %	50 %	378953902
1995	NC_016831	CGC	2	6	115562	115567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953902
1996	NC_016831	GCC	2	6	115595	115600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953902
1997	NC_016831	CG	3	6	115613	115618	0 %	0 %	50 %	50 %	378953902
1998	NC_016831	TGT	2	6	115626	115631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953902
1999	NC_016831	CG	3	6	115729	115734	0 %	0 %	50 %	50 %	378953902
2000	NC_016831	CTGA	2	8	115745	115752	25 %	25 %	25 %	25 %	378953902

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