MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016831	T	6	6	342919	342924	0 %	100 %	0 %	0 %	378954102
6002	NC_016831	GAT	2	6	342929	342934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954102
6003	NC_016831	CATC	2	8	342985	342992	25 %	25 %	0 %	50 %	378954102
6004	NC_016831	TCTT	2	8	342999	343006	0 %	75 %	0 %	25 %	378954102
6005	NC_016831	GCCAT	2	10	343076	343085	20 %	20 %	20 %	40 %	378954102
6006	NC_016831	TCA	2	6	343252	343257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954102
6007	NC_016831	CGC	2	6	343259	343264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954102
6008	NC_016831	GTG	2	6	343305	343310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954102
6009	NC_016831	CAT	2	6	343316	343321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954102
6010	NC_016831	TTC	2	6	343340	343345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954102
6011	NC_016831	CGC	2	6	343388	343393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954102
6012	NC_016831	CAG	2	6	343394	343399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954102
6013	NC_016831	CGC	2	6	343447	343452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954102
6014	NC_016831	AATG	2	8	343516	343523	50 %	25 %	25 %	0 %	378954102
6015	NC_016831	ACA	2	6	343564	343569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954102
6016	NC_016831	TAA	2	6	343591	343596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954102
6017	NC_016831	AAAT	2	8	343716	343723	75 %	25 %	0 %	0 %	378954102
6018	NC_016831	TCA	4	12	343738	343749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954102
6019	NC_016831	TGC	2	6	343792	343797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954102
6020	NC_016831	CGA	2	6	343819	343824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954102
6021	NC_016831	CTT	2	6	343903	343908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954102
6022	NC_016831	CAG	2	6	343928	343933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954102
6023	NC_016831	GAA	2	6	343988	343993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954102
6024	NC_016831	TGC	2	6	344005	344010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954102
6025	NC_016831	GCG	2	6	344107	344112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954102
6026	NC_016831	CGC	2	6	344156	344161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954102
6027	NC_016831	GCG	2	6	344172	344177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954102
6028	NC_016831	AAG	2	6	344193	344198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954102
6029	NC_016831	CGC	2	6	344338	344343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954102
6030	NC_016831	CAG	2	6	344372	344377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954102
6031	NC_016831	TCT	2	6	344379	344384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954102
6032	NC_016831	CTT	2	6	344452	344457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954102
6033	NC_016831	TTG	2	6	344602	344607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954103
6034	NC_016831	GTT	2	6	344616	344621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954103
6035	NC_016831	GAT	2	6	344658	344663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954103
6036	NC_016831	GCA	2	6	344822	344827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954103
6037	NC_016831	CCG	2	6	344881	344886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954103
6038	NC_016831	ATG	2	6	344896	344901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954103
6039	NC_016831	ATC	2	6	344911	344916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954103
6040	NC_016831	CAG	2	6	344943	344948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954103
6041	NC_016831	T	6	6	344952	344957	0 %	100 %	0 %	0 %	378954103
6042	NC_016831	CGT	2	6	345005	345010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954103
6043	NC_016831	GGC	2	6	345012	345017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954103
6044	NC_016831	CAT	2	6	345042	345047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954103
6045	NC_016831	CAGG	2	8	345066	345073	25 %	0 %	50 %	25 %	378954103
6046	NC_016831	GCG	2	6	345098	345103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954103
6047	NC_016831	CAGCC	2	10	345104	345113	20 %	0 %	20 %	60 %	378954103
6048	NC_016831	GC	3	6	345146	345151	0 %	0 %	50 %	50 %	378954103
6049	NC_016831	GAT	2	6	345213	345218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954103
6050	NC_016831	CGG	2	6	345293	345298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954103
6051	NC_016831	AACG	2	8	345312	345319	50 %	0 %	25 %	25 %	378954103
6052	NC_016831	GCAGA	2	10	345327	345336	40 %	0 %	40 %	20 %	378954103
6053	NC_016831	GTCG	2	8	345360	345367	0 %	25 %	50 %	25 %	378954103
6054	NC_016831	CCCA	2	8	345495	345502	25 %	0 %	0 %	75 %	378954103
6055	NC_016831	TAA	2	6	345509	345514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954103
6056	NC_016831	ATT	2	6	345564	345569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954103
6057	NC_016831	GAA	2	6	345579	345584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954103
6058	NC_016831	ATA	2	6	345645	345650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954103
6059	NC_016831	AAT	2	6	345771	345776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954103
6060	NC_016831	CCA	2	6	345805	345810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954103
6061	NC_016831	TAA	2	6	345831	345836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954103
6062	NC_016831	CAT	2	6	345852	345857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954103
6063	NC_016831	ACG	2	6	345868	345873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954103
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6065	NC_016831	TAA	2	6	346555	346560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954104
6066	NC_016831	T	7	7	346595	346601	0 %	100 %	0 %	0 %	378954104
6067	NC_016831	TGT	2	6	346645	346650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954104
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6069	NC_016831	CGC	2	6	346763	346768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954104
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6071	NC_016831	GCG	2	6	346817	346822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954104
6072	NC_016831	GTT	2	6	346838	346843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954104
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6074	NC_016831	TGGA	2	8	346906	346913	25 %	25 %	50 %	0 %	378954104
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6083	NC_016831	ACC	2	6	347290	347295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954104
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6086	NC_016831	TCG	2	6	347435	347440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954104
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6088	NC_016831	TGA	2	6	347466	347471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954104
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6091	NC_016831	TGGT	2	8	347623	347630	0 %	50 %	50 %	0 %	378954104
6092	NC_016831	AAT	2	6	347658	347663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954104
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6094	NC_016831	GAC	2	6	347753	347758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954104
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6111	NC_016831	T	6	6	348951	348956	0 %	100 %	0 %	0 %	378954105
6112	NC_016831	CCG	2	6	348960	348965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954105
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6121	NC_016831	CTA	2	6	349704	349709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954107
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6228	NC_016831	TGCTG	2	10	354621	354630	0 %	40 %	40 %	20 %	378954111
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6230	NC_016831	CGC	2	6	354687	354692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954111
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6233	NC_016831	GGC	2	6	354895	354900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954111
6234	NC_016831	GCT	2	6	354931	354936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954111
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6237	NC_016831	CGCTGG	2	12	355017	355028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954111
6238	NC_016831	TTG	2	6	355047	355052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954111
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6240	NC_016831	CGG	2	6	355126	355131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954112
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6242	NC_016831	CGC	2	6	355213	355218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954112
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6485	NC_016831	CAT	2	6	369143	369148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954127
6486	NC_016831	GAA	2	6	369151	369156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954127
6487	NC_016831	CAA	2	6	369558	369563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954128
6488	NC_016831	CTG	2	6	369567	369572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954128
6489	NC_016831	A	7	7	369598	369604	100 %	0 %	0 %	0 %	378954128
6490	NC_016831	T	7	7	369621	369627	0 %	100 %	0 %	0 %	378954128
6491	NC_016831	CGA	2	6	369726	369731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954129
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6498	NC_016831	TCAATA	2	12	370070	370081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378954129
6499	NC_016831	TCA	2	6	370118	370123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954129
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