MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid B

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016823	ATG	2	6	41	46	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181724
2	NC_016823	GGT	3	9	106	114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181724
3	NC_016823	GAA	2	6	186	191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181724
4	NC_016823	AAT	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181724
5	NC_016823	AGA	2	6	402	407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181724
6	NC_016823	AAG	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181724
7	NC_016823	AAC	2	6	458	463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181724
8	NC_016823	GCA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181724
9	NC_016823	TGC	3	9	591	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181724
10	NC_016823	GTC	2	6	797	802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181724
11	NC_016823	CCA	2	6	815	820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181724
12	NC_016823	TGA	2	6	840	845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181724
13	NC_016823	GGA	2	6	849	854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181724
14	NC_016823	TAA	3	9	942	950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181724
15	NC_016823	CAG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181724
16	NC_016823	ATG	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181724
17	NC_016823	GCT	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181724
18	NC_016823	ATG	2	6	1331	1336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181724
19	NC_016823	AGA	2	6	1400	1405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181724
20	NC_016823	TGT	3	9	1431	1439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181724
21	NC_016823	ATT	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181724
22	NC_016823	ATT	2	6	1671	1676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181725
23	NC_016823	ATA	2	6	1809	1814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181725
24	NC_016823	GTT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181725
25	NC_016823	GTA	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181725
26	NC_016823	CCT	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181726
27	NC_016823	CAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181726
28	NC_016823	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181726
29	NC_016823	TTC	2	6	2985	2990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181727
30	NC_016823	AGC	2	6	3058	3063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181727
31	NC_016823	TGC	3	9	3109	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181727
32	NC_016823	AGA	3	9	3474	3482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181728
33	NC_016823	GCT	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181728
34	NC_016823	GGC	2	6	3540	3545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181728
35	NC_016823	AAG	2	6	3593	3598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181728
36	NC_016823	TGC	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181729
37	NC_016823	GTT	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181729
38	NC_016823	CAT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181729
39	NC_016823	TCA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181729
40	NC_016823	TGT	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181729
41	NC_016823	CGT	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.