MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016822	AGC	2	6	28285	28290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176615
502	NC_016822	TCTGGC	2	12	28323	28334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176615
503	NC_016822	TGA	2	6	28386	28391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176615
504	NC_016822	CAG	2	6	28552	28557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176615
505	NC_016822	AGT	2	6	28611	28616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176615
506	NC_016822	A	7	7	28624	28630	100 %	0 %	0 %	0 %	383176615
507	NC_016822	AGC	2	6	28640	28645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176615
508	NC_016822	TGA	2	6	28686	28691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176615
509	NC_016822	CCGC	2	8	28697	28704	0 %	0 %	25 %	75 %	383176615
510	NC_016822	T	6	6	28708	28713	0 %	100 %	0 %	0 %	383176615
511	NC_016822	TGA	2	6	28775	28780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
512	NC_016822	TGA	3	9	28875	28883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
513	NC_016822	CAT	2	6	28893	28898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176616
514	NC_016822	A	6	6	28909	28914	100 %	0 %	0 %	0 %	383176616
515	NC_016822	A	7	7	28918	28924	100 %	0 %	0 %	0 %	383176616
516	NC_016822	ATG	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
517	NC_016822	CCT	2	6	28945	28950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176616
518	NC_016822	GCA	2	6	28961	28966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
519	NC_016822	CTGG	2	8	29054	29061	0 %	25 %	50 %	25 %	383176616
520	NC_016822	CCG	3	9	29129	29137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176616
521	NC_016822	CAT	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176616
522	NC_016822	CG	3	6	29275	29280	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
523	NC_016822	ATC	2	6	29290	29295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176616
524	NC_016822	GCGGAA	2	12	29362	29373	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383176616
525	NC_016822	CTGC	2	8	29515	29522	0 %	25 %	25 %	50 %	383176616
526	NC_016822	TGC	2	6	29684	29689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
527	NC_016822	GAC	2	6	29797	29802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
528	NC_016822	TCG	2	6	29921	29926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
529	NC_016822	GCT	2	6	29931	29936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
530	NC_016822	GC	3	6	29948	29953	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
531	NC_016822	TGC	2	6	29954	29959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
532	NC_016822	GCA	2	6	29973	29978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
533	NC_016822	TGC	2	6	29989	29994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
534	NC_016822	ATC	2	6	30013	30018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176616
535	NC_016822	CG	3	6	30022	30027	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
536	NC_016822	CGC	2	6	30029	30034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176616
537	NC_016822	TGCG	2	8	30065	30072	0 %	25 %	50 %	25 %	383176616
538	NC_016822	GAA	2	6	30256	30261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176616
539	NC_016822	GTG	2	6	30297	30302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176616
540	NC_016822	TGT	2	6	30405	30410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176616
541	NC_016822	TGGT	2	8	30477	30484	0 %	50 %	50 %	0 %	383176616
542	NC_016822	CGC	2	6	30611	30616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176616
543	NC_016822	TGA	2	6	30623	30628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
544	NC_016822	TGC	2	6	30717	30722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
545	NC_016822	TCG	2	6	30732	30737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
546	NC_016822	CG	3	6	30750	30755	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
547	NC_016822	CTG	2	6	30760	30765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
548	NC_016822	TGG	2	6	30818	30823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176616
549	NC_016822	CAT	2	6	30963	30968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176616
550	NC_016822	CGT	2	6	31009	31014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
551	NC_016822	TGA	2	6	31089	31094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
552	NC_016822	GTGG	2	8	31270	31277	0 %	25 %	75 %	0 %	383176616
553	NC_016822	ACG	2	6	31397	31402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
554	NC_016822	CTG	2	6	31406	31411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
555	NC_016822	CAG	2	6	31417	31422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
556	NC_016822	GCT	2	6	31484	31489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
557	NC_016822	CGGTGA	2	12	31563	31574	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383176616
558	NC_016822	TGA	2	6	31591	31596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
559	NC_016822	GCTG	2	8	31624	31631	0 %	25 %	50 %	25 %	383176617
560	NC_016822	TGG	2	6	31636	31641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176617
561	NC_016822	GCA	2	6	31666	31671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176617
562	NC_016822	TCC	2	6	31681	31686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176617
563	NC_016822	GCG	2	6	31758	31763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176617
564	NC_016822	GCG	2	6	31783	31788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176617
565	NC_016822	TGA	2	6	31846	31851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176617
566	NC_016822	ATT	2	6	31902	31907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176617
567	NC_016822	GGC	2	6	31908	31913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176617
568	NC_016822	GC	3	6	31912	31917	0 %	0 %	50 %	50 %	383176617
569	NC_016822	T	6	6	32057	32062	0 %	100 %	0 %	0 %	383176617
570	NC_016822	A	6	6	32076	32081	100 %	0 %	0 %	0 %	383176617
571	NC_016822	AAT	2	6	32083	32088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176617
572	NC_016822	CGA	2	6	32268	32273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176618
573	NC_016822	CAC	2	6	32277	32282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176618
574	NC_016822	CAA	2	6	32298	32303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176618
575	NC_016822	ACC	2	6	32392	32397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176618
576	NC_016822	GCG	2	6	32416	32421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176618
577	NC_016822	CCG	2	6	32460	32465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176618
578	NC_016822	ATGG	2	8	32521	32528	25 %	25 %	50 %	0 %	383176618
579	NC_016822	TTG	2	6	32724	32729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176619
580	NC_016822	AT	3	6	32759	32764	50 %	50 %	0 %	0 %	383176619
581	NC_016822	CGT	2	6	32993	32998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176619
582	NC_016822	CAGTA	2	10	33059	33068	40 %	20 %	20 %	20 %	383176619
583	NC_016822	TG	3	6	33109	33114	0 %	50 %	50 %	0 %	383176619
584	NC_016822	TGG	2	6	33315	33320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176619
585	NC_016822	CTC	2	6	33334	33339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176619
586	NC_016822	CG	3	6	33383	33388	0 %	0 %	50 %	50 %	383176619
587	NC_016822	TTGA	2	8	33392	33399	25 %	50 %	25 %	0 %	383176619
588	NC_016822	TGG	2	6	33495	33500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176619
589	NC_016822	GCA	2	6	33508	33513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176619
590	NC_016822	GGT	2	6	33521	33526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176619
591	NC_016822	GAA	2	6	33551	33556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176619
592	NC_016822	GCC	2	6	33736	33741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176620
593	NC_016822	TGA	2	6	33773	33778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176620
594	NC_016822	ACC	2	6	33811	33816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176620
595	NC_016822	CTG	2	6	33832	33837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176620
596	NC_016822	GCA	2	6	33907	33912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176620
597	NC_016822	TGGC	2	8	33935	33942	0 %	25 %	50 %	25 %	383176620
598	NC_016822	TTG	2	6	33950	33955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176620
599	NC_016822	TGG	2	6	34037	34042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176620
600	NC_016822	TCG	2	6	34107	34112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176620
601	NC_016822	TTC	2	6	34131	34136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176620
602	NC_016822	CTGG	2	8	34395	34402	0 %	25 %	50 %	25 %	383176620
603	NC_016822	ACG	2	6	34474	34479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176620
604	NC_016822	CAG	2	6	34555	34560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176620
605	NC_016822	CGT	2	6	34586	34591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176620
606	NC_016822	ATG	2	6	34764	34769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176621
607	NC_016822	G	6	6	34799	34804	0 %	0 %	100 %	0 %	383176621
608	NC_016822	GCC	2	6	34812	34817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176621
609	NC_016822	GGC	2	6	34828	34833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176621
610	NC_016822	GCG	2	6	34862	34867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176621
611	NC_016822	TCT	2	6	34883	34888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176621
612	NC_016822	GCTG	2	8	34912	34919	0 %	25 %	50 %	25 %	383176621
613	NC_016822	AGC	2	6	34949	34954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176621
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615	NC_016822	CGC	3	9	35107	35115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176621
616	NC_016822	GCC	2	6	35135	35140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176621
617	NC_016822	GCT	2	6	35173	35178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176621
618	NC_016822	AGC	2	6	35185	35190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176621
619	NC_016822	ATT	2	6	35222	35227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176621
620	NC_016822	CAT	2	6	35234	35239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176621
621	NC_016822	CGTG	2	8	35389	35396	0 %	25 %	50 %	25 %	383176621
622	NC_016822	AAT	2	6	35570	35575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176621
623	NC_016822	CATG	2	8	35859	35866	25 %	25 %	25 %	25 %	383176622
624	NC_016822	ATA	2	6	35876	35881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176622
625	NC_016822	A	6	6	35883	35888	100 %	0 %	0 %	0 %	383176622
626	NC_016822	CGG	2	6	36110	36115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176623
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749	NC_016822	CT	3	6	42319	42324	0 %	50 %	0 %	50 %	383176628
750	NC_016822	CCAT	2	8	42340	42347	25 %	25 %	0 %	50 %	383176628
751	NC_016822	CA	3	6	42387	42392	50 %	0 %	0 %	50 %	383176628
752	NC_016822	CAC	2	6	42521	42526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176628
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754	NC_016822	GTT	2	6	42658	42663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176629
755	NC_016822	TCC	2	6	42723	42728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176629
756	NC_016822	CGC	2	6	42760	42765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176629
757	NC_016822	CTT	2	6	42784	42789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176629
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759	NC_016822	GCT	2	6	42862	42867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176629
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762	NC_016822	GCA	2	6	43015	43020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176629
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772	NC_016822	TTCA	2	8	43697	43704	25 %	50 %	0 %	25 %	383176630
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787	NC_016822	CGC	2	6	44411	44416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176630
788	NC_016822	CAC	2	6	44534	44539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176630
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861	NC_016822	CACC	2	8	48242	48249	25 %	0 %	0 %	75 %	383176634
862	NC_016822	GCC	2	6	48284	48289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176634
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