MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 6442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016822	CT	3	6	445	450	0 %	50 %	0 %	50 %	383176585
2	NC_016822	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	383176585
3	NC_016822	TG	3	6	1435	1440	0 %	50 %	50 %	0 %	383176585
4	NC_016822	CG	4	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	383176585
5	NC_016822	GC	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	383176587
6	NC_016822	GC	3	6	4442	4447	0 %	0 %	50 %	50 %	383176587
7	NC_016822	TG	3	6	4815	4820	0 %	50 %	50 %	0 %	383176587
8	NC_016822	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	383176587
9	NC_016822	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	383176591
10	NC_016822	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	383176591
11	NC_016822	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	383176592
12	NC_016822	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	383176592
13	NC_016822	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	383176593
14	NC_016822	AG	3	6	11612	11617	50 %	0 %	50 %	0 %	383176596
15	NC_016822	CG	3	6	13558	13563	0 %	0 %	50 %	50 %	383176597
16	NC_016822	CG	3	6	14501	14506	0 %	0 %	50 %	50 %	383176598
17	NC_016822	CT	3	6	15556	15561	0 %	50 %	0 %	50 %	383176599
18	NC_016822	AG	3	6	17151	17156	50 %	0 %	50 %	0 %	383176601
19	NC_016822	TG	3	6	17670	17675	0 %	50 %	50 %	0 %	383176601
20	NC_016822	TG	3	6	18115	18120	0 %	50 %	50 %	0 %	383176601
21	NC_016822	AG	3	6	18833	18838	50 %	0 %	50 %	0 %	383176603
22	NC_016822	GA	3	6	19008	19013	50 %	0 %	50 %	0 %	383176603
23	NC_016822	CT	3	6	20338	20343	0 %	50 %	0 %	50 %	383176605
24	NC_016822	TG	3	6	20388	20393	0 %	50 %	50 %	0 %	383176605
25	NC_016822	TA	3	6	22820	22825	50 %	50 %	0 %	0 %	383176607
26	NC_016822	AT	4	8	22942	22949	50 %	50 %	0 %	0 %	383176608
27	NC_016822	TA	3	6	23156	23161	50 %	50 %	0 %	0 %	383176608
28	NC_016822	AT	3	6	23591	23596	50 %	50 %	0 %	0 %	383176608
29	NC_016822	AT	3	6	25718	25723	50 %	50 %	0 %	0 %	383176612
30	NC_016822	TA	3	6	26288	26293	50 %	50 %	0 %	0 %	383176612
31	NC_016822	GC	3	6	27433	27438	0 %	0 %	50 %	50 %	383176613
32	NC_016822	GT	3	6	27843	27848	0 %	50 %	50 %	0 %	383176615
33	NC_016822	CG	3	6	27889	27894	0 %	0 %	50 %	50 %	383176615
34	NC_016822	CG	3	6	29275	29280	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
35	NC_016822	GC	3	6	29948	29953	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
36	NC_016822	CG	3	6	30022	30027	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
37	NC_016822	CG	3	6	30750	30755	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
38	NC_016822	GC	3	6	31912	31917	0 %	0 %	50 %	50 %	383176617
39	NC_016822	AT	3	6	32759	32764	50 %	50 %	0 %	0 %	383176619
40	NC_016822	TG	3	6	33109	33114	0 %	50 %	50 %	0 %	383176619
41	NC_016822	CG	3	6	33383	33388	0 %	0 %	50 %	50 %	383176619
42	NC_016822	CT	3	6	36328	36333	0 %	50 %	0 %	50 %	383176623
43	NC_016822	CG	3	6	36478	36483	0 %	0 %	50 %	50 %	383176623
44	NC_016822	GC	3	6	37291	37296	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
45	NC_016822	GC	3	6	37495	37500	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
46	NC_016822	CG	3	6	37631	37636	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
47	NC_016822	CA	3	6	37648	37653	50 %	0 %	0 %	50 %	383176624
48	NC_016822	TC	3	6	37793	37798	0 %	50 %	0 %	50 %	383176624
49	NC_016822	GC	5	10	39153	39162	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
50	NC_016822	CG	3	6	40263	40268	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
51	NC_016822	TG	3	6	41463	41468	0 %	50 %	50 %	0 %	383176627
52	NC_016822	AG	3	6	41543	41548	50 %	0 %	50 %	0 %	383176627
53	NC_016822	CG	3	6	41722	41727	0 %	0 %	50 %	50 %	383176627
54	NC_016822	CT	3	6	42319	42324	0 %	50 %	0 %	50 %	383176628
55	NC_016822	CA	3	6	42387	42392	50 %	0 %	0 %	50 %	383176628
56	NC_016822	TC	3	6	43276	43281	0 %	50 %	0 %	50 %	383176629
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59	NC_016822	CG	3	6	47161	47166	0 %	0 %	50 %	50 %	383176633
60	NC_016822	TG	3	6	47364	47369	0 %	50 %	50 %	0 %	383176633
61	NC_016822	GC	4	8	48039	48046	0 %	0 %	50 %	50 %	383176634
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63	NC_016822	GC	3	6	51023	51028	0 %	0 %	50 %	50 %	383176636
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71	NC_016822	CG	4	8	58387	58394	0 %	0 %	50 %	50 %	383176644
72	NC_016822	AC	3	6	58871	58876	50 %	0 %	0 %	50 %	383176645
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77	NC_016822	AT	3	6	64648	64653	50 %	50 %	0 %	0 %	383176650
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109	NC_016822	GC	3	6	93212	93217	0 %	0 %	50 %	50 %	383176673
110	NC_016822	GA	3	6	93855	93860	50 %	0 %	50 %	0 %	383176673
111	NC_016822	GC	3	6	94104	94109	0 %	0 %	50 %	50 %	383176674
112	NC_016822	CG	3	6	94335	94340	0 %	0 %	50 %	50 %	383176674
113	NC_016822	GC	3	6	95096	95101	0 %	0 %	50 %	50 %	383176675
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117	NC_016822	GA	3	6	100522	100527	50 %	0 %	50 %	0 %	383176682
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120	NC_016822	GC	3	6	101574	101579	0 %	0 %	50 %	50 %	383176682
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124	NC_016822	GC	3	6	105450	105455	0 %	0 %	50 %	50 %	383176685
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