MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016825	GT	3	6	480	485	0 %	50 %	50 %	0 %	378962822
2	NC_016825	TC	3	6	974	979	0 %	50 %	0 %	50 %	378962823
3	NC_016825	CA	3	6	1035	1040	50 %	0 %	0 %	50 %	378962823
4	NC_016825	AT	3	6	1534	1539	50 %	50 %	0 %	0 %	378962823
5	NC_016825	CA	3	6	2158	2163	50 %	0 %	0 %	50 %	378962824
6	NC_016825	TG	4	8	2467	2474	0 %	50 %	50 %	0 %	378962825
7	NC_016825	CA	3	6	2978	2983	50 %	0 %	0 %	50 %	378962825
8	NC_016825	TC	3	6	3108	3113	0 %	50 %	0 %	50 %	378962825
9	NC_016825	TC	3	6	3458	3463	0 %	50 %	0 %	50 %	378962826
10	NC_016825	CA	3	6	5995	6000	50 %	0 %	0 %	50 %	378962831
11	NC_016825	GA	3	6	8235	8240	50 %	0 %	50 %	0 %	378962834
12	NC_016825	GA	3	6	8901	8906	50 %	0 %	50 %	0 %	378962835
13	NC_016825	AT	4	8	9266	9273	50 %	50 %	0 %	0 %	378962835
14	NC_016825	AT	3	6	9351	9356	50 %	50 %	0 %	0 %	378962835
15	NC_016825	AC	3	6	9792	9797	50 %	0 %	0 %	50 %	378962836
16	NC_016825	TA	3	6	11676	11681	50 %	50 %	0 %	0 %	378962838
17	NC_016825	CT	3	6	11843	11848	0 %	50 %	0 %	50 %	378962838
18	NC_016825	CA	3	6	13990	13995	50 %	0 %	0 %	50 %	378962841
19	NC_016825	AT	3	6	14028	14033	50 %	50 %	0 %	0 %	378962841
20	NC_016825	TC	3	6	14512	14517	0 %	50 %	0 %	50 %	378962841
21	NC_016825	AT	3	6	14842	14847	50 %	50 %	0 %	0 %	378962842
22	NC_016825	AC	3	6	15694	15699	50 %	0 %	0 %	50 %	378962843
23	NC_016825	TC	3	6	16751	16756	0 %	50 %	0 %	50 %	378962843
24	NC_016825	AG	3	6	17189	17194	50 %	0 %	50 %	0 %	378962844
25	NC_016825	TA	3	6	18380	18385	50 %	50 %	0 %	0 %	378962845
26	NC_016825	TA	3	6	19333	19338	50 %	50 %	0 %	0 %	378962846
27	NC_016825	AC	3	6	20411	20416	50 %	0 %	0 %	50 %	378962847
28	NC_016825	TA	3	6	20487	20492	50 %	50 %	0 %	0 %	378962847
29	NC_016825	CT	3	6	20769	20774	0 %	50 %	0 %	50 %	378962848
30	NC_016825	TC	4	8	20896	20903	0 %	50 %	0 %	50 %	378962848
31	NC_016825	GT	3	6	21365	21370	0 %	50 %	50 %	0 %	378962849
32	NC_016825	CT	3	6	21547	21552	0 %	50 %	0 %	50 %	378962849
33	NC_016825	GT	3	6	21690	21695	0 %	50 %	50 %	0 %	378962849
34	NC_016825	GC	3	6	23806	23811	0 %	0 %	50 %	50 %	378962851
35	NC_016825	CT	3	6	25288	25293	0 %	50 %	0 %	50 %	378962854
36	NC_016825	CT	3	6	25435	25440	0 %	50 %	0 %	50 %	378962854
37	NC_016825	CT	3	6	27370	27375	0 %	50 %	0 %	50 %	378962855
38	NC_016825	CA	3	6	27478	27483	50 %	0 %	0 %	50 %	378962855
39	NC_016825	CG	3	6	27894	27899	0 %	0 %	50 %	50 %	378962855
40	NC_016825	CA	3	6	28222	28227	50 %	0 %	0 %	50 %	378962855
41	NC_016825	AT	3	6	29195	29200	50 %	50 %	0 %	0 %	378962855
42	NC_016825	TA	3	6	29228	29233	50 %	50 %	0 %	0 %	378962856
43	NC_016825	CA	3	6	29437	29442	50 %	0 %	0 %	50 %	378962856
44	NC_016825	CT	3	6	30340	30345	0 %	50 %	0 %	50 %	378962857
45	NC_016825	CT	3	6	30913	30918	0 %	50 %	0 %	50 %	378962858
46	NC_016825	TC	3	6	32416	32421	0 %	50 %	0 %	50 %	378962859
47	NC_016825	GA	3	6	34393	34398	50 %	0 %	50 %	0 %	378962862
48	NC_016825	AG	3	6	35402	35407	50 %	0 %	50 %	0 %	378962862
49	NC_016825	AG	3	6	36212	36217	50 %	0 %	50 %	0 %	378962862
50	NC_016825	AT	3	6	36430	36435	50 %	50 %	0 %	0 %	378962862
51	NC_016825	GA	3	6	37520	37525	50 %	0 %	50 %	0 %	378962863
52	NC_016825	CT	3	6	37680	37685	0 %	50 %	0 %	50 %	378962864
53	NC_016825	CT	3	6	37860	37865	0 %	50 %	0 %	50 %	378962864
54	NC_016825	CT	3	6	39370	39375	0 %	50 %	0 %	50 %	378962866
55	NC_016825	TC	3	6	39576	39581	0 %	50 %	0 %	50 %	378962866
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58	NC_016825	AC	3	6	42113	42118	50 %	0 %	0 %	50 %	378962869
59	NC_016825	AT	4	8	43532	43539	50 %	50 %	0 %	0 %	378962872
60	NC_016825	TA	3	6	44427	44432	50 %	50 %	0 %	0 %	378962873
61	NC_016825	GT	3	6	45722	45727	0 %	50 %	50 %	0 %	378962874
62	NC_016825	CG	3	6	45918	45923	0 %	0 %	50 %	50 %	378962874
63	NC_016825	AG	3	6	46299	46304	50 %	0 %	50 %	0 %	378962874
64	NC_016825	CG	3	6	50995	51000	0 %	0 %	50 %	50 %	378962882
65	NC_016825	TA	3	6	51357	51362	50 %	50 %	0 %	0 %	378962882
66	NC_016825	AT	3	6	51408	51413	50 %	50 %	0 %	0 %	378962882
67	NC_016825	AG	3	6	51576	51581	50 %	0 %	50 %	0 %	378962882
68	NC_016825	TG	3	6	51750	51755	0 %	50 %	50 %	0 %	378962882
69	NC_016825	AT	3	6	52336	52341	50 %	50 %	0 %	0 %	378962883
70	NC_016825	GT	3	6	52773	52778	0 %	50 %	50 %	0 %	378962883
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72	NC_016825	TG	3	6	57302	57307	0 %	50 %	50 %	0 %	378962887
73	NC_016825	GA	3	6	58629	58634	50 %	0 %	50 %	0 %	378962888
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77	NC_016825	AT	3	6	66398	66403	50 %	50 %	0 %	0 %	378962901
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81	NC_016825	AT	3	6	69860	69865	50 %	50 %	0 %	0 %	378962906
82	NC_016825	CA	3	6	70465	70470	50 %	0 %	0 %	50 %	378962906
83	NC_016825	AG	3	6	70582	70587	50 %	0 %	50 %	0 %	378962906
84	NC_016825	AT	3	6	70976	70981	50 %	50 %	0 %	0 %	378962907
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90	NC_016825	AC	3	6	83065	83070	50 %	0 %	0 %	50 %	378962920
91	NC_016825	AG	3	6	83100	83105	50 %	0 %	50 %	0 %	378962920
92	NC_016825	GA	3	6	85718	85723	50 %	0 %	50 %	0 %	378962921
93	NC_016825	TC	3	6	88139	88144	0 %	50 %	0 %	50 %	378962927
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103	NC_016825	AT	3	6	97707	97712	50 %	50 %	0 %	0 %	378962941
104	NC_016825	AG	3	6	98035	98040	50 %	0 %	50 %	0 %	378962941
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106	NC_016825	TG	3	6	98395	98400	0 %	50 %	50 %	0 %	378962942
107	NC_016825	GA	3	6	99429	99434	50 %	0 %	50 %	0 %	378962945
108	NC_016825	TC	3	6	100145	100150	0 %	50 %	0 %	50 %	378962947
109	NC_016825	CG	3	6	101794	101799	0 %	0 %	50 %	50 %	378962951
110	NC_016825	AG	4	8	103652	103659	50 %	0 %	50 %	0 %	378962955
111	NC_016825	GC	4	8	104095	104102	0 %	0 %	50 %	50 %	378962956
112	NC_016825	CA	3	6	104733	104738	50 %	0 %	0 %	50 %	378962957
113	NC_016825	GA	3	6	108018	108023	50 %	0 %	50 %	0 %	378962967
114	NC_016825	TA	3	6	116499	116504	50 %	50 %	0 %	0 %	378962982
115	NC_016825	CA	4	8	117376	117383	50 %	0 %	0 %	50 %	378962983
116	NC_016825	GA	4	8	117515	117522	50 %	0 %	50 %	0 %	378962983
117	NC_016825	CA	3	6	117957	117962	50 %	0 %	0 %	50 %	378962983
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121	NC_016825	TC	3	6	119752	119757	0 %	50 %	0 %	50 %	378962984
122	NC_016825	GA	3	6	119769	119774	50 %	0 %	50 %	0 %	378962984
123	NC_016825	AT	3	6	122529	122534	50 %	50 %	0 %	0 %	378962985
124	NC_016825	AT	3	6	123291	123296	50 %	50 %	0 %	0 %	378962986
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126	NC_016825	AT	3	6	124031	124036	50 %	50 %	0 %	0 %	378962987
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128	NC_016825	AG	3	6	127175	127180	50 %	0 %	50 %	0 %	378962991
129	NC_016825	AT	3	6	131162	131167	50 %	50 %	0 %	0 %	378962997
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138	NC_016825	GC	3	6	135344	135349	0 %	0 %	50 %	50 %	378963001
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141	NC_016825	GT	3	6	135550	135555	0 %	50 %	50 %	0 %	378963001
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.