MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016822	ATT	2	6	345244	345249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176912
6003	NC_016822	GCCT	2	8	345306	345313	0 %	25 %	25 %	50 %	383176912
6004	NC_016822	ACCA	2	8	345379	345386	50 %	0 %	0 %	50 %	383176912
6005	NC_016822	CGC	2	6	345398	345403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176912
6006	NC_016822	ATG	2	6	345425	345430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176912
6007	NC_016822	CAG	2	6	345442	345447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176912
6008	NC_016822	GT	4	8	345618	345625	0 %	50 %	50 %	0 %	383176913
6009	NC_016822	TGCGGA	2	12	345636	345647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383176913
6010	NC_016822	CAG	2	6	345724	345729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176913
6011	NC_016822	GCT	2	6	345738	345743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176913
6012	NC_016822	CACT	3	12	345785	345796	25 %	25 %	0 %	50 %	383176913
6013	NC_016822	TGA	2	6	345798	345803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176913
6014	NC_016822	ATT	2	6	345964	345969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176913
6015	NC_016822	TAAA	2	8	346037	346044	75 %	25 %	0 %	0 %	383176913
6016	NC_016822	ACG	2	6	346059	346064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176913
6017	NC_016822	CGC	2	6	346101	346106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176913
6018	NC_016822	GAT	2	6	346156	346161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176913
6019	NC_016822	TTATT	2	10	346181	346190	20 %	80 %	0 %	0 %	383176913
6020	NC_016822	TTA	2	6	346267	346272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176913
6021	NC_016822	ACA	2	6	346299	346304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176913
6022	NC_016822	ATT	2	6	346342	346347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176913
6023	NC_016822	A	6	6	346382	346387	100 %	0 %	0 %	0 %	383176913
6024	NC_016822	ATGGC	2	10	346427	346436	20 %	20 %	40 %	20 %	383176913
6025	NC_016822	TGGCGA	2	12	346581	346592	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383176914
6026	NC_016822	CTG	2	6	346628	346633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176914
6027	NC_016822	TGA	2	6	346668	346673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176914
6028	NC_016822	TCA	2	6	346677	346682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176914
6029	NC_016822	TGG	2	6	346716	346721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176914
6030	NC_016822	GAA	2	6	346727	346732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176914
6031	NC_016822	GCT	2	6	346963	346968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176914
6032	NC_016822	GAT	2	6	346969	346974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176914
6033	NC_016822	ATT	2	6	346997	347002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176914
6034	NC_016822	CGGCG	2	10	347005	347014	0 %	0 %	60 %	40 %	383176914
6035	NC_016822	TTG	2	6	347055	347060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176914
6036	NC_016822	CCGGCA	2	12	347067	347078	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383176914
6037	NC_016822	TGG	2	6	347110	347115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176914
6038	NC_016822	CGG	2	6	347140	347145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176914
6039	NC_016822	CGG	2	6	347167	347172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176914
6040	NC_016822	TGA	2	6	347175	347180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176914
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6042	NC_016822	GGT	3	9	347305	347313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176914
6043	NC_016822	GCA	2	6	347373	347378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176914
6044	NC_016822	GGC	2	6	347383	347388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176914
6045	NC_016822	TGCG	2	8	347469	347476	0 %	25 %	50 %	25 %	383176914
6046	NC_016822	GCA	2	6	347488	347493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176914
6047	NC_016822	GCG	2	6	347517	347522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176914
6048	NC_016822	CGA	2	6	347533	347538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176914
6049	NC_016822	GCA	2	6	347625	347630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176914
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6054	NC_016822	CCA	2	6	347808	347813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176914
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6058	NC_016822	TGC	2	6	347931	347936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176914
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6060	NC_016822	GGA	2	6	348010	348015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176914
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6062	NC_016822	TTA	2	6	348056	348061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176915
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6069	NC_016822	CAG	2	6	348220	348225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176915
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6103	NC_016822	AGGCGG	2	12	349659	349670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	383176916
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6107	NC_016822	A	6	6	349901	349906	100 %	0 %	0 %	0 %	383176916
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6111	NC_016822	TCG	2	6	350065	350070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176916
6112	NC_016822	TCGCC	2	10	350076	350085	0 %	20 %	20 %	60 %	383176916
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6115	NC_016822	TC	3	6	350233	350238	0 %	50 %	0 %	50 %	383176916
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6121	NC_016822	ATC	2	6	350417	350422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176916
6122	NC_016822	GGC	2	6	350447	350452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176916
6123	NC_016822	AAG	2	6	350454	350459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176916
6124	NC_016822	CAC	2	6	350467	350472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176916
6125	NC_016822	TGCC	2	8	350480	350487	0 %	25 %	25 %	50 %	383176916
6126	NC_016822	GCG	2	6	350489	350494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176916
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6131	NC_016822	GCG	2	6	350639	350644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176917
6132	NC_016822	GCGAA	2	10	350664	350673	40 %	0 %	40 %	20 %	383176917
6133	NC_016822	TGC	2	6	350718	350723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176917
6134	NC_016822	GC	3	6	350774	350779	0 %	0 %	50 %	50 %	383176917
6135	NC_016822	AGC	2	6	350829	350834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176917
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6138	NC_016822	GCTC	2	8	350943	350950	0 %	25 %	25 %	50 %	383176917
6139	NC_016822	GGCA	2	8	350959	350966	25 %	0 %	50 %	25 %	383176917
6140	NC_016822	TGC	2	6	351003	351008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176917
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6142	NC_016822	GATC	2	8	351049	351056	25 %	25 %	25 %	25 %	383176917
6143	NC_016822	CAC	2	6	351073	351078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176917
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6145	NC_016822	GCG	2	6	351154	351159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176917
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6152	NC_016822	GGC	2	6	351523	351528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176917
6153	NC_016822	GCA	2	6	351529	351534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176917
6154	NC_016822	TGA	2	6	351612	351617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176917
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6181	NC_016822	GGC	2	6	353184	353189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176918
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6226	NC_016822	A	6	6	356588	356593	100 %	0 %	0 %	0 %	383176923
6227	NC_016822	AG	3	6	356612	356617	50 %	0 %	50 %	0 %	383176923
6228	NC_016822	TAAT	2	8	356623	356630	50 %	50 %	0 %	0 %	383176923
6229	NC_016822	A	6	6	356639	356644	100 %	0 %	0 %	0 %	383176923
6230	NC_016822	AGG	2	6	356653	356658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176923
6231	NC_016822	GTT	2	6	356668	356673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176923
6232	NC_016822	GGC	2	6	356701	356706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176923
6233	NC_016822	TGC	2	6	356710	356715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176923
6234	NC_016822	GCC	2	6	356741	356746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176923
6235	NC_016822	A	6	6	356764	356769	100 %	0 %	0 %	0 %	383176923
6236	NC_016822	TTA	2	6	356785	356790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176923
6237	NC_016822	CAAA	2	8	356803	356810	75 %	0 %	0 %	25 %	383176923
6238	NC_016822	TAC	2	6	356897	356902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176923
6239	NC_016822	A	7	7	356927	356933	100 %	0 %	0 %	0 %	383176923
6240	NC_016822	TGC	2	6	357123	357128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176924
6241	NC_016822	GCCA	2	8	357217	357224	25 %	0 %	25 %	50 %	383176924
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6365	NC_016822	CG	3	6	364161	364166	0 %	0 %	50 %	50 %	383176929
6366	NC_016822	CTG	2	6	364198	364203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176929
6367	NC_016822	CAT	2	6	364221	364226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176929
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6369	NC_016822	GCT	2	6	364326	364331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176929
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6371	NC_016822	GAT	2	6	364371	364376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176929
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6383	NC_016822	GGT	2	6	364743	364748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176929
6384	NC_016822	ACG	2	6	364784	364789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176929
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6388	NC_016822	TGA	2	6	364940	364945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176929
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6396	NC_016822	CGC	2	6	365821	365826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176930
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6402	NC_016822	CTG	2	6	366073	366078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176931
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6404	NC_016822	CTG	2	6	366163	366168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176931
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6435	NC_016822	CTG	2	6	367948	367953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176933
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6452	NC_016822	A	6	6	368542	368547	100 %	0 %	0 %	0 %	383176933
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6454	NC_016822	A	6	6	368594	368599	100 %	0 %	0 %	0 %	383176934
6455	NC_016822	TCA	2	6	368647	368652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176934
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6469	NC_016822	CGCTGG	2	12	369420	369431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383176934
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6480	NC_016822	GTTG	2	8	370085	370092	0 %	50 %	50 %	0 %	383176935
6481	NC_016822	GTTTG	2	10	370151	370160	0 %	60 %	40 %	0 %	383176935
6482	NC_016822	TGA	2	6	370216	370221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176935
6483	NC_016822	GCG	2	6	370239	370244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176935
6484	NC_016822	GGCGC	2	10	370335	370344	0 %	0 %	60 %	40 %	383176935
6485	NC_016822	GGC	2	6	370346	370351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176935
6486	NC_016822	GGT	2	6	370404	370409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176935
6487	NC_016822	GTG	2	6	370410	370415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176935
6488	NC_016822	GCTG	2	8	370444	370451	0 %	25 %	50 %	25 %	383176935
6489	NC_016822	CCA	2	6	370491	370496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176935
6490	NC_016822	GCT	3	9	370535	370543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176935
6491	NC_016822	TTC	2	6	370557	370562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176935
6492	NC_016822	CTG	2	6	370566	370571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176935
6493	NC_016822	TGG	2	6	370609	370614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176935
6494	NC_016822	GGC	2	6	370637	370642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176935
6495	NC_016822	GGC	2	6	370670	370675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176935
6496	NC_016822	GCT	2	6	370763	370768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176935
6497	NC_016822	GTC	2	6	370784	370789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176935
6498	NC_016822	GTT	2	6	370826	370831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176935
6499	NC_016822	GTT	2	6	370871	370876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176935
6500	NC_016822	TTG	2	6	371026	371031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176935

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