MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_016831	GTT	2	6	3243779	3243784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956845
55002	NC_016831	GTG	2	6	3243785	3243790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956845
55003	NC_016831	TGT	2	6	3243810	3243815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956845
55004	NC_016831	CGC	2	6	3243904	3243909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956845
55005	NC_016831	TGG	2	6	3243914	3243919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956845
55006	NC_016831	GCT	2	6	3244162	3244167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956845
55007	NC_016831	CTG	2	6	3244187	3244192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956845
55008	NC_016831	GAAG	2	8	3244219	3244226	50 %	0 %	50 %	0 %	378956845
55009	NC_016831	CGTA	2	8	3244315	3244322	25 %	25 %	25 %	25 %	378956845
55010	NC_016831	CTG	2	6	3244331	3244336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956845
55011	NC_016831	CGC	2	6	3244344	3244349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956845
55012	NC_016831	TGC	2	6	3244350	3244355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956845
55013	NC_016831	CAC	2	6	3244426	3244431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956845
55014	NC_016831	GC	3	6	3244480	3244485	0 %	0 %	50 %	50 %	378956845
55015	NC_016831	CTG	2	6	3244496	3244501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956845
55016	NC_016831	TCG	2	6	3244581	3244586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956845
55017	NC_016831	AAT	2	6	3244701	3244706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956845
55018	NC_016831	GCTT	2	8	3245090	3245097	0 %	50 %	25 %	25 %	378956846
55019	NC_016831	TCG	2	6	3245108	3245113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55020	NC_016831	ACC	2	6	3245174	3245179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956846
55021	NC_016831	A	6	6	3245189	3245194	100 %	0 %	0 %	0 %	378956846
55022	NC_016831	TCTT	2	8	3245213	3245220	0 %	75 %	0 %	25 %	378956846
55023	NC_016831	GGC	2	6	3245250	3245255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956846
55024	NC_016831	CCTTC	2	10	3245273	3245282	0 %	40 %	0 %	60 %	378956846
55025	NC_016831	GCC	2	6	3245319	3245324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956846
55026	NC_016831	CTG	2	6	3245353	3245358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55027	NC_016831	GCT	2	6	3245388	3245393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55028	NC_016831	ACC	2	6	3245464	3245469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956846
55029	NC_016831	TCA	2	6	3245560	3245565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956846
55030	NC_016831	ACC	2	6	3245575	3245580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956846
55031	NC_016831	CTG	2	6	3245611	3245616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55032	NC_016831	GTC	2	6	3245617	3245622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55033	NC_016831	TGC	2	6	3245636	3245641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55034	NC_016831	TGG	2	6	3245651	3245656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956846
55035	NC_016831	TCG	2	6	3245685	3245690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55036	NC_016831	GCCT	2	8	3245713	3245720	0 %	25 %	25 %	50 %	378956846
55037	NC_016831	GCG	2	6	3245729	3245734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956846
55038	NC_016831	CTT	2	6	3245742	3245747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956846
55039	NC_016831	GCC	2	6	3245761	3245766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956846
55040	NC_016831	TACT	2	8	3245817	3245824	25 %	50 %	0 %	25 %	378956846
55041	NC_016831	GGC	2	6	3245895	3245900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956846
55042	NC_016831	GCT	3	9	3245940	3245948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55043	NC_016831	GTG	2	6	3245953	3245958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956846
55044	NC_016831	TG	3	6	3245966	3245971	0 %	50 %	50 %	0 %	378956846
55045	NC_016831	GCG	2	6	3245975	3245980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956846
55046	NC_016831	TGC	2	6	3246005	3246010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956846
55047	NC_016831	GTA	2	6	3246064	3246069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956846
55048	NC_016831	TAT	2	6	3246081	3246086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956846
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55050	NC_016831	TTAT	2	8	3246747	3246754	25 %	75 %	0 %	0 %	378956847
55051	NC_016831	GCT	2	6	3246776	3246781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956847
55052	NC_016831	GCC	2	6	3246786	3246791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956847
55053	NC_016831	TGC	2	6	3246871	3246876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956847
55054	NC_016831	GCTG	2	8	3246925	3246932	0 %	25 %	50 %	25 %	378956847
55055	NC_016831	CT	3	6	3246960	3246965	0 %	50 %	0 %	50 %	378956847
55056	NC_016831	ATC	2	6	3246982	3246987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956847
55057	NC_016831	ATT	2	6	3247028	3247033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956847
55058	NC_016831	CTG	2	6	3247065	3247070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956847
55059	NC_016831	CCA	2	6	3247072	3247077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956847
55060	NC_016831	CG	3	6	3247103	3247108	0 %	0 %	50 %	50 %	378956847
55061	NC_016831	TTC	2	6	3247116	3247121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956847
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55064	NC_016831	TGC	3	9	3247231	3247239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956847
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55066	NC_016831	T	6	6	3247254	3247259	0 %	100 %	0 %	0 %	378956847
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55069	NC_016831	CG	3	6	3247440	3247445	0 %	0 %	50 %	50 %	378956848
55070	NC_016831	CAT	2	6	3247488	3247493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956848
55071	NC_016831	CATT	2	8	3247508	3247515	25 %	50 %	0 %	25 %	378956848
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55076	NC_016831	GC	3	6	3248045	3248050	0 %	0 %	50 %	50 %	378956849
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55079	NC_016831	A	7	7	3248189	3248195	100 %	0 %	0 %	0 %	378956849
55080	NC_016831	ACT	2	6	3248209	3248214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956849
55081	NC_016831	GC	3	6	3248287	3248292	0 %	0 %	50 %	50 %	378956850
55082	NC_016831	GAA	2	6	3248321	3248326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956850
55083	NC_016831	AGA	2	6	3248356	3248361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956850
55084	NC_016831	GC	4	8	3248389	3248396	0 %	0 %	50 %	50 %	378956850
55085	NC_016831	GTGAT	2	10	3248430	3248439	20 %	40 %	40 %	0 %	378956850
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55087	NC_016831	GAT	2	6	3248474	3248479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956850
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55089	NC_016831	CGT	2	6	3248555	3248560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956850
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55099	NC_016831	TCAG	2	8	3249004	3249011	25 %	25 %	25 %	25 %	378956852
55100	NC_016831	CAG	2	6	3249015	3249020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956852
55101	NC_016831	CTGG	2	8	3249053	3249060	0 %	25 %	50 %	25 %	378956852
55102	NC_016831	ACC	2	6	3249063	3249068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956852
55103	NC_016831	AGC	2	6	3249129	3249134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956852
55104	NC_016831	CAA	2	6	3249240	3249245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956852
55105	NC_016831	CGG	2	6	3249252	3249257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956852
55106	NC_016831	TCTTT	2	10	3249264	3249273	0 %	80 %	0 %	20 %	378956852
55107	NC_016831	G	6	6	3250027	3250032	0 %	0 %	100 %	0 %	378956853
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55111	NC_016831	CGT	2	6	3250224	3250229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956853
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55113	NC_016831	CGG	2	6	3250277	3250282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956853
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55115	NC_016831	CCG	2	6	3250415	3250420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956853
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55233	NC_016831	TCG	2	6	3258988	3258993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956859
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