MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 2883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016825	AGG	2	6	96450	96455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962940
1502	NC_016825	TGC	2	6	96462	96467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962940
1503	NC_016825	G	7	7	96548	96554	0 %	0 %	100 %	0 %	378962940
1504	NC_016825	TCT	2	6	96562	96567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962940
1505	NC_016825	CGA	2	6	96568	96573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962940
1506	NC_016825	CAC	2	6	96615	96620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962940
1507	NC_016825	GAGC	2	8	96716	96723	25 %	0 %	50 %	25 %	378962940
1508	NC_016825	TGA	2	6	96735	96740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962940
1509	NC_016825	GAA	2	6	96773	96778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962940
1510	NC_016825	GT	3	6	96852	96857	0 %	50 %	50 %	0 %	378962940
1511	NC_016825	GGC	3	9	96880	96888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962940
1512	NC_016825	CGC	2	6	97002	97007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962940
1513	NC_016825	GCC	2	6	97026	97031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962940
1514	NC_016825	TG	3	6	97130	97135	0 %	50 %	50 %	0 %	378962940
1515	NC_016825	ACA	2	6	97149	97154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962940
1516	NC_016825	G	7	7	97165	97171	0 %	0 %	100 %	0 %	378962940
1517	NC_016825	ACG	2	6	97178	97183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962940
1518	NC_016825	AAC	2	6	97197	97202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962940
1519	NC_016825	GAA	2	6	97298	97303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962940
1520	NC_016825	CGG	2	6	97476	97481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962940
1521	NC_016825	GTT	2	6	97483	97488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962940
1522	NC_016825	CTG	2	6	97517	97522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962940
1523	NC_016825	AT	3	6	97707	97712	50 %	50 %	0 %	0 %	378962941
1524	NC_016825	TAA	2	6	97779	97784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962941
1525	NC_016825	CTT	2	6	97804	97809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962941
1526	NC_016825	TTG	2	6	97814	97819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962941
1527	NC_016825	T	9	9	97888	97896	0 %	100 %	0 %	0 %	378962941
1528	NC_016825	GAA	2	6	97944	97949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962941
1529	NC_016825	GGAA	2	8	97955	97962	50 %	0 %	50 %	0 %	378962941
1530	NC_016825	AG	3	6	98035	98040	50 %	0 %	50 %	0 %	378962941
1531	NC_016825	TA	3	6	98096	98101	50 %	50 %	0 %	0 %	378962941
1532	NC_016825	A	6	6	98275	98280	100 %	0 %	0 %	0 %	378962942
1533	NC_016825	CGTTTT	2	12	98285	98296	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378962942
1534	NC_016825	GCT	3	9	98319	98327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962942
1535	NC_016825	TGCAC	2	10	98339	98348	20 %	20 %	20 %	40 %	378962942
1536	NC_016825	TG	3	6	98395	98400	0 %	50 %	50 %	0 %	378962942
1537	NC_016825	CGG	2	6	98429	98434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962942
1538	NC_016825	ATG	2	6	98652	98657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962943
1539	NC_016825	CGG	2	6	98699	98704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962943
1540	NC_016825	TCT	2	6	98733	98738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962943
1541	NC_016825	AAT	2	6	98766	98771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962943
1542	NC_016825	TTG	2	6	98907	98912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962944
1543	NC_016825	GGCG	2	8	98929	98936	0 %	0 %	75 %	25 %	378962944
1544	NC_016825	CAT	2	6	98937	98942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962944
1545	NC_016825	ATA	2	6	99030	99035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962944
1546	NC_016825	T	6	6	99080	99085	0 %	100 %	0 %	0 %	378962944
1547	NC_016825	CTG	2	6	99113	99118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962944
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1550	NC_016825	GA	3	6	99429	99434	50 %	0 %	50 %	0 %	378962945
1551	NC_016825	ATTA	2	8	99533	99540	50 %	50 %	0 %	0 %	378962945
1552	NC_016825	CCA	2	6	99639	99644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962946
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1555	NC_016825	GAA	2	6	99680	99685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962946
1556	NC_016825	GCC	2	6	99718	99723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962946
1557	NC_016825	ATG	2	6	99760	99765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962946
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1559	NC_016825	GCT	2	6	100065	100070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962947
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1561	NC_016825	T	6	6	100181	100186	0 %	100 %	0 %	0 %	378962947
1562	NC_016825	CGGA	2	8	100196	100203	25 %	0 %	50 %	25 %	378962947
1563	NC_016825	T	6	6	100216	100221	0 %	100 %	0 %	0 %	378962947
1564	NC_016825	AGC	2	6	100310	100315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962947
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1583	NC_016825	CG	3	6	101794	101799	0 %	0 %	50 %	50 %	378962951
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1588	NC_016825	TGA	2	6	102075	102080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962951
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1591	NC_016825	CGT	2	6	102220	102225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962951
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1593	NC_016825	A	7	7	102258	102264	100 %	0 %	0 %	0 %	378962951
1594	NC_016825	GCCA	2	8	102266	102273	25 %	0 %	25 %	50 %	378962951
1595	NC_016825	GCT	2	6	102465	102470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962952
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1599	NC_016825	ATG	2	6	102657	102662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962953
1600	NC_016825	CGG	2	6	102669	102674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962953
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1602	NC_016825	CAC	2	6	103104	103109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962954
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1604	NC_016825	CAA	2	6	103178	103183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962954
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1606	NC_016825	T	6	6	103329	103334	0 %	100 %	0 %	0 %	378962954
1607	NC_016825	GCGG	2	8	103373	103380	0 %	0 %	75 %	25 %	378962954
1608	NC_016825	GCA	2	6	103630	103635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962955
1609	NC_016825	AAAAT	2	10	103642	103651	80 %	20 %	0 %	0 %	378962955
1610	NC_016825	AG	4	8	103652	103659	50 %	0 %	50 %	0 %	378962955
1611	NC_016825	A	6	6	103680	103685	100 %	0 %	0 %	0 %	378962955
1612	NC_016825	A	7	7	103711	103717	100 %	0 %	0 %	0 %	378962955
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1619	NC_016825	GC	4	8	104095	104102	0 %	0 %	50 %	50 %	378962956
1620	NC_016825	TCG	2	6	104172	104177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962956
1621	NC_016825	CAG	2	6	104288	104293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962956
1622	NC_016825	TCACGC	2	12	104367	104378	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378962956
1623	NC_016825	GAC	2	6	104389	104394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962956
1624	NC_016825	AGA	3	9	104452	104460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962956
1625	NC_016825	CGT	3	9	104479	104487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962956
1626	NC_016825	CGGG	2	8	104528	104535	0 %	0 %	75 %	25 %	378962956
1627	NC_016825	TCG	3	9	104577	104585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962956
1628	NC_016825	CA	3	6	104733	104738	50 %	0 %	0 %	50 %	378962957
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1630	NC_016825	TGA	2	6	105157	105162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962959
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1633	NC_016825	CGG	2	6	105328	105333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962959
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1639	NC_016825	CAGCGT	2	12	106002	106013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378962961
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1644	NC_016825	CTG	2	6	106379	106384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962962
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