MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016822	CTGA	2	8	190063	190070	25 %	25 %	25 %	25 %	383176765
3502	NC_016822	GGC	2	6	190086	190091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176765
3503	NC_016822	ACGGG	2	10	190101	190110	20 %	0 %	60 %	20 %	383176765
3504	NC_016822	GAA	2	6	190111	190116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176765
3505	NC_016822	GCG	2	6	190131	190136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176765
3506	NC_016822	GTG	2	6	190263	190268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176765
3507	NC_016822	TTA	2	6	190317	190322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176765
3508	NC_016822	GAA	2	6	190330	190335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176765
3509	NC_016822	CGA	2	6	190416	190421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176765
3510	NC_016822	TG	3	6	190432	190437	0 %	50 %	50 %	0 %	383176765
3511	NC_016822	TGC	2	6	190455	190460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176765
3512	NC_016822	CCT	2	6	190530	190535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176766
3513	NC_016822	GTG	2	6	190553	190558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176766
3514	NC_016822	A	6	6	190756	190761	100 %	0 %	0 %	0 %	383176766
3515	NC_016822	GCTG	2	8	190868	190875	0 %	25 %	50 %	25 %	383176767
3516	NC_016822	GTT	2	6	190906	190911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176767
3517	NC_016822	CTG	2	6	190963	190968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176767
3518	NC_016822	GTG	2	6	190981	190986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176767
3519	NC_016822	TGGC	2	8	191001	191008	0 %	25 %	50 %	25 %	383176767
3520	NC_016822	GCA	2	6	191097	191102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176767
3521	NC_016822	T	6	6	191386	191391	0 %	100 %	0 %	0 %	383176768
3522	NC_016822	TAAA	2	8	191414	191421	75 %	25 %	0 %	0 %	383176768
3523	NC_016822	CTGC	2	8	191458	191465	0 %	25 %	25 %	50 %	383176768
3524	NC_016822	ATT	2	6	191493	191498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176768
3525	NC_016822	TCT	2	6	191523	191528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176768
3526	NC_016822	TA	3	6	191534	191539	50 %	50 %	0 %	0 %	383176768
3527	NC_016822	AGC	2	6	191582	191587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176768
3528	NC_016822	ATT	2	6	191619	191624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176768
3529	NC_016822	TTA	2	6	191641	191646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176768
3530	NC_016822	ATT	2	6	191813	191818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176768
3531	NC_016822	GCC	2	6	191825	191830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176768
3532	NC_016822	GACC	2	8	191856	191863	25 %	0 %	25 %	50 %	383176768
3533	NC_016822	A	7	7	192043	192049	100 %	0 %	0 %	0 %	383176769
3534	NC_016822	CT	3	6	192103	192108	0 %	50 %	0 %	50 %	383176769
3535	NC_016822	CGG	2	6	192113	192118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176769
3536	NC_016822	CTT	2	6	192125	192130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176769
3537	NC_016822	CAG	2	6	192145	192150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3538	NC_016822	CGC	2	6	192233	192238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176769
3539	NC_016822	CAG	2	6	192256	192261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3540	NC_016822	TTC	2	6	192262	192267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176769
3541	NC_016822	TGA	2	6	192270	192275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176769
3542	NC_016822	G	6	6	192327	192332	0 %	0 %	100 %	0 %	383176769
3543	NC_016822	GGC	3	9	192346	192354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176769
3544	NC_016822	TCA	2	6	192389	192394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176769
3545	NC_016822	GTC	2	6	192415	192420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3546	NC_016822	CAA	2	6	192423	192428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176769
3547	NC_016822	TGT	2	6	192432	192437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176769
3548	NC_016822	GGT	2	6	192748	192753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176769
3549	NC_016822	CGG	2	6	192813	192818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176769
3550	NC_016822	ATCGGT	2	12	192823	192834	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383176769
3551	NC_016822	TGG	2	6	192878	192883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176769
3552	NC_016822	TCC	2	6	193006	193011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176769
3553	NC_016822	GTGAT	2	10	193037	193046	20 %	40 %	40 %	0 %	383176769
3554	NC_016822	CAG	2	6	193071	193076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3555	NC_016822	GCA	2	6	193118	193123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3556	NC_016822	GCA	2	6	193179	193184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3557	NC_016822	AGC	2	6	193186	193191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3558	NC_016822	CAA	2	6	193248	193253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176769
3559	NC_016822	AAC	2	6	193279	193284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176769
3560	NC_016822	GAA	2	6	193320	193325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176769
3561	NC_016822	GTGAT	2	10	193328	193337	20 %	40 %	40 %	0 %	383176769
3562	NC_016822	CAG	2	6	193351	193356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3563	NC_016822	GCG	2	6	193430	193435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176769
3564	NC_016822	TGGC	3	12	193620	193631	0 %	25 %	50 %	25 %	383176770
3565	NC_016822	CAT	2	6	193678	193683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176770
3566	NC_016822	GCG	2	6	193731	193736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176770
3567	NC_016822	GTC	2	6	193796	193801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176770
3568	NC_016822	ATG	2	6	193958	193963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176770
3569	NC_016822	GAA	2	6	194015	194020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176770
3570	NC_016822	TGA	2	6	194025	194030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176770
3571	NC_016822	GAG	2	6	194045	194050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176770
3572	NC_016822	TCAA	2	8	194097	194104	50 %	25 %	0 %	25 %	383176770
3573	NC_016822	GTG	2	6	194111	194116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176770
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3578	NC_016822	TGG	2	6	194244	194249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176770
3579	NC_016822	AGA	2	6	194290	194295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176770
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3583	NC_016822	GCT	2	6	194463	194468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176770
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3587	NC_016822	TGA	2	6	194725	194730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176770
3588	NC_016822	TGC	2	6	194736	194741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176770
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3590	NC_016822	GACT	2	8	194922	194929	25 %	25 %	25 %	25 %	383176771
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3592	NC_016822	TCA	2	6	195007	195012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176771
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3594	NC_016822	CGA	2	6	195077	195082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176771
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3600	NC_016822	CCG	2	6	195588	195593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176772
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3603	NC_016822	GGT	2	6	195702	195707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176772
3604	NC_016822	ACA	2	6	195790	195795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176772
3605	NC_016822	T	7	7	195837	195843	0 %	100 %	0 %	0 %	383176772
3606	NC_016822	G	6	6	195904	195909	0 %	0 %	100 %	0 %	383176772
3607	NC_016822	ATA	2	6	195952	195957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176772
3608	NC_016822	CGC	2	6	195964	195969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176772
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3610	NC_016822	A	6	6	196100	196105	100 %	0 %	0 %	0 %	383176772
3611	NC_016822	TCG	2	6	196183	196188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176772
3612	NC_016822	CAA	2	6	196202	196207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176772
3613	NC_016822	CGG	2	6	196209	196214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176772
3614	NC_016822	ATC	2	6	196221	196226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176772
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3619	NC_016822	ATG	2	6	196572	196577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176773
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3621	NC_016822	TCA	2	6	196698	196703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176773
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3732	NC_016822	GAA	2	6	202673	202678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176777
3733	NC_016822	CGTT	2	8	202711	202718	0 %	50 %	25 %	25 %	383176777
3734	NC_016822	GCT	2	6	202745	202750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176777
3735	NC_016822	GACT	2	8	202820	202827	25 %	25 %	25 %	25 %	383176777
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3738	NC_016822	TGGTG	2	10	203164	203173	0 %	40 %	60 %	0 %	383176778
3739	NC_016822	TGG	2	6	203176	203181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176778
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3852	NC_016822	TC	3	6	209665	209670	0 %	50 %	0 %	50 %	383176784
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3862	NC_016822	AACC	2	8	210503	210510	50 %	0 %	0 %	50 %	383176784
3863	NC_016822	GGT	2	6	210540	210545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176784
3864	NC_016822	TCT	2	6	210550	210555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176784
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3866	NC_016822	GACGT	2	10	210618	210627	20 %	20 %	40 %	20 %	383176784
3867	NC_016822	GAC	2	6	210786	210791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176784
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3869	NC_016822	CGAT	2	8	210943	210950	25 %	25 %	25 %	25 %	383176784
3870	NC_016822	GTT	2	6	210966	210971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176784
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3873	NC_016822	CGTG	2	8	211061	211068	0 %	25 %	50 %	25 %	383176784
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3878	NC_016822	TTA	2	6	211651	211656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176785
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3982	NC_016822	GCC	2	6	217232	217237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176791
3983	NC_016822	TGG	2	6	217388	217393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176791
3984	NC_016822	CTG	2	6	217438	217443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176791
3985	NC_016822	ATC	2	6	217570	217575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176791
3986	NC_016822	GGC	2	6	217590	217595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176791
3987	NC_016822	CCCG	2	8	217671	217678	0 %	0 %	25 %	75 %	383176791
3988	NC_016822	AGCCG	2	10	217710	217719	20 %	0 %	40 %	40 %	383176791
3989	NC_016822	GAA	2	6	217747	217752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176791
3990	NC_016822	GC	3	6	217774	217779	0 %	0 %	50 %	50 %	383176791
3991	NC_016822	GGTGG	2	10	217819	217828	0 %	20 %	80 %	0 %	383176791
3992	NC_016822	CAT	2	6	217971	217976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176791
3993	NC_016822	GAT	2	6	217992	217997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176791
3994	NC_016822	CAA	2	6	217998	218003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176791
3995	NC_016822	GCG	2	6	218004	218009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176791
3996	NC_016822	GAA	2	6	218013	218018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176791
3997	NC_016822	GCC	2	6	218025	218030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176791
3998	NC_016822	GAT	2	6	218056	218061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176791
3999	NC_016822	TGC	2	6	218078	218083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176791
4000	NC_016822	CGG	2	6	218099	218104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176791

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