MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016831	AGGC	2	8	255615	255622	25 %	0 %	50 %	25 %	378954023
4502	NC_016831	GTT	2	6	255634	255639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954023
4503	NC_016831	GGT	2	6	255680	255685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954023
4504	NC_016831	T	6	6	255754	255759	0 %	100 %	0 %	0 %	378954023
4505	NC_016831	GC	3	6	256341	256346	0 %	0 %	50 %	50 %	378954024
4506	NC_016831	CAT	2	6	256360	256365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954024
4507	NC_016831	CTGAA	2	10	256407	256416	40 %	20 %	20 %	20 %	378954024
4508	NC_016831	AAGCG	2	10	256471	256480	40 %	0 %	40 %	20 %	378954024
4509	NC_016831	GCT	2	6	256490	256495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954024
4510	NC_016831	TTC	2	6	256511	256516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954024
4511	NC_016831	GCTG	2	8	256527	256534	0 %	25 %	50 %	25 %	378954024
4512	NC_016831	AAGA	2	8	256634	256641	75 %	0 %	25 %	0 %	378954024
4513	NC_016831	AAC	2	6	256772	256777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954024
4514	NC_016831	GAA	2	6	256943	256948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954024
4515	NC_016831	TAA	2	6	256967	256972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954024
4516	NC_016831	ATG	2	6	257284	257289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954025
4517	NC_016831	A	6	6	257296	257301	100 %	0 %	0 %	0 %	378954025
4518	NC_016831	CTGA	2	8	257305	257312	25 %	25 %	25 %	25 %	378954025
4519	NC_016831	GCG	2	6	257371	257376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954025
4520	NC_016831	A	6	6	257377	257382	100 %	0 %	0 %	0 %	378954025
4521	NC_016831	GCT	2	6	257395	257400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954025
4522	NC_016831	GACT	2	8	257463	257470	25 %	25 %	25 %	25 %	378954025
4523	NC_016831	CGC	2	6	257520	257525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954025
4524	NC_016831	GAA	2	6	257572	257577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954025
4525	NC_016831	TCG	2	6	257622	257627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954025
4526	NC_016831	GC	3	6	257674	257679	0 %	0 %	50 %	50 %	378954025
4527	NC_016831	GCAA	2	8	257749	257756	50 %	0 %	25 %	25 %	378954025
4528	NC_016831	CTG	2	6	257786	257791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954025
4529	NC_016831	GAAA	2	8	257850	257857	75 %	0 %	25 %	0 %	378954025
4530	NC_016831	GAA	2	6	257886	257891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954025
4531	NC_016831	CTG	2	6	257959	257964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954025
4532	NC_016831	GACT	2	8	258033	258040	25 %	25 %	25 %	25 %	378954025
4533	NC_016831	GCA	2	6	258043	258048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954025
4534	NC_016831	TGC	2	6	258054	258059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954025
4535	NC_016831	GCG	2	6	258272	258277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954026
4536	NC_016831	TGGTG	2	10	258375	258384	0 %	40 %	60 %	0 %	378954026
4537	NC_016831	GGT	2	6	258391	258396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954026
4538	NC_016831	CGCC	2	8	258525	258532	0 %	0 %	25 %	75 %	378954026
4539	NC_016831	CTG	2	6	258595	258600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954026
4540	NC_016831	TAA	2	6	258603	258608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954026
4541	NC_016831	TCTG	2	8	258621	258628	0 %	50 %	25 %	25 %	378954026
4542	NC_016831	TTC	2	6	258646	258651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954026
4543	NC_016831	GGC	2	6	258828	258833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954026
4544	NC_016831	GC	3	6	258893	258898	0 %	0 %	50 %	50 %	378954026
4545	NC_016831	CGT	2	6	258901	258906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954026
4546	NC_016831	GTG	2	6	258907	258912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954026
4547	NC_016831	AAG	2	6	258923	258928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954026
4548	NC_016831	AAT	2	6	258944	258949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954026
4549	NC_016831	CTG	2	6	259200	259205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954027
4550	NC_016831	AGA	2	6	259271	259276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954027
4551	NC_016831	GCC	2	6	259400	259405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954027
4552	NC_016831	GAA	2	6	259413	259418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954027
4553	NC_016831	CGT	2	6	259419	259424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954027
4554	NC_016831	CCG	2	6	259487	259492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954027
4555	NC_016831	CTG	2	6	259518	259523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954027
4556	NC_016831	TCG	2	6	259553	259558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954027
4557	NC_016831	GAA	2	6	259566	259571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954027
4558	NC_016831	GCG	2	6	259611	259616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954027
4559	NC_016831	AAG	2	6	259627	259632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954027
4560	NC_016831	TGAT	2	8	259650	259657	25 %	50 %	25 %	0 %	378954027
4561	NC_016831	GTG	2	6	259704	259709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954028
4562	NC_016831	AGA	2	6	259725	259730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954028
4563	NC_016831	GCG	2	6	259749	259754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954028
4564	NC_016831	GCA	2	6	259837	259842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954028
4565	NC_016831	GTG	2	6	259851	259856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954028
4566	NC_016831	TGG	2	6	259891	259896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954028
4567	NC_016831	CGC	2	6	259942	259947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954028
4568	NC_016831	AAT	2	6	259991	259996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954028
4569	NC_016831	CAG	2	6	260001	260006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954028
4570	NC_016831	CAG	2	6	260037	260042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954028
4571	NC_016831	GGC	2	6	260057	260062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954028
4572	NC_016831	TGA	2	6	260066	260071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954028
4573	NC_016831	GGC	2	6	260087	260092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954028
4574	NC_016831	GGC	2	6	260126	260131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954028
4575	NC_016831	CTG	2	6	260154	260159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954028
4576	NC_016831	GCGG	2	8	260185	260192	0 %	0 %	75 %	25 %	378954028
4577	NC_016831	GCA	2	6	260215	260220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954028
4578	NC_016831	TGG	2	6	260351	260356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954028
4579	NC_016831	GTC	2	6	260413	260418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954028
4580	NC_016831	CCA	2	6	260461	260466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954028
4581	NC_016831	TGA	2	6	260467	260472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954028
4582	NC_016831	ATCC	2	8	260541	260548	25 %	25 %	0 %	50 %	378954028
4583	NC_016831	TCAT	2	8	260557	260564	25 %	50 %	0 %	25 %	378954028
4584	NC_016831	ATGGC	2	10	260643	260652	20 %	20 %	40 %	20 %	378954028
4585	NC_016831	GC	3	6	260671	260676	0 %	0 %	50 %	50 %	378954028
4586	NC_016831	GC	3	6	260701	260706	0 %	0 %	50 %	50 %	378954028
4587	NC_016831	GC	3	6	260716	260721	0 %	0 %	50 %	50 %	378954028
4588	NC_016831	GGC	2	6	260780	260785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954028
4589	NC_016831	ACG	2	6	260787	260792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954028
4590	NC_016831	GGAT	2	8	260890	260897	25 %	25 %	50 %	0 %	378954028
4591	NC_016831	TGA	2	6	260918	260923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954028
4592	NC_016831	CG	3	6	260945	260950	0 %	0 %	50 %	50 %	378954028
4593	NC_016831	ATGG	2	8	261372	261379	25 %	25 %	50 %	0 %	378954029
4594	NC_016831	GTCC	2	8	261443	261450	0 %	25 %	25 %	50 %	378954029
4595	NC_016831	TGC	2	6	261467	261472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954029
4596	NC_016831	TAG	2	6	261509	261514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954029
4597	NC_016831	ACCG	2	8	261526	261533	25 %	0 %	25 %	50 %	378954029
4598	NC_016831	TG	3	6	261566	261571	0 %	50 %	50 %	0 %	378954029
4599	NC_016831	TAT	2	6	261623	261628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954029
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4601	NC_016831	CGG	2	6	261734	261739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954029
4602	NC_016831	TGC	2	6	261796	261801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954029
4603	NC_016831	TGA	2	6	261815	261820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954029
4604	NC_016831	AG	3	6	261821	261826	50 %	0 %	50 %	0 %	378954029
4605	NC_016831	ACTTT	2	10	261938	261947	20 %	60 %	0 %	20 %	378954029
4606	NC_016831	CGT	2	6	262020	262025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954029
4607	NC_016831	CGG	2	6	262028	262033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954029
4608	NC_016831	TGA	2	6	262046	262051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954029
4609	NC_016831	T	7	7	262132	262138	0 %	100 %	0 %	0 %	378954030
4610	NC_016831	GCC	2	6	262142	262147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954030
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4612	NC_016831	CGC	2	6	262220	262225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954030
4613	NC_016831	TGGC	2	8	262242	262249	0 %	25 %	50 %	25 %	378954030
4614	NC_016831	TG	3	6	262255	262260	0 %	50 %	50 %	0 %	378954030
4615	NC_016831	TTG	2	6	262287	262292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954030
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4620	NC_016831	CGG	2	6	262399	262404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954030
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4622	NC_016831	ATT	2	6	262592	262597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954030
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4986	NC_016831	AGC	2	6	281884	281889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954045
4987	NC_016831	AGA	2	6	281890	281895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954045
4988	NC_016831	AAG	2	6	281898	281903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954045
4989	NC_016831	ATG	2	6	282199	282204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954046
4990	NC_016831	TCAT	2	8	282260	282267	25 %	50 %	0 %	25 %	378954047
4991	NC_016831	GCA	2	6	282297	282302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954047
4992	NC_016831	GCC	2	6	282345	282350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954047
4993	NC_016831	CGT	2	6	282687	282692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954048
4994	NC_016831	ATG	2	6	282775	282780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954048
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5000	NC_016831	CAG	2	6	283006	283011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954048

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