MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016822	CTGA	2	8	136174	136181	25 %	25 %	25 %	25 %	383176711
2502	NC_016822	AAG	2	6	136184	136189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176711
2503	NC_016822	GCT	2	6	136234	136239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176711
2504	NC_016822	GGT	2	6	136318	136323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176711
2505	NC_016822	CGG	2	6	136341	136346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176711
2506	NC_016822	GCT	2	6	136350	136355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176711
2507	NC_016822	GGC	2	6	136452	136457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176711
2508	NC_016822	GAA	3	9	136503	136511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176711
2509	NC_016822	AG	3	6	136616	136621	50 %	0 %	50 %	0 %	383176712
2510	NC_016822	CTG	2	6	136633	136638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
2511	NC_016822	GGC	2	6	136693	136698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176712
2512	NC_016822	GTT	2	6	136729	136734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176712
2513	NC_016822	GGCG	2	8	136759	136766	0 %	0 %	75 %	25 %	383176712
2514	NC_016822	GCT	2	6	136795	136800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
2515	NC_016822	CT	3	6	136865	136870	0 %	50 %	0 %	50 %	383176712
2516	NC_016822	GCT	2	6	136873	136878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
2517	NC_016822	GCT	2	6	136921	136926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
2518	NC_016822	GCG	2	6	136956	136961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176712
2519	NC_016822	TTG	2	6	136967	136972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176712
2520	NC_016822	GTC	2	6	137009	137014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
2521	NC_016822	GCG	2	6	137091	137096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176712
2522	NC_016822	TGC	2	6	137120	137125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
2523	NC_016822	GCTG	2	8	137134	137141	0 %	25 %	50 %	25 %	383176712
2524	NC_016822	CCG	2	6	137178	137183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176712
2525	NC_016822	TGA	2	6	137196	137201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176712
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2527	NC_016822	TTG	2	6	137313	137318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176712
2528	NC_016822	TGT	2	6	137332	137337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176712
2529	NC_016822	GCCA	2	8	137350	137357	25 %	0 %	25 %	50 %	383176712
2530	NC_016822	GTG	2	6	137381	137386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176712
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2532	NC_016822	ATG	4	12	137405	137416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176712
2533	NC_016822	TCG	2	6	137424	137429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
2534	NC_016822	TGC	2	6	137443	137448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176712
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2538	NC_016822	GGTTG	2	10	137585	137594	0 %	40 %	60 %	0 %	383176712
2539	NC_016822	GTT	2	6	137646	137651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176712
2540	NC_016822	CTGT	2	8	137716	137723	0 %	50 %	25 %	25 %	383176712
2541	NC_016822	TTC	2	6	137739	137744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176712
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2543	NC_016822	TGA	2	6	137771	137776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176712
2544	NC_016822	TTG	2	6	137792	137797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176712
2545	NC_016822	CCA	2	6	137920	137925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176712
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2549	NC_016822	TGT	2	6	138210	138215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176712
2550	NC_016822	TA	4	8	138257	138264	50 %	50 %	0 %	0 %	383176712
2551	NC_016822	GGC	2	6	138275	138280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176712
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2554	NC_016822	GCT	2	6	138793	138798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176713
2555	NC_016822	CCCG	2	8	138805	138812	0 %	0 %	25 %	75 %	383176713
2556	NC_016822	GAA	3	9	138818	138826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176713
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2558	NC_016822	GCC	2	6	138875	138880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176713
2559	NC_016822	GCT	2	6	138902	138907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176713
2560	NC_016822	CTG	2	6	138935	138940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176713
2561	NC_016822	CTG	2	6	138962	138967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176713
2562	NC_016822	ACA	2	6	138987	138992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176713
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2564	NC_016822	CA	3	6	139058	139063	50 %	0 %	0 %	50 %	383176713
2565	NC_016822	CTG	2	6	139064	139069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176713
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2567	NC_016822	GCTG	2	8	139180	139187	0 %	25 %	50 %	25 %	383176713
2568	NC_016822	TGA	2	6	139234	139239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176713
2569	NC_016822	CCAG	2	8	139333	139340	25 %	0 %	25 %	50 %	383176713
2570	NC_016822	GTT	2	6	139343	139348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176713
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2609	NC_016822	GAAA	2	8	141565	141572	75 %	0 %	25 %	0 %	383176714
2610	NC_016822	TGA	2	6	141586	141591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176714
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2612	NC_016822	GCAC	2	8	141607	141614	25 %	0 %	25 %	50 %	383176714
2613	NC_016822	GGGCA	2	10	141642	141651	20 %	0 %	60 %	20 %	383176714
2614	NC_016822	TGGA	2	8	141665	141672	25 %	25 %	50 %	0 %	383176714
2615	NC_016822	GAA	2	6	141728	141733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176714
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2620	NC_016822	GCA	2	6	141820	141825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176714
2621	NC_016822	TAAA	2	8	141830	141837	75 %	25 %	0 %	0 %	383176714
2622	NC_016822	TAA	2	6	141895	141900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176715
2623	NC_016822	TTTC	2	8	141911	141918	0 %	75 %	0 %	25 %	383176715
2624	NC_016822	CAGCG	2	10	141921	141930	20 %	0 %	40 %	40 %	383176715
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2651	NC_016822	TCG	2	6	143368	143373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176716
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2738	NC_016822	CTG	2	6	148478	148483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176720
2739	NC_016822	TTTATG	2	12	148493	148504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383176720
2740	NC_016822	CCA	2	6	148581	148586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176720
2741	NC_016822	TTG	2	6	148647	148652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176720
2742	NC_016822	ATC	2	6	148658	148663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176720
2743	NC_016822	GCT	2	6	148738	148743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176720
2744	NC_016822	CCGTC	2	10	148751	148760	0 %	20 %	20 %	60 %	383176720
2745	NC_016822	GTGAA	2	10	148761	148770	40 %	20 %	40 %	0 %	383176720
2746	NC_016822	TGG	2	6	148815	148820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176720
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2749	NC_016822	TGG	2	6	149111	149116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176721
2750	NC_016822	GTTCA	2	10	149148	149157	20 %	40 %	20 %	20 %	383176721
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2752	NC_016822	GCA	2	6	149234	149239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176721
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2758	NC_016822	A	6	6	149520	149525	100 %	0 %	0 %	0 %	383176721
2759	NC_016822	CCA	2	6	149540	149545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176721
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2763	NC_016822	GGC	2	6	149751	149756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176722
2764	NC_016822	TAT	2	6	149852	149857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176722
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2766	NC_016822	TAAA	2	8	149869	149876	75 %	25 %	0 %	0 %	383176722
2767	NC_016822	CGGG	2	8	149882	149889	0 %	0 %	75 %	25 %	383176722
2768	NC_016822	GCA	2	6	149990	149995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176722
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2770	NC_016822	TAC	2	6	150018	150023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176722
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2772	NC_016822	AACG	2	8	150096	150103	50 %	0 %	25 %	25 %	383176722
2773	NC_016822	ACT	2	6	150173	150178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176722
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2849	NC_016822	ACG	2	6	154329	154334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176727
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2854	NC_016822	TGC	2	6	154538	154543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176727
2855	NC_016822	GA	3	6	154587	154592	50 %	0 %	50 %	0 %	383176727
2856	NC_016822	GGGAG	2	10	154602	154611	20 %	0 %	80 %	0 %	383176727
2857	NC_016822	ATG	2	6	154615	154620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176727
2858	NC_016822	CAG	2	6	154666	154671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176727
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2863	NC_016822	ATC	2	6	155209	155214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176728
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2865	NC_016822	AAT	2	6	155257	155262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176728
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2880	NC_016822	CCG	2	6	156070	156075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176729
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2969	NC_016822	T	6	6	161579	161584	0 %	100 %	0 %	0 %	383176738
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2982	NC_016822	CCT	2	6	162239	162244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176740
2983	NC_016822	GTG	2	6	162262	162267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176740
2984	NC_016822	A	6	6	162465	162470	100 %	0 %	0 %	0 %	383176740
2985	NC_016822	GCTG	2	8	162577	162584	0 %	25 %	50 %	25 %	383176741
2986	NC_016822	GTT	2	6	162615	162620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176741
2987	NC_016822	CTG	2	6	162672	162677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176741
2988	NC_016822	GTG	2	6	162690	162695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176741
2989	NC_016822	TGGC	2	8	162710	162717	0 %	25 %	50 %	25 %	383176741
2990	NC_016822	GCA	2	6	162806	162811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176741
2991	NC_016822	T	6	6	162939	162944	0 %	100 %	0 %	0 %	383176742
2992	NC_016822	TTG	2	6	162958	162963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176742
2993	NC_016822	TTC	2	6	162994	162999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176742
2994	NC_016822	CTG	2	6	163024	163029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176742
2995	NC_016822	TCA	2	6	163091	163096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176742
2996	NC_016822	GCA	2	6	163106	163111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176742
2997	NC_016822	GAC	2	6	163189	163194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176742
2998	NC_016822	ATCG	2	8	163323	163330	25 %	25 %	25 %	25 %	383176742
2999	NC_016822	GCC	2	6	163432	163437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176742
3000	NC_016822	ACC	2	6	163453	163458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176742

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