MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016822	TAT	2	6	55260	55265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176642
1002	NC_016822	TGCG	2	8	55301	55308	0 %	25 %	50 %	25 %	383176642
1003	NC_016822	CGG	2	6	55317	55322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176642
1004	NC_016822	GCG	2	6	55346	55351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176642
1005	NC_016822	CTG	2	6	55354	55359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1006	NC_016822	CTC	2	6	55428	55433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176642
1007	NC_016822	ATGA	2	8	55456	55463	50 %	25 %	25 %	0 %	383176642
1008	NC_016822	TGC	2	6	55508	55513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1009	NC_016822	TGG	2	6	55541	55546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176642
1010	NC_016822	GAT	2	6	55548	55553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176642
1011	NC_016822	CGA	3	9	55580	55588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1012	NC_016822	CT	3	6	55601	55606	0 %	50 %	0 %	50 %	383176642
1013	NC_016822	GCTGGT	2	12	55629	55640	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383176642
1014	NC_016822	TGC	2	6	55751	55756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1015	NC_016822	CGATGG	2	12	55775	55786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383176642
1016	NC_016822	GGCG	2	8	55797	55804	0 %	0 %	75 %	25 %	383176642
1017	NC_016822	CTG	2	6	55807	55812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1018	NC_016822	GCT	2	6	55920	55925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1019	NC_016822	TGC	2	6	55952	55957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1020	NC_016822	TCA	3	9	55967	55975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176642
1021	NC_016822	CGT	2	6	56029	56034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1022	NC_016822	GTT	2	6	56046	56051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176642
1023	NC_016822	AGGGC	2	10	56052	56061	20 %	0 %	60 %	20 %	383176642
1024	NC_016822	GGC	2	6	56160	56165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176642
1025	NC_016822	CTG	2	6	56176	56181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1026	NC_016822	TCT	2	6	56206	56211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176642
1027	NC_016822	TGA	2	6	56232	56237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176642
1028	NC_016822	CGA	2	6	56241	56246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1029	NC_016822	TGG	2	6	56330	56335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176642
1030	NC_016822	GGAT	2	8	56411	56418	25 %	25 %	50 %	0 %	383176642
1031	NC_016822	GCG	2	6	56437	56442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176642
1032	NC_016822	CGA	2	6	56469	56474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176642
1033	NC_016822	AACC	2	8	56481	56488	50 %	0 %	0 %	50 %	383176642
1034	NC_016822	ATT	2	6	56533	56538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176642
1035	NC_016822	GCCCGC	2	12	56539	56550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176642
1036	NC_016822	CAGG	2	8	56578	56585	25 %	0 %	50 %	25 %	383176642
1037	NC_016822	CCG	2	6	56697	56702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176642
1038	NC_016822	TGG	2	6	56717	56722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176642
1039	NC_016822	CG	3	6	56758	56763	0 %	0 %	50 %	50 %	383176642
1040	NC_016822	TGGC	2	8	56844	56851	0 %	25 %	50 %	25 %	383176642
1041	NC_016822	GAA	2	6	56860	56865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176642
1042	NC_016822	GAAAC	2	10	56899	56908	60 %	0 %	20 %	20 %	383176642
1043	NC_016822	TAA	2	6	56917	56922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176642
1044	NC_016822	GCG	2	6	57126	57131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176643
1045	NC_016822	CCTG	2	8	57179	57186	0 %	25 %	25 %	50 %	383176643
1046	NC_016822	TAAA	2	8	57217	57224	75 %	25 %	0 %	0 %	383176643
1047	NC_016822	GCC	2	6	57238	57243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176643
1048	NC_016822	AATC	2	8	57253	57260	50 %	25 %	0 %	25 %	383176643
1049	NC_016822	GTC	2	6	57262	57267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176643
1050	NC_016822	CAG	2	6	57296	57301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176643
1051	NC_016822	GTG	2	6	57364	57369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176643
1052	NC_016822	GGC	2	6	57393	57398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176643
1053	NC_016822	GCG	2	6	57581	57586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176643
1054	NC_016822	CGC	3	9	57674	57682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176644
1055	NC_016822	GCAG	2	8	57742	57749	25 %	0 %	50 %	25 %	383176644
1056	NC_016822	ACC	2	6	57758	57763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176644
1057	NC_016822	CAG	3	9	57765	57773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1058	NC_016822	TA	3	6	57789	57794	50 %	50 %	0 %	0 %	383176644
1059	NC_016822	TTC	2	6	57851	57856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176644
1060	NC_016822	TGGGGC	2	12	57893	57904	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383176644
1061	NC_016822	AAG	2	6	58059	58064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176644
1062	NC_016822	CG	4	8	58099	58106	0 %	0 %	50 %	50 %	383176644
1063	NC_016822	GCG	2	6	58135	58140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176644
1064	NC_016822	TCG	2	6	58176	58181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1065	NC_016822	GCA	2	6	58186	58191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1066	NC_016822	AGC	2	6	58215	58220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1067	NC_016822	TCG	2	6	58221	58226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1068	NC_016822	CAG	2	6	58241	58246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1069	NC_016822	CAG	2	6	58298	58303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1070	NC_016822	CG	4	8	58387	58394	0 %	0 %	50 %	50 %	383176644
1071	NC_016822	GCA	2	6	58450	58455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176644
1072	NC_016822	AAC	2	6	58474	58479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176644
1073	NC_016822	AATG	2	8	58519	58526	50 %	25 %	25 %	0 %	383176645
1074	NC_016822	GCCATT	2	12	58724	58735	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383176645
1075	NC_016822	CAA	2	6	58757	58762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176645
1076	NC_016822	AACGT	2	10	58811	58820	40 %	20 %	20 %	20 %	383176645
1077	NC_016822	AC	3	6	58871	58876	50 %	0 %	0 %	50 %	383176645
1078	NC_016822	ATC	2	6	58890	58895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176645
1079	NC_016822	ACG	2	6	59053	59058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176646
1080	NC_016822	GTG	2	6	59075	59080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176646
1081	NC_016822	ACG	2	6	59144	59149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176646
1082	NC_016822	GTG	3	9	59166	59174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176646
1083	NC_016822	CGG	2	6	59185	59190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176646
1084	NC_016822	CAC	2	6	59284	59289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176646
1085	NC_016822	CTG	2	6	59449	59454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176646
1086	NC_016822	GCC	2	6	59501	59506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176646
1087	NC_016822	GCC	2	6	59570	59575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176646
1088	NC_016822	TGG	2	6	59699	59704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176646
1089	NC_016822	ATT	2	6	59710	59715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176646
1090	NC_016822	TAA	2	6	59759	59764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176647
1091	NC_016822	CGGCGT	2	12	59924	59935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383176647
1092	NC_016822	GGCA	2	8	59967	59974	25 %	0 %	50 %	25 %	383176647
1093	NC_016822	AAT	2	6	60024	60029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176647
1094	NC_016822	CGT	2	6	60210	60215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176647
1095	NC_016822	TTC	2	6	60234	60239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176647
1096	NC_016822	CAT	2	6	60249	60254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176647
1097	NC_016822	CAC	2	6	60255	60260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176647
1098	NC_016822	T	6	6	60261	60266	0 %	100 %	0 %	0 %	383176647
1099	NC_016822	CGT	2	6	60320	60325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176647
1100	NC_016822	GCA	2	6	60361	60366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176647
1101	NC_016822	CCA	2	6	60410	60415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176647
1102	NC_016822	CGGT	2	8	60568	60575	0 %	25 %	50 %	25 %	383176647
1103	NC_016822	AAC	2	6	60597	60602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176647
1104	NC_016822	CGG	2	6	60659	60664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176647
1105	NC_016822	GTT	2	6	60739	60744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176648
1106	NC_016822	TGC	2	6	60758	60763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1107	NC_016822	TTC	2	6	60764	60769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176648
1108	NC_016822	TCA	2	6	60784	60789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176648
1109	NC_016822	CAG	2	6	60848	60853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1110	NC_016822	GA	3	6	61003	61008	50 %	0 %	50 %	0 %	383176648
1111	NC_016822	GCA	2	6	61023	61028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1112	NC_016822	GCA	2	6	61056	61061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1113	NC_016822	GTCA	2	8	61091	61098	25 %	25 %	25 %	25 %	383176648
1114	NC_016822	CAG	2	6	61115	61120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1115	NC_016822	CGC	2	6	61165	61170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176648
1116	NC_016822	CAA	2	6	61222	61227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176648
1117	NC_016822	TTC	2	6	61236	61241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176648
1118	NC_016822	GCC	2	6	61304	61309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176648
1119	NC_016822	CTG	2	6	61319	61324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1120	NC_016822	GC	4	8	61389	61396	0 %	0 %	50 %	50 %	383176648
1121	NC_016822	CGT	2	6	61483	61488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1122	NC_016822	CTG	2	6	61502	61507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1123	NC_016822	CGA	2	6	61545	61550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1124	NC_016822	GTT	2	6	61559	61564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176648
1125	NC_016822	ATC	2	6	61581	61586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176648
1126	NC_016822	TGT	2	6	61666	61671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176648
1127	NC_016822	GCT	2	6	61705	61710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176648
1128	NC_016822	GAT	2	6	61751	61756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176648
1129	NC_016822	TGG	2	6	61785	61790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176648
1130	NC_016822	GCGTC	2	10	61795	61804	0 %	20 %	40 %	40 %	383176648
1131	NC_016822	GCT	2	6	61813	61818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176648
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1149	NC_016822	TAG	2	6	62647	62652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176649
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1231	NC_016822	TACC	2	8	66725	66732	25 %	25 %	0 %	50 %	383176652
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1234	NC_016822	GGTGAT	2	12	66876	66887	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383176652
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1238	NC_016822	ATA	2	6	66985	66990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176652
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1242	NC_016822	TGGC	2	8	67432	67439	0 %	25 %	50 %	25 %	383176652
1243	NC_016822	CAG	2	6	67479	67484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1244	NC_016822	TCT	2	6	67501	67506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176652
1245	NC_016822	GGC	2	6	67518	67523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176652
1246	NC_016822	CG	3	6	67691	67696	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
1247	NC_016822	CCA	2	6	67707	67712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176652
1248	NC_016822	CGGCAG	2	12	67839	67850	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383176652
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1498	NC_016822	ATT	2	6	80875	80880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176661
1499	NC_016822	GCC	2	6	80884	80889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176661
1500	NC_016822	GGC	2	6	80947	80952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176661

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