MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016822	CGG	2	6	109722	109727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176689
2003	NC_016822	GCA	2	6	109823	109828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176689
2004	NC_016822	CTG	2	6	109831	109836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176689
2005	NC_016822	AGCCG	2	10	109958	109967	20 %	0 %	40 %	40 %	383176689
2006	NC_016822	AGT	2	6	109995	110000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176689
2007	NC_016822	GAA	2	6	110050	110055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176689
2008	NC_016822	ATTG	2	8	110058	110065	25 %	50 %	25 %	0 %	383176689
2009	NC_016822	GAA	2	6	110110	110115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176689
2010	NC_016822	TC	3	6	110175	110180	0 %	50 %	0 %	50 %	383176689
2011	NC_016822	TGA	2	6	110181	110186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176689
2012	NC_016822	GAC	2	6	110262	110267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176689
2013	NC_016822	CTG	2	6	110329	110334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176689
2014	NC_016822	GGC	2	6	110382	110387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176689
2015	NC_016822	CAGG	2	8	110392	110399	25 %	0 %	50 %	25 %	383176689
2016	NC_016822	GTA	2	6	110419	110424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176689
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2020	NC_016822	CGC	2	6	110501	110506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176690
2021	NC_016822	AAT	2	6	110507	110512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176690
2022	NC_016822	CTG	2	6	110540	110545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176690
2023	NC_016822	TGGA	2	8	110591	110598	25 %	25 %	50 %	0 %	383176690
2024	NC_016822	CAT	2	6	110728	110733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176690
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2031	NC_016822	CG	3	6	111031	111036	0 %	0 %	50 %	50 %	383176690
2032	NC_016822	CAG	3	9	111140	111148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176690
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2053	NC_016822	TAT	2	6	112399	112404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176691
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2060	NC_016822	TGCG	2	8	112862	112869	0 %	25 %	50 %	25 %	383176692
2061	NC_016822	TGC	2	6	112899	112904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176692
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2065	NC_016822	GTC	2	6	112987	112992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176692
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2120	NC_016822	ATT	2	6	116297	116302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176695
2121	NC_016822	AGA	2	6	116326	116331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176695
2122	NC_016822	GAA	2	6	116420	116425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176695
2123	NC_016822	CTG	2	6	116426	116431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176695
2124	NC_016822	CAT	2	6	116443	116448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176695
2125	NC_016822	CAT	2	6	116482	116487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176695
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2129	NC_016822	ATC	2	6	116573	116578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176695
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2143	NC_016822	ATC	2	6	117239	117244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176695
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2145	NC_016822	GTC	2	6	117300	117305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176695
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2151	NC_016822	CTG	2	6	117569	117574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176695
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2223	NC_016822	CATCG	2	10	121716	121725	20 %	20 %	20 %	40 %	383176701
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2228	NC_016822	GCCA	2	8	121957	121964	25 %	0 %	25 %	50 %	383176701
2229	NC_016822	CT	3	6	122047	122052	0 %	50 %	0 %	50 %	383176701
2230	NC_016822	A	6	6	122062	122067	100 %	0 %	0 %	0 %	383176701
2231	NC_016822	GGTC	2	8	122187	122194	0 %	25 %	50 %	25 %	383176701
2232	NC_016822	CAG	2	6	122223	122228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176701
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2234	NC_016822	CAG	2	6	122244	122249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176701
2235	NC_016822	GCA	2	6	122360	122365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176701
2236	NC_016822	ACC	2	6	122374	122379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176701
2237	NC_016822	ATG	3	9	122398	122406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176701
2238	NC_016822	TAACG	2	10	122410	122419	40 %	20 %	20 %	20 %	383176701
2239	NC_016822	AGC	2	6	122477	122482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176701
2240	NC_016822	ATC	2	6	122518	122523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176701
2241	NC_016822	TAA	2	6	122559	122564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176701
2242	NC_016822	GCA	2	6	122612	122617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176701
2243	NC_016822	CAG	2	6	122652	122657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176701
2244	NC_016822	TGA	2	6	122707	122712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176701
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2247	NC_016822	ATGCC	2	10	122869	122878	20 %	20 %	20 %	40 %	383176701
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2250	NC_016822	TGCC	2	8	123133	123140	0 %	25 %	25 %	50 %	383176702
2251	NC_016822	GCG	2	6	123150	123155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176702
2252	NC_016822	ATGG	2	8	123178	123185	25 %	25 %	50 %	0 %	383176702
2253	NC_016822	TGC	2	6	123194	123199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176702
2254	NC_016822	TGA	2	6	123259	123264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176702
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2258	NC_016822	ATG	2	6	123413	123418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176702
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2262	NC_016822	CTG	2	6	123718	123723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176702
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2351	NC_016822	AGT	2	6	128433	128438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176707
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2353	NC_016822	TTC	2	6	128512	128517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176707
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2355	NC_016822	GCT	2	6	128700	128705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176707
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2358	NC_016822	AGC	2	6	129317	129322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176708
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2360	NC_016822	CGAAG	2	10	129444	129453	40 %	0 %	40 %	20 %	383176708
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2362	NC_016822	TCG	2	6	129465	129470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176708
2363	NC_016822	GGC	2	6	129478	129483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176708
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2399	NC_016822	ATC	2	6	131018	131023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176709
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2401	NC_016822	CTG	2	6	131099	131104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176709
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2478	NC_016822	CAT	2	6	134721	134726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176710
2479	NC_016822	AAC	2	6	134728	134733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176710
2480	NC_016822	GTAA	2	8	134763	134770	50 %	25 %	25 %	0 %	383176710
2481	NC_016822	ATG	2	6	135088	135093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176711
2482	NC_016822	ACA	2	6	135203	135208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176711
2483	NC_016822	CTG	2	6	135256	135261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176711
2484	NC_016822	GAA	2	6	135280	135285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176711
2485	NC_016822	GCTG	2	8	135294	135301	0 %	25 %	50 %	25 %	383176711
2486	NC_016822	ATCA	2	8	135370	135377	50 %	25 %	0 %	25 %	383176711
2487	NC_016822	GGT	2	6	135385	135390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176711
2488	NC_016822	CTGG	2	8	135391	135398	0 %	25 %	50 %	25 %	383176711
2489	NC_016822	CAAAGT	2	12	135414	135425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383176711
2490	NC_016822	AAG	2	6	135605	135610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176711
2491	NC_016822	CTG	2	6	135622	135627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176711
2492	NC_016822	ATC	2	6	135643	135648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176711
2493	NC_016822	CCG	2	6	135806	135811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176711
2494	NC_016822	AGA	2	6	135822	135827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176711
2495	NC_016822	A	6	6	135853	135858	100 %	0 %	0 %	0 %	383176711
2496	NC_016822	ACG	2	6	135881	135886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176711
2497	NC_016822	GAC	2	6	135958	135963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176711
2498	NC_016822	CA	3	6	136052	136057	50 %	0 %	0 %	50 %	383176711
2499	NC_016822	A	6	6	136102	136107	100 %	0 %	0 %	0 %	383176711
2500	NC_016822	ACT	2	6	136109	136114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176711

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