MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016822	GA	3	6	163468	163473	50 %	0 %	50 %	0 %	383176742
3002	NC_016822	GAC	2	6	163479	163484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176742
3003	NC_016822	TTA	2	6	163661	163666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176742
3004	NC_016822	GTT	2	6	163719	163724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176742
3005	NC_016822	TGC	2	6	164013	164018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176743
3006	NC_016822	GCCA	2	8	164107	164114	25 %	0 %	25 %	50 %	383176743
3007	NC_016822	CAC	2	6	164129	164134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176743
3008	NC_016822	CAG	2	6	164147	164152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176743
3009	NC_016822	CAA	2	6	164203	164208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176743
3010	NC_016822	AGCG	2	8	164241	164248	25 %	0 %	50 %	25 %	383176743
3011	NC_016822	T	6	6	164354	164359	0 %	100 %	0 %	0 %	383176743
3012	NC_016822	CAC	2	6	164557	164562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176744
3013	NC_016822	CCA	2	6	165915	165920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176745
3014	NC_016822	TCA	2	6	165993	165998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176745
3015	NC_016822	CAC	2	6	166057	166062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176745
3016	NC_016822	GTA	2	6	166076	166081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176745
3017	NC_016822	ATCC	2	8	166177	166184	25 %	25 %	0 %	50 %	383176745
3018	NC_016822	GCA	2	6	166225	166230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176745
3019	NC_016822	TGG	2	6	166265	166270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176745
3020	NC_016822	CT	4	8	166299	166306	0 %	50 %	0 %	50 %	383176745
3021	NC_016822	GCTG	2	8	166325	166332	0 %	25 %	50 %	25 %	383176745
3022	NC_016822	GGC	2	6	166383	166388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176745
3023	NC_016822	GTT	2	6	166427	166432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176745
3024	NC_016822	ACGT	2	8	166490	166497	25 %	25 %	25 %	25 %	383176745
3025	NC_016822	T	6	6	166504	166509	0 %	100 %	0 %	0 %	383176745
3026	NC_016822	TA	3	6	166519	166524	50 %	50 %	0 %	0 %	383176745
3027	NC_016822	TGT	2	6	166601	166606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176745
3028	NC_016822	A	6	6	166619	166624	100 %	0 %	0 %	0 %	383176745
3029	NC_016822	TACT	2	8	166729	166736	25 %	50 %	0 %	25 %	383176746
3030	NC_016822	CAG	2	6	166776	166781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176746
3031	NC_016822	CAG	2	6	166833	166838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176746
3032	NC_016822	GTT	2	6	166882	166887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176746
3033	NC_016822	GTT	2	6	166954	166959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176746
3034	NC_016822	GTT	2	6	166972	166977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176746
3035	NC_016822	TAC	2	6	167031	167036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176746
3036	NC_016822	TTTGC	2	10	167048	167057	0 %	60 %	20 %	20 %	383176746
3037	NC_016822	GCA	2	6	167148	167153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176746
3038	NC_016822	CCG	2	6	167174	167179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176746
3039	NC_016822	CAA	2	6	167205	167210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176746
3040	NC_016822	ACC	2	6	167233	167238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176746
3041	NC_016822	CAG	2	6	167247	167252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176746
3042	NC_016822	T	6	6	167305	167310	0 %	100 %	0 %	0 %	383176746
3043	NC_016822	TGTA	2	8	167716	167723	25 %	50 %	25 %	0 %	383176747
3044	NC_016822	TTC	2	6	167804	167809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176747
3045	NC_016822	GCGT	2	8	167883	167890	0 %	25 %	50 %	25 %	383176747
3046	NC_016822	GCGA	2	8	167969	167976	25 %	0 %	50 %	25 %	383176747
3047	NC_016822	CGG	2	6	167991	167996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176747
3048	NC_016822	GAA	2	6	168050	168055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176747
3049	NC_016822	GCA	2	6	168101	168106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176747
3050	NC_016822	TGC	2	6	168135	168140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176747
3051	NC_016822	ACG	2	6	168177	168182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3052	NC_016822	GAC	2	6	168200	168205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3053	NC_016822	TGG	2	6	168264	168269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176748
3054	NC_016822	CCA	2	6	168291	168296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176748
3055	NC_016822	CAG	2	6	168384	168389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3056	NC_016822	GCAACT	2	12	168425	168436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383176748
3057	NC_016822	CGT	2	6	168456	168461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3058	NC_016822	CGT	2	6	168506	168511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3059	NC_016822	CGT	2	6	168530	168535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3060	NC_016822	TCT	2	6	168563	168568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176748
3061	NC_016822	CAG	2	6	168579	168584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3062	NC_016822	GGC	2	6	168600	168605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176748
3063	NC_016822	TTC	2	6	168658	168663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176748
3064	NC_016822	GAT	2	6	168749	168754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176748
3065	NC_016822	CA	3	6	168758	168763	50 %	0 %	0 %	50 %	383176748
3066	NC_016822	TTC	2	6	168813	168818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176748
3067	NC_016822	CAG	2	6	168846	168851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176748
3068	NC_016822	GCGAG	2	10	168856	168865	20 %	0 %	60 %	20 %	383176748
3069	NC_016822	GGC	2	6	168909	168914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176748
3070	NC_016822	CG	3	6	168924	168929	0 %	0 %	50 %	50 %	383176748
3071	NC_016822	ACGG	2	8	169026	169033	25 %	0 %	50 %	25 %	383176748
3072	NC_016822	TCT	2	6	169090	169095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176748
3073	NC_016822	TGT	2	6	169112	169117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176748
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3078	NC_016822	CGC	3	9	169355	169363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176748
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3083	NC_016822	CTG	2	6	169693	169698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176749
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3085	NC_016822	ATCAG	2	10	169932	169941	40 %	20 %	20 %	20 %	383176749
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3088	NC_016822	ATGA	2	8	170024	170031	50 %	25 %	25 %	0 %	383176749
3089	NC_016822	TCG	2	6	170055	170060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176749
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3091	NC_016822	TGC	2	6	170106	170111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176749
3092	NC_016822	ATG	2	6	170144	170149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176749
3093	NC_016822	CGT	2	6	170167	170172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176749
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3095	NC_016822	CGT	2	6	170266	170271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176749
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3099	NC_016822	AG	3	6	170448	170453	50 %	0 %	50 %	0 %	383176749
3100	NC_016822	TG	3	6	170502	170507	0 %	50 %	50 %	0 %	383176749
3101	NC_016822	A	6	6	170526	170531	100 %	0 %	0 %	0 %	383176749
3102	NC_016822	AGCC	2	8	170584	170591	25 %	0 %	25 %	50 %	383176750
3103	NC_016822	CAGC	2	8	170611	170618	25 %	0 %	25 %	50 %	383176750
3104	NC_016822	GC	3	6	170651	170656	0 %	0 %	50 %	50 %	383176750
3105	NC_016822	T	6	6	170723	170728	0 %	100 %	0 %	0 %	383176750
3106	NC_016822	TCT	2	6	170734	170739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176750
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3108	NC_016822	GCT	2	6	170838	170843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176750
3109	NC_016822	ACG	2	6	170912	170917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176750
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3111	NC_016822	CTT	2	6	171028	171033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176750
3112	NC_016822	TAC	2	6	171213	171218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176751
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3116	NC_016822	GC	3	6	171344	171349	0 %	0 %	50 %	50 %	383176751
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3118	NC_016822	TCA	2	6	171424	171429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176751
3119	NC_016822	GTTC	2	8	171484	171491	0 %	50 %	25 %	25 %	383176751
3120	NC_016822	AAAT	2	8	171685	171692	75 %	25 %	0 %	0 %	383176751
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3122	NC_016822	GT	3	6	171723	171728	0 %	50 %	50 %	0 %	383176751
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3124	NC_016822	CG	3	6	171890	171895	0 %	0 %	50 %	50 %	383176751
3125	NC_016822	GA	3	6	171907	171912	50 %	0 %	50 %	0 %	383176751
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3240	NC_016822	TGC	2	6	176988	176993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176754
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3243	NC_016822	GGC	2	6	177157	177162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176754
3244	NC_016822	GCA	2	6	177184	177189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176754
3245	NC_016822	GGT	2	6	177190	177195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176754
3246	NC_016822	GTC	2	6	177210	177215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176754
3247	NC_016822	CAA	2	6	177268	177273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176754
3248	NC_016822	GCA	2	6	177306	177311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176754
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3252	NC_016822	ACG	2	6	177471	177476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176754
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3254	NC_016822	CAG	2	6	177545	177550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176754
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3258	NC_016822	GTA	2	6	177687	177692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176754
3259	NC_016822	GTA	2	6	177971	177976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176755
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3261	NC_016822	CTG	2	6	178086	178091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176755
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3264	NC_016822	CGC	2	6	178152	178157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176755
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3273	NC_016822	GAT	2	6	178568	178573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176755
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3281	NC_016822	GACT	2	8	178804	178811	25 %	25 %	25 %	25 %	383176755
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3350	NC_016822	CAC	2	6	182155	182160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176758
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3352	NC_016822	TGG	2	6	182292	182297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176758
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3355	NC_016822	TGA	2	6	182491	182496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176758
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3357	NC_016822	TCGC	2	8	182528	182535	0 %	25 %	25 %	50 %	383176758
3358	NC_016822	GGC	2	6	182542	182547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3359	NC_016822	TCA	2	6	182565	182570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176758
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3361	NC_016822	CGC	2	6	182622	182627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176758
3362	NC_016822	GCG	2	6	182650	182655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3363	NC_016822	TTG	2	6	182657	182662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176758
3364	NC_016822	ATC	2	6	182720	182725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176758
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3395	NC_016822	GCA	2	6	184006	184011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176759
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3465	NC_016822	GAC	2	6	187632	187637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176762
3466	NC_016822	TGGC	2	8	187758	187765	0 %	25 %	50 %	25 %	383176762
3467	NC_016822	CGC	2	6	187874	187879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176762
3468	NC_016822	TGT	2	6	188072	188077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176763
3469	NC_016822	ATA	2	6	188087	188092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176763
3470	NC_016822	GGTCC	2	10	188184	188193	0 %	20 %	40 %	40 %	383176763
3471	NC_016822	T	6	6	188374	188379	0 %	100 %	0 %	0 %	383176763
3472	NC_016822	CAG	2	6	188422	188427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176763
3473	NC_016822	GGA	2	6	188678	188683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176763
3474	NC_016822	GCT	2	6	188695	188700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176763
3475	NC_016822	CGG	2	6	188721	188726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176763
3476	NC_016822	TGA	2	6	188760	188765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176763
3477	NC_016822	CG	3	6	188766	188771	0 %	0 %	50 %	50 %	383176763
3478	NC_016822	GCG	2	6	188774	188779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176763
3479	NC_016822	ACA	2	6	188961	188966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176764
3480	NC_016822	TGA	2	6	189076	189081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176764
3481	NC_016822	CGC	2	6	189088	189093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176764
3482	NC_016822	CGT	2	6	189235	189240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176764
3483	NC_016822	TAA	2	6	189316	189321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176764
3484	NC_016822	CAG	2	6	189347	189352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176764
3485	NC_016822	CCG	2	6	189444	189449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176764
3486	NC_016822	GCA	2	6	189484	189489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176764
3487	NC_016822	CTT	3	9	189496	189504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176764
3488	NC_016822	ATG	2	6	189516	189521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176764
3489	NC_016822	GATT	2	8	189624	189631	25 %	50 %	25 %	0 %	383176765
3490	NC_016822	A	8	8	189636	189643	100 %	0 %	0 %	0 %	383176765
3491	NC_016822	TCG	2	6	189654	189659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176765
3492	NC_016822	ATC	2	6	189730	189735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176765
3493	NC_016822	TCG	2	6	189750	189755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176765
3494	NC_016822	CAA	2	6	189760	189765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176765
3495	NC_016822	GCC	2	6	189796	189801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176765
3496	NC_016822	CAG	2	6	189835	189840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176765
3497	NC_016822	TTG	2	6	189941	189946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176765
3498	NC_016822	CCG	2	6	189979	189984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176765
3499	NC_016822	AGC	2	6	190002	190007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176765
3500	NC_016822	AGCC	2	8	190054	190061	25 %	0 %	25 %	50 %	383176765

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