MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 10291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016822	CAGG	2	8	420	427	25 %	0 %	50 %	25 %	383176585
2	NC_016822	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	383176585
3	NC_016822	GCTG	2	8	975	982	0 %	25 %	50 %	25 %	383176585
4	NC_016822	GGAC	2	8	1013	1020	25 %	0 %	50 %	25 %	383176585
5	NC_016822	GCTG	2	8	1802	1809	0 %	25 %	50 %	25 %	383176585
6	NC_016822	CCAG	2	8	2003	2010	25 %	0 %	25 %	50 %	383176585
7	NC_016822	GCAA	2	8	3030	3037	50 %	0 %	25 %	25 %	383176586
8	NC_016822	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	383176586
9	NC_016822	CAGC	2	8	3283	3290	25 %	0 %	25 %	50 %	383176586
10	NC_016822	CTGG	2	8	3419	3426	0 %	25 %	50 %	25 %	383176586
11	NC_016822	TTCA	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	383176586
12	NC_016822	AGCG	2	8	3565	3572	25 %	0 %	50 %	25 %	383176586
13	NC_016822	CTGA	2	8	3851	3858	25 %	25 %	25 %	25 %	383176587
14	NC_016822	CAGT	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	383176589
15	NC_016822	AGCG	2	8	6270	6277	25 %	0 %	50 %	25 %	383176589
16	NC_016822	GCCA	2	8	7227	7234	25 %	0 %	25 %	50 %	383176590
17	NC_016822	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	383176592
18	NC_016822	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	383176592
19	NC_016822	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	383176592
20	NC_016822	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	383176592
21	NC_016822	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	383176592
22	NC_016822	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	383176594
23	NC_016822	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	383176594
24	NC_016822	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	383176595
25	NC_016822	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	383176595
26	NC_016822	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	383176596
27	NC_016822	ATGG	2	8	12216	12223	25 %	25 %	50 %	0 %	383176597
28	NC_016822	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	383176597
29	NC_016822	ACCG	2	8	12674	12681	25 %	0 %	25 %	50 %	383176597
30	NC_016822	AAGA	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	383176597
31	NC_016822	GTGG	2	8	13179	13186	0 %	25 %	75 %	0 %	383176597
32	NC_016822	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	383176597
33	NC_016822	GACA	2	8	16276	16283	50 %	0 %	25 %	25 %	383176600
34	NC_016822	TGCC	2	8	16777	16784	0 %	25 %	25 %	50 %	383176600
35	NC_016822	ACGG	2	8	17234	17241	25 %	0 %	50 %	25 %	383176601
36	NC_016822	GCCA	2	8	17270	17277	25 %	0 %	25 %	50 %	383176601
37	NC_016822	CGTC	2	8	17448	17455	0 %	25 %	25 %	50 %	383176601
38	NC_016822	GCTG	2	8	17759	17766	0 %	25 %	50 %	25 %	383176601
39	NC_016822	TCAA	2	8	17899	17906	50 %	25 %	0 %	25 %	383176601
40	NC_016822	CTGG	2	8	18217	18224	0 %	25 %	50 %	25 %	383176602
41	NC_016822	GTCA	2	8	18264	18271	25 %	25 %	25 %	25 %	383176602
42	NC_016822	GGCA	2	8	18455	18462	25 %	0 %	50 %	25 %	383176603
43	NC_016822	CTGG	2	8	18575	18582	0 %	25 %	50 %	25 %	383176603
44	NC_016822	CAAA	2	8	18903	18910	75 %	0 %	0 %	25 %	383176603
45	NC_016822	GGTT	2	8	19939	19946	0 %	50 %	50 %	0 %	383176605
46	NC_016822	GTGG	2	8	20563	20570	0 %	25 %	75 %	0 %	383176605
47	NC_016822	CGTT	2	8	20935	20942	0 %	50 %	25 %	25 %	383176605
48	NC_016822	TTTA	2	8	21107	21114	25 %	75 %	0 %	0 %	383176606
49	NC_016822	CCAC	2	8	21410	21417	25 %	0 %	0 %	75 %	383176606
50	NC_016822	AATA	2	8	22040	22047	75 %	25 %	0 %	0 %	383176607
51	NC_016822	CTTC	2	8	22062	22069	0 %	50 %	0 %	50 %	383176607
52	NC_016822	TGTT	2	8	23335	23342	0 %	75 %	25 %	0 %	383176608
53	NC_016822	GCTG	2	8	24142	24149	0 %	25 %	50 %	25 %	383176610
54	NC_016822	TGGC	2	8	24275	24282	0 %	25 %	50 %	25 %	383176610
55	NC_016822	TGGC	2	8	24572	24579	0 %	25 %	50 %	25 %	383176611
56	NC_016822	TAAA	2	8	26006	26013	75 %	25 %	0 %	0 %	383176612
57	NC_016822	CATA	2	8	27810	27817	50 %	25 %	0 %	25 %	383176615
58	NC_016822	TGCG	2	8	28066	28073	0 %	25 %	50 %	25 %	383176615
59	NC_016822	GCGT	2	8	28274	28281	0 %	25 %	50 %	25 %	383176615
60	NC_016822	CCGC	2	8	28697	28704	0 %	0 %	25 %	75 %	383176615
61	NC_016822	CTGG	2	8	29054	29061	0 %	25 %	50 %	25 %	383176616
62	NC_016822	CTGC	2	8	29515	29522	0 %	25 %	25 %	50 %	383176616
63	NC_016822	TGCG	2	8	30065	30072	0 %	25 %	50 %	25 %	383176616
64	NC_016822	TGGT	2	8	30477	30484	0 %	50 %	50 %	0 %	383176616
65	NC_016822	GTGG	2	8	31270	31277	0 %	25 %	75 %	0 %	383176616
66	NC_016822	GCTG	2	8	31624	31631	0 %	25 %	50 %	25 %	383176617
67	NC_016822	ATGG	2	8	32521	32528	25 %	25 %	50 %	0 %	383176618
68	NC_016822	TTGA	2	8	33392	33399	25 %	50 %	25 %	0 %	383176619
69	NC_016822	TGGC	2	8	33935	33942	0 %	25 %	50 %	25 %	383176620
70	NC_016822	CTGG	2	8	34395	34402	0 %	25 %	50 %	25 %	383176620
71	NC_016822	GCTG	2	8	34912	34919	0 %	25 %	50 %	25 %	383176621
72	NC_016822	CGTG	2	8	35389	35396	0 %	25 %	50 %	25 %	383176621
73	NC_016822	CATG	2	8	35859	35866	25 %	25 %	25 %	25 %	383176622
74	NC_016822	TCCT	2	8	36171	36178	0 %	50 %	0 %	50 %	383176623
75	NC_016822	CTTA	2	8	36199	36206	25 %	50 %	0 %	25 %	383176623
76	NC_016822	AGCC	2	8	37101	37108	25 %	0 %	25 %	50 %	383176623
77	NC_016822	GACC	2	8	37367	37374	25 %	0 %	25 %	50 %	383176624
78	NC_016822	CGCA	2	8	38367	38374	25 %	0 %	25 %	50 %	383176624
79	NC_016822	CTGT	2	8	38541	38548	0 %	50 %	25 %	25 %	383176624
80	NC_016822	GGCG	2	8	38717	38724	0 %	0 %	75 %	25 %	383176624
81	NC_016822	ACCG	2	8	38871	38878	25 %	0 %	25 %	50 %	383176624
82	NC_016822	CGTC	2	8	39345	39352	0 %	25 %	25 %	50 %	383176624
83	NC_016822	GGCG	2	8	39554	39561	0 %	0 %	75 %	25 %	383176624
84	NC_016822	TGGC	2	8	39808	39815	0 %	25 %	50 %	25 %	383176624
85	NC_016822	GCTG	2	8	39821	39828	0 %	25 %	50 %	25 %	383176624
86	NC_016822	GCCA	2	8	40785	40792	25 %	0 %	25 %	50 %	383176625
87	NC_016822	CAGC	2	8	40918	40925	25 %	0 %	25 %	50 %	383176625
88	NC_016822	GGTG	2	8	41529	41536	0 %	25 %	75 %	0 %	383176627
89	NC_016822	AAGA	2	8	41764	41771	75 %	0 %	25 %	0 %	383176627
90	NC_016822	CCAT	2	8	42340	42347	25 %	25 %	0 %	50 %	383176628
91	NC_016822	ATTT	2	8	43554	43561	25 %	75 %	0 %	0 %	383176630
92	NC_016822	TTCT	2	8	43566	43573	0 %	75 %	0 %	25 %	383176630
93	NC_016822	TTCA	2	8	43697	43704	25 %	50 %	0 %	25 %	383176630
94	NC_016822	AGCC	2	8	43911	43918	25 %	0 %	25 %	50 %	383176630
95	NC_016822	CCCG	2	8	44073	44080	0 %	0 %	25 %	75 %	383176630
96	NC_016822	TCGG	2	8	44545	44552	0 %	25 %	50 %	25 %	383176630
97	NC_016822	GGCG	2	8	44824	44831	0 %	0 %	75 %	25 %	383176630
98	NC_016822	CCAT	2	8	45358	45365	25 %	25 %	0 %	50 %	383176631
99	NC_016822	TGAT	2	8	45380	45387	25 %	50 %	25 %	0 %	383176631
100	NC_016822	AGGC	2	8	45911	45918	25 %	0 %	50 %	25 %	383176631
101	NC_016822	CCGA	2	8	46997	47004	25 %	0 %	25 %	50 %	383176633
102	NC_016822	CCCG	2	8	47393	47400	0 %	0 %	25 %	75 %	383176633
103	NC_016822	TCCA	2	8	47445	47452	25 %	25 %	0 %	50 %	383176633
104	NC_016822	TTAA	2	8	47698	47705	50 %	50 %	0 %	0 %	383176634
105	NC_016822	TATC	2	8	48091	48098	25 %	50 %	0 %	25 %	383176634
106	NC_016822	CACC	2	8	48242	48249	25 %	0 %	0 %	75 %	383176634
107	NC_016822	AGCC	2	8	48809	48816	25 %	0 %	25 %	50 %	383176634
108	NC_016822	CCAG	2	8	49009	49016	25 %	0 %	25 %	50 %	383176634
109	NC_016822	AACC	2	8	49017	49024	50 %	0 %	0 %	50 %	383176634
110	NC_016822	GTGC	2	8	49712	49719	0 %	25 %	50 %	25 %	383176635
111	NC_016822	TGAT	2	8	49948	49955	25 %	50 %	25 %	0 %	383176635
112	NC_016822	CTGC	2	8	50208	50215	0 %	25 %	25 %	50 %	383176635
113	NC_016822	GTCG	2	8	51074	51081	0 %	25 %	50 %	25 %	383176636
114	NC_016822	ATGG	2	8	51181	51188	25 %	25 %	50 %	0 %	383176636
115	NC_016822	TGGT	2	8	51276	51283	0 %	50 %	50 %	0 %	383176636
116	NC_016822	GTTA	2	8	51558	51565	25 %	50 %	25 %	0 %	383176637
117	NC_016822	CACC	2	8	52109	52116	25 %	0 %	0 %	75 %	383176637
118	NC_016822	GTTG	2	8	52338	52345	0 %	50 %	50 %	0 %	383176637
119	NC_016822	ATTG	2	8	52356	52363	25 %	50 %	25 %	0 %	383176637
120	NC_016822	CCTT	2	8	52568	52575	0 %	50 %	0 %	50 %	383176637
121	NC_016822	TGTT	2	8	53396	53403	0 %	75 %	25 %	0 %	383176639
122	NC_016822	TGTT	2	8	53641	53648	0 %	75 %	25 %	0 %	383176639
123	NC_016822	CTGG	2	8	54096	54103	0 %	25 %	50 %	25 %	383176640
124	NC_016822	TGCG	2	8	55301	55308	0 %	25 %	50 %	25 %	383176642
125	NC_016822	ATGA	2	8	55456	55463	50 %	25 %	25 %	0 %	383176642
126	NC_016822	GGCG	2	8	55797	55804	0 %	0 %	75 %	25 %	383176642
127	NC_016822	GGAT	2	8	56411	56418	25 %	25 %	50 %	0 %	383176642
128	NC_016822	AACC	2	8	56481	56488	50 %	0 %	0 %	50 %	383176642
129	NC_016822	CAGG	2	8	56578	56585	25 %	0 %	50 %	25 %	383176642
130	NC_016822	TGGC	2	8	56844	56851	0 %	25 %	50 %	25 %	383176642
131	NC_016822	CCTG	2	8	57179	57186	0 %	25 %	25 %	50 %	383176643
132	NC_016822	TAAA	2	8	57217	57224	75 %	25 %	0 %	0 %	383176643
133	NC_016822	AATC	2	8	57253	57260	50 %	25 %	0 %	25 %	383176643
134	NC_016822	GCAG	2	8	57742	57749	25 %	0 %	50 %	25 %	383176644
135	NC_016822	AATG	2	8	58519	58526	50 %	25 %	25 %	0 %	383176645
136	NC_016822	GGCA	2	8	59967	59974	25 %	0 %	50 %	25 %	383176647
137	NC_016822	CGGT	2	8	60568	60575	0 %	25 %	50 %	25 %	383176647
138	NC_016822	GTCA	2	8	61091	61098	25 %	25 %	25 %	25 %	383176648
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